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鲍曼不动杆菌快速表型药敏检测方法的建立和初步应用
被引量:
3
1
作者
罗丹
李玉良
+1 位作者
翁邦碧
枉前
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第18期1775-1782,共8页
目的利用表面活性剂-叠氮溴化丙锭(propidium monoazide, PMAxx)-qPCR反应体系对鲍曼不动杆菌进行快速表型药敏预测。方法依次对加入反应体系中表面活性剂的种类和最适浓度、叠氮溴化丙锭曝光时间和浓度进行优化;采用qPCR检测鲍曼不动...
目的利用表面活性剂-叠氮溴化丙锭(propidium monoazide, PMAxx)-qPCR反应体系对鲍曼不动杆菌进行快速表型药敏预测。方法依次对加入反应体系中表面活性剂的种类和最适浓度、叠氮溴化丙锭曝光时间和浓度进行优化;采用qPCR检测鲍曼不动杆菌特异性鉴别基因(blaOXA-51)拷贝数;采用抗菌药物-细菌共反应体系测定鲍曼不动杆菌对抗菌药物的敏感性。结果当表面活性剂月桂酰基甘氨酸钠浓度为0.2%,叠氮溴化丙锭最佳曝光时间和浓度为5 min和20μmol/L时,能有效抑制死细胞DNA扩增,且不影响活细胞。基于此建立的表型药敏预测模型能快速(2 h内)和准确地预测鲍曼不动杆菌对多西环素及左氧氟沙星的敏感性(P<0.01),对头孢哌酮/舒巴坦的敏感性更可靠的预测需超过2 h。结论基于月桂酰基甘氨酸钠-PMAxx-qPCR体系的快速表型药敏预测新方法可在短时间内为鲍曼不动杆菌感染的治疗提供药敏依据,以指导其临床精准用药。
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关键词
鲍曼不动杆菌
快速
表型药敏
检测
月桂酰基甘氨酸钠
叠氮溴化丙锭
实时荧光定量PCR
细菌特异性鉴别基因
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职称材料
肺炎克雷伯菌25株的PFGE基因分型和药敏表型的比较分析
被引量:
2
2
作者
龚文胜
刘厚明
+2 位作者
何林
杨自华
唐曙明
《实用医学杂志》
CAS
2005年第11期1214-1216,共3页
目的:探讨肺炎克雷伯菌耐药表型和基因组型之间的关系。方法:临床菌株用VITEK仪器鉴定,以双纸片协同试验(DDST)筛选出产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌(ESBL-KP)11株和不产超广谱β-内酰胺酶肺炎(WESBL-KP)14株;用XbaⅠ酶对各试验菌株...
目的:探讨肺炎克雷伯菌耐药表型和基因组型之间的关系。方法:临床菌株用VITEK仪器鉴定,以双纸片协同试验(DDST)筛选出产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌(ESBL-KP)11株和不产超广谱β-内酰胺酶肺炎(WESBL-KP)14株;用XbaⅠ酶对各试验菌株进行限制性酶切,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离酶切片段,FingerprintingⅡ指纹图谱分析软件分析PFGE图谱。结果:菌株间AST结果相差较大,并可在较短时间内发生耐药变迁;筛选出产ESBLs11株,占实验菌株的44%;PFGE图谱分析,将肺炎克雷伯菌分为6群,相似性系数为52.63%~78.24%,还有1株不能分型。结论:在用于ESBLs-KP治疗时,碳青霉烯类抗生素是首选应用的抗生素;PFGE图谱分析,产ESBLs菌株和不产ESBLs分在各个群中,没有发现特异的ESBLs条带,但在同一群中,产ESBLs的菌株常为同一亚群,不产ESBLs的菌株常为另一亚群;肺炎克雷伯菌的耐药表型和PFGE的基因分型可以表现为一致,也可以表现不同。
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关键词
肺炎克雷伯菌
PFGE基因分型
药敏
表型
比较分析
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职称材料
从新生儿分离到1株ST5型单增李斯特菌的药敏及基因组特征分析
3
作者
刘增宾
刘力
+6 位作者
李志荣
许彩红
王红彬
杨如刚
樊涛
赵建宏
张敬蕊
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期644-651,共8页
目的对1株新生儿感染ST5型单增李斯特菌LK100进行全基因组测序和耐药分析。方法从新生儿感染患者胃液标本中分离到1株疑似单增李斯特菌,采用VITEK2-Compact全自动微生物鉴定仪和16S RNA序列测定进行鉴定,对鉴定的菌株应用E-test法进行5...
目的对1株新生儿感染ST5型单增李斯特菌LK100进行全基因组测序和耐药分析。方法从新生儿感染患者胃液标本中分离到1株疑似单增李斯特菌,采用VITEK2-Compact全自动微生物鉴定仪和16S RNA序列测定进行鉴定,对鉴定的菌株应用E-test法进行5种药物敏感性试验,同时利用三代测序平台对菌株进行全基因组测序,获得菌株基因组序列。基于基因组序列利用CARD抗生素耐药基因数据库获得菌株的耐药元件。基因组序列与巴斯德数据库中的单增李斯特菌的数据进行比对,获得菌株的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、血清分型;同时利用毒力分析网站对菌株的毒力基因分布进行分析。利用前噬菌体数据库,在线进行菌株噬菌体的预测和注释。结果从新生儿患者分离到的菌株(LK100)鉴定为单增李斯特菌,该菌株对青霉素、氨苄西林、美罗培南、红霉素及复方新诺明等5种抗生素均敏感,其MLST分型为ST5型,血清型为1/2b-3b,染色体基因组全长为3032582 bp,GC含量为37.91%,包含一条完整的环状质粒,序列长度为52822 bp,携带LIPI-1毒力岛,且具有完整的InlA蛋白。固有耐药相关基因主要在染色体,1个SSI-1压力生存岛和1个LGI2基因组岛;LK100基因组中共预测到5个前噬菌体序列。结论本研究综合分析说明了ST5型临床单增李斯特菌的基因组特征和抗生素敏感性特点,为后期临床单增李斯特菌的感染治疗及其致病机理的研究提供数据支持。
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关键词
新生儿
单增李斯特菌
表型药敏
全基因组测序
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职称材料
肺炎克雷伯菌25株PFGE基因分型和药敏表型的比较
被引量:
3
4
作者
龚文胜
刘厚明
+2 位作者
何林
杨自华
唐曙明
《实用医学杂志》
CAS
2005年第10期1103-1105,共3页
目的:探讨肺炎克雷伯菌耐药表型和基因组型之间的关系。方法:临床菌株用VITEK60仪器鉴定,以双纸片协同试验(DDST)筛选出产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌(ESBLs-KP)11株和不产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌(NESBLs-KP)14株;用XbaⅠ酶对...
目的:探讨肺炎克雷伯菌耐药表型和基因组型之间的关系。方法:临床菌株用VITEK60仪器鉴定,以双纸片协同试验(DDST)筛选出产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌(ESBLs-KP)11株和不产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌(NESBLs-KP)14株;用XbaⅠ酶对各试验菌株进行限制性酶切,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离酶切片段,FingerprintingⅡ指纹图谱分析软件分析PFGE图谱。结果:菌株间AST结果相差较大,并可在较短时间内发生耐药变迁;筛选出产ESBLs11株,占实验菌株的44%;PFGE图谱分析,将肺炎克雷伯菌分为6群,相似性系数为52.63%~78.24%,还有1株不能分型。结论:在用于ESBLs-KP治疗时,碳青霉烯类抗生素是首选应用的抗生素;PFGE图谱分析,产ESBLs菌株和不产ESBLs分在各个群中,没有发现特异的ESBLs条带,但在同一群中,产ESBLs的菌株常为同一亚群,不产ESBLs的菌株常为另一亚群;肺炎克雷伯菌的耐药表型和PFGE的基因分型可以表现为一致,也可以表现不同。
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关键词
肺炎克雷伯菌
PFGE基因分型
药敏
表型
比较分析
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职称材料
题名
鲍曼不动杆菌快速表型药敏检测方法的建立和初步应用
被引量:
3
1
作者
罗丹
李玉良
翁邦碧
枉前
机构
陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院药剂科
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第18期1775-1782,共8页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(81802117)
陆军军医大学优秀青年人才库(XZ-2019-505-012)。
文摘
目的利用表面活性剂-叠氮溴化丙锭(propidium monoazide, PMAxx)-qPCR反应体系对鲍曼不动杆菌进行快速表型药敏预测。方法依次对加入反应体系中表面活性剂的种类和最适浓度、叠氮溴化丙锭曝光时间和浓度进行优化;采用qPCR检测鲍曼不动杆菌特异性鉴别基因(blaOXA-51)拷贝数;采用抗菌药物-细菌共反应体系测定鲍曼不动杆菌对抗菌药物的敏感性。结果当表面活性剂月桂酰基甘氨酸钠浓度为0.2%,叠氮溴化丙锭最佳曝光时间和浓度为5 min和20μmol/L时,能有效抑制死细胞DNA扩增,且不影响活细胞。基于此建立的表型药敏预测模型能快速(2 h内)和准确地预测鲍曼不动杆菌对多西环素及左氧氟沙星的敏感性(P<0.01),对头孢哌酮/舒巴坦的敏感性更可靠的预测需超过2 h。结论基于月桂酰基甘氨酸钠-PMAxx-qPCR体系的快速表型药敏预测新方法可在短时间内为鲍曼不动杆菌感染的治疗提供药敏依据,以指导其临床精准用药。
关键词
鲍曼不动杆菌
快速
表型药敏
检测
月桂酰基甘氨酸钠
叠氮溴化丙锭
实时荧光定量PCR
细菌特异性鉴别基因
Keywords
Acinetobacter baumannii
rapid pathogen-specific phenotypic antibiotic susceptibility testing
sodium lauroylsarcosinate
propidium monoazide
real-time quantitative PCR
bacteria-specific identification and quantification genes
分类号
R378.7 [医药卫生—病原生物学]
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
肺炎克雷伯菌25株的PFGE基因分型和药敏表型的比较分析
被引量:
2
2
作者
龚文胜
刘厚明
何林
杨自华
唐曙明
机构
广东省深圳市人民医院医学检验部
出处
《实用医学杂志》
CAS
2005年第11期1214-1216,共3页
文摘
目的:探讨肺炎克雷伯菌耐药表型和基因组型之间的关系。方法:临床菌株用VITEK仪器鉴定,以双纸片协同试验(DDST)筛选出产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌(ESBL-KP)11株和不产超广谱β-内酰胺酶肺炎(WESBL-KP)14株;用XbaⅠ酶对各试验菌株进行限制性酶切,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离酶切片段,FingerprintingⅡ指纹图谱分析软件分析PFGE图谱。结果:菌株间AST结果相差较大,并可在较短时间内发生耐药变迁;筛选出产ESBLs11株,占实验菌株的44%;PFGE图谱分析,将肺炎克雷伯菌分为6群,相似性系数为52.63%~78.24%,还有1株不能分型。结论:在用于ESBLs-KP治疗时,碳青霉烯类抗生素是首选应用的抗生素;PFGE图谱分析,产ESBLs菌株和不产ESBLs分在各个群中,没有发现特异的ESBLs条带,但在同一群中,产ESBLs的菌株常为同一亚群,不产ESBLs的菌株常为另一亚群;肺炎克雷伯菌的耐药表型和PFGE的基因分型可以表现为一致,也可以表现不同。
关键词
肺炎克雷伯菌
PFGE基因分型
药敏
表型
比较分析
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
从新生儿分离到1株ST5型单增李斯特菌的药敏及基因组特征分析
3
作者
刘增宾
刘力
李志荣
许彩红
王红彬
杨如刚
樊涛
赵建宏
张敬蕊
机构
河北医科大学第二医院
石家庄市第四医院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期644-651,共8页
基金
石家庄市科学技术研究与发展计划项目(No.211460593)
河北省医学科学研究课题计划(No.20221681)。
文摘
目的对1株新生儿感染ST5型单增李斯特菌LK100进行全基因组测序和耐药分析。方法从新生儿感染患者胃液标本中分离到1株疑似单增李斯特菌,采用VITEK2-Compact全自动微生物鉴定仪和16S RNA序列测定进行鉴定,对鉴定的菌株应用E-test法进行5种药物敏感性试验,同时利用三代测序平台对菌株进行全基因组测序,获得菌株基因组序列。基于基因组序列利用CARD抗生素耐药基因数据库获得菌株的耐药元件。基因组序列与巴斯德数据库中的单增李斯特菌的数据进行比对,获得菌株的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、血清分型;同时利用毒力分析网站对菌株的毒力基因分布进行分析。利用前噬菌体数据库,在线进行菌株噬菌体的预测和注释。结果从新生儿患者分离到的菌株(LK100)鉴定为单增李斯特菌,该菌株对青霉素、氨苄西林、美罗培南、红霉素及复方新诺明等5种抗生素均敏感,其MLST分型为ST5型,血清型为1/2b-3b,染色体基因组全长为3032582 bp,GC含量为37.91%,包含一条完整的环状质粒,序列长度为52822 bp,携带LIPI-1毒力岛,且具有完整的InlA蛋白。固有耐药相关基因主要在染色体,1个SSI-1压力生存岛和1个LGI2基因组岛;LK100基因组中共预测到5个前噬菌体序列。结论本研究综合分析说明了ST5型临床单增李斯特菌的基因组特征和抗生素敏感性特点,为后期临床单增李斯特菌的感染治疗及其致病机理的研究提供数据支持。
关键词
新生儿
单增李斯特菌
表型药敏
全基因组测序
Keywords
neonatal
Listeria monocytogenes
phenotypic drug sensitivity
whole genome sequencing
分类号
R378.99 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
肺炎克雷伯菌25株PFGE基因分型和药敏表型的比较
被引量:
3
4
作者
龚文胜
刘厚明
何林
杨自华
唐曙明
机构
广东省深圳市人民医院
出处
《实用医学杂志》
CAS
2005年第10期1103-1105,共3页
文摘
目的:探讨肺炎克雷伯菌耐药表型和基因组型之间的关系。方法:临床菌株用VITEK60仪器鉴定,以双纸片协同试验(DDST)筛选出产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌(ESBLs-KP)11株和不产超广谱β内酰胺酶肺炎克雷伯菌(NESBLs-KP)14株;用XbaⅠ酶对各试验菌株进行限制性酶切,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分离酶切片段,FingerprintingⅡ指纹图谱分析软件分析PFGE图谱。结果:菌株间AST结果相差较大,并可在较短时间内发生耐药变迁;筛选出产ESBLs11株,占实验菌株的44%;PFGE图谱分析,将肺炎克雷伯菌分为6群,相似性系数为52.63%~78.24%,还有1株不能分型。结论:在用于ESBLs-KP治疗时,碳青霉烯类抗生素是首选应用的抗生素;PFGE图谱分析,产ESBLs菌株和不产ESBLs分在各个群中,没有发现特异的ESBLs条带,但在同一群中,产ESBLs的菌株常为同一亚群,不产ESBLs的菌株常为另一亚群;肺炎克雷伯菌的耐药表型和PFGE的基因分型可以表现为一致,也可以表现不同。
关键词
肺炎克雷伯菌
PFGE基因分型
药敏
表型
比较分析
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲍曼不动杆菌快速表型药敏检测方法的建立和初步应用
罗丹
李玉良
翁邦碧
枉前
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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职称材料
2
肺炎克雷伯菌25株的PFGE基因分型和药敏表型的比较分析
龚文胜
刘厚明
何林
杨自华
唐曙明
《实用医学杂志》
CAS
2005
2
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职称材料
3
从新生儿分离到1株ST5型单增李斯特菌的药敏及基因组特征分析
刘增宾
刘力
李志荣
许彩红
王红彬
杨如刚
樊涛
赵建宏
张敬蕊
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
4
肺炎克雷伯菌25株PFGE基因分型和药敏表型的比较
龚文胜
刘厚明
何林
杨自华
唐曙明
《实用医学杂志》
CAS
2005
3
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职称材料
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