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鱼类表型组学的发展、现状与挑战
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作者 车帅 李昂 +3 位作者 王焕 安长廷 柳淑芳 庄志猛 《渔业科学进展》 北大核心 2025年第5期1-22,共22页
鱼类表型组学是在基因组水平上系统研究鱼类表型信息的学科,通过对鱼类表型特征、基因组信息及环境条件之间的联合分析,揭示鱼类应对环境变化的响应及适应机制,可为鱼类的养殖生产实践提供有价值的信息和指标。将鱼类表型组学与基因组... 鱼类表型组学是在基因组水平上系统研究鱼类表型信息的学科,通过对鱼类表型特征、基因组信息及环境条件之间的联合分析,揭示鱼类应对环境变化的响应及适应机制,可为鱼类的养殖生产实践提供有价值的信息和指标。将鱼类表型组学与基因组学相结合是提高养殖鱼类选择育种效率的有效途径。相较于基因组学研究的快速发展,鱼类表型组学发展相对滞后。由于鱼类特殊的水生环境、较高的养殖密度以及较强的运动能力,导致目前对鱼类表型数据的获取仍存在困难,加之研究群体规模的不断扩大,鱼类表型数据的高通量精准获取和分析更加难以实现,已成为限制鱼类表型组学研究发展的瓶颈。近年来,传感器技术和人工智能的发展为鱼类表型组学研究提供了高通量、无损且精确的方案,可显著提高鱼类表型的分型效率,成为解决这一瓶颈问题的有效方法。本文综述了表型组研究的发展历程,提出了鱼类表型组学的研究策略,整理了鱼类表型组学的研究现状、鱼类表型组数据获取的主流方法,最后提出了鱼类表型组学研究存在的问题及其应用前景,以期丰富对鱼类表型组学的认知,为提升鱼类遗传育种效率提供参考。 展开更多
关键词 鱼类 表型组 传感器 高通量表型获取 联合分析
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基于表型组学探究糖脂代谢紊乱的中医证候生物学基础
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作者 方心怡 张艳娇 +2 位作者 张宇昕 苗润宇 田佳星 《世界中医药》 北大核心 2025年第2期320-326,共7页
糖脂代谢紊乱相关疾病的发病率居高不下,严重威胁人类健康,成为全球范围内的重大公共卫生问题。中医药防治糖脂代谢紊乱优势突出。从整体出发,宏观调控机体代谢紊乱,是中医药防治糖脂代谢紊乱的特色和要点。解读清楚中医药疗效必不可少... 糖脂代谢紊乱相关疾病的发病率居高不下,严重威胁人类健康,成为全球范围内的重大公共卫生问题。中医药防治糖脂代谢紊乱优势突出。从整体出发,宏观调控机体代谢紊乱,是中医药防治糖脂代谢紊乱的特色和要点。解读清楚中医药疗效必不可少的关键环节是研究证候的本质。然而,由于现在对中医证候的有限认知,其生物学基础尚未阐明,限制了中医证候研究的发展和应用。借助表型组学等现代科技手段阐明中医证候实质,揭开中医药“黑箱”,有助于中医精准医学的发展。 展开更多
关键词 表型组 糖脂代谢紊乱 中医证候 糖尿病 代谢综合征 代谢 蛋白 肠道微生物
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基于BERT和SSA-BXS的水稻表型组学实体分类研究
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作者 祝心雨 徐达宇 张旭尧 《南方农机》 2025年第15期1-8,14,共9页
【目的】解决由于水稻表型组学数据丰富多样而导致的信息提取和利用效率较低等问题,提高水稻表型组学实体分类的准确性和效率。【方法】提出了一种基于麻雀搜索算法优化的水稻表型组学实体分类模型。该模型采用创新的混合集成学习策略,... 【目的】解决由于水稻表型组学数据丰富多样而导致的信息提取和利用效率较低等问题,提高水稻表型组学实体分类的准确性和效率。【方法】提出了一种基于麻雀搜索算法优化的水稻表型组学实体分类模型。该模型采用创新的混合集成学习策略,并引入BERT模型,以利用其深度双向编码能力高效提取水稻表型组学实体的词向量特征,实现精准分类。此外,与传统单一分类器(SVM、LGBM、XGBoost、CatBoost和MLP)进行了比较实验,验证本研究所提方法的优越性。【结果】SSA-BXS模型在准确率、精确率、召回率和F1-score等关键指标上均显著优于其他方法,分别达88.07%、90.85%、88.07%和88.32%。【结论】本研究所提出的混合整合方法在水稻表型组学实体分类任务中的表现出色,显示出其实用价值与潜力,可为未来水稻表型组学的深入研究提供有力支持。 展开更多
关键词 水稻表型组 实体分类 麻雀搜索算法 混合集成学习 BERT模型
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华中农业大学植物科学技术学院作物表型组团队
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《农业机械学报》 北大核心 2025年第3期F0003-F0003,共1页
华中农业大学作物表型组学团队依托作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室等6个国家省部级平台,聚焦作物全生命周期地上-地下、物理-生理、设施-大田、宏观-微观表型性状获取及解析关键技术突破、高通量表型系统研制及育种研究应... 华中农业大学作物表型组学团队依托作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室等6个国家省部级平台,聚焦作物全生命周期地上-地下、物理-生理、设施-大田、宏观-微观表型性状获取及解析关键技术突破、高通量表型系统研制及育种研究应用。团队由杨万能教授领衔,现有固定研究人员10人,其中国家及省市级人才4人,包含工学、农学、计算机、生命科学等交叉学科背景。 展开更多
关键词 作物表型组 湖北洪山实验室 杨万能教授
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植物表型组学研究进展 被引量:11
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作者 杨有新 杨泽茂 +1 位作者 吴才君 范淑英 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1105-1112,共8页
基因型、表型和环境三者构成了遗传学研究的铁三角。近年来,随着高通量测序技术的快速发展,基因型的研究更加简单快速。然而由于植物表型本身的复杂性以及动态变化的特性,表型研究严重滞后于基因型研究。为了充分挖掘基因组、转录组、... 基因型、表型和环境三者构成了遗传学研究的铁三角。近年来,随着高通量测序技术的快速发展,基因型的研究更加简单快速。然而由于植物表型本身的复杂性以及动态变化的特性,表型研究严重滞后于基因型研究。为了充分挖掘基因组、转录组、蛋白质组等各种组学的信息以提高动植物育种效率,加快高通量、高分辨率表型组学研究具有重要意义。分析和概括了植物表型组学的概念和研究意义,对目前的表型组学的研究现状、具体的研究技术与重要的研究公司进行阐述,并对表型组学的发展进行了展望。表型组学作为一个与表型鉴定相关的研究领域,是联系生物体基因型和表型的桥梁。大力推动表型组学发展,整合有效资源,建立相关的研究设施和平台对推动我国分子育种和加速挖掘我国种质资源至关重要,这有助于推动我国动植物育种和农业的跨越式发展。 展开更多
关键词 基因 表型 表型组 表型组 高通量分析平台
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论植物表型组和植物表型组学的概念与范畴 被引量:79
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作者 潘映红 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期175-186,共12页
植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然... 植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学科的发展。本文分析了植物表型组和植物表型组学的相关概念和范畴,引入了准表型组、可辨识性状、映射性状、植物表型的遗传和环境包容性等新概念,将植物表型组定义为"受基因组和环境因素决定或影响的,反映植物结构及组成、植物生长发育过程及结果的全部物理、生理、生化特征和性状",将植物表型组学定义为"对植物表型组信息及相关环境参数的综合控制、完整采集和系统分析",并提出了植物表型组学的研究范围、研究方向和顶层设计原则。 展开更多
关键词 表型组 表型组 植物 概念 范畴
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植物表型组学大数据及其研究进展 被引量:68
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作者 赵春江 《农业大数据学报》 2019年第2期5-18,共14页
植物表型组学通过集成自动化平台装备和信息化技术手段,获取多尺度、多生境、多源异构植物表型海量数据,形成植物表型组学大数据,从组学高度系统深入地挖掘“基因型-表型-环境型”内在关系、全面揭示特定生物性状的形成机制,将极大地促... 植物表型组学通过集成自动化平台装备和信息化技术手段,获取多尺度、多生境、多源异构植物表型海量数据,形成植物表型组学大数据,从组学高度系统深入地挖掘“基因型-表型-环境型”内在关系、全面揭示特定生物性状的形成机制,将极大地促进功能基因组学、作物分子育种与高效栽培的进程。本文概括了植物表型组学大数据的发展背景、含义、产生过程和特点,系统综述了植物表型组学大数据研究进展,包括植物表型数据获取与解析、植物表型组大数据管理及建库技术、表型性状预测和基于表型组的多重组学分析的进展;从植物表型数据采集标准、多样化表型配套设施和低成本表型设备研发、开放共享植物表型组大数据平台构建、表型大数据融合与挖掘理论方法、植物表型组学协同共享和互作机制五个方面探讨了当前植物表型组学大数据研究与应用中面临的问题和挑战;最后从加强植物表型组技术体系设计与标准研究、植物表型-环境感知机理研究和智能化设备研发、植物表型组大数据建设以及人才队伍和协作网络建设四个方面提出具体建议。 展开更多
关键词 植物表型组 大数据 数字植物 数据挖掘 数据管理 数据获取 性状预测 植物表型组大数据平台
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药物表型组学:药理毒理学和个体化医学的新模式(英文) 被引量:11
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作者 Dayue Darrel DUAN 韩业山 +2 位作者 李立 赵建中 王忠 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期1-9,共9页
近年来,药物基因组学(pharmacogenomics)研究收集了大量有关遗传多态性对药物反应(疗效和毒性反应)的普遍影响的信息,并突出显示了基因组指导下的个体化药物治疗的必要性。然而,由于疾病和药物治疗临床效果和毒性反应的内在复杂性,并且... 近年来,药物基因组学(pharmacogenomics)研究收集了大量有关遗传多态性对药物反应(疗效和毒性反应)的普遍影响的信息,并突出显示了基因组指导下的个体化药物治疗的必要性。然而,由于疾病和药物治疗临床效果和毒性反应的内在复杂性,并且往往涉及数十个或数百个基因和环境因素的动态变化的影响,将药物基因组学的知识转化为个体化医学的临床实践面临着重大的挑战和障碍。为了克服这些障碍,些包括药物蛋白质组学(pharmacoproteomics)和药物代谢组学(pharmacometabolomics)等在内的新学科应运而生。同时,这些"组学"研究也揭示了在越来越详细的基因组/蛋白质组学/代谢组学的变异性与目前定义的各种临床疾病和药物治疗表型的复杂性之间存在着种非平行关系。因而要种新的研究模式来重新定义这种表型与基因组/蛋白质组/代谢组之间的非平行关系。此文将介绍个跨领域的新学科,它能为从只注重于单纯的表型-基因型关系的研究模式转化到系统性的表型组-基因组关系的研究方法提供整套新的技术平台,从而在系统生物学水平重新定义具有整合性的药物治疗靶点群,改进药物研究的模式,使其更适合于临床个体化医学与药物治疗。这个新学科就是"药物表型组学(pharmacophenomics)"。表型组(phenome)是在特定环境影响下有机体基因组/蛋白质组/代谢组表达的整体表型特征的总和。表型组学(phenomics)则是对表型组与基因组/转录组(transcritome)/蛋白质组/代谢组/相互作用组(interactome)和环境因素变化之间的复杂关系的定量研究。药物表型组学将系统性地确定对应于定义明确的疾病表型组的综合性药物靶标群。因此,药物表型组学将与药物基因组学、药物蛋白质组学组学和药物代谢组学等学科互补,为药物作用和毒性的研究提供个革命性的新模式。 展开更多
关键词 药物基因 药物代谢 表型组 表型组 个体化医学
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中医药表型组学相关术语释义与应用 被引量:6
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作者 王小强 杜鑫 +11 位作者 曹谦 田园 姜小燕 高晨皓 刘子渝 陶星星 许婷 雷明 叶玲玉 郭东更 程海波 段大跃 《南京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期210-220,共11页
中医药表型组学是研究传统中医药学的新兴学科。“表型”“表型组”和“表型组学”等作为舶来术语名词,与传统中医药学原创术语的结合衍生出中医表型、证候表型、证候表型组、证候表型组学、复方药物表型组学、方剂组学等新术语。近年来... 中医药表型组学是研究传统中医药学的新兴学科。“表型”“表型组”和“表型组学”等作为舶来术语名词,与传统中医药学原创术语的结合衍生出中医表型、证候表型、证候表型组、证候表型组学、复方药物表型组学、方剂组学等新术语。近年来,学者们在中医药表型组学研究中对相关术语进行了概念诠释,同时也产生了一些概念错位、术语误用、观点各异等问题,故为了构建中医药表型组学研究体系,有必要对中医药表型组学相关术语释义与应用进行正本清源与深度剖析,以期在学科发展之初即建立统一的概念及术语,为中医药表型组学的学科发展奠定坚实基础。 展开更多
关键词 中医 证候 表型 表型组 表型组
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基于Scopus的植物表型组学研究进展分析 被引量:13
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作者 唐惠燕 倪峰 +5 位作者 李小涛 陈蓉蓉 袁曦临 朱艳 周济 丁艳锋 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1133-1141,共9页
[目的]文献计量方法可以用于反映和预测科学技术发展的历史和趋势。本文基于科学大数据的计量方法探讨植物表型组学的研究现状,为植物表型组学的发展提供参考。[方法]基于Scopus数据库,分析2013年—2018年9月数据库中植物表型组学及其... [目的]文献计量方法可以用于反映和预测科学技术发展的历史和趋势。本文基于科学大数据的计量方法探讨植物表型组学的研究现状,为植物表型组学的发展提供参考。[方法]基于Scopus数据库,分析2013年—2018年9月数据库中植物表型组学及其相关学术产出的文献数量、引用次数、合作单位、研究方向、学术机构和科研团队等信息,利用Sci Val和Cite Space 5.0等统计分析工具,运用可视化数据方法,分析植物表型组学研究领域的发展特点和趋势。[结果]基于Scopus共检索到与植物表型组学研究和应用相关的文献共20 953篇,总被引数217 105,TOP1%高被引论文为2.0%。相关学术产出总被引量TOP10的国家是美国、中国、德国、英国、法国、日本、澳大利亚、西班牙、加拿大和荷兰。相关论文被引总量TOP10的机构分别是中国科学院、法国国家农业研究院、美国农业部、法国国家科学研究院、中国农业科学院、美国康奈尔大学、西班牙高等科学研究委员会、美国加州大学戴维斯分校、法国巴黎萨克莱大学、荷兰瓦赫宁根大学。学术产出最多的学者是德国克斯·普朗克分子植物生理研究所的Alisdair Robert Fernie,共发表58篇植物细胞表型论文,被引1 246次。目前植物表型组学研究的植物种类较少,主要包括拟南芥、水稻、小麦、玉米、番茄和大豆。[结论]作为一个新兴的研究方向,植物表型组学体现出作物栽培、育种、生物学与计算机科学等多学科交叉发展的特性。高通量图像及相关数据分析是现阶段植物表型组学的重要研究方向,主题显著度指数达到98.8%,受关注度极高。 展开更多
关键词 植物表型组 文献计量学 Scopes 可视化 主题显著度 CITESPACE
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基于Stacking集成学习的水稻表型组学实体分类研究 被引量:24
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作者 袁培森 杨承林 +2 位作者 宋玉红 翟肇裕 徐焕良 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第11期144-152,共9页
为研究整合水稻表型组学相关知识,系统地建立水稻表型组学知识图谱,通过分布式爬虫框架从国家水稻数据中心网站获取水稻表型组学数据集,并以互动百科为辅助数据源获取水稻表型组学数据。对水稻表型组学数据采用TF-IDF技术结合潜在语义... 为研究整合水稻表型组学相关知识,系统地建立水稻表型组学知识图谱,通过分布式爬虫框架从国家水稻数据中心网站获取水稻表型组学数据集,并以互动百科为辅助数据源获取水稻表型组学数据。对水稻表型组学数据采用TF-IDF技术结合潜在语义模型进行预处理,并对水稻表型组学实体进行人工分类和标注。为实现水稻表型组学实体分类,研究了基于堆叠式两阶段集成学习的分类器组合模型,结合K-近邻算法、支持向量机、随机森林、梯度提升决策树机器学习方法,提升水稻表型组学实体数据分类的性能。研究表明,基于堆叠式两阶段集成学习的分类器组合模型对不同类别的水稻表型组学数据都具有较好的多分类能力,对于不平衡的水稻表型组学数据集,本文方法的分类器组合模型对水稻表型组学数据分类效果最佳,Gene类别的F1为90.47%,总体准确率达80.55%,比支持向量机、K-近邻、随机森林和梯度提升决策树4种基分类器的分类准确率平均高6.78个百分点。 展开更多
关键词 水稻表型组 实体分类 堆叠式集成学习 知识图谱 潜在语义模型
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中风病痰热腑实证的表型组学研究思路 被引量:8
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作者 王忠 高颖 +3 位作者 王阶 乔延江 申春悌 王永炎 《世界科学技术-中医药现代化》 2015年第12期2423-2429,共7页
在东学与西学融通共进,实体本体论与关系本体论有机结合的多组学时代,进一步阐释以象为素、以素为候、以候为证、据证言病、病证结合、方证相应的具有中医意象思维特征的诊疗系统,具有重要理论意义和现实价值。本文以中风病痰热腑实证... 在东学与西学融通共进,实体本体论与关系本体论有机结合的多组学时代,进一步阐释以象为素、以素为候、以候为证、据证言病、病证结合、方证相应的具有中医意象思维特征的诊疗系统,具有重要理论意义和现实价值。本文以中风病痰热腑实证为例探索中医证候理论的内实外虚、多维时空、动态演变、整体关联、方证相应的五维属性,同时引入表型组和二维基因组的研究方法,分析了中风病痰热腑实证临床表型组学的研究思路。研究发现,只有在意象诊疗模式下才能表达与分析证候的多维属性;而赋予了现代科学内涵的中医药辨证论治体系必将在未来的临床表型组学和个体化医学的研究中发挥独特的引领作用。 展开更多
关键词 中风病 痰热腑实证 证候 表型组 辨证论治 意象思维
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表型组学:解析基因型-表型关系的科学 被引量:11
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作者 李宏 韦晓兰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期41-47,共7页
表型组学是近年来发展起来的一门新科学,主要对在不同环境下的基因型全部细胞表型进行系统研究。表型组学在基因型-表型作图、复杂性状疾病的遗传基础研究、作物改良方面都有广泛的应用,同时表型组学研究也面临着巨大挑战。基因组数据... 表型组学是近年来发展起来的一门新科学,主要对在不同环境下的基因型全部细胞表型进行系统研究。表型组学在基因型-表型作图、复杂性状疾病的遗传基础研究、作物改良方面都有广泛的应用,同时表型组学研究也面临着巨大挑战。基因组数据的广泛特征直接催生了以基因组序列为研究起点的新科学。就表型组学的学科范畴进行深入浅出的介绍,综述表型组学在基因型-表型作图、复杂性状疾病的遗传基础研究、作物改良方面的应用以及表型组学研究面临的挑战。并就目前生物信息学在表型组学中的应用以及表型组学未来和展望进行讨论。 展开更多
关键词 基因型 表型 高通量分析平台 表型组
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节水抗旱稻高通量表型组学研究平台的建设与应用 被引量:2
14
作者 高欢 徐小艳 +5 位作者 陈韵宇 刘鸿艳 陈亮 杨万能 罗利军 楼巧君 《上海农业学报》 2022年第4期46-55,共10页
发展节水抗旱稻对于在“资源节约、环境友好”基础上保障粮食安全具有重大意义。受限于抗旱性状的复杂性和缺乏精准抗旱鉴定平台,基因组序列等大量生物信息的潜力无法得到有效挖掘和应用。发展水稻抗旱表型组学可为稻种资源抗旱性评价... 发展节水抗旱稻对于在“资源节约、环境友好”基础上保障粮食安全具有重大意义。受限于抗旱性状的复杂性和缺乏精准抗旱鉴定平台,基因组序列等大量生物信息的潜力无法得到有效挖掘和应用。发展水稻抗旱表型组学可为稻种资源抗旱性评价、基因发掘与利用提供新思路。通过简略介绍国内外作物表型平台的研发和应用,重点阐述节水抗旱稻表型组学平台的建设和应用。目前,该平台集成了可见光RGB成像、红外成像、高光谱成像和激光雷达成像共4种采集单元,可对水稻的抗旱性进行连续无损的图像采集和分析鉴定,是国内外进行水稻抗旱高通量表型研究和应用较为先进和全面的设施之一。 展开更多
关键词 节水抗旱稻 高通量表型组 RGB 红外热成像 高光谱 激光雷达
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多尺度网络药理学在中药表型组学研究中的应用 被引量:2
15
作者 徐筱杰 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期867-868,共2页
目前一个清晰的趋势是人类疾病机制的研究已开始从遗传学向表型组学转移。精确和全面的分析表型的异常可加快识别临床并发症,疾病亚型与预后或治疗的影响,提高我们对人类健康和疾病的认识。
关键词 网络药理学 表型组
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口腔颌面表型组计划——口腔医学可持续发展的新起点 被引量:1
16
作者 张志愿 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1321-1323,共3页
人类表型组计划是科学研究领域的重大理论创新和突破,是新的国家科技战略,与之衔接的口腔颌面表型组计划也为口腔医学的可持续发展提供了科学的理论基础和新起点。该文从口腔颌面表型组计划对口腔医学的引领作用进行阐述,并用实例说明... 人类表型组计划是科学研究领域的重大理论创新和突破,是新的国家科技战略,与之衔接的口腔颌面表型组计划也为口腔医学的可持续发展提供了科学的理论基础和新起点。该文从口腔颌面表型组计划对口腔医学的引领作用进行阐述,并用实例说明该计划对口腔临床研究和转化医学的桥梁作用。 展开更多
关键词 人类表型组计划 口腔医学 临床研究 转化医学
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基于文献计量的植物表型组学研究进展分析 被引量:3
17
作者 李晓曼 张扬 +1 位作者 徐倩 谢能付 《农业大数据学报》 2019年第2期64-75,共12页
【目的】为了掌握植物表型组学研究的发展脉络和现状,本文基于文献计量学方法探讨了植物表型组学的研究现状。【方法】本研究基于WebofScience核心合集数据库分析了1995-2018年的学术论文,利用多个指标从学术产出(年度变化趋势分析、国... 【目的】为了掌握植物表型组学研究的发展脉络和现状,本文基于文献计量学方法探讨了植物表型组学的研究现状。【方法】本研究基于WebofScience核心合集数据库分析了1995-2018年的学术论文,利用多个指标从学术产出(年度变化趋势分析、国家和地区分析、期刊分析和学科领域分析)和学术合作(国家合作情况分析和机构合作情况分析)两个方面对植物表型组学文献进行了统计分析。同时,本文使用WebofScience数据库文献分析平台和EXCEL、DDA等软件,利用共词分析方法构建文献关键词共现矩阵,进一步对矩阵进行聚类分析,并利用VOSviewer文献计量工具进行可视化。此外,本文构建了1995-2002年、2003-2010年、2011-2018年三个时间片的关键词共现矩阵,分析了不同时间片主题的变化情况。【结果】本文基于WebofScience共检索到与植物表型组学研究和应用相关的文献6800篇,发现植物表型组学文献数量整体呈上升趋势,现阶段正处于高速增长阶段。从学术产出归属国家和地区分布来看,美国发文量最多,中国排名第四。从国际合作来看,澳大利亚、法国和西班牙国际合作论文占比较高,美国的占比靠后。虽然植物表型组组学研究已经呈现多学科合作发展趋势,但植物科学还是主体领域。从研究主题上看,主要包括遥感技术在表型组学中的应用、植物表型组学基础研究、利用光学成像的图像分析、机器学习和计算机视觉技术、利用不同植物种类如小麦和水稻的相关研究。 展开更多
关键词 文献计量学 植物表型组 共现分析 遥感技术 机器学习 计算机视觉 数据挖掘 数据采集
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植物表型组学:发展、现状与挑战 被引量:76
18
作者 周济 Francois Tardieu +9 位作者 Tony Pridmore John Doonan Daniel Reynolds Neil Hall Simon Griffiths 程涛 朱艳 王秀娥 姜东 丁艳锋 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期580-588,共9页
随着遥感、机器人技术、计算机视觉和人工智能的发展,植物表型组学研究已经步入了快速成长阶段。本文首先介绍了植物表型组学的发展简史,包括其理论核心、研究方法、在生物研究中的应用以及国际上最新的研究动向。然后,针对各类表型技... 随着遥感、机器人技术、计算机视觉和人工智能的发展,植物表型组学研究已经步入了快速成长阶段。本文首先介绍了植物表型组学的发展简史,包括其理论核心、研究方法、在生物研究中的应用以及国际上最新的研究动向。然后,针对各类表型技术载体平台如手持、人载、车载、田间实时监控、大型室内外自动化平台和航空机载等,分析这些技术手段在室内、外植物研究中的应用情况和实际问题。为了对表型研究中产生的巨量图像和传感器数据进行量化分析,把大数据转化为有实际意义的性状信息和生物学知识,本文着重讨论了后期表型数据解析和相应的研发过程。最后,提出表型组学的应用前景与未来展望,以期为中国的表型研究提供指导和建议。 展开更多
关键词 表型组 多层次表型 遥感 成像技术 机器人技术 物联网 人工智能 高通量性状分析
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作物育种学领域新的革命:高通量的表型组学时代 被引量:22
19
作者 穆金虎 陈玉泽 +2 位作者 冯慧 李文建 周利斌 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期962-971,共10页
传统的表型组学研究已严重滞后于高速发展的基因组、转录组及蛋白质组学,这也制约了作物育种学、功能基因组学等领域研究的深入开展。为突破这一瓶颈,国内外科研工作者经不懈的努力开发出了各类具有自动化、高精度、高通量特点的表型组... 传统的表型组学研究已严重滞后于高速发展的基因组、转录组及蛋白质组学,这也制约了作物育种学、功能基因组学等领域研究的深入开展。为突破这一瓶颈,国内外科研工作者经不懈的努力开发出了各类具有自动化、高精度、高通量特点的表型组学分析平台,并将该平台与各类"组学"研究相结合,这将是作物育种学领域的一次新的技术革命。本文对植物表型组学的概念和研究意义进行了介绍和分析,并对高通量表型组学分析平台进行了详细介绍,同时对未来表型组学的发展和各类组学及生物大数据的综合利用进行了展望。 展开更多
关键词 基因型 表型 表型组 高通量
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作物表型组大数据技术及装备发展研究 被引量:15
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作者 温维亮 郭新宇 +2 位作者 张颖 顾生浩 赵春江 《中国工程科学》 CSCD 北大核心 2023年第4期227-238,共12页
集成自动化平台装备和信息化技术手段,获取多尺度、多生境、多源异构的作物表型组大数据,将极大地促进作物功能基因组学、数字育种、智慧栽培的研究进程。本文分析了作物表型组大数据技术及装备的应用需求、产业发展形势,从物理、传输... 集成自动化平台装备和信息化技术手段,获取多尺度、多生境、多源异构的作物表型组大数据,将极大地促进作物功能基因组学、数字育种、智慧栽培的研究进程。本文分析了作物表型组大数据技术及装备的应用需求、产业发展形势,从物理、传输、数据、知识、应用5个层面详细梳理了相应研发现状;从作物表型组大数据高通量获取、作物表型组大数据智能解析技术两方面着手,剖析了我国相关技术、装备、产业应用方面的问题和态势。研究建议,从底层芯片层面突破作物表型传感器关键技术,在可控开源的基础上形成自主化的表型解析技术体系,加强作物表型组大数据技术及装备标准体系建设,提出基因–表型–环境多维大数据驱动的数字育种和智慧栽培创新模式,建设作物表型组大数据技术及装备人才队伍和协作网络。 展开更多
关键词 作物表型组 表型大数据 表型技术及装备
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