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感染CDV的犬病料N、H、F基因的克隆与序列分析
被引量：
4
1
作者
刘巧荣
包新奇
+6 位作者
孙明
王芳
乔明明
李佳
陈曦
秦亚嫚
陈西钊
《中国比较医学杂志》
2011年第4期37-41,共5页
目的了解病料中犬瘟热病毒(CDV)的变异情况,为犬瘟热的预防与治疗提供理论依据。方法采用RT-PCR方法对犬病料中CDV的血凝素蛋白(H)、融合蛋白(F)和核衣壳蛋白(N)基因进行扩增,将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体中测序,并进行序列分析。...
目的了解病料中犬瘟热病毒(CDV)的变异情况,为犬瘟热的预防与治疗提供理论依据。方法采用RT-PCR方法对犬病料中CDV的血凝素蛋白(H)、融合蛋白(F)和核衣壳蛋白(N)基因进行扩增,将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体中测序,并进行序列分析。结果测定一株CDV的H、F和N基因大小分别为1863 bp、1653 bp和2235 bp。同源性分析表明,未发现碱基的插入和缺失。该病毒的H、F和N基因分别与国内强毒株BJ080127株的H基因、GN株的F基因和HL株的N基因亲缘关系最近,氨基酸同源性分别为97.3%、97.7%和99.3%。与国外标准野毒株A75-17在核苷酸水平上同源性依次为94.4%、93.8%和97.2%,与疫苗株CDV3在核苷酸水平上同源性分别为88.5%、88.8%和93.9%。系统进化树表明该病毒与国内强毒株在同一谱系。糖基化分析显示,该病毒在F基因3～5位氨基酸处多出1个糖基化位点。结论本研究从犬病料中成功克隆了犬瘟热病毒血凝素蛋白、融合蛋白和核衣壳蛋白,在F基因中新增了一个糖基化位点,为犬瘟热的遗传变异和流行学研究提供了分子生物学依据。
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关键词
犬瘟热
血凝素蛋白基因
融合
蛋白
基因
核衣壳
蛋白
基因
序列分析S
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职称材料
狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析
被引量：
4
2
作者
闫如勋
赵建军
+8 位作者
柴秀丽
闫喜军
倪佳
张海玲
高晗
白雪
张蕾
陈立志
吴威
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2012年第1期23-26,共4页
为研究我国圈养狐、貉流行犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)的基因分型与遗传变异情况,通过RT-PCR方法扩增与测序分析了2009年来源于山东省和河北省病料中的CDV H与F基因,并分别与GenBank CDV野毒株和疫苗株的基因序列比对,构建...
为研究我国圈养狐、貉流行犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)的基因分型与遗传变异情况,通过RT-PCR方法扩增与测序分析了2009年来源于山东省和河北省病料中的CDV H与F基因,并分别与GenBank CDV野毒株和疫苗株的基因序列比对,构建了核苷酸序列的系统发生树。H基因系统发生分析显示,6株毒株归属为Asia-1型。H蛋白氨基酸序列比较表明,除HeB(09)3株有8个潜在N-连接的糖基化位点外,其余毒株N-连接的糖基化位点均为9个。以往的研究结果显示,日本和中国台湾分离株的潜在N-连接糖基化位点为8～9个。6株野毒F蛋白编码区氨基酸的同源性为98.0%～99.5%,与CDV3(登录号EU726268)和Onderstepoort(登录号AF305419)疫苗株的同源性为89.1%～90.6%,F蛋白的前导区(1～135位氨基酸)与疫苗株相比的同源性为62.2%～66.7%;野毒株F蛋白氨基酸在108～110处比疫苗株CDV3多1个潜在N-连接的糖基化位点,HeB(09)3的F蛋白还在366～369位多1个潜在的N-连接的糖基化位点。目前在山东省和河北省2地狐狸和貉中流行的犬瘟热野毒株为Asia-1型,HeB(09)3株H蛋白和F蛋白在N-连接糖基化方面与其他5株野毒株有明显的不同。
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关键词
狐狸
貉
犬瘟热病毒
血凝素蛋白基因
融合
蛋白
基因
遗传变异
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职称材料
题名
感染CDV的犬病料N、H、F基因的克隆与序列分析
被引量：
4
1
作者
刘巧荣
包新奇
孙明
王芳
乔明明
李佳
陈曦
秦亚嫚
陈西钊
机构
北京世纪元亨动物防疫技术有限公司
江苏省动物疫病预防控制中心
中国动物疫病预防控制中心
出处
《中国比较医学杂志》
2011年第4期37-41,共5页
文摘
目的了解病料中犬瘟热病毒(CDV)的变异情况,为犬瘟热的预防与治疗提供理论依据。方法采用RT-PCR方法对犬病料中CDV的血凝素蛋白(H)、融合蛋白(F)和核衣壳蛋白(N)基因进行扩增,将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体中测序,并进行序列分析。结果测定一株CDV的H、F和N基因大小分别为1863 bp、1653 bp和2235 bp。同源性分析表明,未发现碱基的插入和缺失。该病毒的H、F和N基因分别与国内强毒株BJ080127株的H基因、GN株的F基因和HL株的N基因亲缘关系最近,氨基酸同源性分别为97.3%、97.7%和99.3%。与国外标准野毒株A75-17在核苷酸水平上同源性依次为94.4%、93.8%和97.2%,与疫苗株CDV3在核苷酸水平上同源性分别为88.5%、88.8%和93.9%。系统进化树表明该病毒与国内强毒株在同一谱系。糖基化分析显示,该病毒在F基因3～5位氨基酸处多出1个糖基化位点。结论本研究从犬病料中成功克隆了犬瘟热病毒血凝素蛋白、融合蛋白和核衣壳蛋白,在F基因中新增了一个糖基化位点,为犬瘟热的遗传变异和流行学研究提供了分子生物学依据。
关键词
犬瘟热
血凝素蛋白基因
融合
蛋白
基因
核衣壳
蛋白
基因
序列分析S
Keywords
Canine distemper virus
Hemagglutinin protein gene
Fusion protein gene
Nucleocapsid protein gene
Sequence analysis
分类号
R33 [医药卫生—人体生理学]
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职称材料
题名
狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析
被引量：
4
2
作者
闫如勋
赵建军
柴秀丽
闫喜军
倪佳
张海玲
高晗
白雪
张蕾
陈立志
吴威
机构
中国农业科学院特产研究所
江苏科技大学生物与环境工程学院
吉林特研生物技术有限责任公司
出处
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2012年第1期23-26,共4页
基金
国家农业科技成果转化资金(编号:2009GB2B100084)
文摘
为研究我国圈养狐、貉流行犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)的基因分型与遗传变异情况,通过RT-PCR方法扩增与测序分析了2009年来源于山东省和河北省病料中的CDV H与F基因,并分别与GenBank CDV野毒株和疫苗株的基因序列比对,构建了核苷酸序列的系统发生树。H基因系统发生分析显示,6株毒株归属为Asia-1型。H蛋白氨基酸序列比较表明,除HeB(09)3株有8个潜在N-连接的糖基化位点外,其余毒株N-连接的糖基化位点均为9个。以往的研究结果显示,日本和中国台湾分离株的潜在N-连接糖基化位点为8～9个。6株野毒F蛋白编码区氨基酸的同源性为98.0%～99.5%,与CDV3(登录号EU726268)和Onderstepoort(登录号AF305419)疫苗株的同源性为89.1%～90.6%,F蛋白的前导区(1～135位氨基酸)与疫苗株相比的同源性为62.2%～66.7%;野毒株F蛋白氨基酸在108～110处比疫苗株CDV3多1个潜在N-连接的糖基化位点,HeB(09)3的F蛋白还在366～369位多1个潜在的N-连接的糖基化位点。目前在山东省和河北省2地狐狸和貉中流行的犬瘟热野毒株为Asia-1型,HeB(09)3株H蛋白和F蛋白在N-连接糖基化方面与其他5株野毒株有明显的不同。
关键词
狐狸
貉
犬瘟热病毒
血凝素蛋白基因
融合
蛋白
基因
遗传变异
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
感染CDV的犬病料N、H、F基因的克隆与序列分析
刘巧荣
包新奇
孙明
王芳
乔明明
李佳
陈曦
秦亚嫚
陈西钊
《中国比较医学杂志》
2011
4
在线阅读
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职称材料
2
狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析
闫如勋
赵建军
柴秀丽
闫喜军
倪佳
张海玲
高晗
白雪
张蕾
陈立志
吴威
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2012
4
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