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基于PubMLST数据库分析蜡样芽胞杆菌群的遗传学
1
作者
万经
赵炜
+2 位作者
崔颖
毛展
周帼萍
《中国酿造》
CAS
北大核心
2019年第5期164-168,共5页
以蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)PubMLST数据库为数据来源,通过Phyloviz、Mega和IQ-tree软件研究蜡样芽胞杆菌群的遗传学。结果表明,筛选后得到1 329株完整的蜡样芽胞杆菌群的菌株信息,其中蜡样芽胞杆菌(B. cereus)及变种864株、苏云...
以蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)PubMLST数据库为数据来源,通过Phyloviz、Mega和IQ-tree软件研究蜡样芽胞杆菌群的遗传学。结果表明,筛选后得到1 329株完整的蜡样芽胞杆菌群的菌株信息,其中蜡样芽胞杆菌(B. cereus)及变种864株、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)及变种345株、炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)61株、韦氏芽胞杆菌(Bacillus weihenstephanensis)、蕈状芽胞杆菌(Bacillus mycoides)、假蕈状芽胞杆菌(Bacillus pseudomycoides)分别为33、21和5株。群内占比很高的蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌具有丰富而复杂的遗传多样性,相互交织地散布于群内几乎所有的进化分支上,两者无法区分;炭疽芽胞杆菌在进化树上位于相对独立而保守的一个分支;韦氏芽胞杆菌与蕈状芽胞杆菌虽然在菌落形态上差异很大,但两者在系统进化树上位于同一个分支,同源性极高。
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关键词
蜡样芽胞杆菌群
PubMLST数据库
多位点序列分型
群
体遗传学分析
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题名
基于PubMLST数据库分析蜡样芽胞杆菌群的遗传学
1
作者
万经
赵炜
崔颖
毛展
周帼萍
机构
武汉轻工大学生物与制药工程学院
南通海关
出处
《中国酿造》
CAS
北大核心
2019年第5期164-168,共5页
基金
江苏出入境检验检疫局科技计划项目(2018KJ34)
文摘
以蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)PubMLST数据库为数据来源,通过Phyloviz、Mega和IQ-tree软件研究蜡样芽胞杆菌群的遗传学。结果表明,筛选后得到1 329株完整的蜡样芽胞杆菌群的菌株信息,其中蜡样芽胞杆菌(B. cereus)及变种864株、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)及变种345株、炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)61株、韦氏芽胞杆菌(Bacillus weihenstephanensis)、蕈状芽胞杆菌(Bacillus mycoides)、假蕈状芽胞杆菌(Bacillus pseudomycoides)分别为33、21和5株。群内占比很高的蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌具有丰富而复杂的遗传多样性,相互交织地散布于群内几乎所有的进化分支上,两者无法区分;炭疽芽胞杆菌在进化树上位于相对独立而保守的一个分支;韦氏芽胞杆菌与蕈状芽胞杆菌虽然在菌落形态上差异很大,但两者在系统进化树上位于同一个分支,同源性极高。
关键词
蜡样芽胞杆菌群
PubMLST数据库
多位点序列分型
群
体遗传学分析
Keywords
Bacillus cereus group
PubMLST database
multilocus sequence typing
group genetics analysis
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
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被引量
操作
1
基于PubMLST数据库分析蜡样芽胞杆菌群的遗传学
万经
赵炜
崔颖
毛展
周帼萍
《中国酿造》
CAS
北大核心
2019
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