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用于蛋白质间相互作用研究的新型双杂交系统被引量：1: 1; 作者薛沿宁《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期229-232,共4页; 近年来 ,一些不依赖于转录因子活性的新型双杂交系统相继建立 ,如分离的泛素系统、蛋白质片段互补分析、阻遏物重构分析和SOS恢复系统等。同利用转录因子活性的酵母双杂交系统相似 ,这些方法也利用了一些活性蛋白的结构与功能特点来研... 展开更多; 关键词双杂交蛋白质间相互作用融合蛋白; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于雷帕霉素与FRB结合的蛋白质间相互作用的相关技术: 2; 作者李芹芹史道华杨牛牛《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期44-47,共4页; FKBP12-rapamycin复合物的结合位点(FKBP12-rapamycin binding,FRB)为雷帕霉素(rapamycin,RAP)与哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)结合的结构域,基于RAP介导FK506结合蛋白12(12 kD FK506-bin-ging protein,F... 展开更多; 关键词 FRB域雷帕霉素蛋白质间相互作用技术; 在线阅读下载PDF 职称材料

蛋白质芯片技术研究进展被引量：1: 3; 作者于洋李敬双《畜牧兽医科技信息》 2010年第12期4-5,共2页; 蛋白质芯片亦被称为蛋白质微阵列。除了在蛋白质间相互作用,前导药物发现等基础研究领域得到重要的应用之外,蛋白芯片技术业已被应用到疾病过程的生物标志分子发现，传染性疾病的分子诊断等应用研究领域。蛋白质芯片所具有的高通量，微... 展开更多; 关键词蛋白质微阵列芯片技术分子诊断技术蛋白质间相互作用蛋白质芯片传染性疾病基础研究药物发现; 在线阅读下载PDF 职称材料

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌PBP2a相互作用蛋白的筛选被引量：6: 4; 作者原薇薇杨杰 +7 位作者王冬梅胡珍朱军民陈志瑾张俊磊王嘉丽刘佳饶贤才《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期749-753,共5页; 目的通过建立细菌双杂交技术,筛选MRSA中与PBP2a相互作用的蛋白。方法利用PCR扩增,获得PBP2a蛋白转肽酶活性区(TPase)的编码基因,插入pRBR构建成诱饵质粒pBR-PBP2a。提取MRSA N315株基因组DNA,经Sau3AⅠ部分酶切后连接到pRAC质粒的BamH... 展开更多; 关键词基因组DNA文库 PBP2a蛋白细菌双杂交系统蛋白质间相互作用; 在线阅读下载PDF 职称材料

新冠病毒入侵过程中spike与人体ACE2相互作用的受力分析被引量：1: 5; 作者李振海胡炜 +1 位作者费攀宇陈伟《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期83-83,共1页; 2019年爆发的新冠病毒引起的新冠肺炎蔓延至全球。至今已造成上亿人的感染,百万人死亡。新冠病毒严重影响了人类的健康,乃至日常出行、工作、生活等方方面面。新冠病毒借助其表面的突刺蛋白(spike)与人体细胞表面的血管紧张素转换酶2(an... 展开更多; 关键词 ACE2 血管紧张素转换酶2 病毒入侵蛋白质间相互作用外力影响人体细胞 ANGIOTENSIN; 在线阅读下载PDF 职称材料

加载历史对低刚度下P-选择素-PSGL-1键寿命的影响: 6; 作者章燕孙淦云 +2 位作者吕守芹李宁龙勉《医用生物力学》 EI CAS CSCD 2009年第S1期26-27,共2页; 关键词加载历史选择素低刚度寿命加载率配体分子蛋白质间相互作用受体调控因素炎症反应; 在线阅读下载PDF 职称材料

捻转血矛线虫酵母双杂交cDNA文库的构建及鉴定: 7; 作者张惠黄艳 +6 位作者周静茹吴飞童丹妮陈学秋杨怡马光旭杜爱芳《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期247-253,共7页; 为构建捻转血矛线虫cDNA文库,进一步研究捻转血矛线虫蛋白互作机制以及为筛选捻转血矛线虫互作蛋白提供依据,本研究以捻转血矛线虫L3期幼虫为材料,利用TriZol法提取捻转血矛线虫总RNA;使用试剂盒构建捻转血矛线虫的cDNA文库,并对cDNA进... 展开更多; 关键词捻转血矛线虫 CDNA文库酵母双杂交系统蛋白质间相互作用; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于深度学习的PPI关系抽取方法研究进展: 8; 作者唐詹王龙鹤 +3 位作者郭旭超周晗刁磊李林《计算机应用与软件》北大核心 2023年第5期1-9,共9页; 蛋白质间相互作用(protein-protein interaction,PPI)在几乎全部的生命活动中发挥着极其重要的作用,如何准确、高效地自动化抽取出科学文献中的PPI关系有着十分重要的研究意义。深度学习作为机器学习的一个重要分支,由于其强大的学习能... 展开更多; 关键词蛋白质间相互作用关系抽取深度学习自然语言处理; 在线阅读下载PDF 职称材料

面向多肽的分子对接算法性能对比研究被引量：1: 9; 作者罗浩刘宇吴思晋《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2017年第14期111-116,154,共7页; 蛋白质-多肽间相互作用是计算生物学中的热门方向,对其结合的精确预测对于了解体内复杂的信号通路以及蛋白质功能,及进一步进行药物设计有着至关重要的作用。蛋白质-多肽对接方法能够有效地模拟蛋白质-多肽间相互作用,其对接性能直接决... 展开更多; 关键词多肽对接蛋白质-多肽间相互作用结合位点预测对接优化; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名用于蛋白质间相互作用研究的新型双杂交系统被引量：1: 1; 作者薛沿宁; 机构军事医学科学院基础医学研究所; 出处《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期229-232,共4页; 基金国家自然科学基金 (3990 0 182 )资助课题; 文摘近年来 ,一些不依赖于转录因子活性的新型双杂交系统相继建立 ,如分离的泛素系统、蛋白质片段互补分析、阻遏物重构分析和SOS恢复系统等。同利用转录因子活性的酵母双杂交系统相似 ,这些方法也利用了一些活性蛋白的结构与功能特点来研究蛋白质间相互作用 ,这些活性蛋白不是转录因子 ,但也可在结构上进行分离并可通过重构使其生物活性得以恢复。由于这些新型双杂交系统的各自特点 ,使得它们成为酵母双杂交系统的有益补充和研究蛋白质间相互作用的有力工具。; 关键词双杂交蛋白质间相互作用融合蛋白; Keywords Two-hybrid Protein-protein interaction Fusion protein; 分类号 Q51 [生物学—生物化学] Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于雷帕霉素与FRB结合的蛋白质间相互作用的相关技术: 2; 作者李芹芹史道华杨牛牛; 机构福建中医药大学药学院南京军区福州总医院药学科; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期44-47,共4页; 基金福建省自然基金资助项目(2008J0103); 文摘 FKBP12-rapamycin复合物的结合位点(FKBP12-rapamycin binding,FRB)为雷帕霉素(rapamycin,RAP)与哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)结合的结构域,基于RAP介导FK506结合蛋白12(12 kD FK506-bin-ging protein,FKBP12)与FRB蛋白质相互作用相关研究技术的发展与应用,使人们对小分子介导的蛋白质相互作用有了更多的认识。就研究RAP作用于FRB域及研究FKBP12-RAP-FRB三元复合物形成的相关技术作一综述,为确认新的mTOR抑制剂的作用机制及认识其他蛋白质间相互作用提供参考。; 关键词 FRB域雷帕霉素蛋白质间相互作用技术; Keywords FRB domain Rapamycin Protein-protein interactions Technology; 分类号 R96 [医药卫生—药理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蛋白质芯片技术研究进展被引量：1: 3; 作者于洋李敬双; 机构辽宁医学院畜牧兽医学院; 出处《畜牧兽医科技信息》 2010年第12期4-5,共2页; 文摘蛋白质芯片亦被称为蛋白质微阵列。除了在蛋白质间相互作用,前导药物发现等基础研究领域得到重要的应用之外,蛋白芯片技术业已被应用到疾病过程的生物标志分子发现，传染性疾病的分子诊断等应用研究领域。蛋白质芯片所具有的高通量，微型化，高自动化特征弥补和扩增了常规的分子诊断技术。; 关键词蛋白质微阵列芯片技术分子诊断技术蛋白质间相互作用蛋白质芯片传染性疾病基础研究药物发现; 分类号 Q819 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名耐甲氧西林金黄色葡萄球菌PBP2a相互作用蛋白的筛选被引量：6: 4; 作者原薇薇杨杰王冬梅胡珍朱军民陈志瑾张俊磊王嘉丽刘佳饶贤才; 机构第三军医大学基础医学部微生物学教研室; 出处《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期749-753,共5页; 基金国家自然科学基金(30571666 30772061)~~; 文摘目的通过建立细菌双杂交技术,筛选MRSA中与PBP2a相互作用的蛋白。方法利用PCR扩增,获得PBP2a蛋白转肽酶活性区(TPase)的编码基因,插入pRBR构建成诱饵质粒pBR-PBP2a。提取MRSA N315株基因组DNA,经Sau3AⅠ部分酶切后连接到pRAC质粒的BamHⅠ位点,获得基因组DNA表达文库;将文库质粒转化入含诱饵质粒pBR-PBP2a的报告菌株KS1,利用细菌双杂交技术进行筛选,获得与诱饵质粒编码的融合蛋白相互作用的猎物,对猎物中编码序列进行DNA测序和生物信息学分析,确定与PBP2a发生相互作用的蛋白质或多肽。结果成功构建了pBR-PBP2a诱饵质粒,可表达PBP2a TPase与大肠埃希菌RNA聚合酶α亚单位N端序列的融合蛋白。所构建的MRSA N315株基因组文库覆盖率达9倍,满足文库筛选的需要。将文库转化含诱饵质粒和报告基因的KS1宿主菌,利用细菌双杂交技术经3次筛选,共获得9个猎物克隆,其报告基因的活性均升高2倍以上,对9个猎物质粒进行了测序,信息学分析表明它们均来自于MRSA N315株基因组,插入片段最长者648 bp,最短者334 bp,9个插入片段中含14个编码基因,其中10个功能未知,1个编码二氢吡啶二羧酸合酶、1个编码二氢吡啶二羧酸还原酶,2个编码染色体解离稳定(SMC)蛋白。9个克隆中介导与PBP2a相互作用的多肽由14～46个氨基酸组成。结论利用细菌双杂交技术从MRSA基因组文库中成功筛选到与PBP2a相互作用的多肽。; 关键词基因组DNA文库 PBP2a蛋白细菌双杂交系统蛋白质间相互作用; Keywords genomic DNA library PBP2a protein bacterial two-hybrid system protein-protein interaction; 分类号 R378.11 [医药卫生—病原生物学] R394.33 [医药卫生—医学遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名新冠病毒入侵过程中spike与人体ACE2相互作用的受力分析被引量：1: 5; 作者李振海胡炜费攀宇陈伟; 机构上海大学力学与工程科学学院浙江大学医学院; 出处《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期83-83,共1页; 基金上海市东方学者特聘教授计划,TP2018040; 文摘 2019年爆发的新冠病毒引起的新冠肺炎蔓延至全球。至今已造成上亿人的感染,百万人死亡。新冠病毒严重影响了人类的健康,乃至日常出行、工作、生活等方方面面。新冠病毒借助其表面的突刺蛋白(spike)与人体细胞表面的血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)相互作用进入人体细胞,从而实现对人的感染。前人的研究已表明各种蛋白质间相互作用往往都受到外力影响。本文相信,spike/ACE2间相互作用亦会受到外力调控。; 关键词 ACE2 血管紧张素转换酶2 病毒入侵蛋白质间相互作用外力影响人体细胞 ANGIOTENSIN; 分类号 R563.1 [医药卫生—呼吸系统] R318.01 [医药卫生—生物医学工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名加载历史对低刚度下P-选择素-PSGL-1键寿命的影响: 6; 作者章燕孙淦云吕守芹李宁龙勉; 机构中国科学院微重力重点实验室中国科学院力学研究所生物力学与生物工程中心; 出处《医用生物力学》 EI CAS CSCD 2009年第S1期26-27,共2页; 基金国家自然科学基金项目(30730032) 科技部"蛋白质科学"国家重大研究计划(2006CB910303) +1 种基金科技部863项目(2007AA02Z306) 中国科学院知识创新工程项目(KJCX2-YW-L08); 关键词加载历史选择素低刚度寿命加载率配体分子蛋白质间相互作用受体调控因素炎症反应; 分类号 R318 [医药卫生—生物医学工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名捻转血矛线虫酵母双杂交cDNA文库的构建及鉴定: 7; 作者张惠黄艳周静茹吴飞童丹妮陈学秋杨怡马光旭杜爱芳; 机构浙江大学动物科学学院动物预防医学研究所; 出处《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期247-253,共7页; 基金国家自然科学基金(32002304) 国家重点研发计划(2017YFD0501203) 浙江省基础公益研究计划(LGN20C180005)。; 文摘为构建捻转血矛线虫cDNA文库,进一步研究捻转血矛线虫蛋白互作机制以及为筛选捻转血矛线虫互作蛋白提供依据,本研究以捻转血矛线虫L3期幼虫为材料,利用TriZol法提取捻转血矛线虫总RNA;使用试剂盒构建捻转血矛线虫的cDNA文库,并对cDNA进行均一化处理,再将纯化后的cDNA与线性化的pGADT7-Rec重组构建的文库质粒转化至Y187酵母中,构建出酵母转录激活结构域(activationdomain,AD)文库。结果表明:本研究构建了重组率为100%,插入片段平均长度为1000 bp,工作液细胞密度大于3.5×10^(7)CFU/mL的捻转血矛线虫均一化酵母AD文库;所构建的表达文库各项指标均达标,符合酵母双杂交筛选要求。本文库为捻转血矛线虫的分子机制研究以及疫苗的开发奠定了基础。; 关键词捻转血矛线虫 CDNA文库酵母双杂交系统蛋白质间相互作用; Keywords Haemonchus contortus cDNA library yeast two-hybrid system protein-protein interaction; 分类号 S855.9 [农业科学—临床兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于深度学习的PPI关系抽取方法研究进展: 8; 作者唐詹王龙鹤郭旭超周晗刁磊李林; 机构中国农业大学信息与电气工程学院; 出处《计算机应用与软件》北大核心 2023年第5期1-9,共9页; 基金国家重点研发计划项目(2016YFD0300710)。; 文摘蛋白质间相互作用(protein-protein interaction,PPI)在几乎全部的生命活动中发挥着极其重要的作用,如何准确、高效地自动化抽取出科学文献中的PPI关系有着十分重要的研究意义。深度学习作为机器学习的一个重要分支,由于其强大的学习能力和特征提取能力,在PPI关系抽取领域得到了广大研究者的关注。对现有基于深度学习的PPI关系抽取方法进行阐述,对这些方法的实验数据及其构成组件进行对比分析,总结这些方法存在的问题,展望可以改进的研究方向。; 关键词蛋白质间相互作用关系抽取深度学习自然语言处理; Keywords Protein-protein interaction Relationship extraction Deep learning Natural language processing; 分类号 TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名面向多肽的分子对接算法性能对比研究被引量：1: 9; 作者罗浩刘宇吴思晋; 机构大连理工大学软件学院大连理工大学IT服务工程与管理研究所大连理工大学生命科学与技术学院; 出处《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2017年第14期111-116,154,共7页; 基金国家自然科学基金委员会与中国民用航空局联合资助项目(No.U1233110) 中央高校基本科研业务费(No.DUT13JR01); 文摘蛋白质-多肽间相互作用是计算生物学中的热门方向,对其结合的精确预测对于了解体内复杂的信号通路以及蛋白质功能,及进一步进行药物设计有着至关重要的作用。蛋白质-多肽对接方法能够有效地模拟蛋白质-多肽间相互作用,其对接性能直接决定模拟实验的准确性和成功与否。针对当前主要的蛋白质-多肽对接方法,综合测试了其算法性能;同时将本实验室开发的基于全信息粒子群算法的分子对接工具FIPSDock(Fully-Informed-ParticleSwarm-Dock)延伸到蛋白质-多肽对接领域,并评估其性能。利用标准蛋白质-多肽对接数据集(pepti DB)的21个测试例及13个定制测试例进行性能测试,主要对比分析了各算法的成功率和对接精度。结果表明FIPSDock可用于蛋白质-多肽对接,并相对于其他对接算法展示出优异的性能。; 关键词多肽对接蛋白质-多肽间相互作用结合位点预测对接优化; Keywords peptide docking protein-peptide interaction binding site prediction docking minimization; 分类号 TP391.9 [自动化与计算机技术—计算机应用技术] TQ015.9 [化学工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	用于蛋白质间相互作用研究的新型双杂交系统	薛沿宁	《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心	2001	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于雷帕霉素与FRB结合的蛋白质间相互作用的相关技术	李芹芹史道华杨牛牛	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2011	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	蛋白质芯片技术研究进展	于洋李敬双	《畜牧兽医科技信息》	2010	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	耐甲氧西林金黄色葡萄球菌PBP2a相互作用蛋白的筛选	原薇薇杨杰王冬梅胡珍朱军民陈志瑾张俊磊王嘉丽刘佳饶贤才	《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2010	6	在线阅读下载PDF 职称材料
5	新冠病毒入侵过程中spike与人体ACE2相互作用的受力分析	李振海胡炜费攀宇陈伟	《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料
6	加载历史对低刚度下P-选择素-PSGL-1键寿命的影响	章燕孙淦云吕守芹李宁龙勉	《医用生物力学》 EI CAS CSCD	2009	0	在线阅读下载PDF 职称材料
7	捻转血矛线虫酵母双杂交cDNA文库的构建及鉴定	张惠黄艳周静茹吴飞童丹妮陈学秋杨怡马光旭杜爱芳	《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料
8	基于深度学习的PPI关系抽取方法研究进展	唐詹王龙鹤郭旭超周晗刁磊李林	《计算机应用与软件》北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料
9	面向多肽的分子对接算法性能对比研究	罗浩刘宇吴思晋	《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心	2017	1	在线阅读下载PDF 职称材料