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蛋白质棕榈酰化对离子型谷氨酸受体运输的调节作用
被引量：
3
1
作者
冯晨
冯磊
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期683-689,共7页
棕榈酰化是一种可逆的翻译后修饰,其对蛋白质的定位和功能具有重要的调节意义.离子型谷氨酸受体有N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体、α-氨基羟甲基恶唑丙酸(AMPA)受体和人海藻酸受体.近期研究发现,它们的棕榈酰化修饰对其膜表面分布和内化...
棕榈酰化是一种可逆的翻译后修饰,其对蛋白质的定位和功能具有重要的调节意义.离子型谷氨酸受体有N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体、α-氨基羟甲基恶唑丙酸(AMPA)受体和人海藻酸受体.近期研究发现,它们的棕榈酰化修饰对其膜表面分布和内化均具有重要的意义.其中NMDA受体在其C末端有2个不同的棕榈酰化位点.1个位于C末端近膜区(CysclusterⅠ),它的棕榈酰化可以增高酪氨酸的磷酸化水平,增加受体膜表面分布,影响神经元中NMDA受体的组构性内化;另1个位于C末端中部(CysclusterⅡ),它受到蛋白质酰基转移酶GODZ的调节,使得受体在高尔基体大量积聚,从而影响受体的膜表面分布.与NMDA受体相似,AMPA受体也存在2个棕榈酰化位点.1个位于在第2跨膜域,受蛋白质酰基转移酶GODZ的调节,能导致AMPA受体在高尔基体的积聚.另1个位点在受体C末端近膜区,它的棕榈酰化能降低AMPA受体和4.1N蛋白的相互作用,并调节受体的内化.这两种离子型谷氨酸受体在棕榈酰化机制上虽然存在差异,但均对受体的运输、膜表面分布和内化具有十分重要的作用.
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关键词
棕榈酰化
N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体
α-氨基羟甲基恶唑丙酸(AMPA)受体
蛋白质酰基转移酶
表面分布
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职称材料
鹅掌楸DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆及表达分析
被引量：
3
2
作者
徐嘉娟
李火根
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1052-1060,共9页
棕榈酰化修饰是一种最普遍且唯一可逆的翻译后脂质修饰方式,赋予蛋白质多样化的生理功能。DHHC(Asp-His-His-Cys)蛋白家族是一类与棕榈酰化修饰相关的蛋白,多数DHHC蛋白家族成员具有蛋白质酰基转移酶(protein S-acyltransferase,PAT)活...
棕榈酰化修饰是一种最普遍且唯一可逆的翻译后脂质修饰方式,赋予蛋白质多样化的生理功能。DHHC(Asp-His-His-Cys)蛋白家族是一类与棕榈酰化修饰相关的蛋白,多数DHHC蛋白家族成员具有蛋白质酰基转移酶(protein S-acyltransferase,PAT)活性。该研究以鹅掌楸叶芽为材料,采用RT-PCR和RACE技术,克隆获得了3个鹅掌楸DHHC蛋白家族基因c DNA全长,命名为Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23。序列分析结果表明:Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23基因全长分别为1 933、2 592、2 217 bp,各包含1 332、1 839、1 662 bp的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),编码433、612、533个氨基酸,预测蛋白分子量分别为40.04、67.3、60.57 k Da,理论等电点为9.15、9.03、7.29。3个基因编码的蛋白均有4个跨膜区,并且都在跨膜域(transmembrane domain,TM)TM2和TM3之间存在一个DHHC蛋白家族典型的DHHC-CRD结构域。同源性分析表明:鹅掌楸Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23编码的氨基酸序列与其他植物中预测的PAT具有较高的相似性。利用荧光定量PCR技术检测3个基因在鹅掌楸不同组织中的表达特性,发现3个基因在不同组织中均有表达,但表达量具有明显区别。同一家族基因表达模式的变化表明其功能非冗余。该研究结果将为鹅掌楸生长发育与形态建成,以及逆境响应信号传导等相关基因的调控研究提供了参考。
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关键词
鹅掌楸
棕榈酰化修饰
蛋白质酰基转移酶
DHHC
蛋白
家族
表达分析
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职称材料
基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析
被引量：
2
3
作者
徐嘉娟
朱亚艳
+2 位作者
李芳
许杰
王港
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2022年第1期81-88,共8页
DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用。基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域...
DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用。基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域、系统进化等进行了分析。结果表明,23个DHHC型锌指蛋白的序列大小为195~725 aa,均包含一个保守的DHHC-CRD结构域,大部分DHHC型锌指蛋白具有4个跨膜区,主要定位于细胞核和细胞膜中。系统进化分析将其分为4类,与拟南芥和水稻均有不同程度的同源关系,DHHC型锌指蛋白在不同物种间具有遗传保守性。23个DHHC型锌指蛋白基因在结实量大和结实量小的单株的不同发育时期叶片中均有不同程度的表达。CoDHHC9、CoDHHC13、CoDHHC22在油茶抽梢生长期的叶片中表达上调;CoDHHC6、CoDHHC12、CoDHHC18、CoDHHC23在花芽分化时期和果实成熟时期的叶片中表达量较高,且在结实量较小而开花较多的单株中表达上调更为明显,这些基因可能参与油茶花芽分化及花朵发育过程;CoDHHC5、CoDHHC11、CoDHHC15在不同时期的叶片中表达量均较低。研究结果为进一步对油茶DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆和功能分析提供依据,有助于进一步研究该基因家族在油茶生殖发育中的调控功能。
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关键词
油茶
DHHC型锌指
蛋白
家族
蛋白质酰基转移酶
生物信息学分析
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职称材料
题名
蛋白质棕榈酰化对离子型谷氨酸受体运输的调节作用
被引量：
3
1
作者
冯晨
冯磊
机构
浙江大学医学院
浙江农林大学健康管理系
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期683-689,共7页
文摘
棕榈酰化是一种可逆的翻译后修饰,其对蛋白质的定位和功能具有重要的调节意义.离子型谷氨酸受体有N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体、α-氨基羟甲基恶唑丙酸(AMPA)受体和人海藻酸受体.近期研究发现,它们的棕榈酰化修饰对其膜表面分布和内化均具有重要的意义.其中NMDA受体在其C末端有2个不同的棕榈酰化位点.1个位于C末端近膜区(CysclusterⅠ),它的棕榈酰化可以增高酪氨酸的磷酸化水平,增加受体膜表面分布,影响神经元中NMDA受体的组构性内化;另1个位于C末端中部(CysclusterⅡ),它受到蛋白质酰基转移酶GODZ的调节,使得受体在高尔基体大量积聚,从而影响受体的膜表面分布.与NMDA受体相似,AMPA受体也存在2个棕榈酰化位点.1个位于在第2跨膜域,受蛋白质酰基转移酶GODZ的调节,能导致AMPA受体在高尔基体的积聚.另1个位点在受体C末端近膜区,它的棕榈酰化能降低AMPA受体和4.1N蛋白的相互作用,并调节受体的内化.这两种离子型谷氨酸受体在棕榈酰化机制上虽然存在差异,但均对受体的运输、膜表面分布和内化具有十分重要的作用.
关键词
棕榈酰化
N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体
α-氨基羟甲基恶唑丙酸(AMPA)受体
蛋白质酰基转移酶
表面分布
Keywords
palmitoylation
N-methyl-D-aspartate （NMDA） receptors
α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4- isoxazole-propionic acid （AMPA） receptors
protein acyl transferases （PATs）
surface expression
分类号
R338.13 [医药卫生—人体生理学]
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职称材料
题名
鹅掌楸DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆及表达分析
被引量：
3
2
作者
徐嘉娟
李火根
机构
南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1052-1060,共9页
基金
国家自然科学基金(31470660
31170621)
江苏省高校优势学科~~
文摘
棕榈酰化修饰是一种最普遍且唯一可逆的翻译后脂质修饰方式,赋予蛋白质多样化的生理功能。DHHC(Asp-His-His-Cys)蛋白家族是一类与棕榈酰化修饰相关的蛋白,多数DHHC蛋白家族成员具有蛋白质酰基转移酶(protein S-acyltransferase,PAT)活性。该研究以鹅掌楸叶芽为材料,采用RT-PCR和RACE技术,克隆获得了3个鹅掌楸DHHC蛋白家族基因c DNA全长,命名为Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23。序列分析结果表明:Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23基因全长分别为1 933、2 592、2 217 bp,各包含1 332、1 839、1 662 bp的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),编码433、612、533个氨基酸,预测蛋白分子量分别为40.04、67.3、60.57 k Da,理论等电点为9.15、9.03、7.29。3个基因编码的蛋白均有4个跨膜区,并且都在跨膜域(transmembrane domain,TM)TM2和TM3之间存在一个DHHC蛋白家族典型的DHHC-CRD结构域。同源性分析表明:鹅掌楸Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23编码的氨基酸序列与其他植物中预测的PAT具有较高的相似性。利用荧光定量PCR技术检测3个基因在鹅掌楸不同组织中的表达特性,发现3个基因在不同组织中均有表达,但表达量具有明显区别。同一家族基因表达模式的变化表明其功能非冗余。该研究结果将为鹅掌楸生长发育与形态建成,以及逆境响应信号传导等相关基因的调控研究提供了参考。
关键词
鹅掌楸
棕榈酰化修饰
蛋白质酰基转移酶
DHHC
蛋白
家族
表达分析
Keywords
Liriodendron chinense, protein S-acylation, protein S-acyltransferase （ PAT） , DHHC protein family, ex-pression analysis
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析
被引量：
2
3
作者
徐嘉娟
朱亚艳
李芳
许杰
王港
机构
贵州省林业科学研究院
出处
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2022年第1期81-88,共8页
基金
贵州省科技计划项目(黔科合服企[2018]4003)
油茶果皮厚度控制分子机理研究(黔科合平台人才[2019]5643)
特色林业产业项目(特林研2020-15)。
文摘
DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用。基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域、系统进化等进行了分析。结果表明,23个DHHC型锌指蛋白的序列大小为195~725 aa,均包含一个保守的DHHC-CRD结构域,大部分DHHC型锌指蛋白具有4个跨膜区,主要定位于细胞核和细胞膜中。系统进化分析将其分为4类,与拟南芥和水稻均有不同程度的同源关系,DHHC型锌指蛋白在不同物种间具有遗传保守性。23个DHHC型锌指蛋白基因在结实量大和结实量小的单株的不同发育时期叶片中均有不同程度的表达。CoDHHC9、CoDHHC13、CoDHHC22在油茶抽梢生长期的叶片中表达上调;CoDHHC6、CoDHHC12、CoDHHC18、CoDHHC23在花芽分化时期和果实成熟时期的叶片中表达量较高,且在结实量较小而开花较多的单株中表达上调更为明显,这些基因可能参与油茶花芽分化及花朵发育过程;CoDHHC5、CoDHHC11、CoDHHC15在不同时期的叶片中表达量均较低。研究结果为进一步对油茶DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆和功能分析提供依据,有助于进一步研究该基因家族在油茶生殖发育中的调控功能。
关键词
油茶
DHHC型锌指
蛋白
家族
蛋白质酰基转移酶
生物信息学分析
Keywords
Camellia oleifera
DHHC-type zinc finger protein family
protein S-acyltransferases(PAT)
bioinformation analysis
分类号
S794.4 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质棕榈酰化对离子型谷氨酸受体运输的调节作用
冯晨
冯磊
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
鹅掌楸DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆及表达分析
徐嘉娟
李火根
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析
徐嘉娟
朱亚艳
李芳
许杰
王港
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2022
2
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