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一种基于空间密度特征的蛋白质结构相似性判定方法被引量：6: 1; 作者胡敏彭群生《工程图学学报》 CSCD 北大核心 2005年第1期90-95,共6页; 基于蛋白质分子基本组成元素的空间区域密度特征,进行两种蛋白质结构的一致性比较。对 PDB 蛋白质数据验证的结果表明,作者所使用的方法可以作为任意结构的蛋白质相似性比较的有效辅助手段。对不具备序列相似性的蛋白质或难以直接抽取... 展开更多; 关键词计算机应用蛋白质结构分析分布密度特征相似形判定; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于球极坐标划分的蛋白质结构相似性比较被引量：1: 2; 作者邹北骥张琦梁鹿鸣《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2009年第5期606-611,共6页; 为了指导新药探索,减少耗费过高的实验次数,需要有一个准确、快速的分子相似性判定方法来选择待比较的分子.为此提出一种蛋白质结构相似性比较方法,使用空间球极坐标3个分量划分蛋白质所在区域,得到蛋白质基本组成元素的空间密度特征,... 展开更多; 关键词蛋白质分子结构分析相似性比较球极坐标; 在线阅读下载PDF 职称材料

利用立体阵列同位素标记法进行大型蛋白质的结构分析: 3; 作者增田智子《生物技术产业》 2007年第01X期7-7,共1页; 日本东京首部大学的甲斐庄正恒名誉教授，理化学研究所的PeterGunter研究员等人的团队开发了使用核磁共振（NMR）法进行大分子量蛋白质结构分析的技术。; 关键词蛋白质结构分析标记法同位素阵列立体化学研究所日本东京大分子量; 原文传递

咖啡豆α-半乳糖苷酶的同源建模及分析被引量：1: 4; 作者陶佳妮李赟 +3 位作者姚娣沈汪洋陈轩周坚《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期326-330,共5页; 为进一步了解咖啡豆α-半乳糖苷酶的结构,对咖啡豆α-半乳糖苷酶的理化性质、二级结构及三级结构等进行了理论分析和预测,并在三级结构的基础上进行同源建模研究。分析表明,该酶呈酸性,亲水,稳定。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,... 展开更多; 关键词咖啡豆α-半乳糖苷酶蛋白质结构分析同源建模; 在线阅读下载PDF 职称材料

大豆GmST1基因的生物信息学分析: 5; 作者井妍孙晶 +4 位作者高赛男赵雪滕卫丽韩英鹏李文滨《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期394-401,共8页; 磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族。对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基... 展开更多; 关键词大豆 GmST1 磺基转移酶蛋白质结构分析功能预测; 在线阅读下载PDF 职称材料

生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续): 6; 作者沈世镒余涛 +1 位作者开波阮吉寿《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第6期862-870,共9页; 本文继续讨论蛋白质一级结构序列的语义结构,利用组合分析与图论方法讨论 Swiss - Prot 数据库的组合结构,给出 Swiss - Prot 数据库中蛋白质一级结构序列的关键词与核心词的定义、搜索算法与特性参数。并由此给出蛋白质一级结... 展开更多; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质一级序列结构数据库的组合图论分析非线性复杂与核心词词典; 在线阅读下载PDF 职称材料

生物序列的语义分析与第二密码规则的探索: 7; 作者沈世镒《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第5期665-674,679,共11页; 生物序列(如DNA、RNA与蛋白质一级结构序列等)都是由一系列小分子团(如核苷酸、氨基酸等)排列组成,如把这些小分子团作为符号单元,那么这些生物序列就是生物序列就是生物学的语言文字,对这些语言文字的结构分析为生物序列的语义分析。... 展开更多; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质~级序列结构数据库的信息、统计分析稳定性度量与原理; 在线阅读下载PDF 职称材料

实用生物信息技术课程教学实例被引量：4: 8; 作者罗静初《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期102-111,共10页; 介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,... 展开更多; 关键词生物信息技术血红蛋白序列比对数据库检索 Blast数据库搜索系统发生树构建蛋白质结构比较分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

X射线晶体学技术迎来里程碑式的革新: 9; 《中国医学计算机成像杂志》 CSCD 北大核心 2013年第6期544-544,共1页; 蛋白质的结构直接决定着它们的功能，蛋白质结构分析能够为人们提供重要信息，帮助人们开发高度靶向性的治疗药物。迄今为止，人们所了解的蛋白质结构，大多离不开X射线晶体学技术。一个世纪以来，许多诺贝尔奖成果都得益于这一技术。; 关键词 X射线晶体学蛋白质结构分析治疗药物诺贝尔奖靶向性; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一种基于空间密度特征的蛋白质结构相似性判定方法被引量：6: 1; 作者胡敏彭群生; 机构浙江大学CAD&CG国家重点实验室; 出处《工程图学学报》 CSCD 北大核心 2005年第1期90-95,共6页; 基金国家自然科学基金创新研究群体科学基金资助项目(60021201); 文摘基于蛋白质分子基本组成元素的空间区域密度特征,进行两种蛋白质结构的一致性比较。对 PDB 蛋白质数据验证的结果表明,作者所使用的方法可以作为任意结构的蛋白质相似性比较的有效辅助手段。对不具备序列相似性的蛋白质或难以直接抽取几何规则的蛋白质分子之间的相似性比较具有现实意义。; 关键词计算机应用蛋白质结构分析分布密度特征相似形判定; Keywords computer application the analysis of protein structure spatial density distribution similarity; 分类号 TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于球极坐标划分的蛋白质结构相似性比较被引量：1: 2; 作者邹北骥张琦梁鹿鸣; 机构中南大学信息科学与工程学院; 出处《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2009年第5期606-611,共6页; 基金国家自然科学基金(60673093) 国家自然科学基金重点项目90715043); 文摘为了指导新药探索,减少耗费过高的实验次数,需要有一个准确、快速的分子相似性判定方法来选择待比较的分子.为此提出一种蛋白质结构相似性比较方法,使用空间球极坐标3个分量划分蛋白质所在区域,得到蛋白质基本组成元素的空间密度特征,进而判定2个蛋白质结构的相似性.实验结果表明,该方法可作为各种结构蛋白质相似性比较的辅助手段,不仅能较好地反映蛋白质分子的空间结构特征,而且还有令人满意的时间复杂性,对大分子的相似性比较及进一步分类将有重要意义.; 关键词蛋白质分子结构分析相似性比较球极坐标; Keywords structural analysis of protein molecule similarity computation spherical polar coordinates; 分类号 TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用立体阵列同位素标记法进行大型蛋白质的结构分析: 3; 作者增田智子; 出处《生物技术产业》 2007年第01X期7-7,共1页; 文摘日本东京首部大学的甲斐庄正恒名誉教授，理化学研究所的PeterGunter研究员等人的团队开发了使用核磁共振（NMR）法进行大分子量蛋白质结构分析的技术。; 关键词蛋白质结构分析标记法同位素阵列立体化学研究所日本东京大分子量; 分类号 Q51 [生物学—生物化学]; 原文传递

题名咖啡豆α-半乳糖苷酶的同源建模及分析被引量：1: 4; 作者陶佳妮李赟姚娣沈汪洋陈轩周坚; 机构武汉轻工大学食品科学与工程学院农产品加工湖北省协同创新中心; 出处《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期326-330,共5页; 基金国家自然科学基金青年科学基金项目(31301415); 文摘为进一步了解咖啡豆α-半乳糖苷酶的结构,对咖啡豆α-半乳糖苷酶的理化性质、二级结构及三级结构等进行了理论分析和预测,并在三级结构的基础上进行同源建模研究。分析表明,该酶呈酸性,亲水,稳定。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,其空间结构与大米α-半乳糖苷酶相似度较高,以此为模版构建了可靠的三维结构模型。模型的一侧是由8个α-螺旋和8个β-转角形成的球状结构,另一侧是8个β-转角。实验结果为咖啡豆α-半乳糖苷酶的空间结构和催化活性位点的研究提供了理论依据。; 关键词咖啡豆α-半乳糖苷酶蛋白质结构分析同源建模; Keywords coffee-bean α-galactosidase protein structure analysis homology modeling; 分类号 TS201.7 [轻工技术与工程—食品科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名大豆GmST1基因的生物信息学分析: 5; 作者井妍孙晶高赛男赵雪滕卫丽韩英鹏李文滨; 机构东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室/东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室; 出处《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期394-401,共8页; 基金国家现代农业产业技术体系(CARS-04-PS04) 国家自然科学基金(31301339) +1 种基金黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划(1253-NCET-005); 文摘磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族。对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基酸。通过序列比对,分析出在感病Williams 82和抗病品种东农93-046中,GmST1序列存在着非同义SNP,导致氨基酸改变。利用Plant CARE分析启动子元件,发现在基因启动子序列中含有多个与光诱导、生长素、水杨酸、干旱等相关的元件。在BAR数据库中分析了GmST1的拟南芥同源基因在不同逆境胁迫条件下基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、干旱胁迫和抗病等相关反应。; 关键词大豆 GmST1 磺基转移酶蛋白质结构分析功能预测; Keywords Soybean GmST1 SULT Protein structure analysis Functional prediction; 分类号 S565.1 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续): 6; 作者沈世镒余涛开波阮吉寿; 机构南开大学数学科学学院与LPMC; 出处《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第6期862-870,共9页; 基金天津市南开大学数学科学学院与 LPMC 本文获天津大学 +2 种基金南开大学联合研究项目 90208022)资助.; 文摘本文继续讨论蛋白质一级结构序列的语义结构,利用组合分析与图论方法讨论 Swiss - Prot 数据库的组合结构,给出 Swiss - Prot 数据库中蛋白质一级结构序列的关键词与核心词的定义、搜索算法与特性参数。并由此给出蛋白质一级结构序列的核心词词典,并由此讨论数据库的复杂性问题、同源蛋白质的分类、预测与比对等问题。; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质一级序列结构数据库的组合图论分析非线性复杂与核心词词典; Keywords semantics analysis of biological sequences second cipher rules combinatorial analysis of primary structure database of proteins nolinear complexity and dictionary of kernel word; 分类号 O157.1 [理学—基础数学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名生物序列的语义分析与第二密码规则的探索: 7; 作者沈世镒; 机构南开大学数学科学学院与LPMC; 出处《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2004年第5期665-674,679,共11页; 基金国家自然科学基金(10271061 90208022) +2 种基金天津大学南开大学联合研究项目刘徽应用数学研究中心资助.; 文摘生物序列(如DNA、RNA与蛋白质一级结构序列等)都是由一系列小分子团(如核苷酸、氨基酸等)排列组成,如把这些小分子团作为符号单元,那么这些生物序列就是生物序列就是生物学的语言文字,对这些语言文字的结构分析为生物序列的语义分析。生物序列语义分析的内容包括词法与语法的分析,它们是在分子水平基础上的生物语言分析,有关的变化规则我们称之为生物序列中的第二密码规则。本文以Swiss-Prot数据库为基础,利用频率统计、组合分析与信息的度量关系等数学工具,分析蛋白质一级结构序列中的词法规则,给出了关于蛋白质一级结构序列的几种稳定性的度量指标及其相应的稳定性理论,并探讨了它们在蛋白质演变与蛋白质工程中可能产生的应用。; 关键词生物序列结构的语义分析第二密码规则蛋白质~级序列结构数据库的信息、统计分析稳定性度量与原理; Keywords semantics analysis of biological sequences second cipher rules information and statistics analysis of primary structure database of proteins stability measurement and principle; 分类号 O236 [理学—运筹学与控制论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名实用生物信息技术课程教学实例被引量：4: 8; 作者罗静初; 机构北京大学生命科学学院北京大学蛋白质与植物基因研究重点实验室北京大学生物信息中心; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期102-111,共10页; 文摘介绍"实用生物信息技术"研究生课程的5个教学实例。以血红蛋白序列和结构为例,介绍常用生物信息技术和分析方法,包括蛋白质和核酸序列相似性比对、蛋白质和核酸序列数据库检索、Blast数据库相似性搜索、分子系统发生树构建,以及蛋白质结构比较分析等。; 关键词生物信息技术血红蛋白序列比对数据库检索 Blast数据库搜索系统发生树构建蛋白质结构比较分析; Keywords bioinformatics hemoglobin sequence alignment database query Blast database similarity search phylogenetic tree construction protein structure comparison; 分类号 Q811.4-4 [生物学—生物工程] G642 [文化科学—高等教育学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名X射线晶体学技术迎来里程碑式的革新: 9; 出处《中国医学计算机成像杂志》 CSCD 北大核心 2013年第6期544-544,共1页; 文摘蛋白质的结构直接决定着它们的功能，蛋白质结构分析能够为人们提供重要信息，帮助人们开发高度靶向性的治疗药物。迄今为止，人们所了解的蛋白质结构，大多离不开X射线晶体学技术。一个世纪以来，许多诺贝尔奖成果都得益于这一技术。; 关键词 X射线晶体学蛋白质结构分析治疗药物诺贝尔奖靶向性; 分类号 R-1 [医药卫生]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	一种基于空间密度特征的蛋白质结构相似性判定方法	胡敏彭群生	《工程图学学报》 CSCD 北大核心	2005	6	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于球极坐标划分的蛋白质结构相似性比较	邹北骥张琦梁鹿鸣	《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心	2009	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	利用立体阵列同位素标记法进行大型蛋白质的结构分析	增田智子	《生物技术产业》	2007	0	原文传递
4	咖啡豆α-半乳糖苷酶的同源建模及分析	陶佳妮李赟姚娣沈汪洋陈轩周坚	《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心	2016	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	大豆GmST1基因的生物信息学分析	井妍孙晶高赛男赵雪滕卫丽韩英鹏李文滨	《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心	2016	0	在线阅读下载PDF 职称材料
6	生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续)	沈世镒余涛开波阮吉寿	《工程数学学报》 CSCD 北大核心	2004	0	在线阅读下载PDF 职称材料
7	生物序列的语义分析与第二密码规则的探索	沈世镒	《工程数学学报》 CSCD 北大核心	2004	0	在线阅读下载PDF 职称材料
8	实用生物信息技术课程教学实例	罗静初	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2015	4	在线阅读下载PDF 职称材料
9	X射线晶体学技术迎来里程碑式的革新		《中国医学计算机成像杂志》 CSCD 北大核心	2013	0	在线阅读下载PDF 职称材料