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基于超高分辨质谱的家蚕脂肪体样品处理方案优化研究
1
作者
赵东超
刘丽婧
+4 位作者
赵莉
张艳
董照明
夏庆友
赵萍
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期109-116,共8页
随着家蚕基因组图谱的发布,家蚕的研究逐渐进入后基因组时代,家蚕蛋白质组样品前处理方法没有统一的标准,鉴定到的蛋白质数量差异较大.基于超高分辨率质谱仪,建立冰上组织研磨器研磨提取蛋白质的方法,能极大地避免材料的损失,具有稳定...
随着家蚕基因组图谱的发布,家蚕的研究逐渐进入后基因组时代,家蚕蛋白质组样品前处理方法没有统一的标准,鉴定到的蛋白质数量差异较大.基于超高分辨率质谱仪,建立冰上组织研磨器研磨提取蛋白质的方法,能极大地避免材料的损失,具有稳定和快速的优点.通过对不同提取试剂的摸索,发现尿素+DTT对家蚕组织样品的提取效果最好.通过对上样量和上样时间的摸索,确定最佳上样量为10μL,最佳上样时间为120 min.利用90%序列相似性原则构建非冗余家蚕数据库Strealine,在家蚕5龄第3 d脂肪体材料中,使用该库能鉴定到1910种蛋白质.进一步采用反相色谱柱对肽段进行分级,将鉴定到的蛋白数量提升至3986种.
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关键词
家蚕
蛋白质
组
脂肪体
蛋白质数量
肽段分级
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职称材料
题名
基于超高分辨质谱的家蚕脂肪体样品处理方案优化研究
1
作者
赵东超
刘丽婧
赵莉
张艳
董照明
夏庆友
赵萍
机构
西南大学西部(重庆)科学城种质创制大科学中心/前沿交叉学科研究院生物学研究中心
重庆市中药研究院中药创新药物与健康干预重庆市重点实验室
兰州大学生态学院
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期109-116,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD1201600)
国家自然科学基金项目(32030103)
西南大学实验技术研究项目(SYJ2024022)。
文摘
随着家蚕基因组图谱的发布,家蚕的研究逐渐进入后基因组时代,家蚕蛋白质组样品前处理方法没有统一的标准,鉴定到的蛋白质数量差异较大.基于超高分辨率质谱仪,建立冰上组织研磨器研磨提取蛋白质的方法,能极大地避免材料的损失,具有稳定和快速的优点.通过对不同提取试剂的摸索,发现尿素+DTT对家蚕组织样品的提取效果最好.通过对上样量和上样时间的摸索,确定最佳上样量为10μL,最佳上样时间为120 min.利用90%序列相似性原则构建非冗余家蚕数据库Strealine,在家蚕5龄第3 d脂肪体材料中,使用该库能鉴定到1910种蛋白质.进一步采用反相色谱柱对肽段进行分级,将鉴定到的蛋白数量提升至3986种.
关键词
家蚕
蛋白质
组
脂肪体
蛋白质数量
肽段分级
Keywords
silkworm(Bombyx mori)
proteome
fat body
number of proteins
peptide fractionation
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
O657.63 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于超高分辨质谱的家蚕脂肪体样品处理方案优化研究
赵东超
刘丽婧
赵莉
张艳
董照明
夏庆友
赵萍
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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