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动态-静态混合的时序蛋白质网络构建方法
被引量：
3
1
作者
代启国
郭茂祖
+1 位作者
刘晓燕
王春宇
《哈尔滨工业大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期41-46,共6页
目前已公开的蛋白质网络多为静态网络,不能有效描述细胞中蛋白质的动态活动特点.通过融合基因表达数据,研究人员可以构建出描述蛋白质动态性的时序蛋白质网络.现有方法假设所有蛋白质都是动态变化的,而事实上除动态蛋白质外细胞中还包...
目前已公开的蛋白质网络多为静态网络,不能有效描述细胞中蛋白质的动态活动特点.通过融合基因表达数据,研究人员可以构建出描述蛋白质动态性的时序蛋白质网络.现有方法假设所有蛋白质都是动态变化的,而事实上除动态蛋白质外细胞中还包含相对稳定的静态蛋白质.为此,提出了一种基于动态-静态蛋白质混合的时序网络构建新方法.该方法根据基因表达变化情况将蛋白质分为动态和静态两类,并在构建各时刻网络时考虑动态与静态蛋白质之间的相互作用关系.实验结果表明,利用本文方法构建的时序蛋白质网络可以提高蛋白质复合体识别的准确性,从而验证了本文方法的可行性.
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关键词
时序
蛋白质
网络
蛋白质
相互作用
基因表达
生物网络
蛋白质复合体识别
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职称材料
题名
动态-静态混合的时序蛋白质网络构建方法
被引量：
3
1
作者
代启国
郭茂祖
刘晓燕
王春宇
机构
哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
大连民族大学计算机科学与工程学院
大连市民族文化数字化重点实验室(大连民族大学)
出处
《哈尔滨工业大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期41-46,共6页
基金
国家自然科学基金(91335112
61571163
+3 种基金
61532014
61402132
61271346)
中央高校基本科研业务费专项资金(DC201501030)
文摘
目前已公开的蛋白质网络多为静态网络,不能有效描述细胞中蛋白质的动态活动特点.通过融合基因表达数据,研究人员可以构建出描述蛋白质动态性的时序蛋白质网络.现有方法假设所有蛋白质都是动态变化的,而事实上除动态蛋白质外细胞中还包含相对稳定的静态蛋白质.为此,提出了一种基于动态-静态蛋白质混合的时序网络构建新方法.该方法根据基因表达变化情况将蛋白质分为动态和静态两类,并在构建各时刻网络时考虑动态与静态蛋白质之间的相互作用关系.实验结果表明,利用本文方法构建的时序蛋白质网络可以提高蛋白质复合体识别的准确性,从而验证了本文方法的可行性.
关键词
时序
蛋白质
网络
蛋白质
相互作用
基因表达
生物网络
蛋白质复合体识别
Keywords
temporal protein network
protein interaction
gene expression
biological network
protein complex identification
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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作者
出处
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被引量
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1
动态-静态混合的时序蛋白质网络构建方法
代启国
郭茂祖
刘晓燕
王春宇
《哈尔滨工业大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
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