期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到10篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
基于SQL Server的蛋白质二级结构预测样本集数据库的构建 被引量：2
1
作者 张宁 吴捷 +1 位作者 宋卓 张涛 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期619-623,共5页
基于SQL Server数据库管理系统，将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来，建立了数据库DataSet，并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来，实现了规范化、结构化... 基于SQL Server数据库管理系统，将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来，建立了数据库DataSet，并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来，实现了规范化、结构化统一管理，便于存储、检索和分析数据，减少错误的发生。通过该数据库可以提取供蛋白质二级结构预测研究的样本、序列转换、变换编码以及分析评价预测结果等，取代许多传统编程处理文本文件的繁琐工作，大大提高效率，促进工作的开展。 展开更多
关键词 数据库 蛋白质二级结构预测 样本集 SQL SERVER 生物信息学
在线阅读 下载PDF
基于遗传算法的蛋白质二级结构预测方法研究进展 被引量：2
2
作者 孟翔燕 孟军 葛家麒 《农机化研究》 北大核心 2009年第5期72-75,79,共5页
蛋白质二级结构预测方法的研究目前已成为生物信息学研究的重要课题之一。为此,从从头预测、比较建模和混合方法3个方面阐述了近几年遗传算法在蛋白质二级结构预测中的应用研究进展,并分析了算法的效果和特点,最后展望了遗传算法在蛋白... 蛋白质二级结构预测方法的研究目前已成为生物信息学研究的重要课题之一。为此,从从头预测、比较建模和混合方法3个方面阐述了近几年遗传算法在蛋白质二级结构预测中的应用研究进展,并分析了算法的效果和特点,最后展望了遗传算法在蛋白质二级结构预测中应用的前景与方向。 展开更多
关键词 遗传算法 蛋白质二级结构预测 从头预测 比较建模
在线阅读 下载PDF
GP-MaxEnt模型的蛋白质二级结构预测 被引量：1
3
作者 杨伟 王宽全 左旺孟 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第8期65-68,共4页
针对单序列蛋白质二级结构预测问题,提出了一种基于高斯先验最大熵(GP-MaxEnt)模型的预测方法.该方法根据氨基酸的构象偏好进行特征构造,利用改进迭代缩放算法(ⅡS)训练高斯先验最大熵模型.使用CB513数据集对GP-MaxEnt模型进行了测试分... 针对单序列蛋白质二级结构预测问题,提出了一种基于高斯先验最大熵(GP-MaxEnt)模型的预测方法.该方法根据氨基酸的构象偏好进行特征构造,利用改进迭代缩放算法(ⅡS)训练高斯先验最大熵模型.使用CB513数据集对GP-MaxEnt模型进行了测试分析.试验表明,该方法简单有效,能够获得较好的预测精度. 展开更多
关键词 蛋白质二级结构预测 单序列预测 最大熵模型 高斯先验
在线阅读 下载PDF
基于改进牛顿算法的蛋白质二级结构预测 被引量：1
4
作者 王建 王彩芸 《现代电子技术》 2009年第14期135-137,共3页
主要介绍构造性机器学习方法即改进牛顿算法在蛋白质二级结构预测中的应用。针对标准BP算法存在的缺点,讨论用迭代矩阵替换二级微商来改进牛顿算法,实现蛋白质二级结构预测。实验表明,采用基于概率的Profile编码方式,改进牛顿算法正确... 主要介绍构造性机器学习方法即改进牛顿算法在蛋白质二级结构预测中的应用。针对标准BP算法存在的缺点,讨论用迭代矩阵替换二级微商来改进牛顿算法,实现蛋白质二级结构预测。实验表明,采用基于概率的Profile编码方式,改进牛顿算法正确率可以高达73.68%,与其他预测方法相比有较好的准确性。 展开更多
关键词 改进牛顿算法 蛋白质二级结构预测 Profile编码 神经网络
在线阅读 下载PDF
基于混合并行遗传算法的蛋白质二级结构预测
5
作者 孟翔燕 孟军 葛家麒 《农机化研究》 北大核心 2009年第6期34-38,79,共6页
蛋白质二级结构预测是后基因组学的重要内容,是准确预测蛋白质分子三维空间结构的关键步骤。为此,提出基于混合并行遗传算法(HPGA)的蛋白质二级结构预测方法,充分考虑蛋白质序列两端氨基酸对中间氨基酸结构的影响,以及蛋白质疏水性对二... 蛋白质二级结构预测是后基因组学的重要内容,是准确预测蛋白质分子三维空间结构的关键步骤。为此,提出基于混合并行遗传算法(HPGA)的蛋白质二级结构预测方法,充分考虑蛋白质序列两端氨基酸对中间氨基酸结构的影响,以及蛋白质疏水性对二级结构的影响,在整合与改进前人算法的基础上,使得计算复杂度降低1个数量级,其预测准确率达到62%左右。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构预测 并行遗传算法 模式 疏水序列
在线阅读 下载PDF
基于ELM的蛋白质二级结构预测及其后处理
6
作者 赵相国 王国仁 《东北大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1402-1405,共4页
将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中,在此基础上提出了基于概率的合并算法(probability-based combining,PBC),用该算法预测结果的合并.根据生物学中关于蛋白质二级结构的特征提出了预测结果的Helix-后处理(Helix-post-processing,H... 将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中,在此基础上提出了基于概率的合并算法(probability-based combining,PBC),用该算法预测结果的合并.根据生物学中关于蛋白质二级结构的特征提出了预测结果的Helix-后处理(Helix-post-processing,HPP)算法,对合并后的预测结果进行有效的后处理,从而进一步提高预测结果的准确率.分别在CB513和RS126两个数据集上进行了实验,实验结果表明,预测结果的准确率是令人满意的,尤其是实现了训练时间上的显著缩短. 展开更多
关键词 蛋白质二级结构预测 ELM 基于概率的合并算法 Helix-后处理算法
在线阅读 下载PDF
基于常用得分矩阵的神经网络法预测蛋白质的二级结构 被引量：3
7
作者 徐建平 方慧生 相秉仁 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期470-473,共4页
本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构。结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能。在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即... 本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构。结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能。在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即80%。这说明该方法具有一定的可行性。 展开更多
关键词 神经网络 得分矩阵 蛋白质二级结构预测
在线阅读 下载PDF
应用优化的隐马尔可夫模型预测蛋白质二级结构 被引量：1
8
作者 石鸥燕 杨惠云 +1 位作者 杨晶 田心 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第7期738-742,共5页
针对3-状态隐马尔可夫模型(HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出了7-状态和15-状态 HMM。研究对象为 CB513数据集合中筛选出的492条蛋白质序列,将其随机均分7组。分别应用7-状态和15-状态 HMM 对以上数据集进行二级结构预测,... 针对3-状态隐马尔可夫模型(HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出了7-状态和15-状态 HMM。研究对象为 CB513数据集合中筛选出的492条蛋白质序列,将其随机均分7组。分别应用7-状态和15-状态 HMM 对以上数据集进行二级结构预测,对预测准确率进行了7-交叉验证,并将预测结果与应用3-状态 HMM 的预测结果进行了比较。结果表明,应用7-状态 HMM,Q_3准确率提高3.11%,SOV 提高6.15%,Q_E提高6.49%;应用15-状态 HMM,Q_E比7-状态 HMM 又提高5.74%。在15.状态 HMM 预测中加入序列的同源信息后,Q_3准确率比单序列15-状态 HMM 增加8.76%。结果表明,7-状态HMM 预测能力优于3-状态 HMM,15-状态 HMM 总体预测能力和7-状态 HMM 相当,但β折叠预测能力强于7-状态 HMM。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构预测 隐马尔可夫模型(HMM) 7-状态 15-状态
在线阅读 下载PDF
神经网络方法在蛋白质结构预测中的研究与应用 被引量：2
9
作者 王化坤 钱伟懿 《黑龙江科技信息》 2008年第4期23-23,共1页
蛋白质结构预测在生物信息学研究中占有重要地位。对神经网络在蛋白质结构预测中的应用作了评述。首先,简要地介绍了人工神经网络,然后对近年来用神经网络算法解决蛋白质结构预测的研究作了回顾,并分析了算法的效果和特点。最后,展望了... 蛋白质结构预测在生物信息学研究中占有重要地位。对神经网络在蛋白质结构预测中的应用作了评述。首先,简要地介绍了人工神经网络,然后对近年来用神经网络算法解决蛋白质结构预测的研究作了回顾,并分析了算法的效果和特点。最后,展望了用神经网络算法解决蛋白质结构预测问题的前景。 展开更多
关键词 神经网络 蛋白质二级结构预测 预测 准确率
在线阅读 下载PDF
不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析 被引量：1
10
作者 顾万君 周童 +2 位作者 马建民 孙啸 陆祖宏 《东南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第1期72-77,共6页
在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (... 在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (α :螺旋 ,β :折叠 ,C :卷曲 )的偏向性参数 .通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析 ,得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息 . 展开更多
关键词 同义密码子使用 氨基酸二级结构偏向性 蛋白质二级结构预测 蛋白质折叠类型 蛋白设计
在线阅读 下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
关于我们 | 版权声明 | 联系我们 | 帮助中心| 意见反馈
主办单位：上海市教育委员会
技术支持：重庆维普资讯有限公司
渝公网安备 50019002500403号
使用帮助 返回顶部