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基于多核LSSVM的谷物蛋白质二级结构预测与优化
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作者 梁俊 刘静 +1 位作者 管骁 陈滢滢 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期117-125,共9页
蛋白质的二级结构对其空间结构和功能有着极其重要的影响,利用机器学习方法进行谷物蛋白质二级结构预测是生物和食品领域的重要研究内容。作者在现有蛋白质数据库中选取玉米、小麦、大豆的谷物蛋白质,使用多特征融合方式对蛋白质序列进... 蛋白质的二级结构对其空间结构和功能有着极其重要的影响,利用机器学习方法进行谷物蛋白质二级结构预测是生物和食品领域的重要研究内容。作者在现有蛋白质数据库中选取玉米、小麦、大豆的谷物蛋白质,使用多特征融合方式对蛋白质序列进行特征提取,提出将多核学习与最小二乘支持向量机(LSSVM)相结合,以多个核函数的线性加权组合代替传统单一核函数,利用核权重调整融合效果,构建多核LSSVM模型预测谷物蛋白质二级结构。使用粒子群优化算法(PSO)对模型超参数进行优化,寻找最佳超参数组合提升模型预测性能。研究结果表明,多核LSSVM模型能够改善单一核函数高维映射的局限性,融合各核函数优势,通过PSO算法获取最佳超参数组合。该模型结合多特征提取方式显著提高了谷物蛋白质二级结构预测的Q_(3)准确率。 展开更多
关键词 谷物 蛋白质二级结构 多核 最小二乘支持向量机 粒子群算法
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响应面法优化仔猪玉米-豆粕型饲粮发酵工艺及其蛋白质二级结构分析 被引量:2
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作者 耿彦超 原雪峰 +7 位作者 王馨 包鑫禹 李梦婷 高宇萌 杨华 洪亮 蒲蕾 张建斌 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期7320-7334,共15页
本试验利用响应面法优化仔猪玉米-豆粕型饲粮的菌酶协同发酵工艺,同时对其蛋白质二级结构特性进行研究,为发酵技术在畜禽饲粮生产中的应用提供参考和借鉴。首先采用单因素试验筛选影响因素,而后利用响应面法优化发酵工艺,确定最佳发酵条... 本试验利用响应面法优化仔猪玉米-豆粕型饲粮的菌酶协同发酵工艺,同时对其蛋白质二级结构特性进行研究,为发酵技术在畜禽饲粮生产中的应用提供参考和借鉴。首先采用单因素试验筛选影响因素,而后利用响应面法优化发酵工艺,确定最佳发酵条件,最后将玉米-豆粕型饲粮按照不同处理方法分为4组,即基础饲粮组(CK组)、乳酸菌组(B组)、酶组(E组)、菌酶协同组(BE组),并使用傅里叶变换红外光谱技术对发酵前后玉米-豆粕型饲粮的蛋白质二级结构进行分析。结果表明:1)玉米-豆粕型饲粮的最佳发酵工艺为菌液接种量6.0%,酶添加量0.036%,发酵温度33.0℃,发酵时间45.0 h,料水比1∶1,蔗糖添加量2.0%。2)在此条件下进行发酵,B组、E组和BE组的粗蛋白质含量相较于发酵前分别提高了12.91%、13.42%和17.28%,酸溶蛋白含量从发酵前的1.97%分别提升到3.28%、3.39%和3.83%。3)玉米-豆粕型饲粮经过菌酶协同发酵后分子结构与发酵前存在明显差异,其中,BE组酰胺Ⅰ区峰面积显著高于其余3组(P<0.05);BE组酰胺Ⅰ区峰面积/酰胺Ⅱ区峰面积以及酰胺Ⅰ区峰高/酰胺Ⅱ区峰高显著高于其余3组(P<0.05);BE组α-螺旋峰面积显著高于其余3组(P<0.05),且β-折叠峰面积/α-螺旋峰面积显著低于其余3组(P<0.05)。综上所述,菌酶协同发酵提高了玉米-豆粕型饲粮的营养价值,且使其蛋白质更容易被畜禽消化利用;菌酶协同发酵的效果优于单独菌株发酵或单独酶制剂酶解。本试验为从分子结构评价菌酶协同发酵饲料营养价值丰富了理论依据。 展开更多
关键词 响应面法 玉米-豆粕型饲粮 发酵工艺 傅里叶变换红外光谱 蛋白质二级结构
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菌酶协同对苜蓿营养成分和蛋白质二级结构的影响
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作者 王中秀 原雪峰 +4 位作者 耿彦超 周柏言 秦仁杰 张建斌 杨华 《猪业科学》 2024年第7期72-75,共4页
饲料占养猪生产饲养成本的70%,为降低猪肉生产成本,需要对现有饲料资源进行二次开发利用。苜蓿具有营养价值高、适口性好、消化率高的特点,其富含的活性物质对动物机体有益,在促进畜禽生长的同时也改善了畜产品品质,是优良的饲料资源。
关键词 饲料资源 畜产品品质 饲养成本 猪肉生产 蛋白质二级结构 二次开发利用 活性物质 营养成分
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蜂王浆不同贮存条件下蛋白质二级结构的Fourier变换红外光谱研究 被引量:29
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作者 吴黎明 周群 +3 位作者 周骁 赵静 孙素琴 胡福良 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第1期82-87,共6页
蜂王浆的质量与贮存时间和温度相关。测定了在不同温度下经过不同时间贮存后的蜂王浆Fourier变换红外光谱,应用去卷积和曲线拟合方法对蜂王浆的酰胺Ⅰ带进行分析,以期得到其蛋白质二级结构的组成。结果表明:这些蜂王浆之间存在明显而有... 蜂王浆的质量与贮存时间和温度相关。测定了在不同温度下经过不同时间贮存后的蜂王浆Fourier变换红外光谱,应用去卷积和曲线拟合方法对蜂王浆的酰胺Ⅰ带进行分析,以期得到其蛋白质二级结构的组成。结果表明:这些蜂王浆之间存在明显而有规律的光谱差异,蛋白质二级结构的组成之间也存在显著差异。随着贮存时间增加和温度升高,蜂王浆蛋白质二级结构的α-螺旋和β-折叠分别显著减少和增加,β-转角也有增加的趋势,其变化幅度为28℃>16℃>4℃>-18℃。这些结果与蜂王浆应该低温保存的理论相符。FTIR红外光谱结合去卷积、二阶导数和曲线拟合方法是评价蜂王浆品质和新鲜度的一种有效方法。 展开更多
关键词 红外光谱 蜂王浆 蛋白质二级结构 品质 贮存
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应用傅里叶红外光谱研究强声波作用下植物壁蛋白质二级结构变化 被引量:26
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作者 沈子威 孙克利 +2 位作者 杨钧 蔡国友 席葆树 《光子学报》 EI CAS CSCD 1999年第7期600-602,共3页
本论文采用傅里叶红外光研究烟草花粉细胞在不同频率和不同功率的强声波作用下,细胞壁蛋白质二级结构的变化.实验表明,在酰胺Ⅰ和酰胺Ⅱ带都有变化.当频率为400Hz,功率分别为110dB、100dB时,酰胺Ⅰ带β⊥折叠向B... 本论文采用傅里叶红外光研究烟草花粉细胞在不同频率和不同功率的强声波作用下,细胞壁蛋白质二级结构的变化.实验表明,在酰胺Ⅰ和酰胺Ⅱ带都有变化.当频率为400Hz,功率分别为110dB、100dB时,酰胺Ⅰ带β⊥折叠向B‖折叠转移,振动态由ν⊥(π,0)→ν‖(0,0);当功率为90dB,频率分别为800Hz、8000Hz时,酰胺Ⅱ带α螺旋稍有改变.因此,本工作的结果将有助于我们了解强声波对植物细胞的作用效应. 展开更多
关键词 傅里叶红外光 强声波 花粉细胞 蛋白质二级结构
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豆浆凝固过程中大豆蛋白质二级结构的研究 被引量:20
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作者 顾小红 孟旭 汤坚 《分析科学学报》 CAS CSCD 2006年第6期675-678,共4页
用变温ATR-FT-IR测定了豆浆加热、豆浆凝固过程中蛋白质二级结构的变化,结果显示:随着温度的升高,熟豆浆中蛋白质分子间强相互作用氢键(1β)和总相互作用氢键(1β+2β)明显下降,豆浆从20℃升温到80℃时,1β由29.2%下降到16.1%,表明蛋白... 用变温ATR-FT-IR测定了豆浆加热、豆浆凝固过程中蛋白质二级结构的变化,结果显示:随着温度的升高,熟豆浆中蛋白质分子间强相互作用氢键(1β)和总相互作用氢键(1β+2β)明显下降,豆浆从20℃升温到80℃时,1β由29.2%下降到16.1%,表明蛋白质分子间的相互作用减弱;豆腐的核心结构(β+α)约38.0%变化不大。随豆腐凝胶强度增加,1β由17.4%上升到43.3%,而维持蛋白质紧密结构的氢键(β+α)由38.8%下降到17.4%。豆浆凝固过程中1β的变化与其凝胶特性G*变化完全一致,说明蛋白质分子间强相互作用氢键与豆腐的硬度有关。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构 傅立叶红外光谱 豆粉 豆腐 凝胶特性
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低钠盐对皮蛋的钠钾含量、硬度及蛋白质二级结构的影响 被引量:8
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作者 周黎 张雅玮 +4 位作者 刘玮 徐萌 马志方 惠腾 彭增起 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期139-143,共5页
以新鲜鸭蛋为原料,采用清料法腌制皮蛋。探讨低钠盐替代食盐对皮蛋的钠钾含量、凝胶的硬度、蛋清蛋白质二级结构、感官品质等的影响,旨在为降低皮蛋中的钠含量提供新的思路,为加工低钠皮蛋提供新的方向。结果表明,100%低钠盐组比食盐组... 以新鲜鸭蛋为原料,采用清料法腌制皮蛋。探讨低钠盐替代食盐对皮蛋的钠钾含量、凝胶的硬度、蛋清蛋白质二级结构、感官品质等的影响,旨在为降低皮蛋中的钠含量提供新的思路,为加工低钠皮蛋提供新的方向。结果表明,100%低钠盐组比食盐组蛋清钠含量降低了21%,蛋黄钠含量降低了30%。不同比例的低钠盐替代组与食盐组对比,皮蛋凝胶的硬度、蛋清蛋白质二级结构的含量均无显著性差异(p>0.05)。70%低钠盐替代食盐制得的皮蛋,感官品质良好。 展开更多
关键词 低钠盐 皮蛋 硬度 蛋白质二级结构
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乳腺癌组织中蛋白质二级结构的Fourier变换红外光谱研究 被引量:9
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作者 高体玉 李俊 慈云祥 《分析科学学报》 CAS CSCD 2000年第5期353-357,共5页
根据乳腺大汗腺癌、小管癌、黏液癌、浸润导管癌、单纯癌和髓样癌组织 Fourier变换红外光谱酰胺 I带的去卷积和拟合分析 ,获得组织中蛋白质二级结构的数目及其组成。结果表明 :这些组织中蛋白质二级结构的数目及其组成存在着显著的差异 ... 根据乳腺大汗腺癌、小管癌、黏液癌、浸润导管癌、单纯癌和髓样癌组织 Fourier变换红外光谱酰胺 I带的去卷积和拟合分析 ,获得组织中蛋白质二级结构的数目及其组成。结果表明 :这些组织中蛋白质二级结构的数目及其组成存在着显著的差异 ,并与组织的类型、分化、坏死等密切相关。其中 ,髓样癌的差异性最大 ;高分化癌中螺旋结构的含量及非典型螺旋和 α-螺旋含量的比值均比低分化癌的相应值高 ;肿瘤边缘坏死的乳腺癌组织也表现出明显的差异。乳腺癌组织蛋白质二级结构的分析对乳腺癌组织的表征和评价具有重要的意义。 展开更多
关键词 乳腺癌组织 蛋白质二级结构 临床评价 FTIR
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基于深度学习的八类蛋白质二级结构预测算法 被引量:5
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作者 张蕾 李征 +1 位作者 郑逢斌 杨伟 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2017年第5期1512-1515,共4页
蛋白质二级结构预测是结构生物学中的一个重要问题。针对八类蛋白质二级结构预测,提出了一种基于递归神经网络和前馈神经网络的深度学习预测算法。该算法通过双向递归神经网络建模氨基酸间的局部和长程相互作用,递归神经网络的隐层输出... 蛋白质二级结构预测是结构生物学中的一个重要问题。针对八类蛋白质二级结构预测,提出了一种基于递归神经网络和前馈神经网络的深度学习预测算法。该算法通过双向递归神经网络建模氨基酸间的局部和长程相互作用,递归神经网络的隐层输出进一步送入到三层的前馈神经网络以便进行八类蛋白质二级结构预测。实验结果表明,提出的算法在CB513数据集上达到了67.9%的Q_8预测精度,显著地优于SSpro8和SC-GSN。 展开更多
关键词 深度学习 递归神经网络 前馈神经网络 蛋白质二级结构预测
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基于径向基函数蛋白质二级结构预测方法 被引量:6
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作者 景楠 周春光 夏斌 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2005年第29期4-7,共4页
文章针对蛋白质二级结构预测这一复杂非线性模式分类问题,提出了基于径向基函数的预测方法。在分析了基于神经网络预测方法的基础上,讨论了蛋白质二级结构预测算法研究中的数据选取、网络结构与参数对网络性能的影响,实验结果表明这一... 文章针对蛋白质二级结构预测这一复杂非线性模式分类问题,提出了基于径向基函数的预测方法。在分析了基于神经网络预测方法的基础上,讨论了蛋白质二级结构预测算法研究中的数据选取、网络结构与参数对网络性能的影响,实验结果表明这一方法的可行性和有效性。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构 径向基函数 神经网络 氨基酸序列
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基于距离矩阵灰度图的蛋白质二级结构类型预测 被引量:4
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作者 肖绚 肖纯材 王普 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2010年第10期3698-3700,共3页
蛋白质二级结构预测在蛋白质结构预测中具有很重要的作用。基于伪氨基酸成分表示蛋白质的方法,能提高蛋白质结构和功能预测的成功率,利用蛋白质距离矩阵灰度图,基于几何矩提出了一种伪氨基酸构造方法,结合氨基酸的成分对蛋白质二级结构... 蛋白质二级结构预测在蛋白质结构预测中具有很重要的作用。基于伪氨基酸成分表示蛋白质的方法,能提高蛋白质结构和功能预测的成功率,利用蛋白质距离矩阵灰度图,基于几何矩提出了一种伪氨基酸构造方法,结合氨基酸的成分对蛋白质二级结构类型进行预测,通过国际公认的Jackknife检验方法显示预测成功率达到95.10%,比其他方法高出许多,说明此方法具有有效的分类效果。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构 距离矩阵 模糊K近邻 几何矩 Jackknife测试
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结合蛋白质二级结构信息预测蛋白质空间结构中的二硫键 被引量:3
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作者 石鸥燕 蔡春泉 +2 位作者 孙伟 杨晶 黎小沛 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2011年第6期2049-2051,2077,共4页
在蛋白质空间结构预测中,二硫键的确定可以大大减少蛋白质构象的搜索空间。为提高二硫键预测的准确率,对形成二硫键的半胱氨酸及其周围的氨基酸残基在蛋白质二级结构形成上的偏性进行了分析,并提出将蛋白质二级结构信息加入到BP神经网... 在蛋白质空间结构预测中,二硫键的确定可以大大减少蛋白质构象的搜索空间。为提高二硫键预测的准确率,对形成二硫键的半胱氨酸及其周围的氨基酸残基在蛋白质二级结构形成上的偏性进行了分析,并提出将蛋白质二级结构信息加入到BP神经网络预测模型的输入编码信息中。研究对象为从Swiss-Prot数据库中选取的252条蛋白质序列,随机均分四组,对预测准确率进行4交-叉验证,各项准确率均比未加入蛋白质二级结构信息前有明显提高。结果表明,结合蛋白质二级结构信息的编码方式是可行且有效的。 展开更多
关键词 二硫键 神经网络 蛋白质二级结构
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编码方式对蛋白质二级结构预测精度的影响 被引量:12
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作者 阮晓钢 孙海军 《北京工业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期229-235,共7页
为了比较在蛋白质二级结构预测中常用的氨基酸序列编码方式的优缺点,借助前向型BP神经网络对正交编码、5位编码、Codon(2种)编码和Profile编码5种氨基酸编码方式进行了对比分析.实验结果显示,用富含"生物进化信息"的Profile... 为了比较在蛋白质二级结构预测中常用的氨基酸序列编码方式的优缺点,借助前向型BP神经网络对正交编码、5位编码、Codon(2种)编码和Profile编码5种氨基酸编码方式进行了对比分析.实验结果显示,用富含"生物进化信息"的Profile编码方式可以得到较高的预测结果,同时也表明,充分利用生物本身所具有的生物信息对提高蛋白质二级结构预测精度是非常重要的. 展开更多
关键词 氨基酸序列编码 蛋白质二级结构 神经网络
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基于混合SVM方法的蛋白质二级结构预测算法 被引量:4
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作者 隋海峰 曲武 +1 位作者 钱文彬 杨炳儒 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2011年第10期169-173,188,共6页
预测蛋白质二级结构,是当今生物信息学中一个难以解决的问题。由于预测蛋白质二级结构的精度在蛋白质结构研究中起到非常重要的作用,因此在基于KDTICM理论基础上,提出一种基于混合SVM方法的蛋白质二级结构预测算法。该算法有效地利用蛋... 预测蛋白质二级结构,是当今生物信息学中一个难以解决的问题。由于预测蛋白质二级结构的精度在蛋白质结构研究中起到非常重要的作用,因此在基于KDTICM理论基础上,提出一种基于混合SVM方法的蛋白质二级结构预测算法。该算法有效地利用蛋白质的物化属性和PSI-SEARCH生成的位置特异性打分矩阵作为双层SVM的输入,从而大大地提高了蛋白质二级结构预测的精度。实验比较分析表明,新算法的预测精度和普适性明显优于目前其他典型的预测方法。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构预测 混合SVM方法 复合金字塔模型
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一种新的预测蛋白质二级结构的模型—贝叶斯神经网络 被引量:3
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作者 邵建林 徐东 +1 位作者 王兰州 王翼飞 《计量学报》 EI CSCD 北大核心 2006年第3期281-285,共5页
提出了一种新的基于贝叶斯神经网络(BNN)的蛋白质二级结构预测方法。计算结果表明,BNN的性能优于反向神经网络(BPNN),平均Q3精度在四组交叉证实数据集与测试数据集下分别提高了3.65%和4.01%;还提出了一种有效缩短马尔可夫链蒙特卡罗(MC... 提出了一种新的基于贝叶斯神经网络(BNN)的蛋白质二级结构预测方法。计算结果表明,BNN的性能优于反向神经网络(BPNN),平均Q3精度在四组交叉证实数据集与测试数据集下分别提高了3.65%和4.01%;还提出了一种有效缩短马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)模拟过程中“burn in”阶段的交叉证实初值选取方法。 展开更多
关键词 计量学 蛋白质二级结构 贝叶斯神经网络 马尔可夫链蒙特卡罗模拟 方差信息准则 BGR收敛性诊断
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基于SQL Server的蛋白质二级结构预测样本集数据库的构建 被引量:2
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作者 张宁 吴捷 +1 位作者 宋卓 张涛 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期619-623,共5页
基于SQL Server数据库管理系统,将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来,建立了数据库DataSet,并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来,实现了规范化、结构化... 基于SQL Server数据库管理系统,将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来,建立了数据库DataSet,并配置了一个IIS服务器以方便网络查询。该数据库将蛋白质二级结构预测样本集有效地组织起来,实现了规范化、结构化统一管理,便于存储、检索和分析数据,减少错误的发生。通过该数据库可以提取供蛋白质二级结构预测研究的样本、序列转换、变换编码以及分析评价预测结果等,取代许多传统编程处理文本文件的繁琐工作,大大提高效率,促进工作的开展。 展开更多
关键词 数据库 蛋白质二级结构预测 样本集 SQL SERVER 生物信息学
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元胞自动机图的蛋白质二级结构类型预测 被引量:2
17
作者 胡鸿豪 宋丽平 肖绚 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第15期226-229,共4页
蛋白质结构预测是后基因组时代的一项重要任务,蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤。利用氨基酸数字编码模型生成蛋白质序列的元胞自动机图(Cellular Automata Image,CAI),提出了一种基于灰度共生矩阵(Gray Level Co-occurre... 蛋白质结构预测是后基因组时代的一项重要任务,蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤。利用氨基酸数字编码模型生成蛋白质序列的元胞自动机图(Cellular Automata Image,CAI),提出了一种基于灰度共生矩阵(Gray Level Co-occurrence Matrix,GLCM)提取纹理图像特征的方法。用扩大的协方差算法进行预测,仿真结果显示有较好的分类效果,Jackknife检验的预测成功率达到94.61%。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构 元胞自动机 灰度共生矩阵 K近邻算法 Jackknife测试
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神经网络在蛋白质二级结构预测中的应用 被引量:4
18
作者 王艳春 何东健 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第16期4172-4174,4188,共4页
叙述了神经网络的结构和工作原理及其在蛋白质二级结构预测中的具体应用,并讨论了神经网络方法在蛋白质二级结构预测中存在的问题及应用前景。
关键词 蛋白质二级结构 神经网络 正交编码 预测精度 工作原理
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基于遗传算法的蛋白质二级结构预测方法研究进展 被引量:2
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作者 孟翔燕 孟军 葛家麒 《农机化研究》 北大核心 2009年第5期72-75,79,共5页
蛋白质二级结构预测方法的研究目前已成为生物信息学研究的重要课题之一。为此,从从头预测、比较建模和混合方法3个方面阐述了近几年遗传算法在蛋白质二级结构预测中的应用研究进展,并分析了算法的效果和特点,最后展望了遗传算法在蛋白... 蛋白质二级结构预测方法的研究目前已成为生物信息学研究的重要课题之一。为此,从从头预测、比较建模和混合方法3个方面阐述了近几年遗传算法在蛋白质二级结构预测中的应用研究进展,并分析了算法的效果和特点,最后展望了遗传算法在蛋白质二级结构预测中应用的前景与方向。 展开更多
关键词 遗传算法 蛋白质二级结构预测 从头预测 比较建模
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应用优化的隐马尔可夫模型预测蛋白质二级结构 被引量:1
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作者 石鸥燕 杨惠云 +1 位作者 杨晶 田心 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第7期738-742,共5页
针对3-状态隐马尔可夫模型(HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出了7-状态和15-状态 HMM。研究对象为 CB513数据集合中筛选出的492条蛋白质序列,将其随机均分7组。分别应用7-状态和15-状态 HMM 对以上数据集进行二级结构预测,... 针对3-状态隐马尔可夫模型(HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出了7-状态和15-状态 HMM。研究对象为 CB513数据集合中筛选出的492条蛋白质序列,将其随机均分7组。分别应用7-状态和15-状态 HMM 对以上数据集进行二级结构预测,对预测准确率进行了7-交叉验证,并将预测结果与应用3-状态 HMM 的预测结果进行了比较。结果表明,应用7-状态 HMM,Q_3准确率提高3.11%,SOV 提高6.15%,Q_E提高6.49%;应用15-状态 HMM,Q_E比7-状态 HMM 又提高5.74%。在15.状态 HMM 预测中加入序列的同源信息后,Q_3准确率比单序列15-状态 HMM 增加8.76%。结果表明,7-状态HMM 预测能力优于3-状态 HMM,15-状态 HMM 总体预测能力和7-状态 HMM 相当,但β折叠预测能力强于7-状态 HMM。 展开更多
关键词 蛋白质二级结构预测 隐马尔可夫模型(HMM) 7-状态 15-状态
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