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蛋白质三级结构预测方法简述被引量：10: 1; 作者张漫常延琦《中国动物检疫》 CAS 北大核心 2005年第5期36-37,共2页; 关键词蛋白质三级结构预测方法空间结构生物学功能结构与功能蛋白质结构测序工作全基因组核酸序列增长速度实验方法; 在线阅读下载PDF 职称材料

蛋白质三级结构对蛋白质内部形成紧密接触对速率的影响被引量：1: 2; 作者施苏广王向红官铬刚《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期400-403,408,共5页; 通过蛋白质分子内两残基间距的概率分布函数P(r),计算了641个蛋白质分子内近程和远程紧密接触对的形成速率.分析了不同蛋白质结构,不同紧密接触对半径以及DNA的绑定对速率的影响.结果表明:不同结构类型蛋白近程和远程紧密接触对的形成... 展开更多; 关键词蛋白质三级结构两残基间距的概率分布函数P(r) 紧密接触对的形成速率; 在线阅读下载PDF 职称材料

HLA新等位基因B＊ 13：92的确认及蛋白质三级结构的初步分析被引量：1: 3; 作者裴永峰黄惠妮 +1 位作者李恒聪吴国光《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1558-1562,共5页; 目的：人类白细胞抗原（HLA）新等位基因B＊13：92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法：应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术（polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT）进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结... 展开更多; 关键词人类白细胞抗原新等位基因B＊13 蛋白质三级结构; 在线阅读下载PDF 职称材料

蛋白质中残基远程相互作用预测算法研究综述被引量：6: 4; 作者张海仓高玉娟 +2 位作者邓明华郑伟谋卜东波《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2017年第1期1-19,共19页; 蛋白质是由多个氨基酸残基顺序连接而成的长链.在天然状态下,蛋白质并不是无规则的自由状态,而是自发形成特定的空间结构,以执行其特定的生物学功能.驱动蛋白质形成特定空间结构的主要因素是残基间的非共价相互作用,包括疏水作用、静电... 展开更多; 关键词残基远程相互作用预测蛋白质三级结构预测图模型共进化机器学习; 在线阅读下载PDF 职称材料

毒蕈碱样乙酰胆碱受体及其信号转导被引量：8: 5; 作者王昊郭政东李智《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期230-234,共5页; 毒蕈碱样乙酰胆碱受体 (MAChRs)是G蛋白偶联受体 (GPCRs)超家族中的一员 ,具有该家族特征性的结构和信号转导方式。GTP结合蛋白 (G proteins)是一类具有GTP酶活性的蛋白质 ,由α、β、γ三个亚基构成。其中α亚基结合GDP或GTP ,分别代表... 展开更多; 关键词 M受体 GTP结合蛋白蛋白质三级结构毒蕈碱样乙酰胆碱受体信号转导; 在线阅读下载PDF 职称材料

牦牛hnRNP K基因的克隆及序列分析: 6; 作者方鸿滨王永 +1 位作者江明锋陈达文《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期172-178,共7页; 为研究hnRNP K基因的生物学功能及其在牦牛中的特异性,利用RT-PCR和粘性末端连接法,分两段克隆了牦牛hnRNP K基因cDNA序列。序列分析结果表明,牦牛hnRNP K基因cDNA序列长11706bp,开放阅读框(ORF)长1389bp,编码463个氨基酸。序列比对结... 展开更多; 关键词牦牛 HNRNP K RT—PCR 粘性末端连接法基因克隆蛋白质三级结构; 在线阅读下载PDF 职称材料

肾小管间质性肾病基因-表型关联性分析: 7; 作者杨雨蒙张颖 +3 位作者魏敏周雅丽杨单植邢国兰《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期320-326,共7页; 目的:筛选肾小管间质性肾病遗传变异枢纽基因。方法:对经肾活检证实且无明确病因的24例肾小管间质性肾病患者进行全外显子组测序,应用Phenolyzer数据库进行基因-表型关联评分,筛选其共有的罕见遗传变异,利用DAVID 6.8数据库进行基因功... 展开更多; 关键词肾小管间质性肾病全外显子组测序基因-表型关联通路富集分析蛋白质三级结构模型; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蛋白质三级结构预测方法简述被引量：10: 1; 作者张漫常延琦; 机构天津市兽药监察所中国农业大学生物学院; 出处《中国动物检疫》 CAS 北大核心 2005年第5期36-37,共2页; 关键词蛋白质三级结构预测方法空间结构生物学功能结构与功能蛋白质结构测序工作全基因组核酸序列增长速度实验方法; 分类号 Q518.2 [生物学—生物化学] O211.67 [理学—概率论与数理统计]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蛋白质三级结构对蛋白质内部形成紧密接触对速率的影响被引量：1: 2; 作者施苏广王向红官铬刚; 机构温州大学物理与电子信息学院; 出处《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期400-403,408,共5页; 基金国家自然科学基金资助项目(No.20774066) 浙江省自然科学基金资助项目(No.Y405553); 文摘通过蛋白质分子内两残基间距的概率分布函数P(r),计算了641个蛋白质分子内近程和远程紧密接触对的形成速率.分析了不同蛋白质结构,不同紧密接触对半径以及DNA的绑定对速率的影响.结果表明:不同结构类型蛋白近程和远程紧密接触对的形成速率的变化趋势恰好相反.近程紧密接触对的形成速率kS随着n(n=|j-i|)的增大而增大,远程紧密接触对的形成速率kL随着n的增大而减小,并且远程紧密接触对的形成速率kL满足kL(n)∝n-γ的关系.γ值随着紧密接触对半径a的增大而变小,当a=0.6 nm时,全α蛋白的γ值等于0.382,α/β蛋白的γ值等于0.343,全β和α+β蛋白的γ值等于0.218.DNA的绑定使蛋白质分子内近程和远程紧密接触对的形成速率都减小.; 关键词蛋白质三级结构两残基间距的概率分布函数P(r) 紧密接触对的形成速率; Keywords protein structural class probability distribution P（r） rate of intra-molecular contact formation; 分类号 O631 [理学—高分子化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名HLA新等位基因B＊ 13：92的确认及蛋白质三级结构的初步分析被引量：1: 3; 作者裴永峰黄惠妮李恒聪吴国光; 机构南宁输血医学研究所; 出处《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1558-1562,共5页; 基金南宁市科学研究与技术开发计划项目(201003048C-3); 文摘目的：人类白细胞抗原（HLA）新等位基因B＊13：92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法：应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术（polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT）进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结果与等位基因B＊13：01：01,B＊58：01：01在189位有1个碱基不匹配,不能指定为任何HLA-B位点等位基因,用针对B＊13、B＊58的组特异性测序引物（GSSP）,确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异,使用SWISS-MODEL方法建立该新基因的空间模型并进行分析。结果：测序结果证实,该等位基因与其同源性最高的等位基因是B＊13：01：01,两者的差异是在第2外显子189位的C〉A,密码子39由GAC变为GAA,编码的氨基酸由天冬氨酸（D）转变为谷氨酸（E）。空间结构分析表明替代氨基酸位于抗原肽结合区α螺旋上。结论：该等位基因是在中国广西壮族人群发现的一个新HLA-B位点等位基因,世界卫生组织（WHO）HLA命名委员会将其正式命名为HLA-B＊13：92。; 关键词人类白细胞抗原新等位基因B＊13 蛋白质三级结构; Keywords Human leukocyte antigen HLA-B＊ 13 allele protein 3D model structure; 分类号 R457.1 [医药卫生—治疗学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名蛋白质中残基远程相互作用预测算法研究综述被引量：6: 4; 作者张海仓高玉娟邓明华郑伟谋卜东波; 机构中国科学院计算技术研究所中国科学院大学北京大学定量生物学中心北京大学数学科学学院北京大学统计科学中心中国科学院理论物理研究所; 出处《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2017年第1期1-19,共19页; 基金国家"九七三"重点基础研究发展计划基金项目(2012CB316502 2015CB910303) +7 种基金国家自然科学基金项目(11175224 11121403 31270834 61272318 31171262 31428012 31471246) 中国科学院理论物理研究所理论物理国家重点实验室开放工程项目(Y4KF171CJ1)~~; 文摘蛋白质是由多个氨基酸残基顺序连接而成的长链.在天然状态下,蛋白质并不是无规则的自由状态,而是自发形成特定的空间结构,以执行其特定的生物学功能.驱动蛋白质形成特定空间结构的主要因素是残基间的非共价相互作用,包括疏水作用、静电相互作用、范德华力等.因此,对残基之间远程相互作用的准确预测将有助于对蛋白质空间结构的预测,进而有助于对蛋白质生物学功能的了解.在蛋白质进化过程,有相互作用残基对之间存在一种"共进化"模式,即当一个残基发生变异时,与其有相互作用的残基也要发生相应的变异,以维持相互作用,进而维持整体空间结构以及生物学功能.基于上述生物学观察,研究者开发了多个统计模型和算法以预测残基对之间的相互作用:1)概述残基之间远程相互作用的两大类基本预测算法,包括无监督学习方法和监督学习方法;2)使用蛋白质结构预测CASP比赛结果来客观比较上述各类算法的性能,分析各个算法的特点和优势;3)从生物学观察和统计模型2个角度分析总结了未来的发展趋势.; 关键词残基远程相互作用预测蛋白质三级结构预测图模型共进化机器学习; Keywords protein contact prediction protein tertiary structure prediction graphical model coevolution machine learning; 分类号 O62 [理学—有机化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名毒蕈碱样乙酰胆碱受体及其信号转导被引量：8: 5; 作者王昊郭政东李智; 机构中国医科大学药理学教研室; 出处《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期230-234,共5页; 基金国家自然科学基金 (30 1710 77) 辽宁省自然科学基金(0 0 2 0 39)资助课题; 文摘毒蕈碱样乙酰胆碱受体 (MAChRs)是G蛋白偶联受体 (GPCRs)超家族中的一员 ,具有该家族特征性的结构和信号转导方式。GTP结合蛋白 (G proteins)是一类具有GTP酶活性的蛋白质 ,由α、β、γ三个亚基构成。其中α亚基结合GDP或GTP ,分别代表G蛋白的非活化和活化状态。M受体与Gi/Go或Gq/ 11间的作用机制仍在探讨中 ,但基本过程与Gs介导的信号转导模式相似。激动剂持续作用后。; 关键词 M受体 GTP结合蛋白蛋白质三级结构毒蕈碱样乙酰胆碱受体信号转导; Keywords Muscarinic acetylcholine receptor GTP binding protein Protein tertiary structure Signal transduction; 分类号 R962 [医药卫生—药理学] Q42 [生物学—神经生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名牦牛hnRNP K基因的克隆及序列分析: 6; 作者方鸿滨王永江明锋陈达文; 机构青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室西南民族大学生命科学与技术学院; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期172-178,共7页; 基金四川省青年重点基金项目(09ZQ026-011); 文摘为研究hnRNP K基因的生物学功能及其在牦牛中的特异性,利用RT-PCR和粘性末端连接法,分两段克隆了牦牛hnRNP K基因cDNA序列。序列分析结果表明,牦牛hnRNP K基因cDNA序列长11706bp,开放阅读框(ORF)长1389bp,编码463个氨基酸。序列比对结果表明,牦牛与黄牛hnRNP K cDNA序列的同源性达99.1%,编码的氨基酸同源性达到97.0%;在牦牛氨基酸序列中有15个突变。通过同源建模的方法成功构建了牦牛hnRNP K蛋白质三级结构,结果表明牦牛hnRNP K属于A型结构,而黄牛hnRNP K蛋白属于B型结构,其差异是由第459-463位氨基酸序列由"ADVEG"突变为"SGKFF"所致。乙酰化分析结果显示,牦牛hnRNP K对基因转录的影响水平跟黄牛是一致,表明不同物种hnRNP K功能的差异可能跟其氨基酸序列的差异有关。成功克隆的牦牛hnRNP K基因的cDNA序列为进一步分析该基因的功能提供参考。; 关键词牦牛 HNRNP K RT—PCR 粘性末端连接法基因克隆蛋白质三级结构; Keywords Bos grunniens hnRNP K RT-PCR Cohesive end connecting method Gene clone Protein tertiary structure; 分类号 R346 [医药卫生—基础医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名肾小管间质性肾病基因-表型关联性分析: 7; 作者杨雨蒙张颖魏敏周雅丽杨单植邢国兰; 机构郑州大学第一附属医院肾脏内科; 出处《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期320-326,共7页; 基金国家自然科学基金项目(U1604186)。; 文摘目的:筛选肾小管间质性肾病遗传变异枢纽基因。方法:对经肾活检证实且无明确病因的24例肾小管间质性肾病患者进行全外显子组测序,应用Phenolyzer数据库进行基因-表型关联评分,筛选其共有的罕见遗传变异,利用DAVID 6.8数据库进行基因功能通路富集分析。应用String数据库构建PPI网络图,并使用Cytoscape中的插件cytoHubba进行可视化分析,寻找枢纽基因。应用SWISS-Pdb Viewer软件分析枢纽基因突变前后表达蛋白三级结构的变化。结果:24例中女9例,男15例,年龄18~40(26.17±8.82)岁。全外显子组测序检测出19例患者携带致病或可能致病的基因突变位点,共发现35个肾小管间质性肾病易感基因,其在TGF-β信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路中富集。PPI网络和Cytoscape分析筛选出4个枢纽基因,即VCP、PRKDC、RBPJ、MYH11,且VCP基因突变造成蛋白质空间结构和功能的改变。结论:肾小管间质性肾病易感基因主要富集在离子跨膜转运的调节、蛋白质转运的调控、蛋白质磷酸化等生物过程,TGF-β信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路中。VCP基因可能与肾小管间质性肾病有关。; 关键词肾小管间质性肾病全外显子组测序基因-表型关联通路富集分析蛋白质三级结构模型; Keywords renal tubulointerstitial nephropathy whole exome sequencing gene-phenotype association pathway enrichment analysis protein tertiary structure model; 分类号 R692.6 [医药卫生—泌尿科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	蛋白质三级结构预测方法简述	张漫常延琦	《中国动物检疫》 CAS 北大核心	2005	10	在线阅读下载PDF 职称材料
2	蛋白质三级结构对蛋白质内部形成紧密接触对速率的影响	施苏广王向红官铬刚	《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心	2008	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	HLA新等位基因B＊ 13：92的确认及蛋白质三级结构的初步分析	裴永峰黄惠妮李恒聪吴国光	《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2016	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	蛋白质中残基远程相互作用预测算法研究综述	张海仓高玉娟邓明华郑伟谋卜东波	《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心	2017	6	在线阅读下载PDF 职称材料
5	毒蕈碱样乙酰胆碱受体及其信号转导	王昊郭政东李智	《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心	2002	8	在线阅读下载PDF 职称材料
6	牦牛hnRNP K基因的克隆及序列分析	方鸿滨王永江明锋陈达文	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2010	0	在线阅读下载PDF 职称材料
7	肾小管间质性肾病基因-表型关联性分析	杨雨蒙张颖魏敏周雅丽杨单植邢国兰	《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料