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基于高通量测序解析赊店老酒浓香型白酒大曲古菌群落多样性
1
作者
刘延波
李海登
+4 位作者
秦梦星
赵志军
王贤
韩素娜
潘春梅
《中国酿造》
CAS
北大核心
2021年第10期112-117,共6页
该研究采用高通量测序技术对赊店老酒制作的浓香型白酒大曲的古菌群落多样性进行分析,并进行蛋白直系同源簇(COG)功能预测。结果表明,大曲的优势古菌门(相对丰度>1%)为广古菌门(Euryarchaeota),相对丰度为98.51%;优势古菌属(相对丰度...
该研究采用高通量测序技术对赊店老酒制作的浓香型白酒大曲的古菌群落多样性进行分析,并进行蛋白直系同源簇(COG)功能预测。结果表明,大曲的优势古菌门(相对丰度>1%)为广古菌门(Euryarchaeota),相对丰度为98.51%;优势古菌属(相对丰度>1%)为甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)、甲烷囊菌属(Methanoculleus)、甲烷发菌属(Methanothrix)、盐碱球菌属(Halalkalicoccus)、Methanomassiliicoccus、甲烷球形菌属(Methanosphaera)、甲烷杆菌属(Methanobacterium)、甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、Methanospirillum、甲烷嗜热杆菌属(Methanothermobacter),相对丰度分别为61.92%、10.51%、7.17%、6.30%、3.84%、1.72%、1.61%、1.07%、1.04%、1.00%。此外,首次在大曲中发现盐碱球菌属(Halalkalicoccus)、热球菌属(Thermococcus)、甲烷绳菌属(Methanolinea)、亚硝化侏儒菌属(Nitrosopumilus)。COG功能主要富集在翻译、核糖体结构和生物发生,能源生产与转化,氨基酸转运和代谢,辅酶运输和代谢,复制、重组和修复,转录,反映了大曲中各种酶系的合成活跃。
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关键词
赊店老酒
浓香型白酒
大曲
高通量测序
古菌
群落多样性
蛋白直系同源簇功能预测
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职称材料
广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析
被引量：
4
2
作者
廖玲玲
李俊
+3 位作者
杨厚德
刘庆友
谢炳坤
崔奎青
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期1276-1280,共5页
【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,...
【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析。【结果】扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列。多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0%、85.5%、85.5%、84.5%、81.2%、80.3%、80.0%和77.3%。德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲。【结论】RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因。
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关键词
德保猪
RENT基因
克隆
基因
功能
分析
同源
性
蛋白
结构
预测
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职称材料
题名
基于高通量测序解析赊店老酒浓香型白酒大曲古菌群落多样性
1
作者
刘延波
李海登
秦梦星
赵志军
王贤
韩素娜
潘春梅
机构
河南牧业经济学院食品与生物工程学院(酒业学院)
河南仰韶酒业有限公司博士后科研工作站
河南牧业经济学院河南省白酒风格工程技术研究中心
河南牧业经济学院郑州市白酒酿造微生物技术重点实验室
赊店老酒股份有限公司
出处
《中国酿造》
CAS
北大核心
2021年第10期112-117,共6页
基金
河南省重点研发与推广专项(科技攻关)项目(202102110130)
河南省重大科技专项(181100211400)
+1 种基金
河南牧业经济学院博士科研启动资金项目(2018HNUAHEDF011)
河南牧业经济学院重点学科项目。
文摘
该研究采用高通量测序技术对赊店老酒制作的浓香型白酒大曲的古菌群落多样性进行分析,并进行蛋白直系同源簇(COG)功能预测。结果表明,大曲的优势古菌门(相对丰度>1%)为广古菌门(Euryarchaeota),相对丰度为98.51%;优势古菌属(相对丰度>1%)为甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)、甲烷囊菌属(Methanoculleus)、甲烷发菌属(Methanothrix)、盐碱球菌属(Halalkalicoccus)、Methanomassiliicoccus、甲烷球形菌属(Methanosphaera)、甲烷杆菌属(Methanobacterium)、甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、Methanospirillum、甲烷嗜热杆菌属(Methanothermobacter),相对丰度分别为61.92%、10.51%、7.17%、6.30%、3.84%、1.72%、1.61%、1.07%、1.04%、1.00%。此外,首次在大曲中发现盐碱球菌属(Halalkalicoccus)、热球菌属(Thermococcus)、甲烷绳菌属(Methanolinea)、亚硝化侏儒菌属(Nitrosopumilus)。COG功能主要富集在翻译、核糖体结构和生物发生,能源生产与转化,氨基酸转运和代谢,辅酶运输和代谢,复制、重组和修复,转录,反映了大曲中各种酶系的合成活跃。
关键词
赊店老酒
浓香型白酒
大曲
高通量测序
古菌
群落多样性
蛋白直系同源簇功能预测
Keywords
She Dian Lao Jiu
strong-flavor Baijiu
Daqu
high-throughput sequencing
archaea
community diversity
protein cluster of orthologous group
分类号
TS261.1 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析
被引量：
4
2
作者
廖玲玲
李俊
杨厚德
刘庆友
谢炳坤
崔奎青
机构
广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室
广西大学动物繁殖研究所/亚热带生物资源保护利用国家重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期1276-1280,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31360544)
广西家畜遗传改良重点实验室开放基金项目(2013GXKFKT-08)
文摘
【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析。【结果】扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列。多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0%、85.5%、85.5%、84.5%、81.2%、80.3%、80.0%和77.3%。德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲。【结论】RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因。
关键词
德保猪
RENT基因
克隆
基因
功能
分析
同源
性
蛋白
结构
预测
Keywords
Debao pig
RENT
cloning
gene function analysis
homology
protein structure prediction
分类号
S828.89 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序解析赊店老酒浓香型白酒大曲古菌群落多样性
刘延波
李海登
秦梦星
赵志军
王贤
韩素娜
潘春梅
《中国酿造》
CAS
北大核心
2021
0
在线阅读
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职称材料
2
广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析
廖玲玲
李俊
杨厚德
刘庆友
谢炳坤
崔奎青
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
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职称材料
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