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蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
1
作者
杜明阳
马健芝
+4 位作者
多杰措
罗天蓉
熊辉岩
陈亦婷
段瑞君
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1781-1792,共12页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT,glycerol-3-phosphate acyltransferase)是三酰甘油(TAG,triacylglycerol)生物合成的核心酶,在植物生长发育以及抗逆过程中发挥重要作用。本研究基于蒿叶猪毛菜(Salsola abrotanoides L.)转录组数据,利用生...
甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT,glycerol-3-phosphate acyltransferase)是三酰甘油(TAG,triacylglycerol)生物合成的核心酶,在植物生长发育以及抗逆过程中发挥重要作用。本研究基于蒿叶猪毛菜(Salsola abrotanoides L.)转录组数据,利用生物信息学和q RT-PCR方法,对蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员进行鉴定分析并探究其表达模式。以BLASTP比对和HMM搜索2种方法共鉴定出35个GPAT成员;理化性质分析表明,大多数蛋白属于碱性蛋白;亚细胞定位预测表明,Sa_GPAT家族成员主要分布于内质网;空间结构预测显示,二级结构主要以α螺旋为主,三级结构较为稳定。系统发育树分析显示,该家族分为4个亚家族,其中组别4为特有亚家族,且与拟南芥GPAT家族不存在聚类关系。信号肽预测显示蒿叶猪毛菜GPAT家族成员中未存在信号肽,且跨膜结构分析表明蒿叶猪毛菜GPAT家族成员中约63%存在跨膜结构。表达模式分析表明,蒿叶猪毛菜GPATs呈现组织特异性表达,其中Sa_GPAT003在幼苗中高度表达,结合幼苗干旱胁迫转录组结果发现多数Sa_GPAT家族成员响应外界干旱胁迫,其中Sa_GPAT032在干旱胁迫后表达量极显著升高。由此推测,蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员可能在抵抗干旱胁迫方面起着重要作用。
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关键词
蒿叶猪毛菜
GPAT基因家族
生物信息学
转录组
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职称材料
《新疆植被及其利用》专著中未曾记载的植物群落类型 Ⅰ.荒漠植物群落类型
被引量：
59
2
作者
张立运
海鹰
《干旱区地理》
CSCD
北大核心
2002年第1期84-89,共6页
《新疆植被及其利用》(1978)一书 ,至少对下述荒漠植物群落类型未曾记载。它们分别是由蒿叶猪毛菜 (Salsolaabrotanoides)、准噶尔猪毛菜 (S .dschungarica)、木碱蓬 (Suaedadendroides)、小叶碱蓬 (S .microphylla)、里海盐爪爪 (Kalid...
《新疆植被及其利用》(1978)一书 ,至少对下述荒漠植物群落类型未曾记载。它们分别是由蒿叶猪毛菜 (Salsolaabrotanoides)、准噶尔猪毛菜 (S .dschungarica)、木碱蓬 (Suaedadendroides)、小叶碱蓬 (S .microphylla)、里海盐爪爪 (Kalidiumcaspicum)、刺山柑 (Capparisspinosa)、新疆沙冬青 (Ammopiptanthusnanus)、准噶尔无叶豆 (Eremospartonsongoricum)、东疆沙拐枣 (Calligonumklementzii)、红皮沙拐枣 (C .rubicundum)、蛇麻黄 (Ephedradistachya) 为建群种所形成的群落类型。
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关键词
新疆
植被
利用
荒漠植物群落
类型
蒿叶猪毛菜
木碱蓬
准噶尔
猪毛菜
里海盐爪爪
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职称材料
题名
蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
1
作者
杜明阳
马健芝
多杰措
罗天蓉
熊辉岩
陈亦婷
段瑞君
机构
青海大学生态环境工程学院
青海大学农牧学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期1781-1792,共12页
基金
青海省中央引导地方科技发展资金计划项目(2023ZY003)
2023年度青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”计划项目~~。
文摘
甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT,glycerol-3-phosphate acyltransferase)是三酰甘油(TAG,triacylglycerol)生物合成的核心酶,在植物生长发育以及抗逆过程中发挥重要作用。本研究基于蒿叶猪毛菜(Salsola abrotanoides L.)转录组数据,利用生物信息学和q RT-PCR方法,对蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员进行鉴定分析并探究其表达模式。以BLASTP比对和HMM搜索2种方法共鉴定出35个GPAT成员;理化性质分析表明,大多数蛋白属于碱性蛋白;亚细胞定位预测表明,Sa_GPAT家族成员主要分布于内质网;空间结构预测显示,二级结构主要以α螺旋为主,三级结构较为稳定。系统发育树分析显示,该家族分为4个亚家族,其中组别4为特有亚家族,且与拟南芥GPAT家族不存在聚类关系。信号肽预测显示蒿叶猪毛菜GPAT家族成员中未存在信号肽,且跨膜结构分析表明蒿叶猪毛菜GPAT家族成员中约63%存在跨膜结构。表达模式分析表明,蒿叶猪毛菜GPATs呈现组织特异性表达,其中Sa_GPAT003在幼苗中高度表达,结合幼苗干旱胁迫转录组结果发现多数Sa_GPAT家族成员响应外界干旱胁迫,其中Sa_GPAT032在干旱胁迫后表达量极显著升高。由此推测,蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员可能在抵抗干旱胁迫方面起着重要作用。
关键词
蒿叶猪毛菜
GPAT基因家族
生物信息学
转录组
Keywords
Salsola abrotanoides
GPAT gene family
bioinformatics
transcriptome
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
《新疆植被及其利用》专著中未曾记载的植物群落类型 Ⅰ.荒漠植物群落类型
被引量：
59
2
作者
张立运
海鹰
机构
中国科学院新疆生态与地理研究所
新疆师范大学地理系
出处
《干旱区地理》
CSCD
北大核心
2002年第1期84-89,共6页
基金
国家重点研究发展规划项目<中国西部干旱区生态环境演变与调控研究>(G19990 435 0 9) 2 0 0 0 40 0 8课题资助
文摘
《新疆植被及其利用》(1978)一书 ,至少对下述荒漠植物群落类型未曾记载。它们分别是由蒿叶猪毛菜 (Salsolaabrotanoides)、准噶尔猪毛菜 (S .dschungarica)、木碱蓬 (Suaedadendroides)、小叶碱蓬 (S .microphylla)、里海盐爪爪 (Kalidiumcaspicum)、刺山柑 (Capparisspinosa)、新疆沙冬青 (Ammopiptanthusnanus)、准噶尔无叶豆 (Eremospartonsongoricum)、东疆沙拐枣 (Calligonumklementzii)、红皮沙拐枣 (C .rubicundum)、蛇麻黄 (Ephedradistachya) 为建群种所形成的群落类型。
关键词
新疆
植被
利用
荒漠植物群落
类型
蒿叶猪毛菜
木碱蓬
准噶尔
猪毛菜
里海盐爪爪
Keywords
vegetation and its utilization in Xinjiang
desert plant community
分类号
Q948.1 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蒿叶猪毛菜GPAT基因家族成员鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
杜明阳
马健芝
多杰措
罗天蓉
熊辉岩
陈亦婷
段瑞君
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
《新疆植被及其利用》专著中未曾记载的植物群落类型 Ⅰ.荒漠植物群落类型
张立运
海鹰
《干旱区地理》
CSCD
北大核心
2002
59
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职称材料
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引证文献
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