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侵染葱鳞葡萄孢的一种新型dsRNA病毒
被引量:
2
1
作者
吴明德
汪青军
+2 位作者
张静
杨龙
李国庆
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期39-46,共8页
测定了葱鳞葡萄孢(Botrytissquamosa)菌株LeekBc-10和GarlicBc-2的菌丝生长速度、致病力和菌株LeekBc-10中一种dsRNA病毒的eDNA序列及其推定编码的蛋白质序列,并对该病毒进行了系统进化分析。结果表明:菌株OarlicBc-2菌丝生长较快...
测定了葱鳞葡萄孢(Botrytissquamosa)菌株LeekBc-10和GarlicBc-2的菌丝生长速度、致病力和菌株LeekBc-10中一种dsRNA病毒的eDNA序列及其推定编码的蛋白质序列,并对该病毒进行了系统进化分析。结果表明:菌株OarlicBc-2菌丝生长较快、致病力较强,菌株LeekBc-10菌丝生长较慢、致病力较弱。菌株Leek-Bc-10菌丝中有2条dsRNA片段(dsRNA-1和dsRNAu2),序列测定表明:dsRNA-1和dsRNA-2核苷酸序列与相对应BotrytisporriRNAvirus1(BpRV1)中2条dsRNA片段的相似性分别为91.7%和97.7%,故可判断菌株LeekBc-10中的dsRNA是一种真菌病毒,暂时命名为BotrytissquareosaRNAvirus1(BsRV1)。BsRV1中dsRNA-1和dsRNA-2分别含有一个大的开放阅读框(ORF),即ORFⅠ和ORFⅡ,各自编码长度为1901和1788个氨基酸的假定蛋白,且分别与BpRV1中的对应假定蛋白的相似度为97.1%和98.7%。对BsRVlORFl编码的假定蛋白的分析表明:该蛋白含有RdRp-4(RNAdependemRNApolymerase)超家族蛋白的保守结构域。BsRVl的RdRp与Totiviridae、Chrysoviridae和Megabirnaviridae等科病毒的RdRp同源性为19%~23%,且具有上述病毒RdRp的8个保守结构域。系统发育分析表明:BsRVl与BpRVl聚在一起形成一个独立分支,属于同一种病毒,且不能归到任何已有的病毒科中,因而可能代表一个新的病毒科。
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关键词
灰霉病
葱鳞葡萄孢
弱毒现象
真菌病毒
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职称材料
葱鳞葡萄孢与灰葡萄孢毒素及其致病性的探索
被引量:
4
2
作者
郑晓莲
李萍
+1 位作者
任建国
张宝杰
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
1993年第1期20-21,共2页
葱鳞葡萄孢Botrytis squamosa(简称B.s.,下同)为韭菜、葱、蒜灰霉病病原;灰葡萄孢B.cinerea(简称B.c.,下同)引起黄瓜、番茄等多种蔬菜的灰霉病,均为保护地重要病害。试验探索了B.s.、B.c.毒素的提取方法,并用生物测定(毒素浸茎及抑制种...
葱鳞葡萄孢Botrytis squamosa(简称B.s.,下同)为韭菜、葱、蒜灰霉病病原;灰葡萄孢B.cinerea(简称B.c.,下同)引起黄瓜、番茄等多种蔬菜的灰霉病,均为保护地重要病害。试验探索了B.s.、B.c.毒素的提取方法,并用生物测定(毒素浸茎及抑制种子根),初步明确毒素粗提液可抑制种子根伸长,抑制率59.2%-79.05%,抗病品种抑制率低于感病品种,毒素浸茎出现典型的灰霉症状。
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关键词
葱鳞葡萄孢
灰
葡萄
孢
致病性
蔬菜
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职称材料
葱鳞葡萄孢菌诱导下韭菜RT-qPCR内参基因的筛选和验证
被引量:
5
3
作者
宋海娜
吴心桐
+3 位作者
杨鲁豫
耿喜宁
张华敏
宋小龙
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期101-115,共15页
葱鳞葡萄胞菌引起的韭菜灰霉病是影响韭菜产量和品质的主要因素之一。为了筛选出感染灰霉病后韭菜叶片中稳定表达的内参基因用于基因定量表达分析,以模拟接种和接种葱鳞葡萄孢菌24、48、72 h的韭菜叶片为材料,基于前期的转录组测序结果...
葱鳞葡萄胞菌引起的韭菜灰霉病是影响韭菜产量和品质的主要因素之一。为了筛选出感染灰霉病后韭菜叶片中稳定表达的内参基因用于基因定量表达分析,以模拟接种和接种葱鳞葡萄孢菌24、48、72 h的韭菜叶片为材料,基于前期的转录组测序结果选取UBC1、UBC2、UBQ1、UBQ2、GAPDH3、GAPDH4、TUB、EF-1α、40S RP、DDX、eIF-1A、PABP和DnaJ共13个基因为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测13个基因的表达情况,采用geNorm、NormFinder、BestKeeper软件和Reffinder在线程序对候选内参基因的表达稳定性进行评估。结果表明,13个候选内参基因中UBQ1的Ct值变化范围最小,表达水平最稳定。GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件筛选出的最佳内参基因不同,RefFinder综合评估显示,UBC2和UBQ1是韭菜叶片接种葱鳞葡萄孢菌后表达稳定性较好的基因,DDX是稳定性较差的基因。为了验证所筛选内参基因的可靠性,选择6个稳定性不同的候选内参基因分别作为定量分析的内部参照,对接种葱鳞葡萄孢菌后不同时间韭菜叶片中GST676和PRP902基因的表达水平进行归一化处理。结果显示,以稳定性较高的UBC2或UBQ1为内参基因时,校正的GST676和PRP902基因的表达趋势与转录组测序结果一致,而以稳定性相对较差的40S RP、eIF-1A、GAPDH4或DDX为内参基因时,校正的目的基因的表达趋势与转录组测序结果稍有差异。软件分析和实验验证结果表明,UBC2和UBQ1基因可作为葱鳞葡萄孢菌侵染韭菜叶片后相关基因定量表达分析的最合适内参基因。研究结果为后续开展韭菜抗灰霉病关键基因表达分析和功能研究奠定了基础。
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关键词
韭菜
葱鳞葡萄孢
菌
内参基因
实时荧光定量PCR
表达稳定性
灰霉病
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职称材料
作物灰霉病综合防治技术
被引量:
4
4
作者
甘晓静
黎起秦
《广西植保》
2004年第4期13-16,共4页
关键词
作物
灰霉病
综合防治
抗药性
灰
葡萄
孢
菌
葱鳞葡萄孢
菌
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职称材料
韭菜灰霉病的发生规律及防治方法
被引量:
8
5
作者
张俐清
史延春
+2 位作者
赵月富
张跃东
王小明
《甘肃农业科技》
2001年第7期35-36,共2页
关键词
韭菜
灰霉病
症状
葱鳞葡萄孢
菌
发生规律
综合防治
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职称材料
题名
侵染葱鳞葡萄孢的一种新型dsRNA病毒
被引量:
2
1
作者
吴明德
汪青军
张静
杨龙
李国庆
机构
华中农业大学植物科学技术学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期39-46,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31000877)
公益性行业(农业)科研专项(201303025)
文摘
测定了葱鳞葡萄孢(Botrytissquamosa)菌株LeekBc-10和GarlicBc-2的菌丝生长速度、致病力和菌株LeekBc-10中一种dsRNA病毒的eDNA序列及其推定编码的蛋白质序列,并对该病毒进行了系统进化分析。结果表明:菌株OarlicBc-2菌丝生长较快、致病力较强,菌株LeekBc-10菌丝生长较慢、致病力较弱。菌株Leek-Bc-10菌丝中有2条dsRNA片段(dsRNA-1和dsRNAu2),序列测定表明:dsRNA-1和dsRNA-2核苷酸序列与相对应BotrytisporriRNAvirus1(BpRV1)中2条dsRNA片段的相似性分别为91.7%和97.7%,故可判断菌株LeekBc-10中的dsRNA是一种真菌病毒,暂时命名为BotrytissquareosaRNAvirus1(BsRV1)。BsRV1中dsRNA-1和dsRNA-2分别含有一个大的开放阅读框(ORF),即ORFⅠ和ORFⅡ,各自编码长度为1901和1788个氨基酸的假定蛋白,且分别与BpRV1中的对应假定蛋白的相似度为97.1%和98.7%。对BsRVlORFl编码的假定蛋白的分析表明:该蛋白含有RdRp-4(RNAdependemRNApolymerase)超家族蛋白的保守结构域。BsRVl的RdRp与Totiviridae、Chrysoviridae和Megabirnaviridae等科病毒的RdRp同源性为19%~23%,且具有上述病毒RdRp的8个保守结构域。系统发育分析表明:BsRVl与BpRVl聚在一起形成一个独立分支,属于同一种病毒,且不能归到任何已有的病毒科中,因而可能代表一个新的病毒科。
关键词
灰霉病
葱鳞葡萄孢
弱毒现象
真菌病毒
Keywords
gray mold
Botrytis squamosa
hypovirulence
mycovirus
分类号
Q939.4 [生物学—微生物学]
S432.44 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
葱鳞葡萄孢与灰葡萄孢毒素及其致病性的探索
被引量:
4
2
作者
郑晓莲
李萍
任建国
张宝杰
机构
河北农业大学植保系
河北省平泉县种子公司
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
1993年第1期20-21,共2页
文摘
葱鳞葡萄孢Botrytis squamosa(简称B.s.,下同)为韭菜、葱、蒜灰霉病病原;灰葡萄孢B.cinerea(简称B.c.,下同)引起黄瓜、番茄等多种蔬菜的灰霉病,均为保护地重要病害。试验探索了B.s.、B.c.毒素的提取方法,并用生物测定(毒素浸茎及抑制种子根),初步明确毒素粗提液可抑制种子根伸长,抑制率59.2%-79.05%,抗病品种抑制率低于感病品种,毒素浸茎出现典型的灰霉症状。
关键词
葱鳞葡萄孢
灰
葡萄
孢
致病性
蔬菜
分类号
S436.3 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
葱鳞葡萄孢菌诱导下韭菜RT-qPCR内参基因的筛选和验证
被引量:
5
3
作者
宋海娜
吴心桐
杨鲁豫
耿喜宁
张华敏
宋小龙
机构
平顶山学院化学与环境工程学院
河南城建学院生命科学与工程学院
河南科技大学化工与制药学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期101-115,共15页
基金
国家自然科学基金青年项目(31401463)
河南省重点研发与推广专项(科技攻关)项目(222102110071)
+1 种基金
平顶山学院博士科研启动项目(PXY-BSQD-202109)
河南城建学院博士科研启动项目(K-Q2021010)。
文摘
葱鳞葡萄胞菌引起的韭菜灰霉病是影响韭菜产量和品质的主要因素之一。为了筛选出感染灰霉病后韭菜叶片中稳定表达的内参基因用于基因定量表达分析,以模拟接种和接种葱鳞葡萄孢菌24、48、72 h的韭菜叶片为材料,基于前期的转录组测序结果选取UBC1、UBC2、UBQ1、UBQ2、GAPDH3、GAPDH4、TUB、EF-1α、40S RP、DDX、eIF-1A、PABP和DnaJ共13个基因为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测13个基因的表达情况,采用geNorm、NormFinder、BestKeeper软件和Reffinder在线程序对候选内参基因的表达稳定性进行评估。结果表明,13个候选内参基因中UBQ1的Ct值变化范围最小,表达水平最稳定。GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件筛选出的最佳内参基因不同,RefFinder综合评估显示,UBC2和UBQ1是韭菜叶片接种葱鳞葡萄孢菌后表达稳定性较好的基因,DDX是稳定性较差的基因。为了验证所筛选内参基因的可靠性,选择6个稳定性不同的候选内参基因分别作为定量分析的内部参照,对接种葱鳞葡萄孢菌后不同时间韭菜叶片中GST676和PRP902基因的表达水平进行归一化处理。结果显示,以稳定性较高的UBC2或UBQ1为内参基因时,校正的GST676和PRP902基因的表达趋势与转录组测序结果一致,而以稳定性相对较差的40S RP、eIF-1A、GAPDH4或DDX为内参基因时,校正的目的基因的表达趋势与转录组测序结果稍有差异。软件分析和实验验证结果表明,UBC2和UBQ1基因可作为葱鳞葡萄孢菌侵染韭菜叶片后相关基因定量表达分析的最合适内参基因。研究结果为后续开展韭菜抗灰霉病关键基因表达分析和功能研究奠定了基础。
关键词
韭菜
葱鳞葡萄孢
菌
内参基因
实时荧光定量PCR
表达稳定性
灰霉病
Keywords
Allium tuberosum
Botrytis squamosa
reference gene
real-time quantitative PCR
expression stability
gray mold
分类号
S436.33 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作物灰霉病综合防治技术
被引量:
4
4
作者
甘晓静
黎起秦
机构
广西大学农学院
出处
《广西植保》
2004年第4期13-16,共4页
关键词
作物
灰霉病
综合防治
抗药性
灰
葡萄
孢
菌
葱鳞葡萄孢
菌
分类号
S432.4 [农业科学—植物病理学]
在线阅读
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职称材料
题名
韭菜灰霉病的发生规律及防治方法
被引量:
8
5
作者
张俐清
史延春
赵月富
张跃东
王小明
机构
天水市植保植检站
武山县植保植检站
张家川县植保植检站
秦安县植保植检站
出处
《甘肃农业科技》
2001年第7期35-36,共2页
关键词
韭菜
灰霉病
症状
葱鳞葡萄孢
菌
发生规律
综合防治
分类号
S436.33 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
侵染葱鳞葡萄孢的一种新型dsRNA病毒
吴明德
汪青军
张静
杨龙
李国庆
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
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职称材料
2
葱鳞葡萄孢与灰葡萄孢毒素及其致病性的探索
郑晓莲
李萍
任建国
张宝杰
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
1993
4
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职称材料
3
葱鳞葡萄孢菌诱导下韭菜RT-qPCR内参基因的筛选和验证
宋海娜
吴心桐
杨鲁豫
耿喜宁
张华敏
宋小龙
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
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职称材料
4
作物灰霉病综合防治技术
甘晓静
黎起秦
《广西植保》
2004
4
在线阅读
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职称材料
5
韭菜灰霉病的发生规律及防治方法
张俐清
史延春
赵月富
张跃东
王小明
《甘肃农业科技》
2001
8
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职称材料
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