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沙地葡萄茎痘相关病毒RT-PCR检测
被引量:
7
1
作者
董雅凤
张尊平
+2 位作者
刘凤之
王宝亮
张少瑜
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期705-708,共4页
为建立快速、灵敏、可靠的沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)检测方法,以总RNA为模板,采用2组GRSPaV特异性引物对29个品种52株葡萄样品进行RT-PCR检测,并对扩增产物进行了测序和分析。结果表明,从20个品种25株葡萄样品中检测到GRSPaV,平均...
为建立快速、灵敏、可靠的沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)检测方法,以总RNA为模板,采用2组GRSPaV特异性引物对29个品种52株葡萄样品进行RT-PCR检测,并对扩增产物进行了测序和分析。结果表明,从20个品种25株葡萄样品中检测到GRSPaV,平均带毒株率为48.1%。外壳蛋白基因片段引物F1/R1从25个样品中扩增到905bp的特异片段,复制酶基因片段引物F2/R2从20个样品中扩增到498bp的特异片段,表明GRSPaV外壳蛋白基因比复制酶基因更加保守,RT-PCR检测时采用F1/R1则更为适宜。PCR产物测序结果与GenBank中登录的GRSPaV序列比较,同源性为97.90%~98.11%。
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关键词
沙地
葡萄茎痘相关病毒
RT-PCR
检测
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职称材料
山东省沙地葡萄茎痘相关病毒的检测
被引量:
2
2
作者
尚佑芬
王升吉
+5 位作者
赵玖华
张家魁
吕志华
路兴波
孙红炜
杨崇良
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期158-162,共5页
为明确沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)在山东省发生的情况,2006-2007年在葡萄主栽区和葡萄品种资源圃进行了田间调查、样品采集和病原检测。应用GRSPaV外壳蛋白基因表达获得的多克隆抗体,经间接酶联免疫吸附试验(PTA-ELISA)和斑点酶联免...
为明确沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)在山东省发生的情况,2006-2007年在葡萄主栽区和葡萄品种资源圃进行了田间调查、样品采集和病原检测。应用GRSPaV外壳蛋白基因表达获得的多克隆抗体,经间接酶联免疫吸附试验(PTA-ELISA)和斑点酶联免疫吸附试验(Dot-ELISA)检测,在2a采集的298个样品中,125个样品为阳性反应,阳性率41.95%。125个阳性样品涉及43个品种,品种被侵染率74.14%。研究对检测的样品用RT-PCR法验证,有3对引物均扩增出了预期片段,分别为解旋酶基因340bp片段、外壳蛋白(CP)基因842bp片段和RNA聚合酶(RdRp)基因499bp片段。
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关键词
葡萄茎痘相关病毒
病原检测
ELISA
RT-PCR
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职称材料
葡萄GLRaV-3和GRSPaV病毒双重PCR方法建立及初步应用
3
作者
李升
李玲玉
+2 位作者
乔光
龙天文
王嘉福
《中国南方果树》
北大核心
2019年第1期72-77,共6页
针对我国西南地区葡萄园中卷叶相关病毒3(grapevine leafroll-associated virus 3,GLRaV-3)和茎痘相关病毒(grapevine rupestris stem pitting-associated virus,GRSPaV)发生普遍的情况,在单一PCR检测的基础上,分别从引物浓度和退火温...
针对我国西南地区葡萄园中卷叶相关病毒3(grapevine leafroll-associated virus 3,GLRaV-3)和茎痘相关病毒(grapevine rupestris stem pitting-associated virus,GRSPaV)发生普遍的情况,在单一PCR检测的基础上,分别从引物浓度和退火温度对双重PCR体系进行优化,建立了同时检测GLRaV-3和GRSPaV的双重PCR技术。建立的双重PCR反应体系最适退火温度为56.1℃,20μL PCR反应体系中10μmol/L浓度的混合引物最适用量为0.1μL;该方法能够检测出GLRaV-3和GRSPaV的cDNA最低浓度分别为0.99pg/μL和99.43ng/μL,且特异性良好。应用该双重PCR方法检测了来自贵州凯里和遵义地区"南玉""温克""摩尔多瓦"葡萄品种疑似病株样品,GLRaV-3检出率为100%,部分样品检出GRSPaV。通过核苷酸序列克隆测序和对比发现,贵州检测出的GLRaV-3与美国分离株(AJ748523)相似度最高,为99.82%;贵州检测出的GRSPaV与巴西分离株(KT008370)相似度最高,为99.08%。
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关键词
葡萄
卷叶
相关
病毒
3
葡萄茎痘相关病毒
多重PCR
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职称材料
题名
沙地葡萄茎痘相关病毒RT-PCR检测
被引量:
7
1
作者
董雅凤
张尊平
刘凤之
王宝亮
张少瑜
机构
中国农业科学院果树研究所
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期705-708,共4页
基金
辽宁省自然科学基金(20032139)
人事部留学回国人员科技活动择优资助项目(农办人[2004]121号)
辽宁省葫芦岛市科技攻关项目(04105B1601)
文摘
为建立快速、灵敏、可靠的沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)检测方法,以总RNA为模板,采用2组GRSPaV特异性引物对29个品种52株葡萄样品进行RT-PCR检测,并对扩增产物进行了测序和分析。结果表明,从20个品种25株葡萄样品中检测到GRSPaV,平均带毒株率为48.1%。外壳蛋白基因片段引物F1/R1从25个样品中扩增到905bp的特异片段,复制酶基因片段引物F2/R2从20个样品中扩增到498bp的特异片段,表明GRSPaV外壳蛋白基因比复制酶基因更加保守,RT-PCR检测时采用F1/R1则更为适宜。PCR产物测序结果与GenBank中登录的GRSPaV序列比较,同源性为97.90%~98.11%。
关键词
沙地
葡萄茎痘相关病毒
RT-PCR
检测
Keywords
GRSPaV
RT-PCR
Detection
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
山东省沙地葡萄茎痘相关病毒的检测
被引量:
2
2
作者
尚佑芬
王升吉
赵玖华
张家魁
吕志华
路兴波
孙红炜
杨崇良
机构
山东省农业科学院植物保护研究所
山东省葡萄研究所
山东省济宁市林业局经济林站
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期158-162,共5页
基金
山东省自然科学基金(Y2006D32)
文摘
为明确沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV)在山东省发生的情况,2006-2007年在葡萄主栽区和葡萄品种资源圃进行了田间调查、样品采集和病原检测。应用GRSPaV外壳蛋白基因表达获得的多克隆抗体,经间接酶联免疫吸附试验(PTA-ELISA)和斑点酶联免疫吸附试验(Dot-ELISA)检测,在2a采集的298个样品中,125个样品为阳性反应,阳性率41.95%。125个阳性样品涉及43个品种,品种被侵染率74.14%。研究对检测的样品用RT-PCR法验证,有3对引物均扩增出了预期片段,分别为解旋酶基因340bp片段、外壳蛋白(CP)基因842bp片段和RNA聚合酶(RdRp)基因499bp片段。
关键词
葡萄茎痘相关病毒
病原检测
ELISA
RT-PCR
Keywords
GRSPaV
Detecting of pathogen
ELISA
RT-PCR
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
葡萄GLRaV-3和GRSPaV病毒双重PCR方法建立及初步应用
3
作者
李升
李玲玉
乔光
龙天文
王嘉福
机构
贵州大学农业生物工程研究院
贵州大学生命科学学院
铜仁学院
出处
《中国南方果树》
北大核心
2019年第1期72-77,共6页
基金
贵州省农业攻关项目(黔科合农NY字(2014)3057号)
贵州2015年度千层次创新型人才项目
贵州省2015年度"三区"科技人才项目资助
文摘
针对我国西南地区葡萄园中卷叶相关病毒3(grapevine leafroll-associated virus 3,GLRaV-3)和茎痘相关病毒(grapevine rupestris stem pitting-associated virus,GRSPaV)发生普遍的情况,在单一PCR检测的基础上,分别从引物浓度和退火温度对双重PCR体系进行优化,建立了同时检测GLRaV-3和GRSPaV的双重PCR技术。建立的双重PCR反应体系最适退火温度为56.1℃,20μL PCR反应体系中10μmol/L浓度的混合引物最适用量为0.1μL;该方法能够检测出GLRaV-3和GRSPaV的cDNA最低浓度分别为0.99pg/μL和99.43ng/μL,且特异性良好。应用该双重PCR方法检测了来自贵州凯里和遵义地区"南玉""温克""摩尔多瓦"葡萄品种疑似病株样品,GLRaV-3检出率为100%,部分样品检出GRSPaV。通过核苷酸序列克隆测序和对比发现,贵州检测出的GLRaV-3与美国分离株(AJ748523)相似度最高,为99.82%;贵州检测出的GRSPaV与巴西分离株(KT008370)相似度最高,为99.08%。
关键词
葡萄
卷叶
相关
病毒
3
葡萄茎痘相关病毒
多重PCR
分类号
S436.631 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
沙地葡萄茎痘相关病毒RT-PCR检测
董雅凤
张尊平
刘凤之
王宝亮
张少瑜
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
山东省沙地葡萄茎痘相关病毒的检测
尚佑芬
王升吉
赵玖华
张家魁
吕志华
路兴波
孙红炜
杨崇良
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
葡萄GLRaV-3和GRSPaV病毒双重PCR方法建立及初步应用
李升
李玲玉
乔光
龙天文
王嘉福
《中国南方果树》
北大核心
2019
0
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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