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葡萄卷叶伴随病毒2实时荧光定量RT-PCR技术的检测应用
被引量：
4
1
作者
任芳
张尊平
+3 位作者
范旭东
胡国君
张梦妍
董雅凤
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期180-187,共8页
通过引物筛选和体系优化建立了葡萄卷叶伴随病毒2 Grapevine leafroll-associated virus 2(GLRaV-2)的SYBR GreenⅠ染料法实时荧光定量RT-PCR检测技术。该技术标准曲线扩增效率为102.2%,决定系数为0.999,最低检出限可达10-3稀释梯度,是...
通过引物筛选和体系优化建立了葡萄卷叶伴随病毒2 Grapevine leafroll-associated virus 2(GLRaV-2)的SYBR GreenⅠ染料法实时荧光定量RT-PCR检测技术。该技术标准曲线扩增效率为102.2%,决定系数为0.999,最低检出限可达10-3稀释梯度,是常规RT-PCR的100倍。对不同季节和不同部位葡萄样品的检出率普遍高于常规RT-PCR。春夏秋季样品检出率分别为67%、89%和86%,比常规RT-PCR检出率分别高42%、28%和17%。冬季休眠枝条检出率最高(100%),与常规RT-PCR相同。夏季老叶柄和卷须、秋季和冬季枝条等样品检测效果最好,检出率均为100%。对来自我国17个省38个品种的116份田间葡萄样品检测结果表明,qRT-PCR共检测到10个样品为阳性,检出率略高于常规RT-PCR。
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关键词
葡萄
葡萄卷叶伴随病毒2
实时荧光定量RT-PCR
常规RT-PCR
检测
在线阅读
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职称材料
3种葡萄卷叶伴随病毒RT-PCR检测
被引量：
2
2
作者
王仲
刘命华
+2 位作者
李捷
李明骏
程玉琴
《中国果树》
北大核心
2012年第4期43-46,I0002,共5页
2010—2011年我们对河北省涿鹿、怀来、昌黎、宣化等县(区)以及北京市葡萄卷叶病的发生情况进行了调查,并对采集的葡萄植株样品用RT-PCR方法检测病毒种类。在检测的82个样品中,葡萄卷叶伴随病毒3号(GLRaV-3)的检出率为100.0%,葡萄卷叶...
2010—2011年我们对河北省涿鹿、怀来、昌黎、宣化等县(区)以及北京市葡萄卷叶病的发生情况进行了调查,并对采集的葡萄植株样品用RT-PCR方法检测病毒种类。在检测的82个样品中,葡萄卷叶伴随病毒3号(GLRaV-3)的检出率为100.0%,葡萄卷叶伴随病毒1号(GLRaV-1)的检出率为17.1%,葡萄卷叶伴随病毒2号(GLRaV-2)的检出率为11.0%;病毒混合侵染的样品占总检测样品数的28.1%,其中葡萄卷叶伴随病毒1号、3号混合侵染样品占总检测样品数的17.1%,葡萄卷叶伴随病毒2号、3号混合侵染的样品占总检测样品数的11.0%,且在这些被病毒混合侵染的样品中,有2个样品被葡萄卷叶伴随病毒1号、2号、3号三重侵染。
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关键词
葡萄
卷
叶
病
葡萄
卷
叶
伴随
病毒
1号
葡萄卷叶伴随病毒2
号
葡萄
卷
叶
伴随
病毒
3号
RT-PCR
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职称材料
三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析
被引量：
12
3
作者
王建辉
刘建军
+3 位作者
陈克玲
李洪雯
何建
关斌
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期197-201,共5页
【目的】为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,【方法】比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法。分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析。【结果】结果表明,...
【目的】为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,【方法】比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法。分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析。【结果】结果表明,改进硅胶颗粒吸附法快速从葡萄枝条的韧皮组织中提取了总RNA,并以葡萄18SRNA为内参基因,RT-PCR分别成功扩增出3种病毒的目的片段。把16个地理起源的GLRaV-2分离株的外壳蛋白基因(Coat protein,CP)分成5个系统进化组。而7个地理起源的GVB分离株CP同源性为79.1%～98.7%。此外,5个GVA四川分离株分别位于系统进化树的4个聚类群。【结论】GLRaV-2、GVB和GVA不同地理起源的分离株在核酸水平上具有变异性,其中GVA四川分离株之间具有显著的遗传差异,可能包括4种株系。
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关键词
葡萄
卷
叶
伴随
2型
病毒
葡萄
B
病毒
葡萄
A
病毒
病毒
外壳蛋白基因
病毒
沉默抑制子基因
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职称材料
题名
葡萄卷叶伴随病毒2实时荧光定量RT-PCR技术的检测应用
被引量：
4
1
作者
任芳
张尊平
范旭东
胡国君
张梦妍
董雅凤
机构
中国农业科学院果树研究所
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期180-187,共8页
基金
国家重点研发计划(2019YFD1001800)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-29-bc-1)。
文摘
通过引物筛选和体系优化建立了葡萄卷叶伴随病毒2 Grapevine leafroll-associated virus 2(GLRaV-2)的SYBR GreenⅠ染料法实时荧光定量RT-PCR检测技术。该技术标准曲线扩增效率为102.2%,决定系数为0.999,最低检出限可达10-3稀释梯度,是常规RT-PCR的100倍。对不同季节和不同部位葡萄样品的检出率普遍高于常规RT-PCR。春夏秋季样品检出率分别为67%、89%和86%,比常规RT-PCR检出率分别高42%、28%和17%。冬季休眠枝条检出率最高(100%),与常规RT-PCR相同。夏季老叶柄和卷须、秋季和冬季枝条等样品检测效果最好,检出率均为100%。对来自我国17个省38个品种的116份田间葡萄样品检测结果表明,qRT-PCR共检测到10个样品为阳性,检出率略高于常规RT-PCR。
关键词
葡萄
葡萄卷叶伴随病毒2
实时荧光定量RT-PCR
常规RT-PCR
检测
Keywords
grapevine
Grapevine leafroll-associated virus
2
qRT-PCR
conventional RT-PCR
detection
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
3种葡萄卷叶伴随病毒RT-PCR检测
被引量：
2
2
作者
王仲
刘命华
李捷
李明骏
程玉琴
机构
北京市优质农产品产销服务站
中国农业大学农学与生物技术学院
出处
《中国果树》
北大核心
2012年第4期43-46,I0002,共5页
基金
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-30-bc-1)
文摘
2010—2011年我们对河北省涿鹿、怀来、昌黎、宣化等县(区)以及北京市葡萄卷叶病的发生情况进行了调查,并对采集的葡萄植株样品用RT-PCR方法检测病毒种类。在检测的82个样品中,葡萄卷叶伴随病毒3号(GLRaV-3)的检出率为100.0%,葡萄卷叶伴随病毒1号(GLRaV-1)的检出率为17.1%,葡萄卷叶伴随病毒2号(GLRaV-2)的检出率为11.0%;病毒混合侵染的样品占总检测样品数的28.1%,其中葡萄卷叶伴随病毒1号、3号混合侵染样品占总检测样品数的17.1%,葡萄卷叶伴随病毒2号、3号混合侵染的样品占总检测样品数的11.0%,且在这些被病毒混合侵染的样品中,有2个样品被葡萄卷叶伴随病毒1号、2号、3号三重侵染。
关键词
葡萄
卷
叶
病
葡萄
卷
叶
伴随
病毒
1号
葡萄卷叶伴随病毒2
号
葡萄
卷
叶
伴随
病毒
3号
RT-PCR
分类号
S436.631 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
在线阅读
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职称材料
题名
三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析
被引量：
12
3
作者
王建辉
刘建军
陈克玲
李洪雯
何建
关斌
机构
四川省农业科学院园艺研究所
农业部西南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
四川省农业科学院
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期197-201,共5页
基金
"十二五"四川省财政基因工程:果树生物技术研究与创新(2011JYGC05-018)
文摘
【目的】为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,【方法】比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法。分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析。【结果】结果表明,改进硅胶颗粒吸附法快速从葡萄枝条的韧皮组织中提取了总RNA,并以葡萄18SRNA为内参基因,RT-PCR分别成功扩增出3种病毒的目的片段。把16个地理起源的GLRaV-2分离株的外壳蛋白基因(Coat protein,CP)分成5个系统进化组。而7个地理起源的GVB分离株CP同源性为79.1%～98.7%。此外,5个GVA四川分离株分别位于系统进化树的4个聚类群。【结论】GLRaV-2、GVB和GVA不同地理起源的分离株在核酸水平上具有变异性,其中GVA四川分离株之间具有显著的遗传差异,可能包括4种株系。
关键词
葡萄
卷
叶
伴随
2型
病毒
葡萄
B
病毒
葡萄
A
病毒
病毒
外壳蛋白基因
病毒
沉默抑制子基因
Keywords
Grapevine leafroll associated virus-
2
Grapevine virus B
Grapevine virus A
Coat proteingene
RNA silence suppressor
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
葡萄卷叶伴随病毒2实时荧光定量RT-PCR技术的检测应用
任芳
张尊平
范旭东
胡国君
张梦妍
董雅凤
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
3种葡萄卷叶伴随病毒RT-PCR检测
王仲
刘命华
李捷
李明骏
程玉琴
《中国果树》
北大核心
2012
2
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职称材料
3
三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析
王建辉
刘建军
陈克玲
李洪雯
何建
关斌
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
12
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职称材料
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