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萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种的实时荧光定量PCR检测
被引量：
4
1
作者
李博
李金庆
+1 位作者
尹燕妮
郭坚华
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2007年第5期65-68,共4页
依据萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种(Curtobacterium flaccumfacienspv.beticola)的16S^23S rRNA间隔区ITS序列,设计引物CfbF/CfbR。PCR扩增3个糖甜菜叶斑菌及29个参比菌株,仅靶标菌扩增出191 bp产物。用SYRB Green I荧光染料进行实时荧光...
依据萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种(Curtobacterium flaccumfacienspv.beticola)的16S^23S rRNA间隔区ITS序列,设计引物CfbF/CfbR。PCR扩增3个糖甜菜叶斑菌及29个参比菌株,仅靶标菌扩增出191 bp产物。用SYRB Green I荧光染料进行实时荧光定量PCR检测,制作标准曲线,回归直线决定系数R2为0.99。整个检测过程操作便捷,仅需2 h,可灵敏、特异、定量地对该病原菌进行检测。
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关键词
萎蔫短小杆菌
糖甜菜致病变种
实时荧光定量PCR
标准曲线
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职称材料
菜豆萎蔫病菌的PCR检测技术
被引量：
9
2
作者
张晓梅
林友伟
+1 位作者
吴新华
郭坚华
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期42-45,共4页
根据在GenBank已登录的萎蔫短小杆菌 (Curtobacterium flaccumfaciens)的基因间重复序列 ,用DNAman 5 0软件比较同源性 ,设计了一对引物CffF1和CffR2 ,并以菜豆萎蔫病菌的基因组DNA为模板进行扩增 ,得到了一段长 2 80bp的PCR特异产物...
根据在GenBank已登录的萎蔫短小杆菌 (Curtobacterium flaccumfaciens)的基因间重复序列 ,用DNAman 5 0软件比较同源性 ,设计了一对引物CffF1和CffR2 ,并以菜豆萎蔫病菌的基因组DNA为模板进行扩增 ,得到了一段长 2 80bp的PCR特异产物。参试的其他属如棒形细菌属 (Clavibacter)、节杆菌属 (Arthrobacter)、拉氏杆菌属 (Rathayibac ter)、红球菌属 (Rhodococcus)细菌和萎蔫短小杆菌的其他致病变种 (Cur f pv oortii、Cur f pv poinsettiae、Cur f pv betae) ,以及其他植物病原细菌的基因组DNA均无扩增产物。该检测方法特异性强、灵敏度高 ,在 10
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关键词
菜豆
萎蔫
病菌
PCR
检测技术
萎蔫短小杆菌
基因间重复序列
基因组DNA
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职称材料
氯菊酯微生物手性降解的研究
被引量：
1
3
作者
李森
田晶
+4 位作者
李朝阳
李巧玲
罗湘南
张春晓
李劭彤
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第20期282-284,共3页
通过对河北省石家庄市的黄土进行取样、筛选、分离,得到1株以氯菊酯为唯一碳源的细菌,命名为PM-A,经鉴定为萎蔫短小杆菌(Curtobacterium flaccumfaciens)。此菌对氯菊酯有良好的降解能力,采用一级动力学模拟,半衰期为1.41 d。进一步考...
通过对河北省石家庄市的黄土进行取样、筛选、分离,得到1株以氯菊酯为唯一碳源的细菌,命名为PM-A,经鉴定为萎蔫短小杆菌(Curtobacterium flaccumfaciens)。此菌对氯菊酯有良好的降解能力,采用一级动力学模拟,半衰期为1.41 d。进一步考察对各异构体的降解情况,顺式体和反式体降解差异不明显,对顺式体的1对对映体(1R-cis和1S-cis)降解不存在对映体选择性,对反式体的1对对映体(1R-trans和1S-trans)降解存在明显的对映体选择性。
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关键词
氯菊酯
萎蔫短小杆菌
手性
降解
对映体
对映体选择性
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职称材料
题名
萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种的实时荧光定量PCR检测
被引量：
4
1
作者
李博
李金庆
尹燕妮
郭坚华
机构
南京农业大学植物病理学系
出处
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2007年第5期65-68,共4页
基金
国家自然科学基金(编号:30571211)
国家高技术研究发展计划资助项目(编号:2003AA249020)
文摘
依据萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种(Curtobacterium flaccumfacienspv.beticola)的16S^23S rRNA间隔区ITS序列,设计引物CfbF/CfbR。PCR扩增3个糖甜菜叶斑菌及29个参比菌株,仅靶标菌扩增出191 bp产物。用SYRB Green I荧光染料进行实时荧光定量PCR检测,制作标准曲线,回归直线决定系数R2为0.99。整个检测过程操作便捷,仅需2 h,可灵敏、特异、定量地对该病原菌进行检测。
关键词
萎蔫短小杆菌
糖甜菜致病变种
实时荧光定量PCR
标准曲线
分类号
S435.663 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
菜豆萎蔫病菌的PCR检测技术
被引量：
9
2
作者
张晓梅
林友伟
吴新华
郭坚华
机构
南京农业大学农业部病虫监测与治理重点开放实验室
江苏省出入境检验检疫局
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期42-45,共4页
基金
国家自然科学基金 (3 9970 481)
国家 863计划项目(2 0 0 1AA2 490 2 1)
江苏省出入境检验检疫局项目(KJ15 2 0 0 1)
文摘
根据在GenBank已登录的萎蔫短小杆菌 (Curtobacterium flaccumfaciens)的基因间重复序列 ,用DNAman 5 0软件比较同源性 ,设计了一对引物CffF1和CffR2 ,并以菜豆萎蔫病菌的基因组DNA为模板进行扩增 ,得到了一段长 2 80bp的PCR特异产物。参试的其他属如棒形细菌属 (Clavibacter)、节杆菌属 (Arthrobacter)、拉氏杆菌属 (Rathayibac ter)、红球菌属 (Rhodococcus)细菌和萎蔫短小杆菌的其他致病变种 (Cur f pv oortii、Cur f pv poinsettiae、Cur f pv betae) ,以及其他植物病原细菌的基因组DNA均无扩增产物。该检测方法特异性强、灵敏度高 ,在 10
关键词
菜豆
萎蔫
病菌
PCR
检测技术
萎蔫短小杆菌
基因间重复序列
基因组DNA
Keywords
Curtobacterium flaccumfaciens pv.flaccumfaciens
PCR
detection
分类号
S436.43 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
S41-30 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
氯菊酯微生物手性降解的研究
被引量：
1
3
作者
李森
田晶
李朝阳
李巧玲
罗湘南
张春晓
李劭彤
机构
河北科技大学生物工程学院
河北科技大学理学院
河北科技大学环境工程学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第20期282-284,共3页
基金
河北省自然科学基金(编号:B2014208075)
文摘
通过对河北省石家庄市的黄土进行取样、筛选、分离,得到1株以氯菊酯为唯一碳源的细菌,命名为PM-A,经鉴定为萎蔫短小杆菌(Curtobacterium flaccumfaciens)。此菌对氯菊酯有良好的降解能力,采用一级动力学模拟,半衰期为1.41 d。进一步考察对各异构体的降解情况,顺式体和反式体降解差异不明显,对顺式体的1对对映体(1R-cis和1S-cis)降解不存在对映体选择性,对反式体的1对对映体(1R-trans和1S-trans)降解存在明显的对映体选择性。
关键词
氯菊酯
萎蔫短小杆菌
手性
降解
对映体
对映体选择性
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
X592 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种的实时荧光定量PCR检测
李博
李金庆
尹燕妮
郭坚华
《江苏农业科学》
CSCD
北大核心
2007
4
在线阅读
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职称材料
2
菜豆萎蔫病菌的PCR检测技术
张晓梅
林友伟
吴新华
郭坚华
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
9
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职称材料
3
氯菊酯微生物手性降解的研究
李森
田晶
李朝阳
李巧玲
罗湘南
张春晓
李劭彤
《江苏农业科学》
北大核心
2017
1
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职称材料
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