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四种不同食性鱼类肠道微生物群落组成及多样性比较分析
被引量：
4
1
作者
荣华
谢雨晴
+7 位作者
赵涛
殷红
袁莉芸
刘襄河
杨子寒
石宇
李修峰
张雷
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024年第4期75-85,共11页
本研究旨在探讨食性对鱼类肠道菌群组成和多样性的影响,并预测特定菌群对不同营养素的潜在功能。实验采用高通量16S rRNA基因测序技术,提取获得滇池高背鲫(Carassius auratus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鳜鱼(Siniperca chuatsi...
本研究旨在探讨食性对鱼类肠道菌群组成和多样性的影响,并预测特定菌群对不同营养素的潜在功能。实验采用高通量16S rRNA基因测序技术,提取获得滇池高背鲫(Carassius auratus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鳜鱼(Siniperca chuatsi)、昆明裂腹鱼(Shizothorax grahami) 4种不同食性鱼类的肠道内容物,12个样品的16S rRNA,构建文库并测序,分析这4种鱼类肠道微生物的菌落组成和多样性。结果显示,鱼类肠道菌群多样性受到食性的显著影响(P<0.05),综合表现为杂食性(滇池高倍鲫)>草食性(草鱼)>滤食性(昆明裂腹鱼)>肉食性(鳜鱼)。4种鱼类具有一些相同的优势菌群:变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。然而,优势菌群在属水平上存在一定差异,如不动杆菌属(Acinetobacter)为鳜鱼的优势菌群,拟杆菌属(Bacteroides)为草鱼的优势菌群等。功能预测发现,鳜鱼肠道中以革兰氏阴性菌为主;草鱼抗病潜力略高于其他3种鱼类;约氏不动杆菌(A._johnsonii)、鲁氏不动杆菌(A. lwoffii)和施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)可能有助于宿主对蛋白质的消化,而拟杆菌属中的某些菌群可能有助于宿主消化纤维素。综上所述,食性是影响鱼类肠道菌群组成和多样性差异化的主要因素之一,分析食性与肠道优势菌群之间的关联,探讨特异菌群的功能,可为研究鱼类营养代谢的微生物效应奠定理论基础。
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关键词
食性
肠道微生物
菌群结构和多样性
消化
16S
rRNA
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职称材料
题名
四种不同食性鱼类肠道微生物群落组成及多样性比较分析
被引量：
4
1
作者
荣华
谢雨晴
赵涛
殷红
袁莉芸
刘襄河
杨子寒
石宇
李修峰
张雷
机构
襄阳职业技术学院
昆明海关技术中心
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024年第4期75-85,共11页
基金
云南省农业基础研究联合专项面上项目(2018FG001-044)
云南省基础研究计划面上项目(202201AT070251)
+1 种基金
广东省基础与应用基础研究省市联合基金(2021A1515110179)
湖北省自然科学基金一般面上项目(2023AFB1016)共同资助。
文摘
本研究旨在探讨食性对鱼类肠道菌群组成和多样性的影响,并预测特定菌群对不同营养素的潜在功能。实验采用高通量16S rRNA基因测序技术,提取获得滇池高背鲫(Carassius auratus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鳜鱼(Siniperca chuatsi)、昆明裂腹鱼(Shizothorax grahami) 4种不同食性鱼类的肠道内容物,12个样品的16S rRNA,构建文库并测序,分析这4种鱼类肠道微生物的菌落组成和多样性。结果显示,鱼类肠道菌群多样性受到食性的显著影响(P<0.05),综合表现为杂食性(滇池高倍鲫)>草食性(草鱼)>滤食性(昆明裂腹鱼)>肉食性(鳜鱼)。4种鱼类具有一些相同的优势菌群:变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。然而,优势菌群在属水平上存在一定差异,如不动杆菌属(Acinetobacter)为鳜鱼的优势菌群,拟杆菌属(Bacteroides)为草鱼的优势菌群等。功能预测发现,鳜鱼肠道中以革兰氏阴性菌为主;草鱼抗病潜力略高于其他3种鱼类;约氏不动杆菌(A._johnsonii)、鲁氏不动杆菌(A. lwoffii)和施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)可能有助于宿主对蛋白质的消化,而拟杆菌属中的某些菌群可能有助于宿主消化纤维素。综上所述,食性是影响鱼类肠道菌群组成和多样性差异化的主要因素之一,分析食性与肠道优势菌群之间的关联,探讨特异菌群的功能,可为研究鱼类营养代谢的微生物效应奠定理论基础。
关键词
食性
肠道微生物
菌群结构和多样性
消化
16S
rRNA
Keywords
Feeding habit
Intestinal microorganism
Flora structure and diversity
Digestion
16S rRNA
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
四种不同食性鱼类肠道微生物群落组成及多样性比较分析
荣华
谢雨晴
赵涛
殷红
袁莉芸
刘襄河
杨子寒
石宇
李修峰
张雷
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024
4
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