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不同精料补喂量对准噶尔双峰驼粪便发酵参数和菌群结构的影响
1
作者 李志伟 谢欣杰 +5 位作者 沈宇淞 王卉 许明 臧长江 杨开伦 李凤鸣 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第3期1033-1044,共12页
【目的】探究不同精料补喂量对准噶尔双峰驼粪便发酵参数和菌群结构的影响,以丰富对骆驼消化道发酵特征及菌群的认识。【方法】选取36峰准噶尔双峰驼母驼,随机分为3组,每组12峰,即放牧+补饲粗饲料组(A组),在放牧+补饲粗饲料基础上每峰... 【目的】探究不同精料补喂量对准噶尔双峰驼粪便发酵参数和菌群结构的影响,以丰富对骆驼消化道发酵特征及菌群的认识。【方法】选取36峰准噶尔双峰驼母驼,随机分为3组,每组12峰,即放牧+补饲粗饲料组(A组),在放牧+补饲粗饲料基础上每峰骆驼分别添加精料补充料2和4 kg/d组(B、C组)。试验预试期18 d,正试期42 d。试验第42天采用直肠取粪法采集母驼的粪便样品,用于发酵参数、微生物多样性及菌群结构的检测分析。【结果】①随着精料补喂量的增加,A组双峰驼粪便中异丁酸和异戊酸浓度显著高于B、C组(P<0.05),而戊酸浓度和乙丙比显著低于C组(P<0.05)。②A组双峰驼粪便中Chao1和Observed species指数显著高于C组(P<0.05),精料补喂量增加对其他指数均无显著影响(P>0.05)。③在门水平,3组双峰驼粪便中排名前三的分别为厚壁菌门、拟杆菌门和疣微菌门。A组双峰驼粪便中拟杆菌门相对丰度显著低于B、C组(P<0.05),解糖微小寄生菌门相对丰度则显著高于B、C组(P<0.05);A、B组双峰驼粪便中放线菌门相对丰度显著高于C组(P<0.05)。④在科水平,3组双峰驼粪便中排名前三的分别为瘤胃球菌科、毛螺菌科和拟杆菌科。A组双峰驼粪便中拟杆菌科相对丰度显著高于C组(P<0.05),理研菌科相对丰度显著低于B、C组(P<0.05)。⑤在属水平,3组双峰驼粪便中排名前三的分别为阿克曼菌属、颤螺旋菌属和瘤胃球菌属。A组双峰驼粪便中瘤胃球菌属相对丰度显著高于B、C组(P<0.05),而梭菌属相对丰度显著低于B、C组(P<0.05)。⑥补喂精料时,双峰驼粪便中部分菌群的相对丰度与挥发性脂肪浓度呈显著相关(P<0.05),且随着精料添加量的增加而发生变化。⑦3组双峰驼粪便菌群共检测到7条代谢通路。【结论】本试验条件下,不同精料补喂量显著影响准噶尔双峰驼粪便发酵参数和粪便菌群的丰富度,并改变了菌群结构。研究结果丰富了对骆驼粪便菌群结构的认识。 展开更多
关键词 准噶尔双峰驼 精料补充料 粪便 发酵参数 菌群结构
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种鸽饲粮粗蛋白质水平对乳鸽生长性能、屠宰性能及肠道菌群结构的影响
2
作者 王静 梁贵晨 +3 位作者 付睿 王泽武 臧长江 李凤鸣 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第1期107-120,共14页
[目的]探讨“2+2”(1对亲鸽1个繁殖周期哺育2只乳鸽)生产模式条件下种鸽饲粮粗蛋白质水平对乳鸽生长性能、屠宰性能及肠道微生物菌群及结构的影响。[方法]选取繁殖性能相近的12~18月龄健康哺育期塔里木鸽种鸽60对,共分5个处理组,每个处... [目的]探讨“2+2”(1对亲鸽1个繁殖周期哺育2只乳鸽)生产模式条件下种鸽饲粮粗蛋白质水平对乳鸽生长性能、屠宰性能及肠道微生物菌群及结构的影响。[方法]选取繁殖性能相近的12~18月龄健康哺育期塔里木鸽种鸽60对,共分5个处理组,每个处理组12对种鸽,每对种鸽哺育2只乳鸽,饲喂能量水平为12.64 MJ/kg、粗蛋白质(CP)水平分别为12%、13%、14%、15%、16%的饲粮。预饲期3 d,正式试验期28 d。每3 d测定乳鸽体重,待乳鸽28日龄出雏后,每组选取8只乳鸽进行屠宰,并测定其屠宰性能及空肠肠道菌群结构。[结果](1)种鸽饲粮粗蛋白质水平对乳鸽体重和平均日增重均有显著影响(P<0.05)。乳鸽体重随着日龄增加呈线性增加,乳鸽平均日增重先降低后升高,呈二次曲线变化(P<0.05),其中CP13%组乳鸽平均日增重最大。(2)种鸽饲粮粗蛋白质水平对乳鸽屠宰率、腹脂率、胸肌率和翅膀率均有显著影响(P<0.05),其中CP16%组乳鸽屠宰率显著高于CP13%和CP14%组(P<0.05)。(3)在门水平上,乳鸽肠道菌群各组排名前十的有放线菌门、厚壁菌门、TM7、蓝菌门、变形菌门、拟杆菌门、软壁菌门、OP11、绿弯菌门、芽单胞菌门,其中CP16%组变形菌门相对丰度显著高于CP14%、CP15%组(P<0.05);在科水平上,各组排名前十的有棒状杆菌科、乳杆菌科、红蝽菌科、梭菌科、丹毒丝菌科、肠球菌科、韦荣球菌科、放线菌科、双歧杆菌科、Rs-045,其中CP14%、CP15%、CP16%组红蝽菌科相对丰度显著高于CP12%组(P<0.05),CP14%、CP16%组双歧杆菌科相对丰度显著高于CP12%、CP13%组(P<0.05);在属水平上,各组排名前十的有棒状杆菌属、乳杆菌属、奇异菌属、分节丝状菌属、肠球菌属、韦荣氏球菌属、双歧杆菌属、布雷德菌属、放线菌属、动弯杆菌属,其中CP14%、CP16%组双歧杆菌属相对丰度显著高于CP12%、CP13%组(P<0.05);CP15%、CP16%组奇异菌属相对丰度显著高于CP12%组(P<0.05);CP16%组韦荣氏球菌属相对丰度显著高于CP12%组(P<0.05)。[结论]在本试验条件下,“2+2”生产模式下种鸽饲粮粗蛋白质水平为13%时乳鸽平均日增重最大,屠宰性能较优,种鸽不同粗蛋白质水平饲粮对乳鸽28日龄空肠菌群结构有一定影响。乳鸽生长性能较为适宜的种鸽饲粮粗蛋白质水平为13%。 展开更多
关键词 塔里木鸽 蛋白质水平 生长性能 屠宰性能 菌群结构
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防腐剂对牡蛎中耐药菌群结构的影响
3
作者 宫钰洁 吴书香 +5 位作者 王鹏 姚琳 曲梦 李风铃 王联珠 江艳华 《食品安全质量检测学报》 2025年第3期195-202,共8页
目的探究常用食品防腐剂对牡蛎中耐药共生菌的影响作用。方法以4℃冷藏为对照组,以分别经山梨酸钾、壳聚糖、乳酸链球菌素、ɛ-聚赖氨酸浸泡处理后进行4℃冷藏为实验组,通过耐药平板计数法分析不同食品防腐剂处理后牡蛎中耐药菌含量的变... 目的探究常用食品防腐剂对牡蛎中耐药共生菌的影响作用。方法以4℃冷藏为对照组,以分别经山梨酸钾、壳聚糖、乳酸链球菌素、ɛ-聚赖氨酸浸泡处理后进行4℃冷藏为实验组,通过耐药平板计数法分析不同食品防腐剂处理后牡蛎中耐药菌含量的变化情况,并通过16S rRNA扩增子高通量测序分析耐药菌群结构的变化。结果山梨酸钾与壳聚糖能显著降低单种与多重抗菌药的耐药菌数;乳酸链球菌素能显著降低复方新诺明耐药菌数、氯霉素耐药菌数、庆大霉素耐药菌数和同时耐受2、3、4种药物的耐药菌数;ε-聚赖氨酸能显著降低环丙沙星耐药菌数、复方新诺明耐药菌数、氯霉素耐药菌数、庆大霉素耐药菌数和同时耐受3、4种药物的耐药菌数。山梨酸钾与壳聚糖对四环素与环丙沙星耐药菌群的组成影响较大,乳酸链球菌素与ε-聚赖氨酸对复方新诺明耐药菌群的组成影响较大。结论本研究表明通过应用合适的食品防腐剂可以控制牡蛎中耐药菌的含量,食品防腐剂可以影响牡蛎中可培养耐药菌群的组成且不同防腐剂能抑制特定的抗菌药耐药菌,为建立牡蛎中耐药菌的控制措施提供了新思路。 展开更多
关键词 防腐剂 牡蛎 耐药菌 耐药菌丰度 菌群结构
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青海不同地区传统牦牛酸奶品质差异及菌群结构分析
4
作者 任海佳 吴海玥 +3 位作者 胡蓉 闫忠心 胡博 郭娅慧 《青海畜牧兽医杂志》 2025年第1期16-20,51,共6页
为了解青海省不同地区牦牛酸奶品质的差异和菌群微生物资源,本研究对青海省果洛(G)、玉树(Y)、海北(B)和海南(N)4个地区的24份酸奶样品进行理化特性测定。结果表明,不同地区间牦牛酸奶品质存在差异,果洛(G)和海南(N)地区牦牛酸奶样品的p... 为了解青海省不同地区牦牛酸奶品质的差异和菌群微生物资源,本研究对青海省果洛(G)、玉树(Y)、海北(B)和海南(N)4个地区的24份酸奶样品进行理化特性测定。结果表明,不同地区间牦牛酸奶品质存在差异,果洛(G)和海南(N)地区牦牛酸奶样品的pH和酸度普遍较好,玉树(Y)地区样品的黏度和持水性较高,果洛(G)地区6份样品持水性均达40%以上,海北(B)地区只有B5、B6样品的pH和酸度较好;通过16sRNA测序技术,4个地区牦牛酸奶鉴定出22个门和272个属,其中厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,乳杆菌属(Lactobacillus)和链球菌属(Streptococcus)为G地区的优势菌属,而Y、N和B地区优势菌属均为乳杆菌属。本研究旨在为进一步实现传统发酵乳制品菌种的工业化生产奠定理论基础,为更好地调控牦牛乳发酵产品的品质提供理论科学依据,有效提高青海牦牛乳资源的利用率。 展开更多
关键词 牦牛酸奶 理化特性 菌群结构 高通量测序
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市售真空包装玉米热狗肠生产和贮藏过程中菌群结构变化
5
作者 陈红 焦依帆 +3 位作者 刘梦瑶 张义平 赵丽丽 姜晓冰 《肉类研究》 北大核心 2025年第2期11-17,共7页
为了解和控制市售真空包装玉米热狗肠生产与贮藏过程中的微生物风险水平,利用高通量测序技术和传统的微生物分离纯化技术分析其生产和贮藏过程中的微生物菌群结构变化。结果表明:在玉米热狗肠的生产过程中,微生物种群均以乳杆菌属(Lacto... 为了解和控制市售真空包装玉米热狗肠生产与贮藏过程中的微生物风险水平,利用高通量测序技术和传统的微生物分离纯化技术分析其生产和贮藏过程中的微生物菌群结构变化。结果表明:在玉米热狗肠的生产过程中,微生物种群均以乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、不动杆菌属(Acinetobacter)和魏斯氏菌属(Weissella)为主,对真空包装制品进行二次灭菌后,链球菌属相对丰度变化不大,但乳杆菌属和魏斯氏菌属相对丰度明显降低;随着贮藏时间的延长,玉米热狗肠中的物种丰富度和多样性显著下降(P<0.05),而兼性厌氧或专性厌氧型细菌,如链球菌属中嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)和副血链球菌(Streptococcus parasanguinis)及蛋白分解菌速生热分枝菌(Thermobrachium celere)和解蛋白喜热菌(Caloramator proteoclasticus)共同构成贮藏后期玉米热狗肠中的优势菌群。 展开更多
关键词 真空包装 玉米热狗肠 微生物菌群结构 高通量测序 优势菌群
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高通量测序技术对杀菌型益生菌含乳饮料菌群结构分析 被引量：1
6
作者 俞漪 庄孝飞 《食品安全质量检测学报》 CAS 2024年第2期243-250,共8页
目的分析杀菌型益生菌含乳饮料中菌群组成结构,并探究宣称添加益生菌的真实性和合规性。方法本研究以高通量测序技术为基础,从市售11批次杀菌型益生菌含乳饮料中全基因组提取,进行V3/V4变异区序列的聚合酶链式反应(polymerase chain rea... 目的分析杀菌型益生菌含乳饮料中菌群组成结构,并探究宣称添加益生菌的真实性和合规性。方法本研究以高通量测序技术为基础,从市售11批次杀菌型益生菌含乳饮料中全基因组提取,进行V3/V4变异区序列的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增后,整理及统计样品测序序列数目,操作分类单元(operational taxonomic unit,OUT)归类,生成稀释曲线、Alpha多样性、聚类、丰度分布曲线与分析菌群结构和菌种标示合规性。结果共得到39231条优质序列,分布在210~518 bp范围内;共注解到16个门、37个纲、71个目、129个科、265个属;从门分类水平主要为厚壁菌门(Firmicutes 91.66%),从纲的分类水平主要为芽孢杆菌纲(Bacill 90.43%),从目的分类水平主要为乳杆菌目(Lactobacillales 82.74%);优势菌种为德氏乳杆菌保加利亚亚种、嗜热链球菌;同时产品有检出携带致病性非益生菌菌群。11种产品标签标示与实际检测到菌株完全一致的仅有1批次。结论本研究建立的高通量测序技术能准确、快速地探究杀菌型益生菌含乳饮料中微生物菌群多样性和潜在的致病性,市售产品益生菌种类丰富,但同质化程度较高,产品间菌群分布均匀度差异大。 展开更多
关键词 益生菌 杀菌型 高通量测序技术 菌群结构
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乳酸片球菌对初生肉仔鸡盲肠菌群结构的影响
7
作者 王轶男 胡诗悦 +2 位作者 金春梅 金一 于龙政 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期10-17,共8页
【目的】为探究乳酸片球菌对初生肉仔鸡盲肠菌群结构的影响。【方法】从1日龄开始在饲料中添加乳酸片球菌对肉仔鸡进行饲喂,在第21天和第42天,取肉仔鸡盲肠内容物,通过对盲肠肠道微生物16S rDNA基因V3+V4区高通量测序,检测饲喂乳酸片球... 【目的】为探究乳酸片球菌对初生肉仔鸡盲肠菌群结构的影响。【方法】从1日龄开始在饲料中添加乳酸片球菌对肉仔鸡进行饲喂,在第21天和第42天,取肉仔鸡盲肠内容物,通过对盲肠肠道微生物16S rDNA基因V3+V4区高通量测序,检测饲喂乳酸片球菌后对初生肉仔鸡盲肠菌群结构的变化。【结果】各组42 d时的Chao1指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数均高于21 d时其指数,21 d时各试验组的OTU数目、Chao1指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数均高于对照组;通过PCoA分析和NMDS分析发现,各组在21 d时散在分布聚类,42 d时各中部明显聚类;试验组与对照组相比降低了变形菌门的相对丰度,提高了厚壁菌门、拟杆菌属、巨细胞菌属、另枝杆菌的相对丰度;通过LEfSe分析显示21 d和42 d时各组存在差异微生物,可见不同试验组肉仔鸡肠道微生物在结构和组成上相对稳定但存在差异。【结论】饲喂乳酸片球菌可以提高初生肉仔鸡盲肠菌群的丰度和多样性,在一定程度上促进有益菌群数量的增加。 展开更多
关键词 乳酸片球菌 生长性能 菌群结构
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甘露醇对放牧绵羊瘤胃、粪便菌群结构以及血清抗氧化和免疫指标的影响
8
作者 晓敏 阿拉达尔 弓剑 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2860-2870,共11页
【目的】探讨甘露醇对放牧绵羊瘤胃、粪便微生物菌群及血清抗氧化、免疫指标的影响。【方法】选择7~8月龄、初始体重相近(27.10 kg±3.55 kg)的健康绵羊10只,采用单因素完全随机试验设计分为两组,每组5只。对照组绵羊补饲不添加甘... 【目的】探讨甘露醇对放牧绵羊瘤胃、粪便微生物菌群及血清抗氧化、免疫指标的影响。【方法】选择7~8月龄、初始体重相近(27.10 kg±3.55 kg)的健康绵羊10只,采用单因素完全随机试验设计分为两组,每组5只。对照组绵羊补饲不添加甘露醇的玉米面100 g/d,试验组补饲添加1 g甘露醇的玉米面100 g/d。在自然放牧条件下饲喂35 d,其中预试期5 d,正试期30 d。在正试期开始和结束日放牧前称体重,计算平均日增重(ADG);在试验结束日放牧前分别采集瘤胃液、粪便及颈静脉血液,采用16S rRNA测序方法分析瘤胃及粪便微生物区系;采用相关试剂盒测定血清抗氧化和免疫指标。【结果】与对照组相比,(1)试验组绵羊ADG、瘤胃液pH和氨态氮(NH_(3)-N)含量均无显著差异(P>0.05);瘤胃液的总短链脂肪酸(SCFAs)、乙酸和丙酸浓度均显著提高(P<0.05)。(2)试验组绵羊瘤胃及粪便微生物OTU数目、Alpha多样性指数均无显著差异(P>0.05);瘤胃及粪便微生物基于abund_jaccard近似距离的PCoA均显著分离(P<0.05)。(3)在门水平上,试验组绵羊瘤胃微生物无显著差异(P>0.05),粪便中厚壁菌门相对丰度显著降低(P<0.05),拟杆菌门相对丰度显著提高(P<0.05);在属水平上,试验组绵羊瘤胃中瘤胃球菌科NK4A214相对丰度显著高于对照组(P<0.05),粪便中未分类的毛螺菌科相对丰度显著降低(P<0.05)。(4)试验组绵羊血清免疫相关指标均无显著差异(P>0.05),血清谷胱甘肽(GSH)和丙二醛(MDA)含量显著降低(P<0.05)。【结论】在放牧条件下补饲甘露醇可提高绵羊瘤胃液乙酸、丙酸和总SCFAs浓度和瘤胃中瘤胃球菌科NK4A214相对丰度;使粪便中厚壁菌门和未分类的毛螺菌科相对丰度降低,拟杆菌门相对丰度提高;提高机体抗氧化能力。 展开更多
关键词 甘露醇 放牧绵羊 菌群结构 免疫 抗氧化
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嗜酸乳杆菌对3种弧菌的拮抗效果及对凡纳滨对虾肠道菌群结构的影响 被引量：2
9
作者 刘钢 胡晓娟 +4 位作者 苏浩昌 徐武杰 徐煜 文国樑 曹煜成 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期83-91,共9页
使用益生菌是预防和控制水产养殖细菌感染的非抗生素方法之一。嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)可在机体内分泌抗菌物质,具有抑制有害菌生长、调节肠道微生态平衡和增强抗毒抗病能力等功能。研究了不同氧环境和不同培养基条件下... 使用益生菌是预防和控制水产养殖细菌感染的非抗生素方法之一。嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)可在机体内分泌抗菌物质,具有抑制有害菌生长、调节肠道微生态平衡和增强抗毒抗病能力等功能。研究了不同氧环境和不同培养基条件下嗜酸乳杆菌、副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、哈维氏弧菌(V.harveyi)、溶珊瑚弧菌(V.coral-liilyticus)的生长情况,并通过牛津杯法和液体培养法结合PCR荧光定量技术、高通量测序技术,系统评价了嗜酸乳杆菌对上述弧菌的拮抗效果及对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肠道菌群的组成和变化的影响。结果显示,在厌氧条件下,哈维氏弧菌的菌量显著高于在好氧环境培养后的菌量(P<0.05)。不同培养基配比对4种细菌的生长均具有显著性影响(P<0.05)。嗜酸乳杆菌对3种弧菌的生长均有良好的抑制效果。在对虾肠道菌群背景下,嗜酸乳杆菌对副溶血弧菌的生长有显著抑制作用(P<0.05)。处理组的弧菌属比例较对照组显著减少,高菌量组的有益菌属均显著增加。研究表明,嗜酸乳杆菌对上述3种弧菌的生长有良好的抑制效果,在对虾肠道菌群背景下对副溶血弧菌的生长也有良好的抑制效果,且能够优化菌群结构。 展开更多
关键词 嗜酸乳杆菌 弧菌 拮抗 凡纳滨对虾 肠道菌群结构
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高通量测序解析契达奶酪在加工过程中菌群结构多样性变化 被引量：1
10
作者 孙蒙 刘璐 +4 位作者 谭心 王众 王永顺 李晓东 张秀秀 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2024年第6期161-168,共8页
为明确契达奶酪加工过程中的菌群结构,本研究采用高通量测序技术分析契达奶酪在加工过程中(巴氏杀菌后、凝乳和成熟0、30、60和90 d)三个阶段的菌群结构。结果表明,契达奶酪加工过程中各阶段微生物群落结构差异较大。巴氏杀菌后,微生物... 为明确契达奶酪加工过程中的菌群结构,本研究采用高通量测序技术分析契达奶酪在加工过程中(巴氏杀菌后、凝乳和成熟0、30、60和90 d)三个阶段的菌群结构。结果表明,契达奶酪加工过程中各阶段微生物群落结构差异较大。巴氏杀菌后,微生物群落多样性和丰度均为最高(Chao1和Shannon指数平均值分别为6.09和1415.78);在属水平上,巴氏杀菌后的优势菌群为寡养单胞菌属(Stenotrophomonas,21.04%),在凝乳和成熟阶段菌群结构比较相似,乳球菌属(Lactococcus)为两阶段的绝对优势菌群,丰度平均值达85%以上;在成熟期内,乳球菌属的相对丰度呈先上升后下降的趋势;巴氏杀菌后的奶酪体系中菌群结构与其他组相比差异较大,并且随着成熟期的延长,各组菌群结构变化较小。该研究为明确契达奶酪菌群结构提供依据,对契达奶酪的微生物组信息扩充具有参考价值。 展开更多
关键词 契达奶酪 加工 高通量测序 菌群结构
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福建东吾洋海域海水和沉积物菌群结构及其与环境因子相关性 被引量：1
11
作者 张铭洋 李昊 +9 位作者 王印庚 马翠萍 陈夫山 黄强 廖梅杰 李彬 王锦锦 葛建龙 荣小军 王与凡 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第2期186-198,共13页
福建东吾洋海域是我国刺参(Apostichopus japonicus)吊笼养殖的核心产区,但目前该地区的水域环境现状和环境菌群结构相关研究匮乏。本研究以东吾洋海域东安、马坑、雷江和沙湾4个主要养殖区域为对象,完成了海参养殖高峰期1月的水质环境... 福建东吾洋海域是我国刺参(Apostichopus japonicus)吊笼养殖的核心产区,但目前该地区的水域环境现状和环境菌群结构相关研究匮乏。本研究以东吾洋海域东安、马坑、雷江和沙湾4个主要养殖区域为对象,完成了海参养殖高峰期1月的水质环境因子调查和评价分析,采用高通量测序方法完成了水体和沉积物菌群多样性和差异特征菌群分析,解析了环境因子与菌群结构相关性。结果表明,马坑海域的富营养化指数为21.60,属于严重富营养化;东安和雷江海域属于重度富营养,只有沙湾海域处于中度富营养的水平。东安和沙湾海域水质属于轻度有机污染,而马坑和雷江海域属于中度有机污染。高通量测序共获得1 520个操作分类单元(operational taxonomic units, OTUs),归属于28门、57纲、163目、322科、581属。菌群结构多样性分析表明,各区域沉积物的菌群多样性水平均显著高于相应海域水体菌群多样性,且具有较强的空间异质性。沙湾海域环境菌群多样性与丰度最高。PCo A分析表明,沉积物和水体中细菌群落结构差异极显著,水体交换和海域位置对其水体和沉积物菌群结构的影响较大。具有潜在致病性的弧菌科(Vibrionaceae)在所有水体和沉积物样本中均为优势种类之一。对水体样品和沉积物样品的LEFSe(line discriminant analysis effect size)分析筛选到处于不同分类水平的74个特异菌群。基因功能的预测和COG分类统计表明,水体与沉积物样品在12个代谢途径上存在显著差异(P<0.05)。对4个海区的水体菌群LEFSe分析筛选到处于不同分类水平的30个特异菌群。水体的菌群与环境因子的RDA分析揭示,温度、溶氧、叶绿素a浓度是影响不同海域水体菌群结构的主要环境因子,相关研究将为福建刺参养殖管理提供基础数据和科学参考。 展开更多
关键词 东吾洋海域 刺参吊笼养殖 环境评价 菌群结构分析
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热应激对山羊粪便菌群结构及代谢产物的影响
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作者 王常童 杨连弟 +4 位作者 殷丽 王乐 张进 左福元 黄文明 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3288-3300,共13页
[目的]研究热应激对山羊粪便菌群结构及代谢产物的影响。[方法]选择6只12月龄、体重(28.4±3.2)kg的大足黑山羊成年阉公羊,采用单因子自身对照试验设计,先后接受重度热应激(H组,温湿度指数(THI)=91)、中度热应激(M组,THI=84)和无热... [目的]研究热应激对山羊粪便菌群结构及代谢产物的影响。[方法]选择6只12月龄、体重(28.4±3.2)kg的大足黑山羊成年阉公羊,采用单因子自身对照试验设计,先后接受重度热应激(H组,温湿度指数(THI)=91)、中度热应激(M组,THI=84)和无热应激(L组,THI=71)3个阶段的处理,各阶段处理15 d,过渡期7 d。于各阶段的最后1 d 14:00采集直肠粪便用于微生物16S rRNA测序分析和代谢组学分析。[结果]3个处理组山羊粪便菌群多样性无显著差异(P>0.05)。与L组相比,H和M组山羊粪便拟杆菌门相对丰度显著降低(P<0.05),变形菌门相对丰度显著升高(P<0.05);克里斯滕森菌科R-7属、狭窄梭状芽孢杆菌1属、梭菌家族XⅢAD3011属等相对丰度显著升高(P<0.05),拟杆菌属、未编码_f_毛螺菌属等相对丰度显著降低(P<0.05);粪便中的莠去津、胆酸、牛磺胆酸盐、油酸、贯叶金丝桃素、牛磺胆酸等物质的含量显著增加(P<0.05),脯氨酸-丙氨酸、精氨酸-苏氨酸、高藜芦酸等物质的含量显著降低(P<0.05);热应激条件下粪便中的差异代谢物显著富集在牛磺酸和亚牛磺酸代谢、ABC转运蛋白、谷胱甘肽代谢及紧密连接等通路(P<0.05)。[结论]热应激导致山羊粪便菌群结构改变,不利于山羊肠道健康;还使精氨酸和初级胆汁酸的生物合成代谢通路上调,有助于山羊适应高湿热环境;导致山羊代谢物中有毒物质含量提高,可能对肠道屏障和神经系统造成损伤。 展开更多
关键词 山羊 热应激 粪便菌群结构 代谢产物
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大蒜汁对东北酸菜发酵中细菌菌群结构的影响
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作者 孙全敏 王严 +4 位作者 王晓辉 贾倩雯 李田田 迟乃玉 张庆芳 《中国食品添加剂》 CAS 2024年第4期153-162,共10页
为研究大蒜汁对酸菜发酵中细菌菌群结构的影响,首先对不同浓度蒜汁的抑菌性及对L.pentosus DY2-7生长的影响进行研究,确定酸菜发酵的蒜汁添加量,然后以自然发酵酸菜为对照添加蒜汁发酵,对发酵过程中的理化指标(pH、总酸、亚硝酸盐)进行... 为研究大蒜汁对酸菜发酵中细菌菌群结构的影响,首先对不同浓度蒜汁的抑菌性及对L.pentosus DY2-7生长的影响进行研究,确定酸菜发酵的蒜汁添加量,然后以自然发酵酸菜为对照添加蒜汁发酵,对发酵过程中的理化指标(pH、总酸、亚硝酸盐)进行监测;利用16S rRNA高通量测序技术对发酵后期酸菜样品中细菌菌群结构进行分析。结果表明:蒜汁的抑菌性随蒜汁浓度增大而增强,0.3%左右蒜汁可能对L.pentosus DY2-7的生长有益,0.6%有显著抑制作用;添加0.3%蒜汁发酵能抑制高“亚硝峰”出现,提高微生物物种丰富度和多样性,显著增加Lactiplantibacillus、Leuconostoc的丰度,显著降低Lactococcus、Pseudomonas的丰度,不会对发酵酸菜中微生物的功能造成显著影响。 展开更多
关键词 大蒜汁 酸菜 亚硝酸盐 菌群结构
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老面传代发酵过程中细菌菌群结构及其功能预测
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作者 吴庆 杨小萍 +1 位作者 辛世华 方海田 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第4期152-157,共6页
该研究以老面为研究对象,采用高通量测序技术解析了老面传代1代(SD1)、2代(SD2)和4代(SD3)发酵过程中的细菌菌群多样性,对高通量测序结果进行α多样性及β多样性分析,并对其细菌菌群进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果表... 该研究以老面为研究对象,采用高通量测序技术解析了老面传代1代(SD1)、2代(SD2)和4代(SD3)发酵过程中的细菌菌群多样性,对高通量测序结果进行α多样性及β多样性分析,并对其细菌菌群进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果表明,老面样品共获得538981条优化序列,得到495个操作分类单元(OTU);从SD1到SD3代的优势菌门依次为厚壁菌门(Firmicutes)、蓝藻菌门(Cyanobacteria)和变形菌门(Proteobacteria);优势菌属均为乳杆菌属(Lactobacillus);优势菌种均为旧金山乳杆菌(Lactobacillus sanfranciscensis)、干酪乳杆菌(L.sakei)、短乳杆菌(L.brevis)和加氏乳杆菌(L.gasseri);优势菌门、属和种的平均相对含量变化不显著(P>0.05)。β多样性分析表明,老面传代发酵过程中细菌群落结构较为相似,丰度变化不显著(P>0.05)。从SD1到SD3老面样品中细菌菌群主要功能为碳水化合物代谢,其次为维生素及辅酶因子代谢、分子排序、结构折叠与降解、氨基酸代谢,磷酸戊糖途径是最主要的三级代谢功能。 展开更多
关键词 老面 传代发酵 高通量测序 细菌菌群结构 基因功能预测
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饲粮添加赖氨酸对肉牛粪便发酵参数和微生物菌群结构的影响
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作者 龙唐晖 詹彦波 +5 位作者 廖观香 陈新锋 张健 李艳娇 欧阳克蕙 邱清华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2042-2049,共8页
本试验旨在探究饲粮中添加赖氨酸对肉牛粪便发酵参数、微生物多样性和菌群结构的影响。选取4头健康、体重相近的锦江牛,随机分为2组,每组2头,采用有重复的2×2拉丁方设计,对照组饲喂基础饲粮,处理组饲喂基础饲粮+0.20%赖氨酸。试验... 本试验旨在探究饲粮中添加赖氨酸对肉牛粪便发酵参数、微生物多样性和菌群结构的影响。选取4头健康、体重相近的锦江牛,随机分为2组,每组2头,采用有重复的2×2拉丁方设计,对照组饲喂基础饲粮,处理组饲喂基础饲粮+0.20%赖氨酸。试验期30 d,分2期进行,每期前10 d为适应期,后5 d为采样期。采集粪便样品进行发酵参数和微生物多样性及菌群结构的检测分析。结果显示:1)饲粮添加赖氨酸显著提高了粪便中异丁酸、异戊酸和支链挥发性脂肪酸的含量(P<0.05);2)饲粮添加赖氨酸对粪便微生物的丰富度和均匀度均没有显著影响(P>0.05);3)物种注释发现,饲粮添加赖氨酸显著提高了粪便中毛螺菌科NK4A136群(Lachnospiraceae NK4A136 group)的相对丰度,降低了克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae R-7 group)的相对丰度(P<0.05);4)主坐标分析(PCoA)和相似性分析(ANOSIM)均显示,添加赖氨酸对粪便微生物群落结构无显著影响。综上,饲粮中添加0.20%赖氨酸可以提高锦江牛粪便中异丁酸、异戊酸和支链挥发性脂肪酸的含量,同时改变毛螺菌科NK4A136群和克里斯滕森菌科R-7群的相对丰度,但对微生物多样性和群落结构无显著影响。 展开更多
关键词 赖氨酸 粪便 发酵参数 微生物多样性 菌群结构
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山西老陈醋乳酸菌菌群结构及优良菌株的风味代谢特征
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作者 施明丽 张钰婧 +5 位作者 任晓荣 张慧如 郭鑫磊 李云龙 张晓宇 许女 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第7期66-72,共7页
该研究采用Illumina Miseq高通量测序技术和传统可培养技术分析山西老陈醋大曲、酒醪和醋醅中的乳酸菌菌群结构,并通过传统培养分离技术从中分离筛选产酸性能优良的乳酸菌菌株,采用高效液相色谱(HPLC)及顶空固相微萃取气质联用(HS-SPME-... 该研究采用Illumina Miseq高通量测序技术和传统可培养技术分析山西老陈醋大曲、酒醪和醋醅中的乳酸菌菌群结构,并通过传统培养分离技术从中分离筛选产酸性能优良的乳酸菌菌株,采用高效液相色谱(HPLC)及顶空固相微萃取气质联用(HS-SPME-GC-MS)技术分析其在不同模拟培养基中的风味代谢特征。结果表明,大曲的主要乳酸菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和片球菌属(Pediococcus),酒精和醋酸发酵阶段主要乳酸菌属为魏斯氏菌属(Weissella)、乳杆菌属和片球菌属。共筛选出10株高产酸[总酸(8.26~24.30 g/L)和不挥发性酸(5.60~15.3 g/L)]的优良乳酸菌,经鉴定,4株为植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum),2株为短乳杆菌(Lactobacillus brevis),2株为戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus),1为株乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)和1株为耐久肠球菌(Enterococcus durable)。10株乳酸菌菌株在MRS液体培养基和模拟醋醅培养基中代谢产生的有机酸总量和乳酸含量均较高;从4种模拟培养基中共检测出100种挥发性风味成分,菌株在大麦豌豆培养基和模拟醋醅培养基(除乳酸片球菌L729)中代谢产生的挥发性风味物质总量较高;其中,植物乳植杆菌L19具有优良风味代谢特性。 展开更多
关键词 山西老陈醋 乳酸菌 菌群结构 分离 鉴定 有机酸 挥发性风味物质
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补饲对冷季放牧娟犏牛瘤胃菌群结构的影响 被引量：1
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作者 车陇杰 魏立明 +3 位作者 薛瑞林 石红梅 石斌刚 魏晓云 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第4期45-54,共10页
为了探讨冷季补饲对娟犏牛瘤胃菌群的影响,选取14头5岁龄体况良好的娟犏母牛进行补饲,补饲前记为BQ组,补饲后记为BH组,试验期5个月,并在补饲前、后各采集14例瘤胃液样本进行16S rRNA测序。结果显示,28例瘤胃液样本共获得3581307条原始序... 为了探讨冷季补饲对娟犏牛瘤胃菌群的影响,选取14头5岁龄体况良好的娟犏母牛进行补饲,补饲前记为BQ组,补饲后记为BH组,试验期5个月,并在补饲前、后各采集14例瘤胃液样本进行16S rRNA测序。结果显示,28例瘤胃液样本共获得3581307条原始序列(Raw reads),质控后得到3580024条有效序列(Clean reads)。其中,有效标注(Tags)为2994663条,平均有效率在83.27%~83.95%之间。另外,BQ组和BH组的娟犏牛瘤胃中共同存在1275个OTUs,单独的OTUs分别有259个和317个。补饲后娟犏牛瘤胃中变形菌门(Proteobacteria)、脱硫杆菌门(Desulfobacterota)和热原体门(Thermoplasmatota)的相对丰度显著提高(P<0.05)。在属水平,BH组不动杆菌属(Acinetobacter)、丛毛单胞菌属(Comamonas)和赖氨酸芽孢杆菌属(Lysinibacillus)的相对丰度明显高于BQ组(P<0.05)。PICRUST2分析结果表明,27个代谢相关通路在BQ组和BH组之间差异显著(P<0.05),其中氨基酸代谢平均丰度最高,其次是辅因子、维生素代谢和碳水化合物代谢。综上所述,冷季补饲可提高娟犏牛瘤胃中代谢相关菌群的丰度,进而改善冷季放牧娟犏牛的营养平衡状况。 展开更多
关键词 补饲 娟犏牛 瘤胃 菌群结构
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桑叶提取物对生长猪粪便微生物菌群结构的影响
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作者 唐佳希 陈晨 +9 位作者 崔清明 冯小花 邓东艳 邓缘 李华丽 任慧波 朱吉 胡雄贵 田科雄 刘莹莹 《猪业科学》 2024年第8期74-77,共4页
0引言本研究旨在探索桑叶提取物(MLE)对生长猪粪便微生物多样性和菌群结构的影响。试验选取120头体况健康的宁乡猪杂交F1代(杜洛克×宁乡猪),初始体重为23.71±2.93kg,随机分为2个组,每组6个重复,每个重复10头猪。对照组饲喂基... 0引言本研究旨在探索桑叶提取物(MLE)对生长猪粪便微生物多样性和菌群结构的影响。试验选取120头体况健康的宁乡猪杂交F1代(杜洛克×宁乡猪),初始体重为23.71±2.93kg,随机分为2个组,每组6个重复,每个重复10头猪。对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加0.10%MLE。 展开更多
关键词 桑叶提取物 宁乡猪 菌群结构 生长猪 基础饲粮 初始体重 微生物多样性 MLE
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可降解PLA/PBAT塑料的微生物菌群结构研究
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作者 裴雯玉 江雨韩 +2 位作者 李娜 陈怡 吴弘 《安徽农业科学》 CAS 2024年第4期57-61,70,共6页
为探究PLA/PBAT复合材料在菌群处理下的降解情况,加快该塑料的生物降解速率。通过富集培养法筛选获得不同批次的可降解菌群,基于失重法评估不同批次菌群对于PLA/PBAT复合材料的降解能力,并利用高通量测序分析批次间微生物的结构特点。... 为探究PLA/PBAT复合材料在菌群处理下的降解情况,加快该塑料的生物降解速率。通过富集培养法筛选获得不同批次的可降解菌群,基于失重法评估不同批次菌群对于PLA/PBAT复合材料的降解能力,并利用高通量测序分析批次间微生物的结构特点。结果发现,通过多轮富集后,在相同的处理周期内,PLA/PBAT塑料的失重率由2.52%提高到4.93%。转接多批次后在门分类水平上菌群丰度最高的5个菌门分别为拟杆菌门、浮霉菌门、变形菌门、装甲菌门和绿弯菌门,占比超过95.00%;在属水平上,丰度较高的分别为拟杆菌门OPB56属和浮霉菌门SH-PL14属。微生物群落结构随着不断的转接而趋于稳定。 展开更多
关键词 PLA/PBAT塑料 失重率 高通量测序 菌群结构
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花斑病对中华鲟皮肤黏膜层微生物菌群结构的影响
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作者 田甜 张建明 +2 位作者 张德志 朱欣 李洋 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期186-192,共7页
花斑病是近年来中华鲟(Acipenser sinensis)养殖过程中出现的一种新型疾病。为探索用于监测中华鲟健康状况的菌群标志物,通过高通量测序,分析比较了健康和患花斑病中华鲟幼鱼皮肤黏膜层微生物菌群的结构特征。结果显示,与健康中华鲟相比... 花斑病是近年来中华鲟(Acipenser sinensis)养殖过程中出现的一种新型疾病。为探索用于监测中华鲟健康状况的菌群标志物,通过高通量测序,分析比较了健康和患花斑病中华鲟幼鱼皮肤黏膜层微生物菌群的结构特征。结果显示,与健康中华鲟相比,患病中华鲟皮肤黏膜层微生物多样性和丰富度均显著下降(p<0.001)。在属分类水平上,健康中华鲟皮肤黏膜层的优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、norank_f_Muribaculaceae、明串珠菌属(Leuconostoc)和假单胞菌属(Pseudomonas);患病中华鲟皮肤黏膜层的优势菌属为黄杆菌属(Flavobacterium)和不动杆菌属,其中黄杆菌属占比78.38%。通过差异显著性分析,获得了5种反映中华鲟健康状态的敏感菌群。研究表明,与健康中华鲟相比,花斑病破坏了中华鲟皮肤黏膜层正常的微生态稳态结构,优势菌群由乳杆菌属、不动杆菌属等转变为黄杆菌属;因此黄杆菌属可作为监测中华鲟花斑病病原的菌群标志物,其相对丰度可用于评估中华鲟的患病风险。 展开更多
关键词 中华鲟 花斑病 高通量测序 皮肤黏膜层 菌群结构
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