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基于人工智能的药物人体肠道吸收性质预测
被引量：
1
1
作者
濮澄韬
顾灵茜
+1 位作者
陈兴晔
张艳敏
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期355-362,共8页
人体肠道吸收性(human intestinal absorption,HIA)是衡量药物口服生物利用度的重要标志之一。利用人工智能方法在药物发现早期对药物的HIA进行预测评估,能够加速药物发现过程并且降低成本。本研究分别使用分子模拟软件MOE(molecular op...
人体肠道吸收性(human intestinal absorption,HIA)是衡量药物口服生物利用度的重要标志之一。利用人工智能方法在药物发现早期对药物的HIA进行预测评估,能够加速药物发现过程并且降低成本。本研究分别使用分子模拟软件MOE(molecular operating environment)的2D、3D描述符和ECFP4(extended connectivity fingerprints)对分子进行表征,针对2061条HIA数据建立支持向量机(SVM)、随机森林(RF)、深度神经网络(DNN)等8种模型。结果表明,基于2D、3D描述符和ECFP4指纹的组合描述符构建的SVM模型在各项评价指标上进行综合评价后是最优的,最优模型的受试者工作特征曲线下面积(AUC)、马修斯系数和Kappa系数分别为0.94,0.75及0.74。综上,本研究建立一个鲁棒性高、泛化能力强的预测HIA性质的机器学习模型,该模型可以用于为药物药代动力学性质研究提供指导及早期的分子筛选。
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关键词
人体肠道吸收
药代动力学性质
机器学习
深度神经网络
分类模型
人工智能
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职称材料
有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法
被引量：
13
2
作者
王艳玲
李婕
王任小
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010年第7期1742-1754,共13页
有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中...
有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中应用较多的计算有机化合物脂水分配系数和溶解度的理论方法主要有片段加合法和基于描述符的方法.本文总结了这两大类方法的优缺点以及在该领域中未来可能的发展方向.
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关键词
溶解度
脂水分配系数
药代动力学性质
logP/logD
LOGS
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职称材料
题名
基于人工智能的药物人体肠道吸收性质预测
被引量：
1
1
作者
濮澄韬
顾灵茜
陈兴晔
张艳敏
机构
中国药科大学理学院
出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期355-362,共8页
文摘
人体肠道吸收性(human intestinal absorption,HIA)是衡量药物口服生物利用度的重要标志之一。利用人工智能方法在药物发现早期对药物的HIA进行预测评估,能够加速药物发现过程并且降低成本。本研究分别使用分子模拟软件MOE(molecular operating environment)的2D、3D描述符和ECFP4(extended connectivity fingerprints)对分子进行表征,针对2061条HIA数据建立支持向量机(SVM)、随机森林(RF)、深度神经网络(DNN)等8种模型。结果表明,基于2D、3D描述符和ECFP4指纹的组合描述符构建的SVM模型在各项评价指标上进行综合评价后是最优的,最优模型的受试者工作特征曲线下面积(AUC)、马修斯系数和Kappa系数分别为0.94,0.75及0.74。综上,本研究建立一个鲁棒性高、泛化能力强的预测HIA性质的机器学习模型,该模型可以用于为药物药代动力学性质研究提供指导及早期的分子筛选。
关键词
人体肠道吸收
药代动力学性质
机器学习
深度神经网络
分类模型
人工智能
Keywords
human intestinal absorption
pharmacokinetic properties
machine learning
deep neural networks
classification model
artificial intelligence
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
R911 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法
被引量：
13
2
作者
王艳玲
李婕
王任小
机构
中国科学院上海有机化学研究所、生命有机化学国家重点实验室
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010年第7期1742-1754,共13页
基金
国家高技术研究发展计划(863)(2006AA02Z337)
“重大新药创制”科技重大专项(2009ZX09501-002)资助~~
文摘
有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中应用较多的计算有机化合物脂水分配系数和溶解度的理论方法主要有片段加合法和基于描述符的方法.本文总结了这两大类方法的优缺点以及在该领域中未来可能的发展方向.
关键词
溶解度
脂水分配系数
药代动力学性质
logP/logD
LOGS
Keywords
Solubility
Octanol-water partition coefficient
Pharmacokinetic property
logP/logD
logS
分类号
O645.12 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于人工智能的药物人体肠道吸收性质预测
濮澄韬
顾灵茜
陈兴晔
张艳敏
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法
王艳玲
李婕
王任小
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010
13
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职称材料
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