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SYBR Green II荧光定量PCR结合熔解曲线鉴别不同亚型兔病毒性出血症病毒方法的建立 被引量:3
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作者 谭永贵 刘腾 +7 位作者 朱杰 郭慧敏 吴巧梅 李琦 缪秋红 陈宗艳 李传峰 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2017年第1期7-11,共5页
本研究建立了一种荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR)结合熔解曲线区分不同亚型兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)方法。根据GenBank数据库中已公布的不同亚型RHDV(经典RHDV和RHDV2)的衣... 本研究建立了一种荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR)结合熔解曲线区分不同亚型兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)方法。根据GenBank数据库中已公布的不同亚型RHDV(经典RHDV和RHDV2)的衣壳蛋白VP60序列保守区设计了1对特异性引物,利用SYBR Green II荧光染料,在实时荧光定量PCR方法的基础上结合熔解曲线进行分析,经典RHDV和RHDV2熔解温度(Tm)分别为(86.3±0.1)℃和(85.1±0.1)℃,扩增产物的熔解曲线分析均只出现单特异峰。结果表明,本研究建立的方法能够快速地鉴别经典RHDV和RHDV2。 展开更多
关键词 兔病毒性出血症病毒 荧光定量pcr 熔解曲线 鉴别
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一种基于熔解曲线的实时荧光定量PCR仪校准方法 被引量:7
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作者 崔宏恩 张超 姚绍卫 《中国测试》 CAS 北大核心 2018年第A01期22-28,共7页
针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光... 针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光定量PCR仪校准方法进行分析。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 熔解曲线 熔解温度
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基于荧光熔解曲线模式RT-PCR快速检测H_5N_1亚型禽流感病毒 被引量:1
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作者 岳华 李明义 +3 位作者 马莉 汤承 张兆敏 张斌 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期116-121,共6页
针对H5N1亚型禽流感病毒(AIV)的HA、NA基因保守序列设计2对引物,建立了SYBR GreenⅠ双重荧光RT-PCR(RRT-PCR)方法,实现了同一反应管内同时检测AIV的H5和N1亚型基因。熔解曲线分析显示,H5和N1扩增片段的熔解温度分别为(79.5±0.3)℃... 针对H5N1亚型禽流感病毒(AIV)的HA、NA基因保守序列设计2对引物,建立了SYBR GreenⅠ双重荧光RT-PCR(RRT-PCR)方法,实现了同一反应管内同时检测AIV的H5和N1亚型基因。熔解曲线分析显示,H5和N1扩增片段的熔解温度分别为(79.5±0.3)℃和(83.3±0.3)℃,无引物二聚体形成,扩增产物片段大小分别为150 bp和474bp,与预期大小相符,测序结果证实为H5和N1亚型基因的靶序列。该方法能从H5N1样本中检出阳性扩增信号,熔解曲线可见H5和N1双特异峰;而H5N2样本有阳性扩增,熔解曲线仅见H5单特异峰。AIV的其他HA亚型和其他病毒的RNA、DNA无扩增信号。本法最低可检测21.0拷贝.μL-1和19.5拷贝.μL-1H5和N1重组质粒,敏感度分别是RT-PCR的100、1 000倍。本研究建立的基于荧光熔解曲线模式RT-PCR可用于HN亚型AIV的检测。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H5N1亚型 双重荧光RT—pcr 熔解曲线
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荧光PCR探针熔解曲线技术检测痰标本中结核分枝杆菌异烟肼耐药性的研究 被引量:7
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作者 王嫩寒 赵琰枫 +5 位作者 田丽丽 陈双双 陈昊 任怡宣 李传友 代小伟 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第20期2664-2670,共7页
目的评价荧光PCR探针熔解曲线(fluorescence polymerase chain reaction probe melting curve,Melt Pro)技术检测痰标本结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)异烟肼耐药性的应用价值。方法收集2021年5月至2022年5月在北京市疾... 目的评价荧光PCR探针熔解曲线(fluorescence polymerase chain reaction probe melting curve,Melt Pro)技术检测痰标本结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)异烟肼耐药性的应用价值。方法收集2021年5月至2022年5月在北京市疾病预防控制中心结核病门诊Gene Xpert MTB/RIF检测为MTB的(简称MTB阳性)患者痰标本,对每份标本同时进行涂片镜检、分枝杆菌分离培养、Melt Pro技术和线性探针技术(Geno Type MTBDRplus,简称Hain试验)异烟肼耐药检测。分析Melt Pro技术检测痰标本MTB异烟肼的耐药性,痰标本荷菌量对检测结果的影响;以培养阳性菌株异烟肼比例法药敏结果为参考标准,评价Melt Pro技术耐药检测效能。结果收集MTB阳性的合格痰标本157例,经分枝杆菌分离培养获得阳性菌株130株。Melt Pro技术痰标本MTB异烟肼耐药性检测成功率为84.1%(132/157)。不同痰涂片结果等级间,Melt Pro技术检测异烟肼耐药成功的比例差异存在有统计学意义(H=24.169,P=0.000),随痰涂片结果等级的升高,检测成功率由“阴性”标本的64.8%(35/54)升高到“3+”“4+”标本的100%(17/17,6/6);该比例也随Gene Xpert MTB/RIF检测MTB等级的升高而升高,由“极低”标本的54.8%(17/31),到“高”标本的96.4%(27/28),各等级间差异有统计学意义(H=27.763,P=0.000)。Melt Pro技术、Hain试验和药敏试验的异烟肼耐药检出率分别为22.0%(29/132),15.3%(19/124),和14.6%(19/130),三者差异无统计学意义(χ^(2)=2.997,P=0.223)。以培养阳性菌株比例法药敏试验结果为参考标准,Melt Pro技术检测异烟肼耐药的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为:84.6%(11/13)、91.2%(93/102)、55%(11/20)、97.9%(93/95),Kappa值为0.614;Hain试验检测异烟肼耐药的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为:55.6%(10/18)、92.3%(84/91)、58.8%(10/17)、91.3%(84/92),Kappa值为0.490。结论Melt Pro技术可直接检测痰标本MTB耐药性,快速准确筛查患者耐药情况,缩短耐药筛查时间。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 荧光pcr探针熔解曲线 耐药性检测
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双标准曲线相对定量PCR试验原理与方法 被引量:66
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作者 徐丽华 刘春雷 +4 位作者 常玉梅 梁利群 刘金亮 高国强 韩启霞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期70-75,共6页
实时荧光定量PCR(FQ-PCR)是一种准确有效的核酸定量分析技术,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点,并随新定量PCR仪及新操作方法的发展而得到广泛应用,但是,定量PCR的高敏感性特点使得实验操作严格而繁... 实时荧光定量PCR(FQ-PCR)是一种准确有效的核酸定量分析技术,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点,并随新定量PCR仪及新操作方法的发展而得到广泛应用,但是,定量PCR的高敏感性特点使得实验操作严格而繁琐。阐述了一种改进的相对定量方法——双标准曲线法的试验原理和特点,描述了定量PCR体系的优化方式,探讨了试验误差分析方法及试验操作技巧,并就试验数据的处理方法进行讨论。试验证明,双标准曲线法是一种经济、简单而准确的定量方法。 展开更多
关键词 双标准曲线 相对定量pcr 荧光扩增曲线 试验误差分析 归一化值
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转基因烟草中外源基因实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:10
6
作者 王盛 谢芝勋 +6 位作者 谢丽基 谢志勤 黄莉 罗思思 邓显文 黄娇玲 刘加波 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期745-749,共5页
【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以... 【目的】建立SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法,为转基因植物中外源基因拷贝数的检测提供参考。【方法】采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,检测转基因烟草中外源绿色荧光蛋白基因(GFP)的拷贝数,以烟草单拷贝的内源核糖核酸还原酶基因(RNR2)作为内参基因,建立相对定量的双标准曲线法检测转基因烟草中外源基因拷贝数的方法。【结果】构建RNR2基因、GFP基因实时荧光定量PCR的标准曲线,分别为y=-0.2858x+5.6695和y=-0.2826x+2.1048,R2分别为0.9994和0.9989,相关性较高。在检测的5株转基因烟草中GFP基因的拷贝数分别为5、8、19、28和45,非转基因烟草植株的GFP基因拷贝数为0。【结论】建立的转基因烟草中外源基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法具有简单、快速、准确等优点,可用于基因工程中对优良转化植株的筛选及外源基因表达量的快速检测和定量分析。 展开更多
关键词 转基因烟草 双标准曲线 外源基因 拷贝数 SYBR Green I实时荧光定量pcr
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中华鲟基因SYBR Green实时荧光PCR检测方法的建立
7
作者 祝长青 陈光哲 +5 位作者 周阳 刘欣 石建华 邵景东 蒋原 黄文胜 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第6期60-63,共4页
根据NCBI上已公布的中华鲟D-loop基因、细胞色素b基因、12S rRNA基因的核酸序列设计出4对引物,经SYBR Green实时荧光PCR反应、熔解曲线分析和扩增片段克隆测序后,发现针对D-loop基因的F2-R1引物能够高效、特异地实现对靶序列扩增,选择... 根据NCBI上已公布的中华鲟D-loop基因、细胞色素b基因、12S rRNA基因的核酸序列设计出4对引物,经SYBR Green实时荧光PCR反应、熔解曲线分析和扩增片段克隆测序后,发现针对D-loop基因的F2-R1引物能够高效、特异地实现对靶序列扩增,选择其作为中华鲟基因特异性扩增引物,建立中华鲟基因SYBR Green实时荧光PCR检测方法。所建立的中华鲟D-loop基因SYBR Green实时荧光PCR检测方法特异性好、可操作性强,具有较好的应用价值。 展开更多
关键词 中华鲟 基因鉴定 实时荧光pcr 熔解曲线 克隆测序
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分枝杆菌三种检测方法的比较及结果不一致的原因分析
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作者 陈保羽 张东英 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第4期549-552,555,共5页
目的探讨抗酸染色、RT-PCR法及荧光PCR熔解曲线法对分枝杆菌的阳性检出率,评估三者的准确性及灵敏度。方法选择病理诊断为上皮样肉芽肿病变的石蜡组织样本93例,分别使用抗酸染色检测分枝杆菌、RT-PCR检测组织中结核分枝杆菌复合群(RT-PC... 目的探讨抗酸染色、RT-PCR法及荧光PCR熔解曲线法对分枝杆菌的阳性检出率,评估三者的准确性及灵敏度。方法选择病理诊断为上皮样肉芽肿病变的石蜡组织样本93例,分别使用抗酸染色检测分枝杆菌、RT-PCR检测组织中结核分枝杆菌复合群(RT-PCR法)及荧光PCR熔解曲线法检测分枝杆菌。比较三种方法的检测结果,并分析三种方法结果不一致的原因。结果93例样本中,共有13例(14.0%)样本抗酸染色呈阳性;20例(21.5%)样本组织结核分枝杆菌复合群(RT-PCR法)检测为阳性;共有57例(61.3%)样本通过荧光PCR熔解曲线法检测为阳性,其中10例为结核分枝杆菌复合群阳性。结论对于组织结核分枝杆菌检测RT-PCR法的灵敏度最高。而荧光PCR熔解曲线法可以检出更多的分枝杆菌感染病例。非结核分枝杆菌感染(分枝杆菌属阳性)是导致抗酸染色阳性而结核分枝杆菌复合群检测(RT-PCR法)阴性的原因。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 非结核分枝杆菌 抗酸染色 RT-pcr 荧光pcr熔解曲线法
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一种新型鸭呼肠孤病毒SYBR GreenⅡ荧光定量PCR方法的建立 被引量:7
9
作者 丁明洋 戚伟强 +6 位作者 陈宗艳 朱杰 吴巧梅 缪秋红 李传峰 吴润 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2016年第1期7-14,共8页
该研究旨在建立一种快速、敏感和特异性检测新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV)的荧光定量PCR诊断方法。本实验以感染新型鸭呼肠孤病毒的鸭组织RNA提取物为模板,根据Gen Bank数据库中呼肠孤病毒S1基因全序列,设计合成了一对... 该研究旨在建立一种快速、敏感和特异性检测新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV)的荧光定量PCR诊断方法。本实验以感染新型鸭呼肠孤病毒的鸭组织RNA提取物为模板,根据Gen Bank数据库中呼肠孤病毒S1基因全序列,设计合成了一对特异性引物,PCR扩增基因片段,将其克隆至p ET-30a载体,重组质粒测序并进行同源性分析;以阳性质粒为模板,建立SYBR Green II荧光定量PCR检测方法,并进行敏感性和特异性检测。经测序证实扩增片段与预期目的片段相符,所建立的SYBR Green II荧光定量PCR检测S1的反应在101~108 copies/u L之间具有良好的线性关系,反应的检出下限为10 copies/μL,而H5型禽流感病毒、H9型禽流感病毒、鸡传染性支气管炎病毒、C型鸭肝炎病毒、新城疫病毒、鹅细小病毒、鸭瘟病毒等病毒的检测为阴性,表明该方法敏感、特异。本研究成功建立了SYBR Green II荧光定量PCR检测新型鸭呼肠孤病毒的方法,为新型鸭呼肠孤病毒致病机制和机体免疫保护机制的研究提供了技术平台。 展开更多
关键词 新型鸭呼肠孤病毒 S1 荧光定量pcr 熔解曲线 检测
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大鼠bFGF基因荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:4
10
作者 舒剑波 张瑞 +1 位作者 董茵 郭刚 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 2008年第1期1-4,共4页
目的建立用荧光定量PCR方法检测大鼠bFGF基因mRNA水平。方法以Trizol一步法提取新鲜骨组织总RNA,以Oligo(dt)18为引物逆转录产生cDNA并进行扩增,以T-A克隆法将纯化的目的片断与PGEM—T Easy载体连接成重组质粒并转化E.coli DH5α... 目的建立用荧光定量PCR方法检测大鼠bFGF基因mRNA水平。方法以Trizol一步法提取新鲜骨组织总RNA,以Oligo(dt)18为引物逆转录产生cDNA并进行扩增,以T-A克隆法将纯化的目的片断与PGEM—T Easy载体连接成重组质粒并转化E.coli DH5α。采用碱裂解法提取重组质粒,经蓝白筛选、酶切、测序鉴定后,根据标准品建立标准曲线,由软件自动计算出待测样本中靶基因mRNA准确含量,并以靶基因和内参GAPDH mRNA含量的比值作为评价靶基因表达水平的指标。结果由PGEM-T Easy—bFGF所构建的标准曲线线性关系良好(反应体系中含1×10^2~1×10^7拷贝大鼠bFGF基因分子时,扩增反应α值与拷贝数的对数成线性关系)、灵敏度高、特异性强、准确可靠。批内和批间重复性测定的变异系数分别为1.03%~4、59%以及2.24%~6.46%。结论成功建立了用实时荧光定量PCR检测大鼠bFGF基因表达量的方法。 展开更多
关键词 碱性成纤维生长因子 SYBR Green 实时荧光定量pcr T-A克隆 标准曲线
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EvaGreen实时荧光PCR检测猪繁殖与呼吸综合征(PRRSV)方法的建立和应用 被引量:2
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作者 郑晓文 饶品彬 +2 位作者 蔡晔 杨宗歧 姜永厚 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第9期123-126,共4页
目前,猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)已成为全球范围内影响较广的猪类重要疾病之一,因此建立快速、有效的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)检测技术成为预防和控制PRRS传播的关键。在序列分析的基础上,设计特异性引物,建立基于熔解曲线分析的Ev... 目前,猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)已成为全球范围内影响较广的猪类重要疾病之一,因此建立快速、有效的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)检测技术成为预防和控制PRRS传播的关键。在序列分析的基础上,设计特异性引物,建立基于熔解曲线分析的Eva Green实时荧光定量PCR检测PRRSV方法。该方法能够特异性扩增PRRSV,并用经熔解曲线分析产生特异性的熔解峰,而非靶标病毒未产生非特异性扩增;PRRSV的检测灵敏度可达50 copies/μL;批内、批间重复试验中变异系数均在2%以内;对118份临床样品进行检测,阳性率为31.4%,与普通PCR检测结果相符率为100%。结果表明,建立的Eva Green实时荧光定量PCR检测PRRSV方法具有较高的特异性、灵敏度和良好的重复性,可用于临床PRRSV感染的早期诊断及分子流行病学调查。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) EvaGreen实时荧光定量pcr 熔解曲线分析 检测
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实时荧光定量PCR技术的操作实践 被引量:42
12
作者 杨怡姝 孙晓娜 +3 位作者 王小利 沈思嗣 李泽琳 曾毅 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2011年第7期15-19,共5页
采用Mx3000P型实时荧光定量PCR仪,以SYBRGreen I法相对定量技术为例,设计1例检测针对HIV-1 vpr基因的特异性siRNA基因沉默效果的实验。介绍了实时荧光定量PCR技术上机前样本的制备过程、检测程序及相关参数的设置方法等操作流程;结合... 采用Mx3000P型实时荧光定量PCR仪,以SYBRGreen I法相对定量技术为例,设计1例检测针对HIV-1 vpr基因的特异性siRNA基因沉默效果的实验。介绍了实时荧光定量PCR技术上机前样本的制备过程、检测程序及相关参数的设置方法等操作流程;结合熔解曲线、扩增曲线进行结果分析;强调了实验整体设计、引物设计与PCR反应体系的优化和内参的恰当选择在实时荧光定量PCR技术中的重要性。 展开更多
关键词 荧光定量pcr SYBRGreenI 扩增曲线 熔解曲线
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SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测类猪圆环病毒因子P1 被引量:13
13
作者 温立斌 何孔旺 +3 位作者 杨汉春 郭容利 周俊明 钟书霖 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期31-35,共5页
该研究旨在建立快速、敏感和特异的检测类猪圆环病毒因子P1的SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR法,用于P1的早期诊断。以感染P1的猪血清DNA提取物为模板,采用PCR扩增P1 101 bp的基因片段,将其克隆至pMD18-T载体,重组质粒测序并进行同源性分析;... 该研究旨在建立快速、敏感和特异的检测类猪圆环病毒因子P1的SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR法,用于P1的早期诊断。以感染P1的猪血清DNA提取物为模板,采用PCR扩增P1 101 bp的基因片段,将其克隆至pMD18-T载体,重组质粒测序并进行同源性分析;以阳性质粒为模板,建立SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测方法,并进行敏感性和特异性检测。经测序证实扩增片段属于P1,所建立的SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测P1的反应在101-108拷贝/μL之间具有良好的线性关系,反应的检出下限为10拷贝/μL,而对猪伪狂犬病病毒、猪细小病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒等的检测为阴性,表明该方法敏感、特异。成功建立了SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测P1载量的方法,为P1致病机制和机体免疫保护机制的研究提供了技术平台。 展开更多
关键词 类猪圆环病毒因子 P1 荧光定量pcr 熔解曲线 检测
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不同引物及数据分析方法对定量PCR结果的影响 被引量:18
14
作者 刘正霞 徐阳 +3 位作者 徐进梅 杨明夏 马磊 朱昌亮 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1112-1117,共6页
目的:研究不同引物及数据分析方法对实时荧光定量PCR SYBR Green染料法检测基因表达差异结果分析的影响。方法:通过Primer Express 2.0软件对目的基因CCND1、C-JUN分别设计4对不同引物进行SYBR Green染料法定量PCR扩增,并分别使用2-△... 目的:研究不同引物及数据分析方法对实时荧光定量PCR SYBR Green染料法检测基因表达差异结果分析的影响。方法:通过Primer Express 2.0软件对目的基因CCND1、C-JUN分别设计4对不同引物进行SYBR Green染料法定量PCR扩增,并分别使用2-△△CT法、Pfaffl法及相对标准曲线法计算肺癌紫杉醇敏感细胞株及耐药细胞株间目的基因的表达差异,分析不同引物和数据计算方法对实验结果的影响。结果:统计学分析表明,引物的扩增效率对定量PCR结果分析有显著影响,不同引物特异性扩增得到的样本间表达倍数有显著差异(P<0.05)。3种计算方法中,Pfaffl法与相对标准曲线法无统计学差异(P>0.05),而2-△△CT法与其他2种方法均有显著差异(P<0.05)。结论:引物的选择对于定量PCR结果有显著影响;Pfaffl法是更准确,更合理的相对定量计算方法。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 2^-△△CT Pfaffl 相对标准曲线 扩增效率
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动力学模型在荧光定量PCR数据处理中的优势 被引量:2
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作者 刘彦礼 李旭 +2 位作者 苏振成 徐明恺 张惠文 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期157-162,共6页
近年来荧光定量PCR技术凭借其基因定量的优势而得到了广泛应用,上游技术的发展保障了原始数据的精确性,但定量结果的可靠性仍取决于PCR扩增效率和所采用的数据处理模型,基于不同数学模型对原始数据处理后的结果会有较大差异。试验通过... 近年来荧光定量PCR技术凭借其基因定量的优势而得到了广泛应用,上游技术的发展保障了原始数据的精确性,但定量结果的可靠性仍取决于PCR扩增效率和所采用的数据处理模型,基于不同数学模型对原始数据处理后的结果会有较大差异。试验通过对样品进行5倍梯度稀释后获得相应梯度的荧光定量PCR原始数据,并应用2-△△Ct法、相对标准曲线法和动力学模型处理原始数据,所得定量结果(x-±s)依次为1.76±0.70、0.89±0.14和0.99975±0.06,与理论值1比较表明,动力学模型在定量结果的可靠性、方便性及经费节约方面都具有良好应用前景。 展开更多
关键词 荧光定量pcr2-△△Ct 相对标准曲线 动力学模型
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荧光定量PCR检测山羊褪黑素受体表达体系的优化研究 被引量:1
16
作者 汪运舟 陈维云 +3 位作者 王慧 李俊娴 于婷 王树迎 《山东畜牧兽医》 2010年第5期3-4,共2页
本研究通过系统对比试验,优化建立了检测山羊卵巢组织中褪黑素受体基因表达量差异的荧光定量PCR技术体系,在这种体系下检测褪黑素受体1A基因在山羊卵巢组织中的差异表达量,可以得到最优的标准曲线,使起始模板浓度与循环数有良好的线性关... 本研究通过系统对比试验,优化建立了检测山羊卵巢组织中褪黑素受体基因表达量差异的荧光定量PCR技术体系,在这种体系下检测褪黑素受体1A基因在山羊卵巢组织中的差异表达量,可以得到最优的标准曲线,使起始模板浓度与循环数有良好的线性关系,且扩增效率百分数Eff接近1;荧光动力学曲线符合标准的"S"形荧光增长曲线,曲线拐点清楚,基线平而无明显上扬趋势;熔解曲线成单峰,充分说明扩增的特异性高,产物单一,与SYBR Green I荧光染料结合的为目标DNA片段,荧光曲线能够准确反映目的产物的扩增结果。 展开更多
关键词 荧光定量pcr 反转录 反应体系优化 熔解曲线
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荧光PCR扩增相关技术 被引量:8
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作者 张亚旭 刘紫烟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期890-899,共10页
利用荧光PCR(FPCR)技术扩增DNA是现代生物学研究的重要内容。本文以FPCR的发明为起始,以其主要的发展历程为主线,介绍和阐述了实时定量式PCR(QPCR,包括染料法、水解探针法及其衍生种类、划分为分子信标和阴阳探针等类型的杂交探针法、... 利用荧光PCR(FPCR)技术扩增DNA是现代生物学研究的重要内容。本文以FPCR的发明为起始,以其主要的发展历程为主线,介绍和阐述了实时定量式PCR(QPCR,包括染料法、水解探针法及其衍生种类、划分为分子信标和阴阳探针等类型的杂交探针法、染料熔解曲线法和探针熔解曲线法)与数字式PCR(DPCR,主要是芯片式DPCR,cdPCR和微液滴DPCR,ddPCR)这2代阶段性方法的原理、要点、设计技巧及实际运用等,总结其主要应用领域与局限性,对比不同类型各自的特点,并对未来的发展进行展望。 展开更多
关键词 荧光pcr(Fpcr)扩增 实时定量式pcr(Qpcr) 熔解曲线 数字式pcr(Dpcr)
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磁珠提取DNA结合PCR-HRM方法鉴定植物油掺伪
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作者 肖玲 曹文明 姜元荣 《粮食与油脂》 北大核心 2023年第7期146-149,共4页
为有效鉴别精炼植物油掺伪,通过先富集油中核酸,然后在水相溶液中加入磁珠和特定吸附液来吸附脱氧核糖核酸(DNA),实现快速高效的磁珠DNA提取,并结合荧光定量聚合酶链式反应(PCR)扩增高拷贝叶绿体基因rbcL,对产物进行高分辨率熔解曲线(H... 为有效鉴别精炼植物油掺伪,通过先富集油中核酸,然后在水相溶液中加入磁珠和特定吸附液来吸附脱氧核糖核酸(DNA),实现快速高效的磁珠DNA提取,并结合荧光定量聚合酶链式反应(PCR)扩增高拷贝叶绿体基因rbcL,对产物进行高分辨率熔解曲线(HRM)分析,获得菜籽油、大豆油、花生油、玉米油、葵花籽油、芝麻油、亚麻籽油、山茶油、稻米油和棉籽油HRM的特征曲线。通过对不同货架期的精炼大豆油和花生油掺伪样品的真实性验证,表明建立的方法可有效解决精炼植物油中掺杂其他植物油的鉴别难题。 展开更多
关键词 精炼植物油 DNA提取 荧光定量pcr 高分辨率熔解曲线 掺伪
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石蜡包埋组织样本结核与非结核分枝杆菌感染情况及菌种鉴定结果分析——来自华西医院的单中心研究
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作者 孙林雍 曲俊彦 +1 位作者 李悦 江丹 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第1期105-109,共5页
目的 探讨石蜡包埋组织样本结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis, MTB)和非结核分枝杆菌(non-tuberculousmycobacteria, NTM)感染情况。方法 回顾性分析756例连续疑似结核病石蜡包埋组织样本,应用抗酸染色法和荧光定量PCR法辅助诊... 目的 探讨石蜡包埋组织样本结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis, MTB)和非结核分枝杆菌(non-tuberculousmycobacteria, NTM)感染情况。方法 回顾性分析756例连续疑似结核病石蜡包埋组织样本,应用抗酸染色法和荧光定量PCR法辅助诊断结核分枝杆菌复合群(mycobacterium tuberculosis complex, MTBC),对检测结果不一致(抗酸染色阳性、荧光定量PCR法阴性)样本47例,采用荧光PCR熔解曲线法行分枝杆菌菌种鉴定。结果 756例疑似结核病样本中,阳性检出率为52.5%(397/756);其中,抗酸染色阳性检出率为37.7%(285/756),荧光定量PCR法阳性检出率为46.3%(350/756)。PCR法灵敏性显著高于抗酸染色法(χ^(2)=33.226,P<0.001)。NTM检出率为10.4%(41/394)。共鉴定出5种NTM,分别为胞内分枝杆菌、龟分枝杆菌脓肿亚种、戈登分枝杆菌、鸟分枝杆菌及海分枝杆菌或溃疡分枝杆菌。NTM女性感染率高于男性(χ^(2)=4.318,P=0.038)。NTM感染在不同部位之间差异有统计学意义(χ^(2)=23.866,P<0.001),以肺部最多见。结论 我院石蜡包埋组织MTBC及NTM检出率均保持较高水平,以肺部感染最常见,NTM感染中胞内分枝杆菌最常见。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 非结核分枝杆菌 菌种鉴定 石蜡包埋组织 荧光pcr熔解曲线法
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急性髓系白血病NPM1基因突变检测方法的研究 被引量:4
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作者 李志鹏 张绚 +3 位作者 赵晓明 李庆阁 陈亚玫 鹿全意 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2011年第4期999-1004,共6页
本研究旨在建立检测急性髓系细胞白血病(AML)患者NPM1基因突变的方法。针对NPM1基因突变集中区域设计引物/探针,建立高分辨熔解曲线方法(HRM)和等位基因特异PCR方法(AS-PCR),通过89份AML标本进行了临床评估,并采用毛细管电泳法(CE)和测... 本研究旨在建立检测急性髓系细胞白血病(AML)患者NPM1基因突变的方法。针对NPM1基因突变集中区域设计引物/探针,建立高分辨熔解曲线方法(HRM)和等位基因特异PCR方法(AS-PCR),通过89份AML标本进行了临床评估,并采用毛细管电泳法(CE)和测序法作为对照进行了验证。结果表明,通过上述4种方法共检出阳性标本17例(19.1%),其中A型突变15例,B型和Nm型突变各1例。上述方法中HRM法检测全面,灵敏度为5%,而AS-PCR法有一定的漏检,但灵敏度高达0.01%。结论:考虑到操作的难易程度,同时也结合临床样品的检测情况,HRM在临床上可法用于NPM1突变筛查,而AS-PCR法可用于后续的微小残留病定量检测。 展开更多
关键词 急性髓性细胞白血病 NPM1基因 毛细管电泳 高分辨熔解曲线 等位基因特异pcr
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