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草莓Remorin家族的全基因组鉴定及功能初步研究 被引量:1
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作者 温陈金 薛程 +3 位作者 柯美玉 蔡建法 高震 陈栩 《种子科技》 2020年第11期6-9,共4页
研究将FvREM2.1基因异源过表达到拟南芥中,结果表明:过表达FvREM2.1基因能明显抑制拟南芥根生长,引起根的向重性失衡,且在pSUC2:GFP背景下过表达FvREM2.1导致GFP在根部卸载受抑制,表明FvREM2.1通过调控胞间连丝的通透性,参与了草莓根的... 研究将FvREM2.1基因异源过表达到拟南芥中,结果表明:过表达FvREM2.1基因能明显抑制拟南芥根生长,引起根的向重性失衡,且在pSUC2:GFP背景下过表达FvREM2.1导致GFP在根部卸载受抑制,表明FvREM2.1通过调控胞间连丝的通透性,参与了草莓根的发育。 展开更多
关键词 草莓remorin家族 全基因组 鉴定 功能
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草莓MADS-box基因家族生物信息学分析 被引量:2
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作者 马明臻 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第11期21-25,共5页
通过生物信息学的方法,利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家族进行鉴定和分析,共得到83个草莓MADS-box候选基因,且MADS-box结构域高度保守。进化分析表明,Fv MADS1-Fv MADS33可被细分为10个亚组,分别为AG、AGL12、AGL6... 通过生物信息学的方法,利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家族进行鉴定和分析,共得到83个草莓MADS-box候选基因,且MADS-box结构域高度保守。进化分析表明,Fv MADS1-Fv MADS33可被细分为10个亚组,分别为AG、AGL12、AGL6、AGL2、SE、SVP、FLC、AP3、SOC1、AGL17;Fv MADS34-Fv MADS83可被细分为4个亚组,分别为Mα(22个成员)、Mβ(1个成员)、Mγ(17个成员)、Mδ(10个成员)。 展开更多
关键词 草莓 MADS-box转录因子 基因家族 生物信息学
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草莓TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析 被引量:13
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作者 张志强 卢世雄 +4 位作者 马宗桓 周琪 何红红 陈佰鸿 毛娟 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2031-2043,共13页
TCP转录因子家族是植物特异的一类调控逆境胁迫的重要转录因子。该研究利用生物信息学方法对草莓TCP转录因子家族成员进行鉴定,采用qRT-PCR方法检测转录因子家族在非生物胁迫中的表达,并对相应转录因子家族基因的结构和功能进行了预测,... TCP转录因子家族是植物特异的一类调控逆境胁迫的重要转录因子。该研究利用生物信息学方法对草莓TCP转录因子家族成员进行鉴定,采用qRT-PCR方法检测转录因子家族在非生物胁迫中的表达,并对相应转录因子家族基因的结构和功能进行了预测,为探究TCP转录因子在森林草莓非生物胁迫中的作用奠定基础。结果显示:(1)从森林草莓(Fragaria vesca)基因组和凤梨草莓(Fragaria ananassa)基因组中分别筛选了18个和58个TCP基因,并根据基因在染色体上的位置分别命名为FvTCP1~FvTCP18和FaTCP1~FaTCP58,亚细胞定位显示TCP家族基因主要位于细胞核上。(2)qRT-PCR分析表明,森林草莓家族基因对逆境胁迫具有响应作用,但不同成员在不同胁迫处理下的响应程度存在差异,FvTCP14在200 mmol·L^(-1) NaCl、10%PEG、100μmol·L^(-1) ABA、4℃低温、40℃高温和100 mmol·L^(-1) H_(2)O_(2)处理下相对表达量极显著高于对照,分别是对照的43.78倍、166.73倍、38.39倍、265.87倍、626.24倍和451.85倍,表明FvTCP14响应干旱、盐、ABA、H_(2)O_(2)、低温和高温胁迫;另外发现,FvTCP12在4℃低温、100μmol·L^(-1) ABA和100 mmol·L^(-1) H_(2)O_(2)胁迫下与对照相比呈下调趋势,推测FvTCP12基因对低温、ABA和H_(2)O_(2)胁迫具有负调控作用。研究表明,森林草莓TCP转录因子在不同逆境胁迫中的表达存在一定的差异。 展开更多
关键词 草莓 TCP家族 生物信息学 QRT-PCR
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森林草莓糖基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析 被引量:2
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作者 赵倩倩 宋艳红 +5 位作者 宋盼 陈亚铎 李刚 赵霞 刘丽锋 周厚成 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1615-1624,共10页
【目的】对森林草莓糖基转移酶基因(FvUGT)家族进行生物信息学分析及基因表达分析,为深入研究森林草莓UGT基因功能和探索UGT调控草莓果实发育及花色苷及品质形成提供理论依据。【方法】基于Phytozome数据库鉴定得出138个FvUGT基因家族基... 【目的】对森林草莓糖基转移酶基因(FvUGT)家族进行生物信息学分析及基因表达分析,为深入研究森林草莓UGT基因功能和探索UGT调控草莓果实发育及花色苷及品质形成提供理论依据。【方法】基于Phytozome数据库鉴定得出138个FvUGT基因家族基因,运用生物信息学方法分析其蛋白理化性质、基因结构、保守结构域和进化关系,并采用实时荧光定量PCR对UFGT候选基因在森林草莓(红果和白果2个类型)各组织(根、叶柄、叶和果实)中的表达量进行分析。【结果】FvUGT基因家族可分为12个类群(A、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L和N),每个类群分别包含16、2、23、32、8、1、5、5、7、3、21和4个成员;染色体定位发现FvUGT基因家族成员在除2号染色体之外的其他染色体上均有分布,且分布不均;FvUGT基因内含子长度、外显子位置和数目在不同成员间均存在差异,FvUGT基因家族在进化过程中产生较强的分化。实时荧光定量PCR检测结果表明,FvUFGT70基因在森林草莓白果和红果的叶和叶柄中有较高表达;FvUFGT94基因在各组织中均有表达;FvUFGT67和FvUFGT68基因在根中有较高表达;而FvUFGT95和FvUFGT96基因在果实中有表达,且显著高于其他组织(P<0.05,下同)。同时,在果实的小绿期、转色期和成熟期的表达表现为,成熟期FvUFGT33和FvUFGT95这2个基因在森林草莓红果类型的表达量显著高于白果类型。【结论】7个FvUFGT基因表现出明显的组织差异性,其中FvUFGT33和FvUFGT95基因在果实中有较高表达量,且在森林草莓红果类型表达量显著高于白果类型,故推测其在花色苷合成中发挥作用。 展开更多
关键词 森林草莓 糖基转移酶基因(UGT)家族 基因结构 基因功能 表达分析
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森林草莓HD-ZipⅠ亚家族基因的鉴定及表达分析
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作者 李春 王永 +1 位作者 李义 丁静 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期47-57,共11页
[目的]本文旨在鉴定森林草莓同源异型域-亮氨酸拉链家族(homeodomain-leucine Zipper,HD-Zip)Ⅰ亚家族的转录因子,分析其序列属性及表达模式,为其进一步功能研究和利用奠定基础。[方法]运用生物信息学方法,鉴定和分析森林草莓HD-ZipⅠ... [目的]本文旨在鉴定森林草莓同源异型域-亮氨酸拉链家族(homeodomain-leucine Zipper,HD-Zip)Ⅰ亚家族的转录因子,分析其序列属性及表达模式,为其进一步功能研究和利用奠定基础。[方法]运用生物信息学方法,鉴定和分析森林草莓HD-ZipⅠ亚家族基因的系统进化关系、蛋白基序、基因结构、复制方式及启动子元件等;利用公共转录组数据和荧光定量PCR技术,分析其在花和早期果实中以及黑暗、脱落酸(ABA)、6-苄氨基嘌呤(6-BA)或水杨酸(SA)处理的离体叶片中的表达模式。[结果]森林草莓HD-ZipⅠ亚家族包含11个基因,它们含有0~3个内含子,相对均匀地分布在第1和3~7号染色体上。全基因组/片段复制是HD-ZipⅠ亚家族基因扩张的主要复制方式。光和激素响应元件是其启动子区所占比例最高的2类顺式作用元件。转录组数据显示,多数HD-ZipⅠ基因在森林草莓除成熟花粉粒和胚之外的花和早期果实组织中表达量较高。5个HD-ZipⅠ亚家族基因的定量结果表明,FvH 4_1g20230、FvH4_5g36570、FvH4_5g15520和FvH4_7g32570基因在ABA、6-BA或SA处理3和6 h时有响应;FvH 4_7g32570基因在黑暗时被诱导,FvH4_5g36570、FvH4_7g32570、FvH4_1g20230、FvH4_5g15520基因在ABA诱导的离体叶片衰老过程中发生显著的表达变化;而在6-BA处理的叶片中,这5个基因的表达与对照相比均无持续的显著变化。[结论]HD-ZipⅠ亚家族基因很可能在黑暗和ABA诱导的森林草莓离体叶片衰老过程中起重要的调控作用,并参与森林草莓花和早期果实的发育以及激素响应过程。 展开更多
关键词 森林草莓 HD-ZipⅠ亚家族基因 叶片衰老 激素处理
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浆果家族的食疗档案
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作者 李维 《农家致富》 2017年第16期59-59,共1页
提到浆果,每个人都能列举出几种:葡萄、草莓、蓝莓……“汁多味美”是它们共同的标签。那么,这些浆果在营养价值和食疗方面有哪些专长呢?不妨来了解一下。
关键词 食疗方 浆果 档案 家族 营养价值 葡萄 草莓 蓝莓
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草莓PHT磷转运蛋白家族鉴定及FaPHT2.1功能分析
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作者 刘长金 冯晋婧 +2 位作者 张艳君 沈元月 黄芸 《果树学报》 2025年第9期2003-2017,共15页
【目的】本文旨在对二倍体草莓(Fragaria vesca)磷酸盐转运体(Phosphate transporter,PHT)家族成员的理化性质及分子进化关系等进行分析,并探究草莓FaPHT2.1在植物生长发育和果实成熟过程中的功能。【方法】利用生物信息学方法对草莓PH... 【目的】本文旨在对二倍体草莓(Fragaria vesca)磷酸盐转运体(Phosphate transporter,PHT)家族成员的理化性质及分子进化关系等进行分析,并探究草莓FaPHT2.1在植物生长发育和果实成熟过程中的功能。【方法】利用生物信息学方法对草莓PHT磷转运蛋白家族成员理化性质、亚细胞定位进行预测,分析其基因结构与染色体定位,并通过生理及分子手段解析草莓PHT2.1的生物学功能。【结果】草莓PHT家族蛋白多为稳定的疏水蛋白,亚家族间理化性质存在差异;预测得知PHT1定位于细胞质膜,PHT2定位于叶绿体,PHT3定位于线粒体,PHT4定位于质体或高尔基体,PHT5定位于液泡;FaPHT2.1在果实、茎叶中表达量较高,其蛋白定位于叶绿体膜,具有无机磷转运活性,能够促进植物生长,影响果实硬度、糖和磷积累、叶绿素合成。【结论】本研究鉴定了草莓PHT家族蛋白,分析预测了其理化性质、亚细胞定位等基本信息,初步证明FaPHT2.1作为磷转运体,影响草莓植株生长和果实成熟过程,为未来分子育种和果实品质提升奠定了理论基础。 展开更多
关键词 草莓 磷转运体 PHT家族 PHT2.1 生长发育 果实成熟
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