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山西草莓斑驳病毒cp基因克隆及遗传多样性分析 被引量:3
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作者 陈伟 李志卫 +5 位作者 玉山江·麦麦提 聂园军 李亚娟 赫娟 柴敏 罗永平 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2007-2013,共7页
旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性。从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.1... 旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性。从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.10软件分析cp基因的遗传多样性,采用RDP v.4.31软件检测SMoV中的重组事件。RT-PCR检测后发现,从山西省各地区收集的159份草莓叶片中有65份样品呈阳性,检出率为38.46%。这些阳性样品经过分离、测序、克隆,获得16个SMoV分离物。结合在线的19个SMoV分离物系统进化树分析显示,35个SMoV分离物被分成两组,组1包含28个分离物,均来自中国;组2包含7个分离物,分别来自加拿大、日本和美国。经选择压分析和中性检验,组1和组2 SMoV分离物之间存在显著的遗传差异,且中性检验均为负值,SMoV种群呈扩张状态。序列相似性分析表明,35株分离物的核苷酸同一性为81.34%~100%,氨基酸的一致性为94.77%~100%,呈现出较高的相似性。可见:SMoV存在较高的遗传变异,负选择压力可能是导致SMoV遗传多样性的原因。 展开更多
关键词 草莓斑驳病毒 CP基因 遗传多样性
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草莓斑驳病毒的分子杂交检测 被引量:5
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作者 李丽丽 杨洪一 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期273-276,共4页
为探索分子杂交技术在草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)检测中的运用,利用CTAB法从草莓叶片中提取总核酸,并以此为模板,利用特异引物扩增SMoV非编码区序列,经克隆、测序获得SMoV非编码区序列。系统进化分析结果显示:本研究... 为探索分子杂交技术在草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)检测中的运用,利用CTAB法从草莓叶片中提取总核酸,并以此为模板,利用特异引物扩增SMoV非编码区序列,经克隆、测序获得SMoV非编码区序列。系统进化分析结果显示:本研究中的分离物与GenBank中已报道的分离物的亲缘关系较远,独立形成1个小的进化支。以带有病毒特异片段的质粒为模板,运用PCR技术制备了地高辛标记的cDNA探针。以草莓感染SMoV叶片为试材,利用地高辛标记探针可有效检测草莓叶片中的SMoV,草莓总核酸样品稀释10倍后仍可有效检测。 展开更多
关键词 草莓斑驳病毒 分子杂交技术 CDNA探针
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草莓无病毒苗培育技术 被引量:1
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作者 郭顺美 苏福才 陈淑兰 《内蒙古农业科技》 1998年第S1期118-120,共3页
草莓属蔷薇科、草莓属多年生草本植物,果实为小浆果,营养价值和经济价值较高,除鲜食外,还可制成酱、汁、酒及罐头等多种食品,具有广阔的生产前景。但草莓主要以匍匐茎分株繁殖为主,经长期多代营养繁殖,病毒病日益严重,使植株生... 草莓属蔷薇科、草莓属多年生草本植物,果实为小浆果,营养价值和经济价值较高,除鲜食外,还可制成酱、汁、酒及罐头等多种食品,具有广阔的生产前景。但草莓主要以匍匐茎分株繁殖为主,经长期多代营养繁殖,病毒病日益严重,使植株生长减弱,产量降低,品质变劣,给生产... 展开更多
关键词 病毒 培育技术 草莓斑驳病毒 指示植物 培养基 草莓茎尖培养 病毒鉴定 病毒 黄边病 成活率
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