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山西草莓斑驳病毒cp基因克隆及遗传多样性分析
被引量:
3
1
作者
陈伟
李志卫
+5 位作者
玉山江·麦麦提
聂园军
李亚娟
赫娟
柴敏
罗永平
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期2007-2013,共7页
旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性。从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.1...
旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性。从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.10软件分析cp基因的遗传多样性,采用RDP v.4.31软件检测SMoV中的重组事件。RT-PCR检测后发现,从山西省各地区收集的159份草莓叶片中有65份样品呈阳性,检出率为38.46%。这些阳性样品经过分离、测序、克隆,获得16个SMoV分离物。结合在线的19个SMoV分离物系统进化树分析显示,35个SMoV分离物被分成两组,组1包含28个分离物,均来自中国;组2包含7个分离物,分别来自加拿大、日本和美国。经选择压分析和中性检验,组1和组2 SMoV分离物之间存在显著的遗传差异,且中性检验均为负值,SMoV种群呈扩张状态。序列相似性分析表明,35株分离物的核苷酸同一性为81.34%~100%,氨基酸的一致性为94.77%~100%,呈现出较高的相似性。可见:SMoV存在较高的遗传变异,负选择压力可能是导致SMoV遗传多样性的原因。
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关键词
草莓斑驳病毒
CP基因
遗传多样性
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职称材料
草莓斑驳病毒的分子杂交检测
被引量:
5
2
作者
李丽丽
杨洪一
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期273-276,共4页
为探索分子杂交技术在草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)检测中的运用,利用CTAB法从草莓叶片中提取总核酸,并以此为模板,利用特异引物扩增SMoV非编码区序列,经克隆、测序获得SMoV非编码区序列。系统进化分析结果显示:本研究...
为探索分子杂交技术在草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)检测中的运用,利用CTAB法从草莓叶片中提取总核酸,并以此为模板,利用特异引物扩增SMoV非编码区序列,经克隆、测序获得SMoV非编码区序列。系统进化分析结果显示:本研究中的分离物与GenBank中已报道的分离物的亲缘关系较远,独立形成1个小的进化支。以带有病毒特异片段的质粒为模板,运用PCR技术制备了地高辛标记的cDNA探针。以草莓感染SMoV叶片为试材,利用地高辛标记探针可有效检测草莓叶片中的SMoV,草莓总核酸样品稀释10倍后仍可有效检测。
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关键词
草莓斑驳病毒
分子杂交技术
CDNA探针
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职称材料
草莓无病毒苗培育技术
被引量:
1
3
作者
郭顺美
苏福才
陈淑兰
《内蒙古农业科技》
1998年第S1期118-120,共3页
草莓属蔷薇科、草莓属多年生草本植物,果实为小浆果,营养价值和经济价值较高,除鲜食外,还可制成酱、汁、酒及罐头等多种食品,具有广阔的生产前景。但草莓主要以匍匐茎分株繁殖为主,经长期多代营养繁殖,病毒病日益严重,使植株生...
草莓属蔷薇科、草莓属多年生草本植物,果实为小浆果,营养价值和经济价值较高,除鲜食外,还可制成酱、汁、酒及罐头等多种食品,具有广阔的生产前景。但草莓主要以匍匐茎分株繁殖为主,经长期多代营养繁殖,病毒病日益严重,使植株生长减弱,产量降低,品质变劣,给生产...
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关键词
无
病毒
苗
培育技术
草莓斑驳病毒
指示植物
培养基
草莓
茎尖培养
病毒
鉴定
病毒
病
黄边病
成活率
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职称材料
题名
山西草莓斑驳病毒cp基因克隆及遗传多样性分析
被引量:
3
1
作者
陈伟
李志卫
玉山江·麦麦提
聂园军
李亚娟
赫娟
柴敏
罗永平
机构
山西师范大学生命科学学院
新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室
山西农业大学
铜仁市农业科教信息站
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期2007-2013,共7页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1901102)
国家重点研发计划“科技助力经济2020”重点专项计划(SQ2020YFF0425265)
+2 种基金
山西省应用基础研究计划(201901D211403)
国家自然科学基金(31760511)
青海省中央引导地方科技发展资金项目(2022ZY022)。
文摘
旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性。从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.10软件分析cp基因的遗传多样性,采用RDP v.4.31软件检测SMoV中的重组事件。RT-PCR检测后发现,从山西省各地区收集的159份草莓叶片中有65份样品呈阳性,检出率为38.46%。这些阳性样品经过分离、测序、克隆,获得16个SMoV分离物。结合在线的19个SMoV分离物系统进化树分析显示,35个SMoV分离物被分成两组,组1包含28个分离物,均来自中国;组2包含7个分离物,分别来自加拿大、日本和美国。经选择压分析和中性检验,组1和组2 SMoV分离物之间存在显著的遗传差异,且中性检验均为负值,SMoV种群呈扩张状态。序列相似性分析表明,35株分离物的核苷酸同一性为81.34%~100%,氨基酸的一致性为94.77%~100%,呈现出较高的相似性。可见:SMoV存在较高的遗传变异,负选择压力可能是导致SMoV遗传多样性的原因。
关键词
草莓斑驳病毒
CP基因
遗传多样性
Keywords
SMoV
cp gene
Genetic diversity
分类号
S436.68 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
草莓斑驳病毒的分子杂交检测
被引量:
5
2
作者
李丽丽
杨洪一
机构
黑龙江省林业科学研究所
东北林业大学生命科学学院
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期273-276,共4页
基金
中央高校基本科研业务费项目(DL13EA06–3)
文摘
为探索分子杂交技术在草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)检测中的运用,利用CTAB法从草莓叶片中提取总核酸,并以此为模板,利用特异引物扩增SMoV非编码区序列,经克隆、测序获得SMoV非编码区序列。系统进化分析结果显示:本研究中的分离物与GenBank中已报道的分离物的亲缘关系较远,独立形成1个小的进化支。以带有病毒特异片段的质粒为模板,运用PCR技术制备了地高辛标记的cDNA探针。以草莓感染SMoV叶片为试材,利用地高辛标记探针可有效检测草莓叶片中的SMoV,草莓总核酸样品稀释10倍后仍可有效检测。
关键词
草莓斑驳病毒
分子杂交技术
CDNA探针
Keywords
Strawberry mottle virus
molecular hybridization
cDNA probe
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
草莓无病毒苗培育技术
被引量:
1
3
作者
郭顺美
苏福才
陈淑兰
机构
内蒙古呼和浩特园艺科技试验中心
内蒙古农牧学院
锡林浩特市园林处
出处
《内蒙古农业科技》
1998年第S1期118-120,共3页
文摘
草莓属蔷薇科、草莓属多年生草本植物,果实为小浆果,营养价值和经济价值较高,除鲜食外,还可制成酱、汁、酒及罐头等多种食品,具有广阔的生产前景。但草莓主要以匍匐茎分株繁殖为主,经长期多代营养繁殖,病毒病日益严重,使植株生长减弱,产量降低,品质变劣,给生产...
关键词
无
病毒
苗
培育技术
草莓斑驳病毒
指示植物
培养基
草莓
茎尖培养
病毒
鉴定
病毒
病
黄边病
成活率
分类号
S668.404.3 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
山西草莓斑驳病毒cp基因克隆及遗传多样性分析
陈伟
李志卫
玉山江·麦麦提
聂园军
李亚娟
赫娟
柴敏
罗永平
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
草莓斑驳病毒的分子杂交检测
李丽丽
杨洪一
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
草莓无病毒苗培育技术
郭顺美
苏福才
陈淑兰
《内蒙古农业科技》
1998
1
在线阅读
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职称材料
已选择
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