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氯苯嘧啶醇施用对草坪斑枯病致病菌及根际土壤真菌的影响
被引量：
4
1
作者
赵爽
张宁
+1 位作者
刘东阳
沈其荣
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期590-595,共6页
[目的]本文的目的是深入了解杀菌剂氯苯嘧啶醇施用对草地早熟禾(Poa pratensis L.)夏季草坪斑枯病病菌及根际土壤真菌的影响。[方法]根据真菌内转录间隔区(ITS)基因的种内相对保守和种间差异比较明显的特点,使用Illumina高通量测序技术...
[目的]本文的目的是深入了解杀菌剂氯苯嘧啶醇施用对草地早熟禾(Poa pratensis L.)夏季草坪斑枯病病菌及根际土壤真菌的影响。[方法]根据真菌内转录间隔区(ITS)基因的种内相对保守和种间差异比较明显的特点,使用Illumina高通量测序技术对氯苯嘧啶醇喷施后草地早熟禾根际土壤微生物宏基因组进行高通量测序。[结果]对照和氯苯嘧啶醇喷施处理的根际土壤分别产生4 851 438和3 037 924条Illumina双末端测序序列,经质量控制与序列比对后分别产生28 219和21 288个代表操作分类单位(OTU)。与对照相比,氯苯嘧啶醇施用后草地早熟禾根际土壤中子囊菌门真菌(Ascomycota)比例减少了18%,而担子菌门真菌(Basidiomycota)增加了32%,壶菌门类真菌(Chytridiomycota)和球囊菌门真菌(Glomeromycota)相对比例无显著变化;草地早熟禾根际土壤中真菌在科的分类单位上减少7个,在属的水平上减少152个,在种的水平上减少200个真菌种(类)。[结论]氯苯嘧啶醇喷施后不仅对草地早熟禾根际土壤中夏季草坪斑枯病致病菌有较强的抑制作用,而且对草地早熟禾根际土壤中疱霉属(Phoma)、小球腔菌属(Leptosphaeria)、镰刀菌属(Fusarium)和瓶霉属(Phialophora)土壤优势真菌有明显抑制作用。
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关键词
氯苯嘧啶醇
草坪斑枯病
草坪
根际土壤
ILLUMINA
GAIIx
土壤真菌
高通量测序
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职称材料
草坪斑枯病病原菌及其近缘种属的系统发育及基因宏阵列检测
2
作者
赵爽
张宁
+1 位作者
陈发棣
沈其荣
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期81-86,共6页
夏季草坪斑枯病是由子囊菌纲巨座壳科真菌Magnaporthe poae在夏季高温高湿环境下引起的一种草坪病害。对来源不同的24个Magnaporthe及其近缘种属Gaeumannomyces菌株的ITS1-5.8S-ITS2测序序列进行比较及系统发育分析。结果表明：M.poae...
夏季草坪斑枯病是由子囊菌纲巨座壳科真菌Magnaporthe poae在夏季高温高湿环境下引起的一种草坪病害。对来源不同的24个Magnaporthe及其近缘种属Gaeumannomyces菌株的ITS1-5.8S-ITS2测序序列进行比较及系统发育分析。结果表明：M.poae及其近缘种属真菌可分为A和B 2个群：A群由M.oryzae和Pyricularia oryzae菌种组成并形成2个分支,二者亲缘关系较近,且具有侵染寄主植物根部和地上部分的能力。B群由M.salvinii、M.poae、M.rhizophila、G.incrustans和G.graminis种内的2个变种（G.graminis var.graminis和G.graminis var.tritici）组成,B群真菌除M.salvinii外均有侵染寄主根部能力。在草坪环境中,B群真菌种内检测鉴定较A群困难。本研究根据真菌ITS基因的种内序列高度保守,种间差异明显的特点,分别设计了基因宏阵列单体（20~24 bp）、二聚体（40~48 bp）和单体加20个“A”（30~34 bp）3种寡核苷酸基因宏阵列检测探针来快速检测鉴定B群病原真菌。基因宏阵列检测结果表明：设计的检测探针均能准确、特异地检测鉴定B群的3种真菌,检测灵敏度从高到低依次为：二聚体探针、单体加20个“A”探针、单体探针。结论：在草坪土壤环境中,二聚体基因宏阵列检测探针（40~48 bp）对于Magnaporthe及其近缘种属菌株的检测较传统的单体检测探针更为灵敏与准确。
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关键词
基因宏阵列
草坪斑枯病
MAGNAPORTHE
GAEUMANNOMYCES
核苷酸检测探针
系统发育
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职称材料
题名
氯苯嘧啶醇施用对草坪斑枯病致病菌及根际土壤真菌的影响
被引量：
4
1
作者
赵爽
张宁
刘东阳
沈其荣
机构
南京农业大学园艺学院
Department of Plant Biology and Pathology
南京农业大学资源与环境科学学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期590-595,共6页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31301809)
中国博士后科学基金项目(2014M551613)
+1 种基金
南京农业大学青年科技创新基金项目(KJ2013016)
江苏省六大高峰人才项目(2013-NY-022)
文摘
[目的]本文的目的是深入了解杀菌剂氯苯嘧啶醇施用对草地早熟禾(Poa pratensis L.)夏季草坪斑枯病病菌及根际土壤真菌的影响。[方法]根据真菌内转录间隔区(ITS)基因的种内相对保守和种间差异比较明显的特点,使用Illumina高通量测序技术对氯苯嘧啶醇喷施后草地早熟禾根际土壤微生物宏基因组进行高通量测序。[结果]对照和氯苯嘧啶醇喷施处理的根际土壤分别产生4 851 438和3 037 924条Illumina双末端测序序列,经质量控制与序列比对后分别产生28 219和21 288个代表操作分类单位(OTU)。与对照相比,氯苯嘧啶醇施用后草地早熟禾根际土壤中子囊菌门真菌(Ascomycota)比例减少了18%,而担子菌门真菌(Basidiomycota)增加了32%,壶菌门类真菌(Chytridiomycota)和球囊菌门真菌(Glomeromycota)相对比例无显著变化;草地早熟禾根际土壤中真菌在科的分类单位上减少7个,在属的水平上减少152个,在种的水平上减少200个真菌种(类)。[结论]氯苯嘧啶醇喷施后不仅对草地早熟禾根际土壤中夏季草坪斑枯病致病菌有较强的抑制作用,而且对草地早熟禾根际土壤中疱霉属(Phoma)、小球腔菌属(Leptosphaeria)、镰刀菌属(Fusarium)和瓶霉属(Phialophora)土壤优势真菌有明显抑制作用。
关键词
氯苯嘧啶醇
草坪斑枯病
草坪
根际土壤
ILLUMINA
GAIIx
土壤真菌
高通量测序
Keywords
fenarimol
summer patch
rhizosphere soil
IIIumina GAIIx
soil fungi
high-throughput sequencing
分类号
S144.9 [农业科学—肥料学]
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职称材料
题名
草坪斑枯病病原菌及其近缘种属的系统发育及基因宏阵列检测
2
作者
赵爽
张宁
陈发棣
沈其荣
机构
南京农业大学园艺学院
Department of Plant Biology and Pathology
南京农业大学资源与环境科学学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期81-86,共6页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31301809)
南京农业大学青年科技创新基金项目(KJ2013016)
中国博士后科学基金项目(2014M551615)
文摘
夏季草坪斑枯病是由子囊菌纲巨座壳科真菌Magnaporthe poae在夏季高温高湿环境下引起的一种草坪病害。对来源不同的24个Magnaporthe及其近缘种属Gaeumannomyces菌株的ITS1-5.8S-ITS2测序序列进行比较及系统发育分析。结果表明：M.poae及其近缘种属真菌可分为A和B 2个群：A群由M.oryzae和Pyricularia oryzae菌种组成并形成2个分支,二者亲缘关系较近,且具有侵染寄主植物根部和地上部分的能力。B群由M.salvinii、M.poae、M.rhizophila、G.incrustans和G.graminis种内的2个变种（G.graminis var.graminis和G.graminis var.tritici）组成,B群真菌除M.salvinii外均有侵染寄主根部能力。在草坪环境中,B群真菌种内检测鉴定较A群困难。本研究根据真菌ITS基因的种内序列高度保守,种间差异明显的特点,分别设计了基因宏阵列单体（20~24 bp）、二聚体（40~48 bp）和单体加20个“A”（30~34 bp）3种寡核苷酸基因宏阵列检测探针来快速检测鉴定B群病原真菌。基因宏阵列检测结果表明：设计的检测探针均能准确、特异地检测鉴定B群的3种真菌,检测灵敏度从高到低依次为：二聚体探针、单体加20个“A”探针、单体探针。结论：在草坪土壤环境中,二聚体基因宏阵列检测探针（40~48 bp）对于Magnaporthe及其近缘种属菌株的检测较传统的单体检测探针更为灵敏与准确。
关键词
基因宏阵列
草坪斑枯病
MAGNAPORTHE
GAEUMANNOMYCES
核苷酸检测探针
系统发育
Keywords
macroarray
summer patch
Magnaporthe
Gaeumannomyces
oligonucleotide probes
phylogeny
分类号
S144.9 [农业科学—肥料学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
氯苯嘧啶醇施用对草坪斑枯病致病菌及根际土壤真菌的影响
赵爽
张宁
刘东阳
沈其荣
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
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职称材料
2
草坪斑枯病病原菌及其近缘种属的系统发育及基因宏阵列检测
赵爽
张宁
陈发棣
沈其荣
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
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