苹果锈果类病毒(ASSVd)的研究进展

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作者 徐惠媛 李世访 张志想 《植物保护》 北大核心 2025年第3期85-94,共10页

由苹果锈果类病毒(apple scar skin viroid,ASSVd)引起的苹果锈果病,是危害我国苹果生产的主要病害之一。不仅造成减产,而且降低果实品质,甚至使果实完全失去商品价值,造成严重的经济损失。更重要的是,苹果锈果病危害我国苹果生产已长... 由苹果锈果类病毒(apple scar skin viroid,ASSVd)引起的苹果锈果病,是危害我国苹果生产的主要病害之一。不仅造成减产,而且降低果实品质,甚至使果实完全失去商品价值,造成严重的经济损失。更重要的是,苹果锈果病危害我国苹果生产已长达百年。为增进对ASSVd的了解,更有效防控苹果锈果病,保障我国苹果产业的健康发展,本文综述了ASSVd的发现、分布与危害、生物学特性、基因组特征、遗传变异、检测方法及技术、致病机制以及防控等方面的研究进展。 展开更多

关键词 苹果 苹果锈果病 苹果锈果类病毒 类病毒病害 病害防控

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一步RT-PCR法检测苹果锈果类病毒和苹果凹果类病毒

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作者 马宁 孔令荣 +3 位作者 张学勇 赵玲玲 由春香 张振鲁 《落叶果树》 2024年第3期10-13,共4页

由类病毒引起的苹果病害在中国苹果主产区普遍发生,严重制约苹果产业的健康发展。对采自不同地区的带有典型症状的弘前富士、南方脆及惠民短枝富士果实,进行苹果锈果类病毒(ASSVd)和凹果类病毒(ADFVd)检测,发现两种病毒能够共侵染。根据... 由类病毒引起的苹果病害在中国苹果主产区普遍发生,严重制约苹果产业的健康发展。对采自不同地区的带有典型症状的弘前富士、南方脆及惠民短枝富士果实,进行苹果锈果类病毒(ASSVd)和凹果类病毒(ADFVd)检测,发现两种病毒能够共侵染。根据ASSVd和ADFVd保守序列设计通用引物,建立了能快速、同时检测两种类病毒的RT-PCR方法。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 苹果凹果类病毒 RT-PCR检测

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苹果锈果类病毒实时荧光PCR检测方法的建立 被引量：18

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作者 吴然 李君英 +2 位作者 邵建柱 孙建设 张鹤 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期150-155,共6页

【目的】建立苹果锈果类病毒(ASSVd)检测灵敏的方法。【方法】根据Gen Bank中ASSVd的RNA序列设计特异性引物ASSVd-F和ASSVd-R,利用实时荧光PCR方法对其进行检测,并对体系的特异性、灵敏性及适用性进行验证。【结果】实时荧光PCR体系能... 【目的】建立苹果锈果类病毒(ASSVd)检测灵敏的方法。【方法】根据Gen Bank中ASSVd的RNA序列设计特异性引物ASSVd-F和ASSVd-R,利用实时荧光PCR方法对其进行检测,并对体系的特异性、灵敏性及适用性进行验证。【结果】实时荧光PCR体系能检测至1×10-6的模板浓度,而常规RT-PCR只能检测至1×10-4,由此可知,实时荧光PCR体系灵敏度高于常规RT-PCR 100倍;引物特异性强,能特异检测ASSVd,对苹果褪绿叶斑病毒(ACLSV)、苹果茎沟病毒(ASGV)、苹果茎痘病毒(ASPV)均不能检出;适用性广,可检测出植物不同部位的ASSVd。【结论】所建立的方法能够灵敏检测ASSVd,特异性强,适用性广。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒(ASSVd) 检测 实时荧光PCR

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苹果锈果类病毒山东栖霞分离物的分子鉴定及序列分析 被引量：12

4

作者 马伟 姜冬梅 +5 位作者 陈丽芳 张志想 李世访 贺振 史学功 王红清 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期91-94,共4页

本研究以采自山东省栖霞市的两个苹果样品为试验材料,利用二维电泳、斑点杂交、RT-PCR等分子生物学技术对样品中的苹果锈果类病毒(ASSVd)带毒情况进行了检测。结果表明:两个样品均携带ASSVd。对两个样品中的ASSVd进行克隆测序,并利用生... 本研究以采自山东省栖霞市的两个苹果样品为试验材料,利用二维电泳、斑点杂交、RT-PCR等分子生物学技术对样品中的苹果锈果类病毒(ASSVd)带毒情况进行了检测。结果表明:两个样品均携带ASSVd。对两个样品中的ASSVd进行克隆测序,并利用生物学软件DNAMAN对所得序列进行分析,结果表明:与世界上首次报道的ASSVd序列(X17696)相比,本研究所得到的ASSVd序列变异较小,相对比较保守。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 检测 序列分析

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新疆桃树上苹果锈果类病毒(ASSVd)的检测与全序列分析 被引量：25

5

作者 赵英 牛建新 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期274-276,共3页

在以往研究苹果和梨ASSVd的基础上,利用RT-PCR技术对新疆的桃树进行了检测,检测过程中首次发现桃树上有ASSVd类病毒的存在,利用RT-PCR技术分别获得了其全长序列,通过回收克隆测序,发现桃树苹果锈果类病毒基因组长为331 nt,将克隆测序结... 在以往研究苹果和梨ASSVd的基础上,利用RT-PCR技术对新疆的桃树进行了检测,检测过程中首次发现桃树上有ASSVd类病毒的存在,利用RT-PCR技术分别获得了其全长序列,通过回收克隆测序,发现桃树苹果锈果类病毒基因组长为331 nt,将克隆测序结果在GenBank中登录,获得了桃树上的10条ASSVd的序列登录号为:EU031477～EU031486。为快速鉴定桃树苹果锈果类病毒奠定了良好基础。 展开更多

关键词 桃 苹果锈果类病毒 RT-PCR 序列分析

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新疆梨树上苹果锈果类病毒的检测与全序列分析 被引量：4

6

作者 王钰婷 金珠 +3 位作者 董芳园 和世玉 张莉 牛建新 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期94-99,共6页

[目的]检测并分析新疆和静县223团场多年生早熟梨树上的苹果锈果类病毒(ASSVd)。[方法]对采自新疆和静县223团多年生早熟梨的枝条和叶片样品进行RNA抽提,经RT-PCR技术鉴定检测。[结果](1)多年生早熟梨树检测到苹果锈果类病毒,得到2条AS... [目的]检测并分析新疆和静县223团场多年生早熟梨树上的苹果锈果类病毒(ASSVd)。[方法]对采自新疆和静县223团多年生早熟梨的枝条和叶片样品进行RNA抽提,经RT-PCR技术鉴定检测。[结果](1)多年生早熟梨树检测到苹果锈果类病毒,得到2条ASSVd核酸序列(JX861258～JX861259),所得序列与GenBank中已报道的国内外ASSVd序列同源性达86%以上。(2)原位RT-PCR检测进一步表明ASSVd的RNA阳性信号主要位于叶片肉组织的细胞核内。[结论]通过序列分析比对,各寄主上的ASSVd分离物核酸序列变异较小,地域和品种间核酸序列无明显差异。建立了优化的RT-PCR检测及原位RT-PCR检测方法,为果树ASSVd的快速检测奠定了良好的基础。 展开更多

关键词 梨树 苹果锈果类病毒(ASSVd) 检测 序列分析

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苹果锈果类病毒的几种提取方法及RT-PCR检测灵敏度的比较 被引量：4

7

作者 苏前富 郭瑞 +2 位作者 李世访 白容霖 成卓敏 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期95-97,共3页

以感染苹果锈果类病毒的苹果枝条为材料,利用不同的方法抽提,进行RT-PCR检测。比较了6种RNA的提取方法,结果发现:LiCl法、RNeasy plant mini kit和NA-PEX法检测效果较佳。RNeasy plant mini kit可检测到10-2,NA-PEX可检测到10-1;RNeasy ... 以感染苹果锈果类病毒的苹果枝条为材料,利用不同的方法抽提,进行RT-PCR检测。比较了6种RNA的提取方法,结果发现:LiCl法、RNeasy plant mini kit和NA-PEX法检测效果较佳。RNeasy plant mini kit可检测到10-2,NA-PEX可检测到10-1;RNeasy plant mini kit检测效果好于NA-PEX,但价格比较贵,需要研磨;NA-PEX法组织无需液氮研磨,试剂便宜,耗时短,适合检测大批量的样品。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 RT-PCR NA-PEX 快速提取RNA

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苹果锈果类病毒新疆分离物的克隆和序列分析 被引量：20

8

作者 赵英 牛建新 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期896-898,共3页

利用自行设计的方法分离提取总RNA,通过一对特异引物,扩增出苹果锈果类病毒的全长片段,该片段通过回收、克隆和测序,结果发现该片段全长330bp,与已发表的NC_001340同源性为99.7%,仅在第126有一个碱基差异。由此证明该片段是苹果锈果类... 利用自行设计的方法分离提取总RNA,通过一对特异引物,扩增出苹果锈果类病毒的全长片段,该片段通过回收、克隆和测序,结果发现该片段全长330bp,与已发表的NC_001340同源性为99.7%,仅在第126有一个碱基差异。由此证明该片段是苹果锈果类病毒的全长序列,进一步证明该反应体系能很好地用于苹果锈果类病毒的RT-PCR检测,为快速鉴定类病毒奠定了良好基础。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 RT—PCR 基因组 测序

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北京平谷区苹果锈果类病毒检测初报 被引量：5

9

作者 邢飞 张志想 +2 位作者 陈策 王红清 李世访 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期139-142,共4页

采集北京市平谷区‘中秋王’、‘寒富’苹果叶片样品共12份,以Northern杂交、RT-PCR方法检测苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid,ASSVd）带毒情况。结果表明,表现明显锈果症状的‘中秋王’样品均检出ASSVd,无明显症状的‘中秋王’... 采集北京市平谷区‘中秋王’、‘寒富’苹果叶片样品共12份,以Northern杂交、RT-PCR方法检测苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid,ASSVd）带毒情况。结果表明,表现明显锈果症状的‘中秋王’样品均检出ASSVd,无明显症状的‘中秋王’样品没有检出ASSVd,而无明显症状的‘寒富’样品全部携带ASSVd。测序发现,所得序列与NCBI中已报道的ASSVd基因组序列相似性为91%～99%,且两品种中ASSVd主流序列完全相同。结果说明‘中秋王’对ASSVd较为敏感,感病后易于表现出明显的锈果症状;‘寒富’对ASSVd耐性较强,感病后不表现出明显症状。 展开更多

关键词 苹果锈果病 苹果锈果类病毒 品种

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应用RT-PCR和斑点杂交法检测新疆梨树上的苹果锈果类病毒 被引量：12

10

作者 赵英 牛建新 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期761-764,共4页

利用自行设计的方法分离提取总RNA,通过一对特异引物,分别扩增出不同梨树品种上苹果锈果类病毒的特异片段,通过对库尔勒香梨品种上获得的特异片段回收、克隆和测序。结果表明,该片段长250bp,与已发表的AF421195同源性为99%,在此基础上... 利用自行设计的方法分离提取总RNA,通过一对特异引物,分别扩增出不同梨树品种上苹果锈果类病毒的特异片段,通过对库尔勒香梨品种上获得的特异片段回收、克隆和测序。结果表明,该片段长250bp,与已发表的AF421195同源性为99%,在此基础上利用克隆的ASSVd质粒,通过RT-PCR合成了生物素标记的cDNA探针,利用该探针对梨样品进行了斑点杂交检测,取得了很好的检测效果。进一步证明该反应体系能很好地用于梨树苹果锈果类病毒的RT-PCR检测。 展开更多

关键词 梨树 新疆 苹果锈果类病毒 RT—PCR CDNA探针 测序

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侵染小苹果的苹果锈果类病毒的检测和全序列分析 被引量：3

11

作者 郝璐 叶婷 +3 位作者 王少杰 国立耘 范在丰 周涛 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期126-128,177,共4页

小苹果是抗寒海棠类与大苹果的杂交后代,因耐寒能力强,口感好,被广泛用于嫁接与育种材料,是我国寒凉苹果产区宝贵的种质资源。苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)侵染苹果后引起果实表面产生锈状斑、花脸、畸形等症状,严重... 小苹果是抗寒海棠类与大苹果的杂交后代,因耐寒能力强,口感好,被广泛用于嫁接与育种材料,是我国寒凉苹果产区宝贵的种质资源。苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)侵染苹果后引起果实表面产生锈状斑、花脸、畸形等症状,严重降低果实品质和市场价值。2013年在调查苹果病毒病时发现北京市延庆县种植的小苹果表现出典型畸形症状,应用RT-PCR方法对其进行检测后经测序和序列分析表明,小苹果被苹果锈果类病毒侵染。克隆此分离物(ASSVd-YQ)全基因组序列,分析后得到其基因组全长为329个核苷酸,系统发育分析表明该分离物与来自不同国家和地区的ASSVd分离物间的进化关系极近。二级结构预测表明,该分离物的中央保守区与末端保守区与ASSVd参考序列相同。这是对侵染小苹果的ASSVd的首次检测和鉴定。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 小苹果 分子检测 序列分析

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苹果锈果类病毒RT-PCR检测体系的建立 被引量：9

12

作者 杨金凤 吕运霞 +2 位作者 唐兴敏 王亚南 曹克强 《中国果树》 2015年第5期62-67,共6页

为了开发苹果锈果类病毒（ASSVd）快速、准确的RT—PCR检测方法，以感染苹果锈果类病毒的田间苹果枝条为试材，对苹果锈果类病毒RT—PCR反应体系和程序进行选择和优化，利用优化的检测体系对保定市曲阳县苹果园苗木及3—5年生母本树苹... 为了开发苹果锈果类病毒（ASSVd）快速、准确的RT—PCR检测方法，以感染苹果锈果类病毒的田间苹果枝条为试材，对苹果锈果类病毒RT—PCR反应体系和程序进行选择和优化，利用优化的检测体系对保定市曲阳县苹果园苗木及3—5年生母本树苹果锈果病的发生情况进行检测，验证该体系的可靠性。结果表明：自行设计引物ASSVdQCxin3特异性最好，优化体系灵敏度达到能够检测3．75ng新鲜样本中的病毒，可准确、灵敏检测苹果锈果类病毒田间样本；曲阳县苹果园48株苗木中携带苹果锈果类病毒13株，带毒率为27．1％；18株母本树中携带苹果锈果类病毒5株，带毒率为27.8％。 展开更多

关键词 苹果 苹果锈果病 苹果锈果类病毒 RT-PCR 检测

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新疆苹果树上苹果锈果类病毒(ASSVd)的检测与全序列分析 被引量：1

13

作者 孙晓霞 王钰婷 牛建新 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期693-698,共6页

【目的】检测并分析新疆223团场多年生苹果树上的苹果锈果类病毒。【方法】对采自新疆库尔勒223团的多年生苹果树的枝条、叶片、果实((果皮、种子))样品进行RNA提取,利用RT-PCR技术检测鉴定。【结果】(1)多年生的‘金冠’苹果树上检测... 【目的】检测并分析新疆223团场多年生苹果树上的苹果锈果类病毒。【方法】对采自新疆库尔勒223团的多年生苹果树的枝条、叶片、果实((果皮、种子))样品进行RNA提取,利用RT-PCR技术检测鉴定。【结果】(1)多年生的‘金冠’苹果树上检测到苹果锈果类病毒,得到4条克隆序列(ASSVd Y1:KC110858;ASSVd Y6:KC110859;ASSVd Y8:KC110860;ASSVd Y10:KC110861),所得序列与Gen Bank中已报道的国内外ASSVd序列同源性达85%以上。(2)序列比对可知,4条‘金冠’分离物序列之间只有3个碱基变异,与首次登录生物X17696有26个碱基变异,其中有4个碱基缺失和5个碱基插入,且变异多集中在类病毒序列的TL与TR区。【结论】通过序列分析比对,各寄主上的ASSVd分离物核酸序列变异较小,建立了优化的RT-PCR检测方法,为苹果树ASSVd的快速检测奠定了良好的基础。 展开更多

关键词 苹果树 苹果锈果类病毒(ASSVd) 检测 序列分析

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苹果锈果类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立 被引量：1

14

作者 张永江 辛言言 +1 位作者 朱水芳 李世访 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期151-156,共6页

苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯... 苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以获得有效的杂交信号,其灵敏度与RT-PCR电泳法相当。该芯片可用于苹果锈果类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒属 属级探针 寡核苷酸芯片

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苹果锈果类病毒RNA序列的生物信息学分析 被引量：2

15

作者 陈建刚 王海波 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第8期4112-4114,4125,共4页

[目的]为苹果锈果类病毒结构域功能的关系、复制机制、变异与进化的研究提供理论依据。[方法]应用生物信息学的方法,得到一系列苹果锈果类病毒的RNA序列,对比其核苷酸数目、碱基组成比例,并进行了多重系列对比及二级结构预测。[结果]来... [目的]为苹果锈果类病毒结构域功能的关系、复制机制、变异与进化的研究提供理论依据。[方法]应用生物信息学的方法,得到一系列苹果锈果类病毒的RNA序列,对比其核苷酸数目、碱基组成比例,并进行了多重系列对比及二级结构预测。[结果]来自不同地区的苹果锈果类病毒RNA和核苷酸数目分布在329～336bp。其中核苷酸数为330bp的种类占64.71%,其A的分布范围19.39%～20.61%,T的分布范围在18.79%～20.91%,G的分布范围在29.70%～30.61%,C的分布范围在30.00%～30.91%。用RNAstructure软件进行苹果锈果类病毒的二级结构预测,随着稳定能量级的逐渐增加,其碱基配对区逐渐减小,而茎环区却逐渐增加。[结论]RNA是生物生命活动不可或缺的重要生物大分子,其二级结构比一级结构具有更大的保守性。 展开更多

关键词 类病毒 苹果锈果类病毒 生物信息学分析

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生物素标记cDNA探针检测苹果锈果类病毒 被引量：1

16

作者 赵英 牛建新 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期302-307,共6页

以含苹果锈果类病毒(ASSVd)全长序列的重组质粒PUC为模板DNA,加入ASSVd类病毒特异性引物,应用聚合酶链式反应技术(PCR)合成了生物素标记的cDNA探针,在斑点杂交反应中,探针最适使用浓度为1/10,探针检测感病的ASSVd类病毒的最大稀释倍数是... 以含苹果锈果类病毒(ASSVd)全长序列的重组质粒PUC为模板DNA,加入ASSVd类病毒特异性引物,应用聚合酶链式反应技术(PCR)合成了生物素标记的cDNA探针,在斑点杂交反应中,探针最适使用浓度为1/10,探针检测感病的ASSVd类病毒的最大稀释倍数是1/100。利用制备的探针进行田间检测,结果与RT-PCR检测结果一致,阴性对照均无杂交信号出现。 展开更多

关键词 CDNA探针 检测 苹果锈果类病毒

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苹果锈果类病毒山东文登峰山分离物的克隆 被引量：1

17

作者 刘娟 赵玲玲 +1 位作者 宋来庆 姜中武 《烟台果树》 2014年第4期12-14,共3页

苹果锈果病又名花脸病或裂果病,是严重影响苹果生产的主要病毒病之一.广泛分布于东北、西北、华北各苹果产区,目前仍有扩大蔓延趋势.其病原物为苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid,ASSVd）,主要侵染苹果和梨,最新研究发现还可侵染... 苹果锈果病又名花脸病或裂果病,是严重影响苹果生产的主要病毒病之一.广泛分布于东北、西北、华北各苹果产区,目前仍有扩大蔓延趋势.其病原物为苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid,ASSVd）,主要侵染苹果和梨,最新研究发现还可侵染桃、杏、樱桃核果类果树.感病苹果因品种和环境条件的变化果实表现为5种病状：锈果型、花脸型、锈果-花脸型、环斑型和绿点型,发病较重的果实发生畸形龟裂,大大降低果品的食用价值和经济价值.对文登峰山地区富士苹果进行ASSVd扩增和克隆,以期明确ASSVd在文登地区富士苹果上的变异情况. 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 克隆 分离物 山东 富士苹果 核果类果树 苹果生产 苹果产区

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阿泰灵对苹果锈果类病毒病田间防效及机制研究 被引量：15

18

作者 党海月 张妮妮 +9 位作者 朱明旗 王妍 逯茜 王思敏 梁晓飞 张荣 邹养军 查养良 张志林 孙广宇 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期123-128,共6页

由苹果锈果类病毒引起的苹果花脸病或锈果病在中国发生普遍﹐目前尚缺乏有效的防治方法。新型蛋白诱抗剂阿泰灵能有效激活免疫,已在大田作物和蔬菜上成功应用。本研究探索阿泰灵对苹果花脸型和锈果型类病毒的防治效果,并分析其提高苹果... 由苹果锈果类病毒引起的苹果花脸病或锈果病在中国发生普遍﹐目前尚缺乏有效的防治方法。新型蛋白诱抗剂阿泰灵能有效激活免疫,已在大田作物和蔬菜上成功应用。本研究探索阿泰灵对苹果花脸型和锈果型类病毒的防治效果,并分析其提高苹果树抗病性机制。在生长前期,采用阿泰灵对苹果树进行根淄和叶片喷施处理;在果实成熟期,进行发病情况调查。结果显示阿泰灵处理对‘富士’品种花脸病防效为91.7%,对‘G20'优系花脸病防效为92.3%,对‘秦蜜’品种锈果病防效为67.3%,表明阿泰灵对花脸型和锈果型苹果类病毒病害均有防效。采用阿泰灵处理苹果愈伤组织,利用qRT-PCR检测PRla、PR8、PR10a、PR10b、PR10c、PR10d及DEFl等病程相关蛋白基因的表达情况。结果显示,这些基因均明显上调表达,不同基因诱导表达的时间及程度存在差别,其中PR8最大相对表达量达到41.2倍,PR10a、PR10b、PR10c及PR10d等达到8倍左右,PRla达到5倍﹐DEFl达到3.9倍,推测阿泰灵可能通过诱导病程相关蛋白表达提高苹果树对苹果类病毒的抗病性。 展开更多

关键词 苹果锈果类病毒 免疫诱抗剂 抗病相关蛋白 病毒病 脱毒

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我国部分苹果产区苹果锈果类病毒的检测和全序列分析 被引量：8

19

作者 陈冉冉 谢吉鹏 +3 位作者 叶婷 董云浩 国立耘 周涛 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期97-102,共6页

近年来,由苹果锈果类病毒Apple scar skin viroid(ASSVd)引起的苹果花脸病、锈果病在我国一些苹果产区日趋严重,对我国苹果生产和苹果产业发展造成严重危害。为了解ASSVd在我国一些苹果产区的发生和变异情况,采用RT-PCR对陕西、山东、... 近年来,由苹果锈果类病毒Apple scar skin viroid(ASSVd)引起的苹果花脸病、锈果病在我国一些苹果产区日趋严重,对我国苹果生产和苹果产业发展造成严重危害。为了解ASSVd在我国一些苹果产区的发生和变异情况,采用RT-PCR对陕西、山东、山西、河北、北京和黑龙江6个苹果产区的35份苹果样品进行检测,并克隆获得30个分离物的基因组全序列,大小为330~333个核苷酸。分析表明,这些分离物的基因组全序列与GenBank中ASSVd基因组核苷酸序列相似度为96%~100%,在苹果锈果类病毒属的末端保守区及中央保守区保守,在致病区和左端区域有突变,一些分离物的突变位点相同。系统发育分析表明分离物因相同的突变位点而聚类,而与地理来源无关。 展开更多

关键词 苹果 苹果锈果类病毒 RT-PCR 变异分析 系统发育

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苹果锈果类病毒火焰海棠分离物全基因组克隆及序列分析 被引量：7

20

作者 张富军 张振鲁 +3 位作者 张蕊芬 王寻 由春香 郝玉金 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1005-1012,共8页

【目的】检测从山东青岛采集的有“花脸”症状的火焰海棠(Malus‘Flame’)果实是否带有苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)。【方法】提取带有“花脸”症状的火焰海棠果皮总RNA,设计ASSVd特异性引物,利用RTPCR方法进行检测... 【目的】检测从山东青岛采集的有“花脸”症状的火焰海棠(Malus‘Flame’)果实是否带有苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)。【方法】提取带有“花脸”症状的火焰海棠果皮总RNA,设计ASSVd特异性引物,利用RTPCR方法进行检测。设计基因特异性引物扩增ASSVd基因组全长,并进行克隆、测序,利用CLC RNAWorkbench4预测其二级结构。用DANMAN软件比对来自中国不同地区、不同寄主的苹果锈果类病毒分离物基因序列。用MEGA-7软件分析山东火焰海棠ASSVd分离物与来自不同国家、不同寄主ASSVd分离物的遗传关系。【结果】从山东青岛采集的表现“花脸”症状的火焰海棠果皮中检测到ASSVd,推测火焰海棠果皮的“花脸”症状可能由ASSVd引起。利用基因特异性引物克隆4条ASSVd基因组全长序列,其长度为333~334 bp,在GenBank的登录号依次为MK102981-MK102984。ASSVd序列比对结果显示,来源于不同寄主的分离物存在差异。系统进化树显示ASSVd不存在明显的地区专化性,进一步对ASSVd二级结构分析发现不同寄主的ASSVd致病区(P)存在明显的差异。【结论】从山东青岛采集的带有“花脸”症状的火焰海棠果实带有ASSVd。本研究从火焰海棠检测到ASSVd,明确其为自然寄主之一,且火焰海棠果实的“花脸”症状形成可能与ASSVd侵染有关。 展开更多

关键词 火焰海棠 苹果锈果类病毒 序列分析 寄主特异性

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