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毛茛中与苯丙烷生物合成途径相关的1R-MYB类转录因子的鉴定与分析
1
作者
樊金世博
钟欣欣
+3 位作者
单婷玉
张京晶
王郅炜
吴家文
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期478-487,共10页
1R-MYB家族在植物生长发育、抗胁迫、次生代谢物合成中具有重要的调控作用。本研究基于毛茛(Ranunculus japonicus Thunb.)的全长转录组测序数据库,分析了其1R-MYB家族成员的基序、系统进化关系、表达特性、空间结构及功能。结果共鉴定...
1R-MYB家族在植物生长发育、抗胁迫、次生代谢物合成中具有重要的调控作用。本研究基于毛茛(Ranunculus japonicus Thunb.)的全长转录组测序数据库,分析了其1R-MYB家族成员的基序、系统进化关系、表达特性、空间结构及功能。结果共鉴定出221个1R-MYB基因,其中18个通过KEGG富集到苯丙烷生物合成途径,可能调控此途径中的过氧化物酶。研究结果为深入探究毛茛1R-MYB转录因子调控苯丙烷的生物合成机制奠定了基础。
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关键词
毛茛
转录因子
全长转录组
1R-MYB
苯丙烷生物合成途径
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职称材料
千年桐根部黄酮类化合物生物合成对枯萎病菌侵染的响应
被引量：
5
2
作者
王嘉
梁晓洁
+7 位作者
高暝
吴立文
赵耘霄
汪阳东
黄世清
张永志
傅火勇
陈益存
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期159-170,共12页
【目的】油桐枯萎病是一种土传的根部真菌病害,严重危害油桐主栽品种三年桐,极大地限制了其规模化栽培。而同属的千年桐具有抗枯萎病能力,其根部防御作用机制的研究可以为抗枯萎病防治和抗性育种提供思路。【方法】利用乙酸乙酯萃取法...
【目的】油桐枯萎病是一种土传的根部真菌病害,严重危害油桐主栽品种三年桐,极大地限制了其规模化栽培。而同属的千年桐具有抗枯萎病能力,其根部防御作用机制的研究可以为抗枯萎病防治和抗性育种提供思路。【方法】利用乙酸乙酯萃取法获得三年桐和千年桐根部提取物;基于高效液相色谱和串联质谱检测病原菌侵染后三年桐和千年桐根部代谢物成分;利用Illumina HiSeqTM2000、检测病原菌侵染过程中三年桐和千年桐根部基因表达变化规律和通路变化,并利用实时定量PCR试验验证基因表达规律;利用R软件包等生物信息学方法进行数据分析。【结果】1)与三年桐相比,千年桐根部提取物对油桐枯萎病菌的生长有明显的抑制作用;2)病原菌侵染后千年桐根部产生的芒柄花苷、橙皮苷等异黄酮和黄烷酮化合物是三年桐的1000倍以上;3)病原菌侵染后千年桐根部负责黄酮类化合物生物合成的上游关键通路“苯丙烷类生物合成途径”显著富集;4)苯丙烷类生物合成途径中有4个中心基因,包括4-香豆酸CoA连接酶、β-D-木糖苷酶、β-葡萄糖苷酶和过氧化物酶N1,通过实时定量PCR试验验证在病原菌侵染早期上调表达,且与其他1625基因具有极高的相关关系,激活苯丙烷类生物合成途径从而产生黄酮类化合物抵御病原菌入侵。【结论】通过代谢组和转录组联合分析,揭示了千年桐根部苯丙烷类生物合成途径在枯萎病病原菌入侵后发生响应,产生芒柄花苷、橙皮苷等黄酮类化合物,从而抵御病原菌入侵。
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关键词
油桐
枯萎病
黄酮类化合物
苯
丙烷
类
生物
合成
途径
中心基因
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职称材料
玉米花丝响应干旱胁迫的转录组学分析
被引量：
3
3
作者
朱凡
徐芷琪
+2 位作者
段雨洁
李阳阳
宋有洪
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期37-47,共11页
为探究花丝对干旱胁迫的分子响应,以安农591和先玉335为材料,设置土壤含水量为80%田间持水量(CK)和60%田间持水量(DS)的2个处理,在玉米花丝伸长速增期取样,进行转录组测序。通过对比2个品种干旱组和对照组的基因表达差异,明确玉米花丝...
为探究花丝对干旱胁迫的分子响应,以安农591和先玉335为材料,设置土壤含水量为80%田间持水量(CK)和60%田间持水量(DS)的2个处理,在玉米花丝伸长速增期取样,进行转录组测序。通过对比2个品种干旱组和对照组的基因表达差异,明确玉米花丝响应干旱的关键通路和相关候选基因。结果表明:苯丙烷类生物合成途径(ko00940)和淀粉和蔗糖代谢途径(ko00500)为玉米花丝响应干旱的关键通路。在苯丙烷类生物合成途径通路中编码4-香豆酸-辅酶A连接酶(4CL)、肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)、肉桂醇脱氢酶(CAD)和过氧化物酶(POD)的基因在干旱的玉米花丝中低表达。相关分析表明,编码4CL、CCR、CAD和POD的基因下调与木质素含量降低有关。在淀粉和蔗糖代谢途径中转化酶和蔗糖合酶基因在干旱的玉米花丝中低表达;相关分析表明,转化酶和蔗糖合酶基因下调与蔗糖代谢有关。综上所述,本研究确定了参与蔗糖和木质素代谢的关键基因和代谢物,木质素合成可能与玉米花丝耐旱相关,4CL、CCR、CAD和POD是木质素合成通路中玉米花丝耐旱的候选基因;此外,淀粉和蔗糖代谢途径可能与花丝伸长和花丝耐旱有关,转化酶和蔗糖合酶可能是调控花丝耐旱的关键酶。
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关键词
玉米
花丝
干旱胁迫
转录组
苯
丙烷
类
生物
合成
途径
淀粉和蔗糖代谢
途径
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职称材料
题名
毛茛中与苯丙烷生物合成途径相关的1R-MYB类转录因子的鉴定与分析
1
作者
樊金世博
钟欣欣
单婷玉
张京晶
王郅炜
吴家文
机构
安徽中医药大学研究生院
安徽中医药大学科研实验中心
安徽省中医药科学院
安徽道地中药材品质提升协同创新中心
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期478-487,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFC1701600)
安徽省自然科学基金项目(2008085MH268)
安徽省高等学校科学研究项目(2022AH050474)。
文摘
1R-MYB家族在植物生长发育、抗胁迫、次生代谢物合成中具有重要的调控作用。本研究基于毛茛(Ranunculus japonicus Thunb.)的全长转录组测序数据库,分析了其1R-MYB家族成员的基序、系统进化关系、表达特性、空间结构及功能。结果共鉴定出221个1R-MYB基因,其中18个通过KEGG富集到苯丙烷生物合成途径,可能调控此途径中的过氧化物酶。研究结果为深入探究毛茛1R-MYB转录因子调控苯丙烷的生物合成机制奠定了基础。
关键词
毛茛
转录因子
全长转录组
1R-MYB
苯丙烷生物合成途径
Keywords
Ranunculus japonicus
Transcription factors
Full-length transcriptome
1R-MYB
Phenylpropanoid biosynthesis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
千年桐根部黄酮类化合物生物合成对枯萎病菌侵染的响应
被引量：
5
2
作者
王嘉
梁晓洁
高暝
吴立文
赵耘霄
汪阳东
黄世清
张永志
傅火勇
陈益存
机构
中国林业科学研究院亚热带林业研究所
南京林业大学
安吉县龙山林场
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期159-170,共12页
基金
国家科技基础资源调查专项“工业油料树种种质资源调查收集”课题(2019FY100803)。
文摘
【目的】油桐枯萎病是一种土传的根部真菌病害,严重危害油桐主栽品种三年桐,极大地限制了其规模化栽培。而同属的千年桐具有抗枯萎病能力,其根部防御作用机制的研究可以为抗枯萎病防治和抗性育种提供思路。【方法】利用乙酸乙酯萃取法获得三年桐和千年桐根部提取物;基于高效液相色谱和串联质谱检测病原菌侵染后三年桐和千年桐根部代谢物成分;利用Illumina HiSeqTM2000、检测病原菌侵染过程中三年桐和千年桐根部基因表达变化规律和通路变化,并利用实时定量PCR试验验证基因表达规律;利用R软件包等生物信息学方法进行数据分析。【结果】1)与三年桐相比,千年桐根部提取物对油桐枯萎病菌的生长有明显的抑制作用;2)病原菌侵染后千年桐根部产生的芒柄花苷、橙皮苷等异黄酮和黄烷酮化合物是三年桐的1000倍以上;3)病原菌侵染后千年桐根部负责黄酮类化合物生物合成的上游关键通路“苯丙烷类生物合成途径”显著富集;4)苯丙烷类生物合成途径中有4个中心基因,包括4-香豆酸CoA连接酶、β-D-木糖苷酶、β-葡萄糖苷酶和过氧化物酶N1,通过实时定量PCR试验验证在病原菌侵染早期上调表达,且与其他1625基因具有极高的相关关系,激活苯丙烷类生物合成途径从而产生黄酮类化合物抵御病原菌入侵。【结论】通过代谢组和转录组联合分析,揭示了千年桐根部苯丙烷类生物合成途径在枯萎病病原菌入侵后发生响应,产生芒柄花苷、橙皮苷等黄酮类化合物,从而抵御病原菌入侵。
关键词
油桐
枯萎病
黄酮类化合物
苯
丙烷
类
生物
合成
途径
中心基因
Keywords
tung oil trees
Fusarium wilt disease
flavonoids
phenylpropanoid biosynthesis
hub genes
分类号
S763.7 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
玉米花丝响应干旱胁迫的转录组学分析
被引量：
3
3
作者
朱凡
徐芷琪
段雨洁
李阳阳
宋有洪
机构
安徽农业大学农学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期37-47,共11页
基金
安徽省自然科学基金项目(2208085MC59)。
文摘
为探究花丝对干旱胁迫的分子响应,以安农591和先玉335为材料,设置土壤含水量为80%田间持水量(CK)和60%田间持水量(DS)的2个处理,在玉米花丝伸长速增期取样,进行转录组测序。通过对比2个品种干旱组和对照组的基因表达差异,明确玉米花丝响应干旱的关键通路和相关候选基因。结果表明:苯丙烷类生物合成途径(ko00940)和淀粉和蔗糖代谢途径(ko00500)为玉米花丝响应干旱的关键通路。在苯丙烷类生物合成途径通路中编码4-香豆酸-辅酶A连接酶(4CL)、肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)、肉桂醇脱氢酶(CAD)和过氧化物酶(POD)的基因在干旱的玉米花丝中低表达。相关分析表明,编码4CL、CCR、CAD和POD的基因下调与木质素含量降低有关。在淀粉和蔗糖代谢途径中转化酶和蔗糖合酶基因在干旱的玉米花丝中低表达;相关分析表明,转化酶和蔗糖合酶基因下调与蔗糖代谢有关。综上所述,本研究确定了参与蔗糖和木质素代谢的关键基因和代谢物,木质素合成可能与玉米花丝耐旱相关,4CL、CCR、CAD和POD是木质素合成通路中玉米花丝耐旱的候选基因;此外,淀粉和蔗糖代谢途径可能与花丝伸长和花丝耐旱有关,转化酶和蔗糖合酶可能是调控花丝耐旱的关键酶。
关键词
玉米
花丝
干旱胁迫
转录组
苯
丙烷
类
生物
合成
途径
淀粉和蔗糖代谢
途径
Keywords
Maize
Silks
Drought stress
Transcriptome
Phenylpropanoid biosynthesis
Starch and sucrose metabolism
分类号
S513.03 [农业科学—作物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
毛茛中与苯丙烷生物合成途径相关的1R-MYB类转录因子的鉴定与分析
樊金世博
钟欣欣
单婷玉
张京晶
王郅炜
吴家文
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
千年桐根部黄酮类化合物生物合成对枯萎病菌侵染的响应
王嘉
梁晓洁
高暝
吴立文
赵耘霄
汪阳东
黄世清
张永志
傅火勇
陈益存
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022
5
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职称材料
3
玉米花丝响应干旱胁迫的转录组学分析
朱凡
徐芷琪
段雨洁
李阳阳
宋有洪
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024
3
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