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苦楝丛枝植原体相关膜蛋白基因分析及结构预测
1
作者
吴德喜
袁恩平
+2 位作者
王连春
蔡红
陈海如
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期310-316,共7页
根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定。结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸...
根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定。结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸的SecY蛋白,序列同源性显示该片段与"Ca.Phytoplas-ma asteris"(16SrI组)中的株系最高,达94%～99%;构建16SrI组内基于secY序列的系统进化树,认为该株系为secY(I)-O亚组。扩增的免疫膜蛋白DNA片段长1 176 bp,编码1个包含233个氨基酸的免疫膜蛋白(Amp)。蛋白结构预测显示secY亚基蛋白是一个有9个跨膜区的整合跨膜蛋白,而Amp蛋白是一类两端具有明显跨膜区,且N-端有多肽切割位点的Ⅲ型膜蛋白。
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关键词
苦楝丛枝植原体
膜蛋白
SECY
AMP
结构预测
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职称材料
题名
苦楝丛枝植原体相关膜蛋白基因分析及结构预测
1
作者
吴德喜
袁恩平
王连春
蔡红
陈海如
机构
云南农业大学
出处
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期310-316,共7页
基金
国家自然科学基金(31060239)
云南省科技创新人才计划项目(2011HB026)
文摘
根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定。结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸的SecY蛋白,序列同源性显示该片段与"Ca.Phytoplas-ma asteris"(16SrI组)中的株系最高,达94%～99%;构建16SrI组内基于secY序列的系统进化树,认为该株系为secY(I)-O亚组。扩增的免疫膜蛋白DNA片段长1 176 bp,编码1个包含233个氨基酸的免疫膜蛋白(Amp)。蛋白结构预测显示secY亚基蛋白是一个有9个跨膜区的整合跨膜蛋白,而Amp蛋白是一类两端具有明显跨膜区,且N-端有多肽切割位点的Ⅲ型膜蛋白。
关键词
苦楝丛枝植原体
膜蛋白
SECY
AMP
结构预测
Keywords
Chinaberry witches＇-broom phytoplasma
membrane protein
secY
amp
structure pre-diction
分类号
S718.87 [农业科学—林学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苦楝丛枝植原体相关膜蛋白基因分析及结构预测
吴德喜
袁恩平
王连春
蔡红
陈海如
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2013
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