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绿脓杆菌芳香硫酸酯酶序列与活性关系的初步表征
被引量:
1
1
作者
李雨薇
袁梅
+1 位作者
杨晓兰
廖飞
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期107-112,共6页
目的:通过定点突变初步表征绿脓杆菌芳香硫酸酯酶(Pseudomonas Aeruginosa arylsulfatase,PAAS)序列-活性关系,识别通过迭代饱和突变提高突变体比活性的合适位点。方法:分析PAAS活性中心三维构象初步识别催化相关位点;定点突变获得突变...
目的:通过定点突变初步表征绿脓杆菌芳香硫酸酯酶(Pseudomonas Aeruginosa arylsulfatase,PAAS)序列-活性关系,识别通过迭代饱和突变提高突变体比活性的合适位点。方法:分析PAAS活性中心三维构象初步识别催化相关位点;定点突变获得突变体,重组表达后Ni2+-NTA亲和纯化,表征其酶学性质。结果:与野生型相比,R55、M72、G138、D317、K375等位点用常见氨基酸替换/突变都显著降低其催化活性;R55、D317和K375等突变显著降低底物选择性和/或热稳定性,而M72和G138突变主要改变其催化活性。结论:M72和G138适合作为通过迭代饱和突变实施定向进化的候选位点。
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关键词
芳香硫酸酯酶
定点突变
表征
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职称材料
芳香硫酸酯酶定点饱和突变方案的比较
2
作者
李亚平
种慧敏
+5 位作者
袁梅
周伟
卢进鹏
胡小蕾
廖飞
杨晓兰
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期459-464,共6页
目的比较随机引物与精确引物PCR扩增实施绿脓杆菌芳香硫酸酯酶(Pseudomonas aeruginosa arylsulfatase, PAAS)定点饱和突变的整体效率及成本,以建立高效实用的定点饱和突变方案。方法以大肠杆菌碱性磷酸酶(Escherichia coli alkaline ph...
目的比较随机引物与精确引物PCR扩增实施绿脓杆菌芳香硫酸酯酶(Pseudomonas aeruginosa arylsulfatase, PAAS)定点饱和突变的整体效率及成本,以建立高效实用的定点饱和突变方案。方法以大肠杆菌碱性磷酸酶(Escherichia coli alkaline phosphatase, ECAP)与PAAS融合表达质粒为模板,分别用针对PAAS目的位点的随机引物、精确引物等量混合物及单个精确引物,进行全质粒PCR扩增构建定点饱和突变体库;碱裂解细胞后高通量测定PAAS突变体与ECAP活性比值进行筛选,比较3种定点饱和突变建库方案需筛选的单克隆数量、所获突变体种类、整体耗时、整体成本及影响因素。结果用随机引物PCR对M72位定点饱和突变有明显密码子偏好性,筛选超600个单克隆仅获得10种预期突变体,但对G138位定点饱和突变未见明显的密码子偏好性且筛选不到150个单克隆获得18种预期突变体;精确引物等量混合物对M72位实施定点饱和突变,筛选不超过190个克隆成功获得19种预期突变体;单个精确引物对M72位逐个PCR实施定点饱和突变,仅各筛选2个单克隆就获得19种预期突变体。单个精确引物逐个PCR实施定点突变所获饱和突变体库完整,需筛选的单克隆数最少,总耗时和总成本最低;相比之下,用随机引物和精确引物等量混合物实施定点饱和突变时,所需筛选的单克隆数、整体耗时及成本均显著增加。结论解析序列-活性关系时,用单个精确引物逐个PCR实施定点饱和突变有显著整体成本和效率优势;仅筛选阳性突变体时,用精确引物等量混合物进行PCR建库在成本和效率上更有优势。
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关键词
芳香硫酸酯酶
定点饱和突变
随机引物
精确引物等量混合物
单个精确引物
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职称材料
尿芳香基硫酸酯酶活性检测对肺癌的诊断价值
3
作者
包晓玲
杨磊
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第22期2490-2491,共2页
目的评价晨尿芳香基硫酸酯酶(arylsulphatase, ARS)活性检测在肺癌诊断中的应用价值。方法采用荧光测定法对98例肺癌患者、80例肺良性疾病及98例健康对照者的晨尿芳香基硫酸酯酶活性进行检测,并运用受试者工作特性(ROC)曲线评价...
目的评价晨尿芳香基硫酸酯酶(arylsulphatase, ARS)活性检测在肺癌诊断中的应用价值。方法采用荧光测定法对98例肺癌患者、80例肺良性疾病及98例健康对照者的晨尿芳香基硫酸酯酶活性进行检测,并运用受试者工作特性(ROC)曲线评价尿芳香基硫酸酯酶对肺癌的诊断效能。结果肺癌组的尿ARS活性为(0.359±0.111)U/L,明显高于肺良性疾病组的(0.214±0.082)U/L和健康对照组的(0.238±0.095)U/L,差异有统计学意义(P〈0.01);而肺良性疾病组和健康对照组的ARS活性差异无统计学意义(P=0.385)。ROC曲线分析结果显示,曲线下面积AUC为0.805(P〈0.01, 95%CI: 0.743~0.867),最佳诊断界点值为0.295 U/L,此时尿ARS活性诊断肺癌的敏感度和特异度分别为81.1%和66.7%。结论尿ARS活性检测在肺癌诊断中具有很好的临床应用价值。
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关键词
芳香
基
硫酸酯酶
肺癌
诊断
受试者工作特性曲线
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职称材料
Pseudoalteromonas carrageenovora芳香基硫酸酯酶突变文库热稳定性提高突变体的筛选及鉴定
被引量:
1
4
作者
乔超超
王新侠
+3 位作者
李鹤宾
倪辉
肖安风
朱艳冰
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期18-23,共6页
利用易错聚合酶链式反应技术引入随机诱变,构建一个Pseudoalteromonas carrageenovora芳香基硫酸酯酶突变体库。经过筛选,获得一个芳香基硫酸酯酶热稳定性提高的突变株4-153。序列分析表明,该突变体有2个氨基酸替换,包括D84A和H260L。...
利用易错聚合酶链式反应技术引入随机诱变,构建一个Pseudoalteromonas carrageenovora芳香基硫酸酯酶突变体库。经过筛选,获得一个芳香基硫酸酯酶热稳定性提高的突变株4-153。序列分析表明,该突变体有2个氨基酸替换,包括D84A和H260L。以对硝基苯硫酸钾为底物,突变酶4-153(M4-153)的最适反应温度为55℃,在45、50、55、60℃处理30 min后,M4-153分别保留85%、83%、48%和13%的残留酶活力。野生型酶(WT)在45、50、55、60℃处理30 min后,分别保留79%、68%、21%和1%的残留酶活力。M4-153与WT相比具有更好的热稳定性。M4-153的最适反应pH值为8.0,在pH 5.0~9.0范围内保持稳定。EDTA对突变酶的抑制作用表明,金属离子在突变酶的催化过程中起重要作用。M4-153对一些洗涤剂,包括Triton X-100、Tween 20、Tween 80和Chaps,有好的耐受性。M4-153对龙须菜粗多糖硫酸基团的脱硫率为79.5%。
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关键词
芳香
基
硫酸酯酶
易错聚合酶链式反应
热稳定性提高
突变体性质
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职称材料
突变芳香基硫酸酯酶改性琼脂的工艺优化及其性能表征
被引量:
2
5
作者
张成昊
姜泽东
+3 位作者
李鹤宾
倪辉
朱艳冰
李清彪
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2021年第5期39-44,共6页
目的:明确食鹿角菜交替假单胞菌突变芳香基硫酸酯酶K253Q改性琼脂的制备工艺,表征酶法改性琼脂的性能特征。方法:以硫酸根脱除率为评价指标,考察反应时间、加酶量、温度、pH对突变芳香基硫酸酯酶K253Q处理琼脂的影响,并对理化性质和结...
目的:明确食鹿角菜交替假单胞菌突变芳香基硫酸酯酶K253Q改性琼脂的制备工艺,表征酶法改性琼脂的性能特征。方法:以硫酸根脱除率为评价指标,考察反应时间、加酶量、温度、pH对突变芳香基硫酸酯酶K253Q处理琼脂的影响,并对理化性质和结构进行表征。结果:以4 g琼脂为原料,确定最佳工艺条件为:反应时间6 h,加酶量80 U,反应温度50℃,初始pH7.0。另外,以100 g琼脂为原料进行放大实验,在最佳工艺条件下,硫酸根脱除率达到50.1%。在此条件下,K253Q处理后琼脂的凝胶强度、3,6-内醚半乳糖含量、白度和透明度均有显著提高,而灰分和粘度值显著降低(P<0.05)。扫描电镜分析显示,K253Q处理琼脂的微观结构表面突起之间连接更加紧密,表面更光滑。结论:K253Q处理琼脂后提高了琼脂的品质,琼脂硫酸根含量降低,凝胶强度、3,6-内醚半乳糖含量、白度和透明度提高,灰分降低。
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关键词
琼脂
突变
芳香
基
硫酸酯酶
改性琼脂
制备
性能表征
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职称材料
题名
绿脓杆菌芳香硫酸酯酶序列与活性关系的初步表征
被引量:
1
1
作者
李雨薇
袁梅
杨晓兰
廖飞
机构
重庆医科大学检验医学院
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期107-112,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:31570862)
教育部博士点基金资助项目(编号:20125503110007)
文摘
目的:通过定点突变初步表征绿脓杆菌芳香硫酸酯酶(Pseudomonas Aeruginosa arylsulfatase,PAAS)序列-活性关系,识别通过迭代饱和突变提高突变体比活性的合适位点。方法:分析PAAS活性中心三维构象初步识别催化相关位点;定点突变获得突变体,重组表达后Ni2+-NTA亲和纯化,表征其酶学性质。结果:与野生型相比,R55、M72、G138、D317、K375等位点用常见氨基酸替换/突变都显著降低其催化活性;R55、D317和K375等突变显著降低底物选择性和/或热稳定性,而M72和G138突变主要改变其催化活性。结论:M72和G138适合作为通过迭代饱和突变实施定向进化的候选位点。
关键词
芳香硫酸酯酶
定点突变
表征
Keywords
arylsulfatase
site-directed mutagenesis
characterization
分类号
Q556 [生物学—生物化学]
R446.61 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
芳香硫酸酯酶定点饱和突变方案的比较
2
作者
李亚平
种慧敏
袁梅
周伟
卢进鹏
胡小蕾
廖飞
杨晓兰
机构
重庆医科大学检验医学院临床检验诊断学教育部重点实验室
重庆理工大学药学与生物工程学院
出处
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期459-464,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.31570862
No.81773625)~~
文摘
目的比较随机引物与精确引物PCR扩增实施绿脓杆菌芳香硫酸酯酶(Pseudomonas aeruginosa arylsulfatase, PAAS)定点饱和突变的整体效率及成本,以建立高效实用的定点饱和突变方案。方法以大肠杆菌碱性磷酸酶(Escherichia coli alkaline phosphatase, ECAP)与PAAS融合表达质粒为模板,分别用针对PAAS目的位点的随机引物、精确引物等量混合物及单个精确引物,进行全质粒PCR扩增构建定点饱和突变体库;碱裂解细胞后高通量测定PAAS突变体与ECAP活性比值进行筛选,比较3种定点饱和突变建库方案需筛选的单克隆数量、所获突变体种类、整体耗时、整体成本及影响因素。结果用随机引物PCR对M72位定点饱和突变有明显密码子偏好性,筛选超600个单克隆仅获得10种预期突变体,但对G138位定点饱和突变未见明显的密码子偏好性且筛选不到150个单克隆获得18种预期突变体;精确引物等量混合物对M72位实施定点饱和突变,筛选不超过190个克隆成功获得19种预期突变体;单个精确引物对M72位逐个PCR实施定点饱和突变,仅各筛选2个单克隆就获得19种预期突变体。单个精确引物逐个PCR实施定点突变所获饱和突变体库完整,需筛选的单克隆数最少,总耗时和总成本最低;相比之下,用随机引物和精确引物等量混合物实施定点饱和突变时,所需筛选的单克隆数、整体耗时及成本均显著增加。结论解析序列-活性关系时,用单个精确引物逐个PCR实施定点饱和突变有显著整体成本和效率优势;仅筛选阳性突变体时,用精确引物等量混合物进行PCR建库在成本和效率上更有优势。
关键词
芳香硫酸酯酶
定点饱和突变
随机引物
精确引物等量混合物
单个精确引物
Keywords
arylsulfatase
site-directed saturation mutagenesis
random primer
equal-mole mixture of precise primer
purified precise primer
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
尿芳香基硫酸酯酶活性检测对肺癌的诊断价值
3
作者
包晓玲
杨磊
机构
甘肃省肿瘤医院肿瘤内科
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第22期2490-2491,共2页
文摘
目的评价晨尿芳香基硫酸酯酶(arylsulphatase, ARS)活性检测在肺癌诊断中的应用价值。方法采用荧光测定法对98例肺癌患者、80例肺良性疾病及98例健康对照者的晨尿芳香基硫酸酯酶活性进行检测,并运用受试者工作特性(ROC)曲线评价尿芳香基硫酸酯酶对肺癌的诊断效能。结果肺癌组的尿ARS活性为(0.359±0.111)U/L,明显高于肺良性疾病组的(0.214±0.082)U/L和健康对照组的(0.238±0.095)U/L,差异有统计学意义(P〈0.01);而肺良性疾病组和健康对照组的ARS活性差异无统计学意义(P=0.385)。ROC曲线分析结果显示,曲线下面积AUC为0.805(P〈0.01, 95%CI: 0.743~0.867),最佳诊断界点值为0.295 U/L,此时尿ARS活性诊断肺癌的敏感度和特异度分别为81.1%和66.7%。结论尿ARS活性检测在肺癌诊断中具有很好的临床应用价值。
关键词
芳香
基
硫酸酯酶
肺癌
诊断
受试者工作特性曲线
分类号
R446.12 [医药卫生—诊断学]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
Pseudoalteromonas carrageenovora芳香基硫酸酯酶突变文库热稳定性提高突变体的筛选及鉴定
被引量:
1
4
作者
乔超超
王新侠
李鹤宾
倪辉
肖安风
朱艳冰
机构
集美大学食品与生物工程学院
厦门医学院药学系
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期18-23,共6页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31401632)
福建省高校新世纪优秀人才支持计划项目(B15139)
文摘
利用易错聚合酶链式反应技术引入随机诱变,构建一个Pseudoalteromonas carrageenovora芳香基硫酸酯酶突变体库。经过筛选,获得一个芳香基硫酸酯酶热稳定性提高的突变株4-153。序列分析表明,该突变体有2个氨基酸替换,包括D84A和H260L。以对硝基苯硫酸钾为底物,突变酶4-153(M4-153)的最适反应温度为55℃,在45、50、55、60℃处理30 min后,M4-153分别保留85%、83%、48%和13%的残留酶活力。野生型酶(WT)在45、50、55、60℃处理30 min后,分别保留79%、68%、21%和1%的残留酶活力。M4-153与WT相比具有更好的热稳定性。M4-153的最适反应pH值为8.0,在pH 5.0~9.0范围内保持稳定。EDTA对突变酶的抑制作用表明,金属离子在突变酶的催化过程中起重要作用。M4-153对一些洗涤剂,包括Triton X-100、Tween 20、Tween 80和Chaps,有好的耐受性。M4-153对龙须菜粗多糖硫酸基团的脱硫率为79.5%。
关键词
芳香
基
硫酸酯酶
易错聚合酶链式反应
热稳定性提高
突变体性质
Keywords
arylesterase
error-prone PCR
improved thermostability
mutant property
分类号
Q814.9 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
突变芳香基硫酸酯酶改性琼脂的工艺优化及其性能表征
被引量:
2
5
作者
张成昊
姜泽东
李鹤宾
倪辉
朱艳冰
李清彪
机构
集美大学食品与生物工程学院
福建省食品微生物与酶工程重点实验室
厦门市食品生物工程技术研究中心
厦门市南方海洋研究中心经济海藻资源化利用与深加工重点实验室
厦门医学院
出处
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2021年第5期39-44,共6页
基金
国家自然科学基金(31401632)。
文摘
目的:明确食鹿角菜交替假单胞菌突变芳香基硫酸酯酶K253Q改性琼脂的制备工艺,表征酶法改性琼脂的性能特征。方法:以硫酸根脱除率为评价指标,考察反应时间、加酶量、温度、pH对突变芳香基硫酸酯酶K253Q处理琼脂的影响,并对理化性质和结构进行表征。结果:以4 g琼脂为原料,确定最佳工艺条件为:反应时间6 h,加酶量80 U,反应温度50℃,初始pH7.0。另外,以100 g琼脂为原料进行放大实验,在最佳工艺条件下,硫酸根脱除率达到50.1%。在此条件下,K253Q处理后琼脂的凝胶强度、3,6-内醚半乳糖含量、白度和透明度均有显著提高,而灰分和粘度值显著降低(P<0.05)。扫描电镜分析显示,K253Q处理琼脂的微观结构表面突起之间连接更加紧密,表面更光滑。结论:K253Q处理琼脂后提高了琼脂的品质,琼脂硫酸根含量降低,凝胶强度、3,6-内醚半乳糖含量、白度和透明度提高,灰分降低。
关键词
琼脂
突变
芳香
基
硫酸酯酶
改性琼脂
制备
性能表征
Keywords
agar
mutant arylsulfatase
modified agar
preparation
characterization
分类号
TS201.1 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绿脓杆菌芳香硫酸酯酶序列与活性关系的初步表征
李雨薇
袁梅
杨晓兰
廖飞
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
在线阅读
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职称材料
2
芳香硫酸酯酶定点饱和突变方案的比较
李亚平
种慧敏
袁梅
周伟
卢进鹏
胡小蕾
廖飞
杨晓兰
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
在线阅读
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职称材料
3
尿芳香基硫酸酯酶活性检测对肺癌的诊断价值
包晓玲
杨磊
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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职称材料
4
Pseudoalteromonas carrageenovora芳香基硫酸酯酶突变文库热稳定性提高突变体的筛选及鉴定
乔超超
王新侠
李鹤宾
倪辉
肖安风
朱艳冰
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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下载PDF
职称材料
5
突变芳香基硫酸酯酶改性琼脂的工艺优化及其性能表征
张成昊
姜泽东
李鹤宾
倪辉
朱艳冰
李清彪
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2021
2
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职称材料
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