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酿酒酵母PAD1基因生物信息学分析
1
作者
尹拓
马福仙
+2 位作者
韩沛辰
奚登贤
张汉尧
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1040-1047,共8页
【目的】研究酿酒酵母中PAD1基因的功能,为研究酿酒酵母芳香族化合物代谢过程和途径奠定基础。【方法】对酿酒酵母PAD1基因进行电子克隆,再采用生物信息学分析法对PAD1基因进行分析预测。【结果】酿酒酵母PAD1基因位于Ⅳ染色体1510902~1...
【目的】研究酿酒酵母中PAD1基因的功能,为研究酿酒酵母芳香族化合物代谢过程和途径奠定基础。【方法】对酿酒酵母PAD1基因进行电子克隆,再采用生物信息学分析法对PAD1基因进行分析预测。【结果】酿酒酵母PAD1基因位于Ⅳ染色体1510902~1511630,全长729 bp,可编码242个氨基酸;系统进化树分析表明:该基因编码的蛋白质与肉桂酸脱羧酶(AAA20484.1)最为接近,同源性高达99.59%;蛋白质化学式为C1208H1950N328O336S9,分子量约为26733.31 ku,是稳定的疏水蛋白,在线粒体中发挥作用。二级结构预测结果未发现明显卷曲螺旋区域,有部分跨膜区存在,二级结构元件以α-螺旋和随机卷曲为主,延伸链和β-转角在蛋白质中分散存在。【结论】酿酒酵母PAD1基因是编码芳香族羧酸脱羧酶的基因,编码的蛋白质结构稳定,可能在线粒体中参与代谢,与酿酒酵母芳香族羧酸的代谢和其对芳香族羧酸的耐受性存在直接联系。
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关键词
酿酒酵母PAD1基因
基因电子克隆
生物信息学分析
芳香族羧酸脱羧酶
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题名
酿酒酵母PAD1基因生物信息学分析
1
作者
尹拓
马福仙
韩沛辰
奚登贤
张汉尧
机构
西南林业大学林学院
出处
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1040-1047,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31760450)
云南省农业基础研究联合专项基金(2018FG001-038)。
文摘
【目的】研究酿酒酵母中PAD1基因的功能,为研究酿酒酵母芳香族化合物代谢过程和途径奠定基础。【方法】对酿酒酵母PAD1基因进行电子克隆,再采用生物信息学分析法对PAD1基因进行分析预测。【结果】酿酒酵母PAD1基因位于Ⅳ染色体1510902~1511630,全长729 bp,可编码242个氨基酸;系统进化树分析表明:该基因编码的蛋白质与肉桂酸脱羧酶(AAA20484.1)最为接近,同源性高达99.59%;蛋白质化学式为C1208H1950N328O336S9,分子量约为26733.31 ku,是稳定的疏水蛋白,在线粒体中发挥作用。二级结构预测结果未发现明显卷曲螺旋区域,有部分跨膜区存在,二级结构元件以α-螺旋和随机卷曲为主,延伸链和β-转角在蛋白质中分散存在。【结论】酿酒酵母PAD1基因是编码芳香族羧酸脱羧酶的基因,编码的蛋白质结构稳定,可能在线粒体中参与代谢,与酿酒酵母芳香族羧酸的代谢和其对芳香族羧酸的耐受性存在直接联系。
关键词
酿酒酵母PAD1基因
基因电子克隆
生物信息学分析
芳香族羧酸脱羧酶
Keywords
Saccharomyces cerevisiae PAD1 gene
gene electronic cloning
bioinformatics analysis
aromatic carboxylic acid decarboxylation
分类号
S963.327 [农业科学—水产养殖]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
酿酒酵母PAD1基因生物信息学分析
尹拓
马福仙
韩沛辰
奚登贤
张汉尧
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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