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向日葵EPF基因家族鉴定及参与花发育的功能分析
1
作者
陈静
葛敏茜
+4 位作者
陈彦灼
曾银萍
邹建
杨军
刘金平
《东北农业大学学报》
北大核心
2025年第1期1-11,共11页
植物表皮模式因子EPF是一类广泛参与植物生长发育调节的分泌肽,其家族成员在向日葵(Helianthus annuus L.)花发育调控中的功能尚不清楚。基于基因组和转录组数据库,在向日葵中鉴定得到10个EPF家族基因,分属于4个亚家族。结果表明:其中,H...
植物表皮模式因子EPF是一类广泛参与植物生长发育调节的分泌肽,其家族成员在向日葵(Helianthus annuus L.)花发育调控中的功能尚不清楚。基于基因组和转录组数据库,在向日葵中鉴定得到10个EPF家族基因,分属于4个亚家族。结果表明:其中,HaEPF1、HaEPF3、HaEPF4、HaEPF7、HaEPF9在向日葵花发育早期(St2、St3、St4)特异性高表达,而HaEPF5、HaEPF8、HaEPF10在花发育中后期(St5、St6、St7)特异性高表达。进一步分析发现,HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7在野生型向日葵(WT)花分生组织转变和花器官发生(St2)过程中高表达,并随着花器官发育其表达水平逐渐降低。然而,10个EPF家族基因在向日葵花分生组织转变与花器官分化缺陷突变体Crazy Broccoli 1(cb1)中类花序结构发育过程中始终维持较为稳定的高表达水平,并与WT分生组织转变与花器官发生时期的表达水平相似。结果表明:HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7可能在向日葵花分生组织转变和花器官发生过程中发挥作用;启动子顺式作用元件分析发现,HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7在调控向日葵花分生组织转变和花器官发生过程中可能依赖于生长素、赤霉素、脱落酸信号。HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7表达水平的精确调节对于向日葵花器官发生至关重要,持续异常地高表达,可能是导致cb1突变体出现花器官发育缺陷的重要原因之一。
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关键词
向日葵
EPF基因
表达水平
CB1
花分生组织转变
花
器官发生
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职称材料
向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
被引量：
1
2
作者
王茜
周家燕
+5 位作者
王倩
邓玉萍
张敏慧
陈静
杨军
邹建
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期199-211,共13页
【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因,有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制,为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据,使用生物信息学方法,分析向日葵YABBY基因家族成...
【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因,有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制,为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据,使用生物信息学方法,分析向日葵YABBY基因家族成员的染色体定位、系统进化关系、基因结构、保守基序、蛋白结构及理化性质、启动子顺式作用元件和组织表达模式等,并通过RT-qPCR分析HaYABBY基因在WT向日葵和花分生组织决定和花器官分化缺陷突变体cb1中st2-st8时期的表达差异。【结果】在向日葵基因组中鉴定到12个YABBY基因家族成员,分属于4个亚家族,分布在8条染色体上,并且同一亚家族中成员在基因结构和保守基序组成上高度相似。其中8个基因HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5b、HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb在向日葵花发育时期特异性高表达。在这8个基因中,HaYABBY3、HaYABBY5a和HaYABBY5d在突变体cb1花发育后期表达上调,且与WT花发育早期水平相当;而HaYABBY4b和HaCRABS CLAWa在cb1中的表达被强烈抑制。顺式作用元件分析显示,HaYABBY均含有多个启动子顺式作用元件,部分元件仅存在于特定基因中。其中,胚乳表达元件存在于HaCRABS CLAWa和HaYABBY4a中;生长素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb、HaYABBY4a、HaYABBY4b和HaYABBY5c中;分生组织表达元件存在于HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY4b、HaYABBY5a和HaYABBY5d中;赤霉素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaYABBY5b、HaYABBY5c和HaYABBY5d中;种子特异性调控元件存在于HaYABBY5a、HaYABBY5c和HaYABBY5d中。【结论】HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5d和HaCRABS CLAWa等5个HaYABBY基因在花分生组织的转变和花器官发生过程中可能发挥重要作用,它们在花分生组织转变和花器官发生调控中可能受到生长素响应因子ARF、赤霉素响应因子MYB以及MADS-box等关键因子调节。
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关键词
向日葵
YABBY基因家族
花
发育
花分生组织转变
花
器官发生
基因表达
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职称材料
题名
向日葵EPF基因家族鉴定及参与花发育的功能分析
1
作者
陈静
葛敏茜
陈彦灼
曾银萍
邹建
杨军
刘金平
机构
西南野生动植物资源保护教育部重点实验室(西华师范大学)
出处
《东北农业大学学报》
北大核心
2025年第1期1-11,共11页
基金
四川省自然科学基金面上项目(2023NSFSC0226)
西华师范大学科研创新团队项目(KCXTD2023-7)
四川省中央引导地方—自由探索项目(2024ZYD0071)。
文摘
植物表皮模式因子EPF是一类广泛参与植物生长发育调节的分泌肽,其家族成员在向日葵(Helianthus annuus L.)花发育调控中的功能尚不清楚。基于基因组和转录组数据库,在向日葵中鉴定得到10个EPF家族基因,分属于4个亚家族。结果表明:其中,HaEPF1、HaEPF3、HaEPF4、HaEPF7、HaEPF9在向日葵花发育早期(St2、St3、St4)特异性高表达,而HaEPF5、HaEPF8、HaEPF10在花发育中后期(St5、St6、St7)特异性高表达。进一步分析发现,HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7在野生型向日葵(WT)花分生组织转变和花器官发生(St2)过程中高表达,并随着花器官发育其表达水平逐渐降低。然而,10个EPF家族基因在向日葵花分生组织转变与花器官分化缺陷突变体Crazy Broccoli 1(cb1)中类花序结构发育过程中始终维持较为稳定的高表达水平,并与WT分生组织转变与花器官发生时期的表达水平相似。结果表明:HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7可能在向日葵花分生组织转变和花器官发生过程中发挥作用;启动子顺式作用元件分析发现,HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7在调控向日葵花分生组织转变和花器官发生过程中可能依赖于生长素、赤霉素、脱落酸信号。HaEPF1、HaEPF4、HaEPF7表达水平的精确调节对于向日葵花器官发生至关重要,持续异常地高表达,可能是导致cb1突变体出现花器官发育缺陷的重要原因之一。
关键词
向日葵
EPF基因
表达水平
CB1
花分生组织转变
花
器官发生
Keywords
sunflower
EPF genes
expression level
cb1
floral meristem transition
floral organogenesis
分类号
S565.5 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
被引量：
1
2
作者
王茜
周家燕
王倩
邓玉萍
张敏慧
陈静
杨军
邹建
机构
西南野生动植物资源保护教育部重点实验室西华师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期199-211,共13页
基金
四川省自然科学基金项目(2023NSFSC0226,2022NSFSC0163)
作物发育与优良种质资源选育团队(KCXTD2023-7)。
文摘
【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因,有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制,为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据,使用生物信息学方法,分析向日葵YABBY基因家族成员的染色体定位、系统进化关系、基因结构、保守基序、蛋白结构及理化性质、启动子顺式作用元件和组织表达模式等,并通过RT-qPCR分析HaYABBY基因在WT向日葵和花分生组织决定和花器官分化缺陷突变体cb1中st2-st8时期的表达差异。【结果】在向日葵基因组中鉴定到12个YABBY基因家族成员,分属于4个亚家族,分布在8条染色体上,并且同一亚家族中成员在基因结构和保守基序组成上高度相似。其中8个基因HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5b、HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb在向日葵花发育时期特异性高表达。在这8个基因中,HaYABBY3、HaYABBY5a和HaYABBY5d在突变体cb1花发育后期表达上调,且与WT花发育早期水平相当;而HaYABBY4b和HaCRABS CLAWa在cb1中的表达被强烈抑制。顺式作用元件分析显示,HaYABBY均含有多个启动子顺式作用元件,部分元件仅存在于特定基因中。其中,胚乳表达元件存在于HaCRABS CLAWa和HaYABBY4a中;生长素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb、HaYABBY4a、HaYABBY4b和HaYABBY5c中;分生组织表达元件存在于HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY4b、HaYABBY5a和HaYABBY5d中;赤霉素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaYABBY5b、HaYABBY5c和HaYABBY5d中;种子特异性调控元件存在于HaYABBY5a、HaYABBY5c和HaYABBY5d中。【结论】HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5d和HaCRABS CLAWa等5个HaYABBY基因在花分生组织的转变和花器官发生过程中可能发挥重要作用,它们在花分生组织转变和花器官发生调控中可能受到生长素响应因子ARF、赤霉素响应因子MYB以及MADS-box等关键因子调节。
关键词
向日葵
YABBY基因家族
花
发育
花分生组织转变
花
器官发生
基因表达
Keywords
sunflower
YABBY gene family
flower development
floral meristem transformation
floral organogenesis
gene expression
分类号
S565.5 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
向日葵EPF基因家族鉴定及参与花发育的功能分析
陈静
葛敏茜
陈彦灼
曾银萍
邹建
杨军
刘金平
《东北农业大学学报》
北大核心
2025
0
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下载PDF
职称材料
2
向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
王茜
周家燕
王倩
邓玉萍
张敏慧
陈静
杨军
邹建
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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