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染色体微阵列芯片分析技术应用于产前诊断的关键问题探讨 被引量:16
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作者 安宇 吴柏林 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2014年第3期157-161,210,共6页
染色体微阵列芯片分析(CMA)包括比较基因组杂交微阵列(array CGH)和单核苷酸多态微阵列(SNP array),可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复,与传统染色体核型分析和荧光原位杂交(FISH)检测相比,具有高通量、高分辨率和... 染色体微阵列芯片分析(CMA)包括比较基因组杂交微阵列(array CGH)和单核苷酸多态微阵列(SNP array),可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复,与传统染色体核型分析和荧光原位杂交(FISH)检测相比,具有高通量、高分辨率和高自动化检测的优势,同时可以一次性同步检测许多与出生缺陷和先天性疾病相关的基因组异常,近年来已经开始应用于侵入性产前诊断。回顾近年来多个大样本和多中心的临床试验对CMA技术用于产前诊断的研究结果,借鉴美国妇产科医师协会(ACOG)和母婴医学协会(SMFM)发布的CMA在产前诊断应用中的建议,对CMA在应用过程中如何选择微阵列芯片类型、检测的适用对象和检测的时期、检测结果的解释以及相关的遗传咨询等关键问题进行了详细讨论,并指出CMA在产前诊断应用中面临的机遇和挑战,以及检测前和检测后遗传咨询在实际应用中的重要性和必要性。 展开更多
关键词 芯片分析技术 微阵列分析 生殖技术 辅助 基因组 杂交 遗传 产前诊断 微缺失微重复综合征
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基于miRNAs芯片的喉鳞状细胞癌致癌机制的初步分析 被引量:2
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作者 廉猛 翟杰 +7 位作者 王茹 王海舟 冯凌 时倩 马泓智 房居高 刘晓琴 刘红刚 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CSCD 2016年第9期501-506,共6页
目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNA s,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌... 目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNA s,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌旁组织行差异miRNAs的筛选,原始数据上传Gene Expression Omnibus数据库。采用Mev软件中配对方式t检验进行芯片探针的差异分析,经Affymetrix Analysis Center分析后将差异探针转换为差异表达的miRNAs;选择我们前期工作确定的微小染色体维持蛋白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作为核心基因,采用Mirfocus数据库生物信息学分析MCM4的调控miRNAs并结合相关文献确定目标miRNAs;采用RT-PCR在另外21对LSCC组织及相应的癌旁组织中验证目标miRNAs。结果经差异筛选分析,有127个差异表达的miRNAs,其中78个miRNAs在肿瘤组织中高表达,49个miRNAs在肿瘤组织中低表达;采用Mirfocus数据库生物信息学分析参与核心基因MCM4的调控miRNAs并结合相关文献,确定高表达的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p为与MCM4调控作用相关的目标miRNAs;hsa-miR-30a-5p为另一个潜在的目标miRNA,且在肿瘤组织中低表达;通过RTPCR验证这3个差异表达的目标miRNAs与芯片筛选结果一致。结论基于miRNAs芯片筛选分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p对LSCC的发生发展具有重要调控作用,可作为潜在的诊疗靶点。 展开更多
关键词 肿瘤 鳞状细胞 微RNAS 芯片分析技术 计算生物学
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荧光原位杂交技术在产前诊断染色体嵌合体中的应用价值 被引量:11
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作者 李显筝 许玲 +2 位作者 胡晶晶 黎凤珍 蔡婵慧 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2020年第2期104-108,共5页
目的:探讨荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)在产前诊断染色体嵌合体中的应用。方法:22例行绒毛/羊水细胞体外培养染色体核型结果提示可能存在染色体嵌合现象的病例,进一步用染色体微阵列比较基因组杂交检测(c... 目的:探讨荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)在产前诊断染色体嵌合体中的应用。方法:22例行绒毛/羊水细胞体外培养染色体核型结果提示可能存在染色体嵌合现象的病例,进一步用染色体微阵列比较基因组杂交检测(chromosomal microarray analaysis,CMA)和FISH技术分析确定其异常核型及嵌合比例。结果:22例核型结果提示嵌合体的病例中,性染色体数目嵌合13例,常染色体三体嵌合6例,性染色体结构异常嵌合3例。近50%病例CMA结果未检测到嵌合现象,可能与CMA技术仅能检测基因拷贝数变化且无法检测低比例嵌合有关。因常染色体数目异常对胎儿生长发育影响较大,常染色体数目异常嵌合病例中,除1例病例外其余均选择终止妊娠。3例结构异常嵌合病例经核型分析结合CMA及FISH结果确定均为性染色体双着丝粒染色体复杂结构嵌合。结论:对于产前诊断提示可能存在染色体嵌合的病例,不应急于终止妊娠,需采用多种方法加以验证,应充分应用CMA技术和FISH技术结合G显带核型结果进行综合分析,并需要对胎儿形态进行细致的超声评估,从而更加准确地确定嵌合类型以及异常核型的嵌合比例,为临床医师指导遗传咨询提供更加可靠的依据。 展开更多
关键词 原位杂交 荧光 芯片分析技术 微阵列分析 染色体畸变 镶嵌现象 产前诊断
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单核苷酸多态性微阵列分析对智力障碍和发育迟缓的遗传学诊断价值 被引量:2
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作者 胡珺洁 钱叶青 +3 位作者 孙义锡 俞佳玲 罗玉琴 董旻岳 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期420-428,共9页
目的:评估单核苷酸多态性微阵列(SNP array)分析在智力障碍/发育迟缓(ID/DD)遗传学诊断中的应用价值。方法:以2013年1月至2018年6月在浙江大学医学院附属妇产科医院因ID/DD行SNP array的145例患者为研究对象,采用CHAS软件与多种数据库... 目的:评估单核苷酸多态性微阵列(SNP array)分析在智力障碍/发育迟缓(ID/DD)遗传学诊断中的应用价值。方法:以2013年1月至2018年6月在浙江大学医学院附属妇产科医院因ID/DD行SNP array的145例患者为研究对象,采用CHAS软件与多种数据库对染色体拷贝数变异(CNV)进行分析。结果:145例ID/DD患者通过SNP array技术发现致病性CNV26例,可能致病CNV6例,意义不明18例,可能良性14例,未见明显异常(包含良性)81例。结论:SNP array技术是一种高效和特异的遗传学分析技术,适用于ID/DD的遗传学病因诊断。 展开更多
关键词 智力障碍/遗传学 发育障碍/遗传学 染色体 芯片分析技术 多态性 单核苷酸
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高通量检测技术在植入前胚胎遗传学诊断中的应用 被引量:3
5
作者 徐晨明 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2013年第6期427-432,共6页
基因芯片和深度测序是两大最重要的高通量检测技术,给生物学和医学研究带来巨大的变化,在功能基因组、系统生物学、药物基因组的研究和遗传疾病诊断中得到了广泛的应用。随着全基因组扩增技术的不断改良,高通量技术在辅助生殖植入前遗... 基因芯片和深度测序是两大最重要的高通量检测技术,给生物学和医学研究带来巨大的变化,在功能基因组、系统生物学、药物基因组的研究和遗传疾病诊断中得到了广泛的应用。随着全基因组扩增技术的不断改良,高通量技术在辅助生殖植入前遗传学诊断(PGD)中的应用有了巨大的进展。基于微阵列技术的胚胎全染色体组非整倍体筛查及结构异常的PGD已经开始临床应用,PGD/植入前遗传学筛查(PGS)后的临床妊娠率和胚胎植入率显著提高;基于单细胞高通量测序技术的染色体非整倍体及单基因病诊断的临床试验也已见报道,并有希望在不久的将来走向临床应用。 展开更多
关键词 芯片分析技术 微阵列分析 生殖技术 辅助 高通量测序 植入前遗传学诊断
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人类辅助生殖技术来源胎盘全基因组表达谱研究
6
作者 张园 崔毓桂 +3 位作者 周作民 沙家豪 李瑛 刘嘉茵 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2011年第2期80-87,I0001,共9页
目的:通过比较辅助生殖技术(ART)来源和自然妊娠来源胎盘全基因组表达谱的差异,研究ART技术对胎盘功能和胎儿发育的影响,借此评估ART子代的安全性。方法:胎盘组织取自因输卵管因素行体外受精-胚胎移植和自然妊娠足月产妇各3例。利用Affy... 目的:通过比较辅助生殖技术(ART)来源和自然妊娠来源胎盘全基因组表达谱的差异,研究ART技术对胎盘功能和胎儿发育的影响,借此评估ART子代的安全性。方法:胎盘组织取自因输卵管因素行体外受精-胚胎移植和自然妊娠足月产妇各3例。利用AffymetrixHG-U133 Plus 2.0基因芯片对2组胎盘组织进行芯片杂交分析。用定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)验证其中10个差异表达基因,根据其涉及的不同功能进行生物信息学分析。分为6类:免疫应答、跨膜转运、代谢、氧化应激、细胞分化及其他功能。用免疫组织化学对其中5个差异表达基因产物进行细胞定位研究。结果:ART来源胎盘组织中共鉴定出26个差异表达基因,其中17个上调,9个下调。其中涉及免疫应答的基因,如ERAP2和STAT4;涉及细胞分化的基因如MUC1,经qRT-PCR验证2组间确实存在差异表达。基因产物主要表达在胎盘绒毛组织中,分布在合体滋养层细胞的细胞质和(或)细胞膜中。结论:ART来源胎盘和自然妊娠胎盘存在全基因组表达谱差异。差异表达基因涉及到多种胎盘关键功能,ERAP2,STAT4及MUC1等差异表达基因可能作为评估胎盘与ART子代安全性关联的分子标记物。 展开更多
关键词 基因组 芯片分析技术 生殖技术 辅助 胎盘 自身免疫
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基因芯片筛查子宫内膜容受性相关基因的应用
7
作者 宋晓雯 赵晓明 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2011年第2期95-98,107,共5页
胚胎的顺利着床有赖于子宫内膜对其具有良好的容受能力。深入了解子宫内膜容受性的变化,对确定胚胎移植的时机和提高胚胎种植率具有极其重要的意义。新近发展的基因芯片技术可同时检测同一细胞或组织的大量基因,为研究正常或异常内膜的... 胚胎的顺利着床有赖于子宫内膜对其具有良好的容受能力。深入了解子宫内膜容受性的变化,对确定胚胎移植的时机和提高胚胎种植率具有极其重要的意义。新近发展的基因芯片技术可同时检测同一细胞或组织的大量基因,为研究正常或异常内膜的基因变化及其复杂的内在联系提供了高效的途径。综述基因芯片技术在内膜容受性候选基因的筛查、控制性卵巢刺激及不孕相关疾病对内膜容受性相关基因的影响中的应用。 展开更多
关键词 子宫内膜容受性 基因 芯片分析技术 寡核苷酸序列分析 不育 女(雌)性
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脂蛋白基因在早期骨关节炎软骨下骨的表达 被引量:8
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作者 张荣凯 杨禄坤 +2 位作者 黄丽娟 赵庆 蔡道章 《中国骨伤》 CAS 2014年第1期54-57,共4页
目的:研究早期骨关节炎软骨下骨脂蛋白相关的基因表达改变情况。方法:大鼠分为实验组(15只)和对照组(15只)。实验组切除右膝内侧半月板及内侧副韧带,对照组仅切开关节囊。于术后1、2、4周取右膝关节标本,采用全基因表达谱芯片技术研究... 目的:研究早期骨关节炎软骨下骨脂蛋白相关的基因表达改变情况。方法:大鼠分为实验组(15只)和对照组(15只)。实验组切除右膝内侧半月板及内侧副韧带,对照组仅切开关节囊。于术后1、2、4周取右膝关节标本,采用全基因表达谱芯片技术研究软骨下骨全基因表达,利用差异基因分析的方法分析脂蛋白相关的基因表达改变情况。结果:软骨下骨Apoa5表达于建模术后1周上调,术后2周下调;Apoc2表达于术后2周上调;Apol3表达于术后1周上调,术后4周下调;Lrp1于术后1、2周下调;Lrp5于术后2周下调;Gpihbp1、Lpl、Tfpi、Vldlr表达于术后1周均上调;Lrpap1、RGD1309808于术后4周均下调。结论:脂蛋白相关基因的表达改变在早期膝关节骨关节炎的软骨下骨变化中可能起了重要作用。 展开更多
关键词 基因表达 芯片分析技术 骨关节炎 软骨 脂蛋白类
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幽门螺杆菌感染与脑梗死患者同型半胱氨酸的关系 被引量:9
9
作者 吴海琴 张欣 +2 位作者 汤燕 王虎清 孙宏 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期89-92,共4页
目的:研究幽门螺杆菌(Hp)感染与初发急性脑梗死的关系及对急性脑梗死患者血清同型半胱氨酸(Hcy)的影响。方法:采用生物微矩阵(芯片)分析技术测定初发急性脑梗死(85例)血清Hp-IgG、Hp-CagA-IgG和Hcy,并与对照组(40例)比较。结果:①急性... 目的:研究幽门螺杆菌(Hp)感染与初发急性脑梗死的关系及对急性脑梗死患者血清同型半胱氨酸(Hcy)的影响。方法:采用生物微矩阵(芯片)分析技术测定初发急性脑梗死(85例)血清Hp-IgG、Hp-CagA-IgG和Hcy,并与对照组(40例)比较。结果:①急性脑梗死组Hp-IgG阳性率及Hp-CagA-IgG阳性率高于对照组(P<0.05)。②Hp-IgG阳性组与阴性组的血清Hcy水平无明显差异(P>0.05),而Hp-CagA-IgG阳性组患者Hcy水平高于Hp-CagA-IgG阴性组(P<0.05)。结论:Hp感染与脑梗死发病相关,可能是脑梗死的危险因素;CagA阳性Hp感染可能通过升高血Hcy水平而增加脑梗死的风险。 展开更多
关键词 螺杆菌 幽门/免疫学 高半胱氨酸/血液 螺杆菌感染/并发症 脑梗死/微生物学 芯片分析技术
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蛇床子素通过上调微RNA-101a-3p抑制阿尔茨海默病细胞淀粉样前体蛋白表达 被引量:8
10
作者 蔺莹 姚璎珈 +6 位作者 梁喜才 时悦 孔亮 肖洪贺 吴雨桐 倪颖男 杨静娴 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期473-479,共7页
目的:研究阿尔茨海默病细胞模型中蛇床子素抑制淀粉样前体蛋白(APP)的作用及机制。方法:脂质体2000转染建立APP高表达的SH-SY5Y细胞模型。利用MTT和乳酸脱氢酶(LDH)法检测蛇床子素对APP高表达细胞的存活率和损伤程度的影响。利用基因芯... 目的:研究阿尔茨海默病细胞模型中蛇床子素抑制淀粉样前体蛋白(APP)的作用及机制。方法:脂质体2000转染建立APP高表达的SH-SY5Y细胞模型。利用MTT和乳酸脱氢酶(LDH)法检测蛇床子素对APP高表达细胞的存活率和损伤程度的影响。利用基因芯片技术筛选给予蛇床子素治疗后差异表达的微RNA(miRNA),然后通过生物信息学分析预测与差异表达miRNA靶向结合的基因。细胞内转入差异表达miRNA的抑制剂,然后采用免疫荧光细胞化学法观察细胞中APP、β淀粉样蛋白(Aβ)表达情况,RT-PCR法检测细胞中APP mRNA表达。结果:实验成功构建了APP高表达的阿尔茨海默病细胞模型。MTT和LDH法检测结果显示,蛇床子素对于APP高表达的细胞具有一定的保护作用,可以减轻细胞的损伤。miRNA-101a-3p是蛇床子素调控较明显的miRNA,其与APP的3'非翻译区靶向结合。与模型对照组比较,miR-101a-3p抑制剂组APP和Aβ蛋白荧光强度增加,APP mRNA表达量增加(均P<0.01);加入蛇床子素后细胞中APP和Aβ蛋白荧光强度降低,APP mRNA表达量减少(均P<0.01)。结论:在阿尔茨海默病细胞模型中,蛇床子素通过上调miR-101a-3p抑制APP表达。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 蛇床子素/药理学 微RNAs 淀粉样Β蛋白前体 蛋白质阵列分析 芯片分析技术
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毫米波对人角质形成细胞基因表达的影响 被引量:2
11
作者 陈苘 鲁德强 +1 位作者 姜槐 许正平 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2008年第1期23-28,共6页
目的:研究低强度毫米波对人角质形成细胞(HaCaT)基因表达的影响。方法:采用30.16 GHz、强度为1.0和3.5 mW/cm2的毫米波分别每天连续辐照HaCaT细胞30 min。细胞经不同次数辐照后,用基因芯片技术筛选毫米波反应基因,并以RT-PCR验证基因芯... 目的:研究低强度毫米波对人角质形成细胞(HaCaT)基因表达的影响。方法:采用30.16 GHz、强度为1.0和3.5 mW/cm2的毫米波分别每天连续辐照HaCaT细胞30 min。细胞经不同次数辐照后,用基因芯片技术筛选毫米波反应基因,并以RT-PCR验证基因芯片筛选得到的结果。结果:经基因芯片筛选和RT-PCR证实,30.16 GHz、3.5 mW/cm2的毫米波辐照4次后,人角质形成细胞PAR-2、ERGIC-53基因表达明显上调(相对值分别为1.72±0.11 vs 1.24±0.09、1.52±0.21 vs 0.86±0.09,P均<0.01),而经1次毫米波辐照的细胞,均未见上述基因表达上调;30.16GHz、1.0 mW/cm2的毫米波辐照4次后,ERGIC-53基因表达亦明显上调(相对值为1.49±0.19 vs0.84±0.09,P<0.01),而PAR-2基因表达未见明显改变。结论:毫米波辐照影响基因的表达,基因表达的改变与辐照功率密度的大小和次数有关。 展开更多
关键词 微波 辐射 角蛋白细胞 基因表达 逆转录聚合酶链反应 芯片分析技术
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NF-κB基因对胰腺癌细胞侵袭作用的影响及机制 被引量:1
12
作者 张俊华 韦达 +2 位作者 陈桂英 黄润生 俞力 《山东医药》 CAS 北大核心 2010年第8期7-9,共3页
目的探讨NF-κB基因对胰腺癌细胞侵袭的影响及机制。方法应用NF-κB基因小干扰RNA(siRNA)转染处理人胰腺癌PANC-1细胞,采用W estern b lot方法检测NF-κB蛋白水平,采用Boyden小室模型试验检测癌细胞侵袭能力。收集转染48 h的癌细胞,采... 目的探讨NF-κB基因对胰腺癌细胞侵袭的影响及机制。方法应用NF-κB基因小干扰RNA(siRNA)转染处理人胰腺癌PANC-1细胞,采用W estern b lot方法检测NF-κB蛋白水平,采用Boyden小室模型试验检测癌细胞侵袭能力。收集转染48 h的癌细胞,采用包含有96个转移相关基因的芯片检测基因表达情况;根据基因芯片结果,随机抽取3个表达明显变化的基因采用荧光实时定量PCR(RT-PCR)验证基因芯片结果。结果转染组癌细胞NF-κB蛋白水平下调(P<0.05),且与时间和浓度相关。与对照组比较,转染组细胞的穿膜细胞数减少(P<0.05),且呈浓度依赖关系。基因芯片检测发现,96个基因中有11个基因表达出现明显变化,其中9个基因明显下调,包括基质金属蛋白酶2(MMP-2)、MMP-7和血管内皮生长因子(VEGF),有2个基因出现明显上调。采用荧光RT-PCR方法检测MMP-2、MMP-7、VEGF基因表达,结果也发现这3个基因表达下调,且下调幅度与基因芯片结果一致。结论NF-κB基因siRNA转染可明显抑制胰腺癌细胞的锚着不依赖性增殖和恶性侵袭,其机制可能与下调MMP-2、MMP-7和VEGF有关。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 芯片分析技术 RNA干扰 NF-ΚB
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P16、PTEN、E-cadherin、CtBP1联合检测对子宫内膜腺癌的诊断意义 被引量:2
13
作者 曾永群 肖胜军 李凡彩 《山东医药》 CAS 北大核心 2010年第24期26-28,共3页
目的研究P16、PTEN、E-cadherin、CtBP1在子宫内膜癌中的表达,评价联合检测三者对子宫内膜癌临床病理诊断的意义。方法使用组织芯片和免疫组化染色技术观察P16、PTEN、E-cadherin、CtBP1在60例子宫内膜腺癌和30例正常子宫内膜组织中的... 目的研究P16、PTEN、E-cadherin、CtBP1在子宫内膜癌中的表达,评价联合检测三者对子宫内膜癌临床病理诊断的意义。方法使用组织芯片和免疫组化染色技术观察P16、PTEN、E-cadherin、CtBP1在60例子宫内膜腺癌和30例正常子宫内膜组织中的表达情况,使用二元逻辑回归ROC曲线分析方法对联合检测指标进行筛选,并对个体诊断进行预测。结果 P16、PTEN、E-cadherin在子宫内膜癌中的阳性表达率高于正常子宫内膜(P<0.05);CtBP1在两种组织中均高度表达,未见显著差异(P>0.05)。P16和PTEN联合检测具有中等强度准确性,在假阳性率为10%的条件下诊断点为0.900。结论 P16、PTEN、E-cadherin阳性表达与子宫内膜癌发生有关;P16和PTEN联合检测对子宫内膜腺癌的临床病理诊断有参考价值。 展开更多
关键词 子宫内膜样 芯片分析技术 免疫组织化学
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甲状腺癌p53调节基因Mdm2以及p21^(WAF/CIP1)蛋白的表达 被引量:2
14
作者 彭树文 黄健男 +3 位作者 季锡清 盛新华 唐井岗 张银喜 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2006年第6期372-376,共5页
目的探讨p53、鼠双微体2(murinedonbleminute2,Mdm2)及p21WAF/CIP1等蛋白在甲状腺癌组织中的表达、意义及相互作用关系。方法取甲状腺癌、癌旁与良性病变组织构建组织芯片,应用免疫组化方法检测p53、Mdm2及p21WAF/CIP1在甲状腺良恶性病... 目的探讨p53、鼠双微体2(murinedonbleminute2,Mdm2)及p21WAF/CIP1等蛋白在甲状腺癌组织中的表达、意义及相互作用关系。方法取甲状腺癌、癌旁与良性病变组织构建组织芯片,应用免疫组化方法检测p53、Mdm2及p21WAF/CIP1在甲状腺良恶性病变中的表达。结果p53、Mdm2及p21WAF/CIP1在甲状腺癌中表达的阳性率分别为50.6%(37/73),63.0%(47/73)和38.4%(28/73)。同癌旁组织相比,p53和Mdm2表达明显升高(P<0.01),而p21WAF/CIP1的表达明显降低(P<0.05)。p21WAF/CIP1和p53的阳性表达均与未分化癌、有无淋巴结转移及受累程度显著相关(P<0.05);Mdm2的阳性表达与甲状腺良恶性病变显著相关(P<0.05)。三者阳性表达两两之间统计学上具有关联性(P<0.05)。结论p53和Mdm2的过表达以及p21WAF/CIP1的缺失表达可能会导致甲状腺癌的恶性形成和进展;三者中蛋白主要以p53-Mdm2-p21WAF/CIP1通路的方式作用于细胞的转化和肿瘤的形成;联合检测p53和Mdm2的表达可用于评定甲状腺癌的恶性程度。检测p21WAF/CIP在甲状腺癌中表达的变化可用于评估其生物学行为和判断预后。 展开更多
关键词 甲状腺肿瘤 芯片分析技术 癌基因蛋白质 蛋白质P53
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染色体分离基因在纯化鼻咽癌组织中的表达 被引量:1
15
作者 刘仲奇 田勇泉 +3 位作者 刘俊秀 张迎宏 马芙蓉 胡永芳 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2007年第4期195-198,共4页
目的研究染色体分离基因(homosapiens chromosome segregation gene,CSE1L)在纯化鼻咽癌及非癌组织中的表达。方法首先从全基因组表达谱中筛选到鼻咽癌候选癌基因CSE1L。结合RNA保护、显微切割及线性扩增技术,获得纯化鼻咽组织中反义RNA... 目的研究染色体分离基因(homosapiens chromosome segregation gene,CSE1L)在纯化鼻咽癌及非癌组织中的表达。方法首先从全基因组表达谱中筛选到鼻咽癌候选癌基因CSE1L。结合RNA保护、显微切割及线性扩增技术,获得纯化鼻咽组织中反义RNA(antisense RNA,aRNA),采用半定量逆转录聚合酶链式反应(semi-quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,sqRT-PCR)研究从全基因组表达谱中筛选的候选癌基因—CSE1L在两种不同纯化鼻咽组织aRNA中的表达。结果在纯化鼻咽癌组织和鼻咽部非癌组织全基因组表达谱中,CSE1L基因表达值分别为1.056±0.296和0.465±0.835,相差2.27倍,两组比较有显著性差异(df=16,t=4.317,P=0.001<0.01)。sqRT-PCR检测纯化鼻咽癌组织及非癌组织aRNA中CSE1L基因的表达,分别为1.740±1.105和0.618±0.183,两组比较有显著性差异(df=30,t=3.159,P=0.004<0.01)。结论利用全基因组芯片构建基因表达谱可筛选到鼻咽癌发病相关的候选靶基因,sqRT-PCR可验证芯片杂交结果,CSE1L基因是鼻咽癌发生、发展过程中重要的候选癌基因。 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 显微切割 芯片分析技术 染色体分离 逆转录聚合酶链式反应
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心肌梗死预测概论 被引量:1
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作者 沙立人 胡大一 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2010年第10期952-954,共3页
心肌梗死是冠心病迅速恶化的疾病阶段,往往以急性冠状动脉综合征(ACS)突然发病。倘能实时检出高危状态的患者,提前主动采取预警措施,则将使防治工作更趋完善。当今,生物信息学推动了各项生物技术的应用,思维方式必须有新的突破... 心肌梗死是冠心病迅速恶化的疾病阶段,往往以急性冠状动脉综合征(ACS)突然发病。倘能实时检出高危状态的患者,提前主动采取预警措施,则将使防治工作更趋完善。当今,生物信息学推动了各项生物技术的应用,思维方式必须有新的突破,使预测工作将宏观与微观统一到数字化层面上,把复杂的规律简化至可操作的程序上,从而才能付诸临床应用。 展开更多
关键词 心肌梗死 预测 LOGISTIC模型 因素分析 统计学 芯片分析技术
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食管鳞癌组织中前列腺跨膜蛋白的表达和临床意义
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作者 耿丽 张昭 +1 位作者 李明君 秦艳茹 《临床荟萃》 CAS 2012年第12期1047-1049,F0003,共4页
目的探讨食管鳞癌组织及食管正常组织中雄激素诱导的前列腺跨膜蛋白1(PMEPA1)的表达情况,并分析其与食管鳞癌临床病理之间的关系。方法 230例食管癌患者均来自河南省林州市。利用组织微阵列技术,采用卵白素-生物素-辣根过氧化氢酶复合物... 目的探讨食管鳞癌组织及食管正常组织中雄激素诱导的前列腺跨膜蛋白1(PMEPA1)的表达情况,并分析其与食管鳞癌临床病理之间的关系。方法 230例食管癌患者均来自河南省林州市。利用组织微阵列技术,采用卵白素-生物素-辣根过氧化氢酶复合物(ABC)法,分析230例食管鳞癌组织(观察组)和相应正常食管组织(对照组)中PMEPA1的表达情况,并探讨其与食管鳞癌患者年龄、性别、肿瘤细胞分化程度、淋巴结转移、临床病理分期(TNM)分期和大体分型的关系。结果观察组中PMEPA1蛋白表达明显高于对照组PMEPA1蛋白表达(80.0%vs14.3%,P<0.01);PMEPA1蛋白高表达与淋巴结转移、TNM分期有关,而与年龄、性别、肿瘤细胞分化程度、和大体分型无关。结论 PMEPA1蛋白的异常表达可能在食管鳞癌的发生、发展及预后中起重要作用。 展开更多
关键词 食管肿瘤 肿瘤 鳞状细胞 蛋白质转运 芯片分析技术
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喉癌患者血清蛋白质谱人工神经网络预测模型的初步研究
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作者 刘建敏 黎万荣 +1 位作者 张萌 覃纲 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CSCD 2013年第7期341-344,共4页
目的应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionizationtime-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)分析喉癌患者与对照人群的血清蛋白质谱,筛选喉癌患者血清的差异表达蛋白,并利用人工神... 目的应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionizationtime-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)分析喉癌患者与对照人群的血清蛋白质谱,筛选喉癌患者血清的差异表达蛋白,并利用人工神经网络(artificial neuralnetwork,ANN)建立血清蛋白质分子诊断模型,以期构建可用于喉癌早期诊断敏感和特异的新方法。方法采集血清标本后利用SELDI-TOF-MS技术检测血清蛋白质谱数据,将获得的蛋白质谱图用Ciphergen ProteinChip 3.0软件进行数据的校正和分析,筛选喉癌患者组与对照组差异蛋白。利用筛选的差异蛋白作为标志物,结合ANN技术建立预测模型,评价该模型在喉癌诊断中的价值。结果喉癌组与对照组有79个差异蛋白质,其中差异有显著意义的蛋白质峰(分子量2000~20 000 Da,t=5.143,P<0.05)共24个。经过反复训练,筛选其中9个明显差异表达蛋白建立ANN诊断模型,灵敏度(SEN)为87.1%,特异度(SPE)84.8%,诊断指数为171.9%,其中区分喉癌与癌前病变准确率为100%。结论利用SELDI-TOF-MS技术筛选出的ANN蛋白质分子诊断模型能够较准确的区分喉癌与非喉癌人群,其在喉癌的诊断和血清肿瘤特异性蛋白质生物标志物的筛选方面具有一定临床应用价值。 展开更多
关键词 喉肿瘤 芯片分析技术 质谱分析 肿瘤标志 生物学 人工神经网络
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冠心病患者血浆微小RNA作为生物标记物可能性的研究 被引量:10
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作者 王珺晓 李凤卿 +1 位作者 刘建伟 罗善顺 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 2015年第6期591-594,共4页
目的探讨微小RNA(miRNA)在动脉粥样硬化性心脏病患者循环血浆中表达特点。方法选择男性冠心病患者32例作为冠心病组,男性健康体检者20例作为对照组。另选择载脂蛋白(apo)E-/-小鼠10只为实验组,正常C57BL/6J小鼠10只为观察组,用高通... 目的探讨微小RNA(miRNA)在动脉粥样硬化性心脏病患者循环血浆中表达特点。方法选择男性冠心病患者32例作为冠心病组,男性健康体检者20例作为对照组。另选择载脂蛋白(apo)E-/-小鼠10只为实验组,正常C57BL/6J小鼠10只为观察组,用高通量基因芯片技术分析实验组和观察组小鼠血浆中差异表达的miRNA。用实时定量PCR法检测冠心病组和对照组miRNA的表达。结果与观察组比较,实验组小鼠血浆有14种miRNA显著差异表达,其中6种显著上调3.02~3.46倍,8种显著下调3.02~4.21倍。与对照组血浆miRNA表达比较,冠心病组miR-34a和miR-21显著上调、miR-23a显著下调(P〈0.01)。结论冠心病患者循环血浆中miR-23a、miR-21、miR-34a较健康人群明显升高,提示这3种miRNA具有成为冠心病患者生物标记物的潜能。 展开更多
关键词 冠心病 微RNAS 载脂蛋白E类 聚合酶链反应 芯片分析技术
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骨质疏松发病过程中骨髓间充质干细胞差异性表达microRNA的筛选及其在干细胞多向分化中的功能 被引量:5
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作者 廖立 杨小红 金岩 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期75-80,共6页
目的:研究去势小鼠骨质疏松模型中骨髓间充质干细胞(BMMSC)microRNA表达谱的改变,确定特异性改变microRNA的功能,明确其在骨质疏松发病中的作用。方法:通过微阵列芯片筛查,寻找在骨质疏松模型骨髓间充质干细胞中差异性表达的microRNA,... 目的:研究去势小鼠骨质疏松模型中骨髓间充质干细胞(BMMSC)microRNA表达谱的改变,确定特异性改变microRNA的功能,明确其在骨质疏松发病中的作用。方法:通过微阵列芯片筛查,寻找在骨质疏松模型骨髓间充质干细胞中差异性表达的microRNA,并在成骨成脂分化诱导后行RT-PCR检测其表达水平,研究其在BMMSC多向分化中的作用。结果:本研究发现了10个在骨质疏松发病过程中有差异性表达的microRNA,其中5个microRNA在BMMSC成骨分化过程中,3个microRNA在成脂分化过程中表达出现明显改变。结论:microRNA表达异常可能导致骨质疏松发病过程中BMMSC的功能缺陷。 展开更多
关键词 微RNAs/药理学 骨质疏松 基因表达调控 间质干细胞/药物作用 细胞分化 芯片分析技术
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