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芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析
被引量：
5
1
作者
漆艳香
蒲金基
+4 位作者
张欣
陆英
张贺
张辉强
谢艺贤
《热带作物学报》
CSCD
2011年第4期663-667,共5页
根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF／XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌（Xanthomonas campestria pv．mangiferaeindicae）中获得了约1．4kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明．该基因片段长1422bp含有一个完整...
根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF／XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌（Xanthomonas campestria pv．mangiferaeindicae）中获得了约1．4kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明．该基因片段长1422bp含有一个完整的LuxR同源基因，并命名为XcmR。生物信息学分析表明．XcmR基因完整ORF（开放阅读框）全长765bp，编码254个氨基酸，分子质量和等电点分别约为28．2ku和8．9，与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR／AsaR氨基酸序列具有86％～99％相似性。系统聚类结果表明，XcmR与来源于柑桔溃疡病菌（X．axonopodis pv．citri）、番茄疮痂病菌（X．c．pv．vesicatoria）、水稻白叶枯菌（X．oryzae pv．oryzae）和甘蓝黑腐病菌（X．c．pv．campest如）的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明，XcmR是LuxR蛋白家族的一员，具有LuxR蛋白相似结构。
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关键词
芒果细菌性黑斑病菌
群体感应
XcmR
生物信息学
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职称材料
六种复配剂对芒果细菌性黑斑病菌的室内抑菌效果评价
被引量：
3
2
作者
蒲金基
张贺
+5 位作者
漆艳香
张欣
喻群芳
李小娟
赵丽
刘晓妹
《湖北农业科学》
2015年第10期2387-2389,2393,共4页
为筛选出有效防治芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)的复配剂,采用Horsfall法对6种复配剂进行室内增效评价。试验结果表明,硫酸链霉素与噻菌铜各配比、敌磺钠与中生菌素以1∶4、4∶1配比及噻菌铜与盐酸...
为筛选出有效防治芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)的复配剂,采用Horsfall法对6种复配剂进行室内增效评价。试验结果表明,硫酸链霉素与噻菌铜各配比、敌磺钠与中生菌素以1∶4、4∶1配比及噻菌铜与盐酸四环素以4∶1、3∶2、2∶3配比时有明显的增效作用;其余的组合则表现协同或拮抗作用。
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关键词
芒果细菌性黑斑病菌
(Xanthomonas
CAMPESTRIS
pv.mangiferaeindicae)
复配剂
抑菌效果
评价
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职称材料
芒果细菌性黑斑病病菌rep-PCR遗传多样性
被引量：
3
3
作者
漆艳香
张贺
+5 位作者
蒲金基
张欣
谢艺贤
陆英
喻群芳
张辉强
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第6期88-91,共4页
采用REP、ERIC和BOX引物对22株从海南、四川、广西芒果产区采集的芒果细菌性黑斑病菌菌株和1株源自美国菌种保藏中心(ATCC)的标准菌株进行rep-PCR分析,并根据DNA指纹特征,用NTSYS软件进行聚类分析。结果表明,3组引物共扩增出463条带,其...
采用REP、ERIC和BOX引物对22株从海南、四川、广西芒果产区采集的芒果细菌性黑斑病菌菌株和1株源自美国菌种保藏中心(ATCC)的标准菌株进行rep-PCR分析,并根据DNA指纹特征,用NTSYS软件进行聚类分析。结果表明,3组引物共扩增出463条带,其中有302条多态性条带,多态检测率为65.23%。综合分析3组引物组合的指纹图谱数据,以相似系数0.65为阀值时,供试的23株菌株可以分为A和B 2个遗传相似组,其中来自四川米易县的2株菌株与标准菌株ATCC11637聚在A组,而来自海南省、广西省的所有菌株均聚在B组。取相似系数为0.87时,A组群又可分为2个亚组,而B组群则进一步分为6个亚组。研究结果表明,芒果细菌性黑斑病菌菌株有丰富的遗传多态性和较大的遗传变异,但各遗传聚类组群菌株来源广泛,与地理来源及芒果品种均无明显相关性。
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关键词
芒果细菌性黑斑病菌
遗传多样
性
REP
ERIC
BOX
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职称材料
题名
芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析
被引量：
5
1
作者
漆艳香
蒲金基
张欣
陆英
张贺
张辉强
谢艺贤
机构
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室
海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2011年第4期663-667,共5页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目(No.2009hzs1J006)
公益性行业(农业)科研专项(200903034)资助
文摘
根据黄单孢菌属LuxR基因的同源性设计简并引物XF／XR,采用同源克隆法从芒果细菌性黑斑病菌（Xanthomonas campestria pv．mangiferaeindicae）中获得了约1．4kb的DNA片段。经测序和序列同源性分析表明．该基因片段长1422bp含有一个完整的LuxR同源基因，并命名为XcmR。生物信息学分析表明．XcmR基因完整ORF（开放阅读框）全长765bp，编码254个氨基酸，分子质量和等电点分别约为28．2ku和8．9，与GenBank中公布的Xanthomonas属LuxR或AhyR／AsaR氨基酸序列具有86％～99％相似性。系统聚类结果表明，XcmR与来源于柑桔溃疡病菌（X．axonopodis pv．citri）、番茄疮痂病菌（X．c．pv．vesicatoria）、水稻白叶枯菌（X．oryzae pv．oryzae）和甘蓝黑腐病菌（X．c．pv．campest如）的LuxR蛋白聚成一支。NCBI网站蛋白质保守结构域搜索表明，XcmR是LuxR蛋白家族的一员，具有LuxR蛋白相似结构。
关键词
芒果细菌性黑斑病菌
群体感应
XcmR
生物信息学
Keywords
Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae
Quorum sensing
XcmR
Sequence analysis
分类号
S436.67 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
六种复配剂对芒果细菌性黑斑病菌的室内抑菌效果评价
被引量：
3
2
作者
蒲金基
张贺
漆艳香
张欣
喻群芳
李小娟
赵丽
刘晓妹
机构
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
海南大学环境与植物保护学院
出处
《湖北农业科学》
2015年第10期2387-2389,2393,共4页
基金
公益性行业(农业)科研专项(201203092)
海南省自然基金项目(313082)
文摘
为筛选出有效防治芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae)的复配剂,采用Horsfall法对6种复配剂进行室内增效评价。试验结果表明,硫酸链霉素与噻菌铜各配比、敌磺钠与中生菌素以1∶4、4∶1配比及噻菌铜与盐酸四环素以4∶1、3∶2、2∶3配比时有明显的增效作用;其余的组合则表现协同或拮抗作用。
关键词
芒果细菌性黑斑病菌
(Xanthomonas
CAMPESTRIS
pv.mangiferaeindicae)
复配剂
抑菌效果
评价
Keywords
Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae
compound agent
bacteriostatic effect
evaluation
分类号
S481.9 [农业科学—农药学]
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职称材料
题名
芒果细菌性黑斑病病菌rep-PCR遗传多样性
被引量：
3
3
作者
漆艳香
张贺
蒲金基
张欣
谢艺贤
陆英
喻群芳
张辉强
机构
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第6期88-91,共4页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(编号:2014hzs1J007-2)
文摘
采用REP、ERIC和BOX引物对22株从海南、四川、广西芒果产区采集的芒果细菌性黑斑病菌菌株和1株源自美国菌种保藏中心(ATCC)的标准菌株进行rep-PCR分析,并根据DNA指纹特征,用NTSYS软件进行聚类分析。结果表明,3组引物共扩增出463条带,其中有302条多态性条带,多态检测率为65.23%。综合分析3组引物组合的指纹图谱数据,以相似系数0.65为阀值时,供试的23株菌株可以分为A和B 2个遗传相似组,其中来自四川米易县的2株菌株与标准菌株ATCC11637聚在A组,而来自海南省、广西省的所有菌株均聚在B组。取相似系数为0.87时,A组群又可分为2个亚组,而B组群则进一步分为6个亚组。研究结果表明,芒果细菌性黑斑病菌菌株有丰富的遗传多态性和较大的遗传变异,但各遗传聚类组群菌株来源广泛,与地理来源及芒果品种均无明显相关性。
关键词
芒果细菌性黑斑病菌
遗传多样
性
REP
ERIC
BOX
分类号
S436.679 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析
漆艳香
蒲金基
张欣
陆英
张贺
张辉强
谢艺贤
《热带作物学报》
CSCD
2011
5
在线阅读
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职称材料
2
六种复配剂对芒果细菌性黑斑病菌的室内抑菌效果评价
蒲金基
张贺
漆艳香
张欣
喻群芳
李小娟
赵丽
刘晓妹
《湖北农业科学》
2015
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
芒果细菌性黑斑病病菌rep-PCR遗传多样性
漆艳香
张贺
蒲金基
张欣
谢艺贤
陆英
喻群芳
张辉强
《江苏农业科学》
北大核心
2017
3
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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已选文献
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