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多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用
被引量：
13
1
作者
刘祥
许彦梅
+6 位作者
王斌
邓建平
肖波
孙松松
周阳
熊衍文
王红
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期1033-1036,共4页
目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等...
目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。
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关键词
多位点序列分型技术(MLST)
艾伯特埃希菌
新病原
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职称材料
四川自贡地区健康人群中艾伯特埃希菌的分离鉴定
被引量：
4
2
作者
张玲
刘祥
+3 位作者
许彦梅
李新琼
王红
熊衍文
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期569-573,共5页
目的了解长期从事鸡鸭等家禽养殖及屠宰人员等健康人群艾伯特埃希菌的携带情况。方法收集家禽养殖、屠宰人群及其他健康人粪便,经EC肉汤增菌后PCR检测eae基因,阳性样品接种麦康凯琼脂,挑选不发酵乳糖菌落,通过16SrDNA序列分析和多位点...
目的了解长期从事鸡鸭等家禽养殖及屠宰人员等健康人群艾伯特埃希菌的携带情况。方法收集家禽养殖、屠宰人群及其他健康人粪便,经EC肉汤增菌后PCR检测eae基因,阳性样品接种麦康凯琼脂,挑选不发酵乳糖菌落,通过16SrDNA序列分析和多位点序列分型(MLST)对菌株进行鉴定。分离株进行紧密粘附素亚型和cdtB亚型分析,并通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析与动物来源艾伯特埃希菌菌株间的相关性。结果从189份从事鸡鸭宰杀人员的粪便中,分离到2株艾伯特埃希菌,从58份其他健康人群粪便中分离到1株菌,而138份家禽养殖场人员粪便中未分离到菌株。3株菌株的紧密粘附素亚型分别为sigma,iota 2,nu,cdtB亚型均为Ⅱ/Ⅲ/Ⅴ亚型。PFGE显示三株菌之间的带型相似性小于80%,并且与鸡鸭等来源的艾伯特埃希菌带型不同。结论从事鸡鸭屠宰等健康人员中存在一定程度的艾伯特埃希菌携带率,但其与家禽携带艾伯特埃希菌的关系,仍需进一步研究。
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关键词
艾伯特埃希菌
健康人群
EAE
MLST
PFGE
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职称材料
题名
多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用
被引量：
13
1
作者
刘祥
许彦梅
王斌
邓建平
肖波
孙松松
周阳
熊衍文
王红
机构
四川省自贡市疾病预防控制中心
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期1033-1036,共4页
基金
自贡市重点科技计划项目(No.2013S06)
四川省卫生和计划生育委员会科研课题(No.150259)~~
文摘
目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。
关键词
多位点序列分型技术(MLST)
艾伯特埃希菌
新病原
Keywords
multilocus sequence typing （MLST）
E. agbertii
new pathogens
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
四川自贡地区健康人群中艾伯特埃希菌的分离鉴定
被引量：
4
2
作者
张玲
刘祥
许彦梅
李新琼
王红
熊衍文
机构
自贡市疾病预防控制中心
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期569-573,共5页
基金
自贡市重点科技计划项目(No.2013S06)
四川省卫生和计划生育委员会科研课题(No.150259)
传染病预防控制国家重点实验室开放课题(No.2016SKLID309)联合资助~~
文摘
目的了解长期从事鸡鸭等家禽养殖及屠宰人员等健康人群艾伯特埃希菌的携带情况。方法收集家禽养殖、屠宰人群及其他健康人粪便,经EC肉汤增菌后PCR检测eae基因,阳性样品接种麦康凯琼脂,挑选不发酵乳糖菌落,通过16SrDNA序列分析和多位点序列分型(MLST)对菌株进行鉴定。分离株进行紧密粘附素亚型和cdtB亚型分析,并通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析与动物来源艾伯特埃希菌菌株间的相关性。结果从189份从事鸡鸭宰杀人员的粪便中,分离到2株艾伯特埃希菌,从58份其他健康人群粪便中分离到1株菌,而138份家禽养殖场人员粪便中未分离到菌株。3株菌株的紧密粘附素亚型分别为sigma,iota 2,nu,cdtB亚型均为Ⅱ/Ⅲ/Ⅴ亚型。PFGE显示三株菌之间的带型相似性小于80%,并且与鸡鸭等来源的艾伯特埃希菌带型不同。结论从事鸡鸭屠宰等健康人员中存在一定程度的艾伯特埃希菌携带率,但其与家禽携带艾伯特埃希菌的关系,仍需进一步研究。
关键词
艾伯特埃希菌
健康人群
EAE
MLST
PFGE
Keywords
Escherichia albertii
healthy carriers
eae
MLST
PFGE
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用
刘祥
许彦梅
王斌
邓建平
肖波
孙松松
周阳
熊衍文
王红
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
13
在线阅读
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职称材料
2
四川自贡地区健康人群中艾伯特埃希菌的分离鉴定
张玲
刘祥
许彦梅
李新琼
王红
熊衍文
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
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