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利用酵母双杂交研究铜绿微囊藻生物钟蛋白KaiB的自身相互作用
被引量：
2
1
作者
郑锦乾
徐虹
+2 位作者
章军
王靖
朱斌琳
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第8期41-45,共5页
从铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)PCC7820中克隆了生物钟基因kaiB,并将其克隆入酵母双杂交系统的两个质粒pGADT7和pGBKT7中。经测序验证后,将重组质粒pGADT7-kaiB和pGBKT7-kaiB转化酵母菌AH109进行自激活性和自身相互作用的检测和...
从铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)PCC7820中克隆了生物钟基因kaiB,并将其克隆入酵母双杂交系统的两个质粒pGADT7和pGBKT7中。经测序验证后,将重组质粒pGADT7-kaiB和pGBKT7-kaiB转化酵母菌AH109进行自激活性和自身相互作用的检测和验证。结果表明,铜绿微囊藻生物钟蛋白KaiB无自激活性,KaiB蛋白自身能发生相互作用。因此,可用KaiB蛋白为诱饵利用酵母双杂交系统筛选文库钓取与KaiB发生相互作用的蛋白。
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关键词
铜绿微囊藻(Microcystis
aeruginosa)
生物钟蛋白KaiB
酵母双杂交
自身相互作用
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职称材料
CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具
被引量：
1
2
作者
周雨薇
岳鹏
黄健
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期659-666,共8页
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已...
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已有多种实验方法测定抗体交叉或自身相互作用相关的多种理化特性,但实验测试费力费时费钱。现有的抗体可开发性计算方法,或者依赖于结构,速度慢,通量低;或者未提供可用的软件或在线服务;或者提供的计算服务或软件费用过高;或者预测器的性能与健壮性有待提高。该文仅基于抗体序列,采用二肽期望均值偏差为特征,构建预测抗体交叉或自身相互作用的支持向量机模型。评估结果显示,该集成模型敏感性为100%,准确率为96.18%,可望用于抗体交叉或自身相互作用的高通量评估,加速治疗性抗体研发进程,降低研发成本。
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关键词
交叉
相互作用
可开发性
自身相互作用
支持向量机
治疗性抗体
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职称材料
评“CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具”
3
作者
沈百荣
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期658-658,共1页
侠之大者,为国为民。武侠小说中,大侠往往有奇遇。段誉吞了莽牯朱蛤、郭靖饮下梁子翁的药蛇血,两人于是百毒不侵。凡此种种,类似主动免疫(接种疫苗)或被动免疫(血清疗法)的原始版本。动物免疫血清用于传染病治疗已有上百年的历史,德国...
侠之大者,为国为民。武侠小说中,大侠往往有奇遇。段誉吞了莽牯朱蛤、郭靖饮下梁子翁的药蛇血,两人于是百毒不侵。凡此种种,类似主动免疫(接种疫苗)或被动免疫(血清疗法)的原始版本。动物免疫血清用于传染病治疗已有上百年的历史,德国科学家冯·贝林因此获得首枚诺贝尔生理学与医学奖。当前,康复患者血浆治疗新冠肺炎依然有效。这些疗法其实质是多克隆抗体药物。
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关键词
主动免疫
血清疗法
被动免疫
德国科学家
预测工具
多克隆抗体
动物免疫血清
自身相互作用
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职称材料
题名
利用酵母双杂交研究铜绿微囊藻生物钟蛋白KaiB的自身相互作用
被引量：
2
1
作者
郑锦乾
徐虹
章军
王靖
朱斌琳
机构
厦门大学生命科学学院细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第8期41-45,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(40306024)
文摘
从铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)PCC7820中克隆了生物钟基因kaiB,并将其克隆入酵母双杂交系统的两个质粒pGADT7和pGBKT7中。经测序验证后,将重组质粒pGADT7-kaiB和pGBKT7-kaiB转化酵母菌AH109进行自激活性和自身相互作用的检测和验证。结果表明,铜绿微囊藻生物钟蛋白KaiB无自激活性,KaiB蛋白自身能发生相互作用。因此,可用KaiB蛋白为诱饵利用酵母双杂交系统筛选文库钓取与KaiB发生相互作用的蛋白。
关键词
铜绿微囊藻(Microcystis
aeruginosa)
生物钟蛋白KaiB
酵母双杂交
自身相互作用
Keywords
Microcystis aeruginosa
cirdian-clock protein KaiB
yeast two-hybrid
self-interaction
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具
被引量：
1
2
作者
周雨薇
岳鹏
黄健
机构
电子科技大学生命科学与技术学院
成都东软学院健康医疗科技学院
出处
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期659-666,共8页
基金
国家自然科学基金(62071099)。
文摘
抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已有多种实验方法测定抗体交叉或自身相互作用相关的多种理化特性,但实验测试费力费时费钱。现有的抗体可开发性计算方法,或者依赖于结构,速度慢,通量低;或者未提供可用的软件或在线服务;或者提供的计算服务或软件费用过高;或者预测器的性能与健壮性有待提高。该文仅基于抗体序列,采用二肽期望均值偏差为特征,构建预测抗体交叉或自身相互作用的支持向量机模型。评估结果显示,该集成模型敏感性为100%,准确率为96.18%,可望用于抗体交叉或自身相互作用的高通量评估,加速治疗性抗体研发进程,降低研发成本。
关键词
交叉
相互作用
可开发性
自身相互作用
支持向量机
治疗性抗体
Keywords
cross-interaction
developability
self-interaction
support vector machine
therapeutic antibody
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q615 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
评“CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具”
3
作者
沈百荣
机构
四川大学华西医院系统遗传研究院
中国生物信息学会(筹)
四川省生物信息学学会
四川省医学信息学专委会会
出处
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期658-658,共1页
文摘
侠之大者,为国为民。武侠小说中,大侠往往有奇遇。段誉吞了莽牯朱蛤、郭靖饮下梁子翁的药蛇血,两人于是百毒不侵。凡此种种,类似主动免疫(接种疫苗)或被动免疫(血清疗法)的原始版本。动物免疫血清用于传染病治疗已有上百年的历史,德国科学家冯·贝林因此获得首枚诺贝尔生理学与医学奖。当前,康复患者血浆治疗新冠肺炎依然有效。这些疗法其实质是多克隆抗体药物。
关键词
主动免疫
血清疗法
被动免疫
德国科学家
预测工具
多克隆抗体
动物免疫血清
自身相互作用
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用酵母双杂交研究铜绿微囊藻生物钟蛋白KaiB的自身相互作用
郑锦乾
徐虹
章军
王靖
朱斌琳
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具
周雨薇
岳鹏
黄健
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
评“CISI2.0:更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具”
沈百荣
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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