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基于微卫星标记的钱塘江中下游三角鲂亲本群体和自然捕捞群体遗传多样性及遗传结构
被引量：
6
1
作者
张敏莹
方弟安
+3 位作者
周彦锋
任泷
郑宇辰
徐东坡
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期775-783,共9页
为掌握三角鲂Megalobrama terminalis不同群体的遗传多样性及遗传结构,以钱塘江中下游4个良种场亲本群体(湖州的景山JS和明兴MX群体,杭州的瓜沥镇GLZ和萧乡XX群体)和1个钱塘江自然捕捞群体(BL)为研究对象,利用微卫星分子标记结合毛细管...
为掌握三角鲂Megalobrama terminalis不同群体的遗传多样性及遗传结构,以钱塘江中下游4个良种场亲本群体(湖州的景山JS和明兴MX群体,杭州的瓜沥镇GLZ和萧乡XX群体)和1个钱塘江自然捕捞群体(BL)为研究对象,利用微卫星分子标记结合毛细管电泳基因分型技术,基于8对荧光标记SSR引物对来自5个群体的768尾样本进行了扩增和基因分型测序。结果表明:各群体单个位点检测到的等位基因数(N_(a))平均值为(10±1)~(39±7),有效等位基因数(N_(e))平均值为(6.60±0.98)~(14.22±3.08),5个群体Shannon's信息指数(I)平均值为(2.02±0.14)~(2.85±0.21),其中,明兴亲本群体的N_(a)、N_(e)和I值最小,BL群体的这3项指标明显高于其他群体;5个群体的观测杂合度(H_(o))平均值为(0.96±0.02)~(0.98±0.01),在绝大多数位点上H_(o)均大于期望杂合度(H_(e));分子方差分析显示,遗传变异主要来自群体内的个体间(占94.47%),群体间的遗传变异占5.53%;4个亲本群体间遗传分化程度较小(0<F_(ST)<0.05),BL群体与部分亲本群体(如JS和XX群体)间存在中等遗传分化(0.05<F_(ST)<0.15);主坐标分析(PCoA)与群体遗传结构分析结果具有一致性,所有个体被分成2个理论类群,其中,绝大部分BL群体的个体自成一个类群,少数BL群体的个体与其他4个亲本群体的个体聚集成另一个类群。研究表明,钱塘江中下游三角鲂群体遗传多样性处于较高水平,亲本群体普遍出现杂合子过剩和部分等位基因丢失现象。
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关键词
三角鲂
亲本
群体
自然捕捞群体
微卫星
遗传多样性
遗传结构
钱塘江中下游
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职称材料
题名
基于微卫星标记的钱塘江中下游三角鲂亲本群体和自然捕捞群体遗传多样性及遗传结构
被引量：
6
1
作者
张敏莹
方弟安
周彦锋
任泷
郑宇辰
徐东坡
机构
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期775-783,共9页
基金
国家淡水水产种质资源库项目(FGRC18537)
钱塘江鱼类增殖放流效益评估项目(CTZB-F170543IWZ-ZZZ)
中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2020TD61)。
文摘
为掌握三角鲂Megalobrama terminalis不同群体的遗传多样性及遗传结构,以钱塘江中下游4个良种场亲本群体(湖州的景山JS和明兴MX群体,杭州的瓜沥镇GLZ和萧乡XX群体)和1个钱塘江自然捕捞群体(BL)为研究对象,利用微卫星分子标记结合毛细管电泳基因分型技术,基于8对荧光标记SSR引物对来自5个群体的768尾样本进行了扩增和基因分型测序。结果表明:各群体单个位点检测到的等位基因数(N_(a))平均值为(10±1)~(39±7),有效等位基因数(N_(e))平均值为(6.60±0.98)~(14.22±3.08),5个群体Shannon's信息指数(I)平均值为(2.02±0.14)~(2.85±0.21),其中,明兴亲本群体的N_(a)、N_(e)和I值最小,BL群体的这3项指标明显高于其他群体;5个群体的观测杂合度(H_(o))平均值为(0.96±0.02)~(0.98±0.01),在绝大多数位点上H_(o)均大于期望杂合度(H_(e));分子方差分析显示,遗传变异主要来自群体内的个体间(占94.47%),群体间的遗传变异占5.53%;4个亲本群体间遗传分化程度较小(0<F_(ST)<0.05),BL群体与部分亲本群体(如JS和XX群体)间存在中等遗传分化(0.05<F_(ST)<0.15);主坐标分析(PCoA)与群体遗传结构分析结果具有一致性,所有个体被分成2个理论类群,其中,绝大部分BL群体的个体自成一个类群,少数BL群体的个体与其他4个亲本群体的个体聚集成另一个类群。研究表明,钱塘江中下游三角鲂群体遗传多样性处于较高水平,亲本群体普遍出现杂合子过剩和部分等位基因丢失现象。
关键词
三角鲂
亲本
群体
自然捕捞群体
微卫星
遗传多样性
遗传结构
钱塘江中下游
Keywords
Megalobrama terminalis
broodstock population
captive population
microsatellite
genetic diversity
genetic structure
middle and lower reaches of the Qiantang River
分类号
S931 [农业科学—渔业资源]
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出处
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1
基于微卫星标记的钱塘江中下游三角鲂亲本群体和自然捕捞群体遗传多样性及遗传结构
张敏莹
方弟安
周彦锋
任泷
郑宇辰
徐东坡
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
6
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