期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
3
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析
被引量：
1
1
作者
陈邦兰
翟梦倩
+6 位作者
龙涛
赵顺程
刘娟
尹茂灵
万心言
王治杰
刘继恺
《安徽农业科学》
CAS
2021年第3期100-104,109,共6页
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信...
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析。结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1~6.2,其编码氨基酸长度为500~542 aa,蛋白分子量为54.31~59.11 kD,等电点为5.09~8.73,总平均亲水性为0.475~0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件。染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上。表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性。该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础。
展开更多
关键词
自然
抗
性
相关
巨
噬
细胞
蛋白
烟草
基因
家族
表达分析
在线阅读
下载PDF
职称材料
甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析
被引量：
7
2
作者
卢婷婷
李艳玲
+1 位作者
李存法
李利红
《河南农业科学》
北大核心
2019年第2期40-47,共8页
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维...
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300～549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。
展开更多
关键词
甘草
自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族
生物信息学分析
在线阅读
下载PDF
职称材料
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因克隆与表达分析及SNP筛选
被引量：
4
3
作者
邢贺飞
高峰涛
+2 位作者
张永珍
董忠典
陈松林
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2016年第4期116-127,共12页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表...
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表达分析,并对其与抗鳗弧菌感染相关的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点进行了筛选。该基因c DNA序列全长3717 bp,其中开放阅读框(Open reading frame,ORF)1677 bp,所编码蛋白含有558个氨基酸,该蛋白具有Nramp家族的典型特征,包括10个跨膜区(Transmembrane,TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运蛋白特征结构域(Consensus Transport Motif,CTM)。半滑舌鳎Nramp的ORF末端有1个类似于脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(Iron-responsive regulatory protein-binding site,IRE)。半滑舌鳎Nramp与其他14个物种的Nramp氨基酸序列同源性在63%-91%之间,系统进化分析表明,半滑舌鳎Nramp和所有鱼类Nramp聚集为一簇,与其他物种Nramp2的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析显示,Nramp基因在半滑舌鳎脾脏和肾脏中的表达量最高,而在肌肉和性腺中的表达量最低;在哈维氏弧菌感染的半滑舌鳎肾脏、脾脏和肝脏中表达量呈升高趋势,而在鳃中则表现为下调趋势。利用直接测序法检测感染鳗弧菌后同一家系的233个个体(抗病个体165个,感病个体68个),共检测到15个SNP位点,对其中3个SNP位点即SNP-g.3113(T→C)、SNP-g.3125(A→G)和SNP-g.3164(A→T)进行测序分型后发现,SNPg.3125(A→G)的等位基因(G)频率和基因型(GG)频率与半滑舌鳎抗鳗弧菌疾病呈极显著相关(P<0.01)。研究结果表明,Nramp基因不同基因型对半滑舌鳎的抗病能力有着极其重要的影响,SNP-g.3125(A→G)可作为潜在的抗性遗传标记位点。本研究将为半滑舌鳎抗性品系培育提供技术支持。
展开更多
关键词
半滑舌鳎
天然
抗
性
相关
巨
噬
细胞
蛋白
(Nramp)
基因
克隆
RT-PCR
单核苷酸多态
性
(SNP)
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析
被引量：
1
1
作者
陈邦兰
翟梦倩
龙涛
赵顺程
刘娟
尹茂灵
万心言
王治杰
刘继恺
机构
西南科技大学生命科学与工程学院
伊犁师范大学生物与地理科学学院
西南科技大学核废物与环境安全国防重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2021年第3期100-104,109,共6页
基金
西南科技大学大学生创新创业训练项目(S201910619065)
西南科技大学龙山人才科研支持计划(18LZX626)。
文摘
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析。结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1~6.2,其编码氨基酸长度为500~542 aa,蛋白分子量为54.31~59.11 kD,等电点为5.09~8.73,总平均亲水性为0.475~0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件。染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上。表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性。该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础。
关键词
自然
抗
性
相关
巨
噬
细胞
蛋白
烟草
基因
家族
表达分析
Keywords
Natural resistance associated macrophage proteins
Nicotiana tabacum
Gene family
Expression analysis
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析
被引量：
7
2
作者
卢婷婷
李艳玲
李存法
李利红
机构
河南牧业经济学院制药工程学院
河南大学植物逆境重点实验室
出处
《河南农业科学》
北大核心
2019年第2期40-47,共8页
基金
河南省科技攻关项目(162102110033)
河南牧业经济学院重点学科项目(41000003)
+1 种基金
河南牧业经济学院骨干教师项目(84000063)
河南牧业经济学院科研创新团队项目(2018KYTD18)
文摘
为研究甘草自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从甘草全基因组数据库中筛选并鉴定甘草NRAMP家族基因序列,并对该家族成员做进化分析、基因结构分析、保守结构域和保守基序分析、二级结构和三维结构分析。结果显示,从甘草基因组中共鉴定出11个NRAMP基因家族成员,通过进化分析发现,亲缘关系近的NRAMP家族成员基因结构和保守基序都更为相似,甘草和大豆的NRAMP家族成员间亲缘关系更接近。甘草大部分NRAMP家族成员的氨基酸数量差异不大,介于300～549个,且亚细胞定位在细胞膜上,而2个分子质量较大的成员GurNRAMP7和GurNRAMP8亚细胞定位在叶绿体上,各个成员的跨膜结构数量不尽相同。各个基因在染色体上的分布较为分散,只有NRAMP9、NRAMP10、NRAMP11定位在同一条染色体上。α-螺旋是甘草NRAMP家族成员中最主要的二级结构,但各个成员含有的α-螺旋数量不完全一样。
关键词
甘草
自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族
生物信息学分析
Keywords
Glycyrrhiza uralensis
NRAMP gene family
Bioinformatics analysis
分类号
S567.7 [农业科学—中草药栽培]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因克隆与表达分析及SNP筛选
被引量：
4
3
作者
邢贺飞
高峰涛
张永珍
董忠典
陈松林
机构
农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
上海海洋大学水产与生命学院
中国海洋大学海洋生命学院
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2016年第4期116-127,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31530078)
"山东省泰山学者攀登计划项目"共同资助
文摘
天然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance-associated macrophage protein,Nramp)属于膜整合转运蛋白,具有抑制胞内寄生菌侵染、调节巨噬细胞的抗菌活性等作用。本研究对半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因进行了克隆和表达分析,并对其与抗鳗弧菌感染相关的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点进行了筛选。该基因c DNA序列全长3717 bp,其中开放阅读框(Open reading frame,ORF)1677 bp,所编码蛋白含有558个氨基酸,该蛋白具有Nramp家族的典型特征,包括10个跨膜区(Transmembrane,TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运蛋白特征结构域(Consensus Transport Motif,CTM)。半滑舌鳎Nramp的ORF末端有1个类似于脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(Iron-responsive regulatory protein-binding site,IRE)。半滑舌鳎Nramp与其他14个物种的Nramp氨基酸序列同源性在63%-91%之间,系统进化分析表明,半滑舌鳎Nramp和所有鱼类Nramp聚集为一簇,与其他物种Nramp2的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析显示,Nramp基因在半滑舌鳎脾脏和肾脏中的表达量最高,而在肌肉和性腺中的表达量最低;在哈维氏弧菌感染的半滑舌鳎肾脏、脾脏和肝脏中表达量呈升高趋势,而在鳃中则表现为下调趋势。利用直接测序法检测感染鳗弧菌后同一家系的233个个体(抗病个体165个,感病个体68个),共检测到15个SNP位点,对其中3个SNP位点即SNP-g.3113(T→C)、SNP-g.3125(A→G)和SNP-g.3164(A→T)进行测序分型后发现,SNPg.3125(A→G)的等位基因(G)频率和基因型(GG)频率与半滑舌鳎抗鳗弧菌疾病呈极显著相关(P<0.01)。研究结果表明,Nramp基因不同基因型对半滑舌鳎的抗病能力有着极其重要的影响,SNP-g.3125(A→G)可作为潜在的抗性遗传标记位点。本研究将为半滑舌鳎抗性品系培育提供技术支持。
关键词
半滑舌鳎
天然
抗
性
相关
巨
噬
细胞
蛋白
(Nramp)
基因
克隆
RT-PCR
单核苷酸多态
性
(SNP)
Keywords
Half smooth tongue sole （Cynoglossus semilaevis）
Nramp
Gene clone
RT-PCR
Single Nucleotide Polymorphism （SNP）
分类号
S965 [农业科学—水产养殖]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析
陈邦兰
翟梦倩
龙涛
赵顺程
刘娟
尹茂灵
万心言
王治杰
刘继恺
《安徽农业科学》
CAS
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甘草NRAMP基因家族的鉴定和生物信息学分析
卢婷婷
李艳玲
李存法
李利红
《河南农业科学》
北大核心
2019
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Nramp基因克隆与表达分析及SNP筛选
邢贺飞
高峰涛
张永珍
董忠典
陈松林
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2016
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
