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基因组二代测序数据的自动化分析流程 被引量:9
1
作者 李文轲 李丰余 +5 位作者 张思瑶 蔡斌 郑娜 聂宇 周到 赵倩 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期618-624,共7页
二代测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前二代测序数据分析软件很多,但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如:仅进行序列比对或变异读取或功能注释等),如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。... 二代测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前二代测序数据分析软件很多,但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如:仅进行序列比对或变异读取或功能注释等),如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。文章设计了一套基于perl语言和SGE资源管理的自动化处理流程来分析Illumina平台基因组测序数据。该流程以测序原始序列数据作为输入,调用业界标准的数据处理软件(如:BWA,Samtools,GATK,ANNOVAR等),最终生成带有相应功能注释、便于研究者进一步分析的变异位点列表。该流程通过自动化并行脚本控制流程的高效运行,一站式输出分析结果和报告,简化了数据分析过程中的人工操作,大大提高了运行效率。用户只需填写配置文件或使用图形界面输入即可完成全部操作。该工作为广大研究者分析二代测序数据提供了便利的途径。 展开更多
关键词 二代测序 自动化数据分析 流程 变异检测
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郑州地下水均衡试验场的改建工程——主要测试设施与数据自动化采集 被引量:4
2
作者 李俊亭 张彦辉 +2 位作者 申圆圆 刘尚杰 王帅 《水文地质工程地质》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期38-43,共6页
郑州地下水均衡试验场的改建,是由中国地质环境监测院主持的国家地下水监测工程中地下水均衡试验场的改建项目之一,由河南省环境地质监测院具体负责实施。科学技术的发展,为试验场观测数据采集的自动化奠定了良好基础。试验场数据采集... 郑州地下水均衡试验场的改建,是由中国地质环境监测院主持的国家地下水监测工程中地下水均衡试验场的改建项目之一,由河南省环境地质监测院具体负责实施。科学技术的发展,为试验场观测数据采集的自动化奠定了良好基础。试验场数据采集需要自动化的有:3m高主杆气象站测试系统;太阳全辐射、太阳净辐射、太阳直射观测仪,E—601蒸发仪,5TM含水率、温度传感器,自动补水仪,负压测量仪。除后两项外,其他需要数据采集仪器已经市场化。后两项是作者的发明与实用专利。自动补水仪是用来模拟地下水位埋深的设备,它是以传统的马里奥特瓶补水原理为基础,采用控制电路使其可以自动补给因蒸发而消耗的水量,同时还可以记录降水的历时过程。负压测量是利用空气运动黏度约大于水运动黏度的15倍这一特性,即当水刚通过多孔瓷头时,气体不能通过多孔瓷头,据此设计了在包气带中能测定负压的传感器。数据采集则应用了惠斯登电桥平衡的补偿原理。由于控制、供电、采集数据的电缆过多,因此数据自动化采集系统应用了三级采集、逐级集成的方案。 展开更多
关键词 自动补水仪 负压传感器 5TM水分与温度传感器 数据自动化采集系统
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信息系统中数据库操作自动化型元数据研究 被引量:1
3
作者 许永涛 王延章 +1 位作者 陈雪龙 于淼 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2006年第11期94-97,共4页
本文提出了数据库操作自动化元数据的概念,并概括了它的特点,基于信息系统开发实践的角度,论述了信息系统中的五种数据库操作自动化型元数据,并给出这几种元数据的表示和管理方式。
关键词 数据 数据库操作自动化 信息系统
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基于Snakemake的RNA-seq数据自动化分析流程RNApipe
4
作者 武乐 李益楠 +1 位作者 孔德信 周志鹏 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期143-151,共9页
为使科研工作者简单高效地分析RNA-seq数据,本研究基于Snakemake工作流程管理系统和Conda环境管理器构建了一个自动化和模块化的工作流程:RNApipe(Github:https://github.com/ywu019/RNApipe.git),其可对来自任何有参物种的RNA-seq数据... 为使科研工作者简单高效地分析RNA-seq数据,本研究基于Snakemake工作流程管理系统和Conda环境管理器构建了一个自动化和模块化的工作流程:RNApipe(Github:https://github.com/ywu019/RNApipe.git),其可对来自任何有参物种的RNA-seq数据自动执行质控、比对、定量、鉴定差异基因,以及GO、KEGG、GSEA等功能注释分析;其中,每一步骤的分析结果均以高质量的可视化图片或报告展示,并保留重要的输出文件。使用RNApipe在多个模式物种中的测试与评估结果表明:RNApipe可以平稳运行,且注释结果准确。与现有的自动化分析流程相比,RNApipe的主要特点包括:工作流程较为完整、默认工具消耗时间与资源较少、适用于任何有参物种、全面的可视化、以及用户友好性(易安装、易使用、易扩展)。研究表明,RNApipe便于研究人员快速地从大型RNA-seq测序数据中获取基本信息。 展开更多
关键词 转录组测序 差异表达分析 功能注释 Snakemake Conda 自动化数据分析 可视化
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基于数据重构与孤立森林法的大坝自动化监测数据异常检测方法 被引量:16
5
作者 赵新华 范振东 +1 位作者 何宇 查益华 《中国农村水利水电》 北大核心 2021年第9期174-178,共5页
大坝安全自动化采集的监测数据不可避免地存在粗差、缺测等问题,针对异常数据量值、数量以及分布规律的不确定性,人工删除异常值存在工作量大、主观性强等不足,提出一种基于数据重构与孤立森林法的异常数据检测方法,该方法是一种无监督... 大坝安全自动化采集的监测数据不可避免地存在粗差、缺测等问题,针对异常数据量值、数量以及分布规律的不确定性,人工删除异常值存在工作量大、主观性强等不足,提出一种基于数据重构与孤立森林法的异常数据检测方法,该方法是一种无监督的学习方法,不需要根据特征标签进行样本学习,适用范围较广。首先对大坝自动化监测数据进行分解与重构,分离出趋势项,而后用孤立森林算法对剩余项进行判别,计算测点的异常分数,并剔除明显的异常数据,最后再根据拉依达准则进一步清理异常数据。通过实例验证,该方法能较好检测出大坝安全自动化异常监测数据,满足工程实际应用。 展开更多
关键词 大坝自动化监测数据 异常检测 孤立森林 数据分解与重构 拉依达准则
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自动化监测系统在昆明地铁4号线下穿既有地铁中的应用 被引量:12
6
作者 陈红 刘明光 《都市快轨交通》 北大核心 2020年第6期123-126,共4页
自动化监测系统主要由硬件系统及软件系统构成,具有自动化数据采集、连续监测、变形数据分析、成果评价、远程控制、信息发布管理等优点。在昆明地铁4号线东大盾构区间下穿既有地铁3号线盾构区间工程中,监测系统对施工进行实时监测、监... 自动化监测系统主要由硬件系统及软件系统构成,具有自动化数据采集、连续监测、变形数据分析、成果评价、远程控制、信息发布管理等优点。在昆明地铁4号线东大盾构区间下穿既有地铁3号线盾构区间工程中,监测系统对施工进行实时监测、监测数据实时分析、快速反馈信息,指导盾构下穿施工,并且保障了新建盾构区间的顺利贯通和既有地铁3号线的运营安全。 展开更多
关键词 地铁盾构 自动化监测 下穿既有地铁 数据分析 自动化数据采集
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基于“互联网+”的自动化变形监测系统的设计与应用 被引量:9
7
作者 李新求 梅迎春 +1 位作者 蒙尚雁 张齐 《测绘通报》 CSCD 北大核心 2016年第1期146-147,共2页
传统的人工监测已经无法满足社会对安全越来越高的要求。而具有自动目标照准功能的全站仪的出现及各种不同类型的岩土传感器的发展,为实现变形监测自动化提供了有利条件,基于自动化的变形监测系统的研究和开发也相继展开。
关键词 自动化监测系统 自动化数据 全站仪 控制单元 人工监测 自动生成系统 大坝变形监测 基坑监测 信息管理平台 水平位移
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现代通信技术在油气生产自动化中的应用 被引量:1
8
作者 李凤民 冯玉敏 +1 位作者 米国旗 谢文满 《无线电通信技术》 2006年第6期62-64,共3页
介绍了采用现代通信技术构建华北油田采油五厂自动化监控系统的技术方案。针对采油生产现场的多业务需求,分别建设自动化数据采集、话音和视频监控接入系统。同时,根据采油五厂地理位置特点,灵活运用光纤、微波、WLAN等通信技术构成有线... 介绍了采用现代通信技术构建华北油田采油五厂自动化监控系统的技术方案。针对采油生产现场的多业务需求,分别建设自动化数据采集、话音和视频监控接入系统。同时,根据采油五厂地理位置特点,灵活运用光纤、微波、WLAN等通信技术构成有线/无线混合的三级Ethernet网络,实现多业务综合接入。 展开更多
关键词 采油生产自动化 监控 自动化数据采集
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基于Bernese 5.0的区域CORS数据自动处理系统 被引量:4
9
作者 黄超 杨颖 +2 位作者 熊卫东 周锐 张海平 《山东科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第5期75-81,共7页
高精度GPS数据处理软件已得到广泛应用,但对于区域连续运行参考站系统站点数据自动处理的研究相对较少,Bernese 5.0的批处理模块处理连续运行参考站点数据自动化程度较高,但从整体上看批处理模块的准备阶段存在准备数据、流程繁琐等不... 高精度GPS数据处理软件已得到广泛应用,但对于区域连续运行参考站系统站点数据自动处理的研究相对较少,Bernese 5.0的批处理模块处理连续运行参考站点数据自动化程度较高,但从整体上看批处理模块的准备阶段存在准备数据、流程繁琐等不足。鉴于此设计出"项目的建立与选取、参数设置、文件准备等繁琐流程"的自动化解算策略,基于Bernese 5.0的批处理模块,通过编程实现了区域CORS站点单天数据的全自动处理解算策略,减少数据处理出错概率,提高了处理速度。通过对山东连续运行参考站系统站点数据实例进行计算,证实了系统解算方法的可行性,将得到的解算结果与GAMIT/GLOBK处理结果进行对比,验证解算结果满足±5cm的精度要求,并且有足够可靠性。 展开更多
关键词 Bernese5.0 数据处理自动化 区域连续运行参考站系统
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棉铃虫监测和预警网络数据库的设计与数据建设 被引量:3
10
作者 吕昭智 王涛 +2 位作者 沈佐锐 张建新 马兵建 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2007年第1期31-35,共5页
害虫数据库是害虫信息收集、预测和综合治理的核心,同时是害虫信息化预警、管理的基础和关键。依据棉铃虫测报的国家行业标准(GB/T158000-1995)及其生物生态学特性,以分布式数据库Microsoft SQL Server管理工具,构建棉铃虫预警网络数据... 害虫数据库是害虫信息收集、预测和综合治理的核心,同时是害虫信息化预警、管理的基础和关键。依据棉铃虫测报的国家行业标准(GB/T158000-1995)及其生物生态学特性,以分布式数据库Microsoft SQL Server管理工具,构建棉铃虫预警网络数据库。在此基础上,将监测和预警数据分为人工采集数据、自动化采集数据和模型参数数据3大类,针对不同数据来源,提出了异构数据库批处理、PC版棉铃虫数据库软件处理(CBWMIS,CB management information system)、Web方式录入和基于GPRS或电话调制解调器自动化录入的4种数据建设方式,以中国新疆地区为例,实现了棉铃虫预警网络数据库设计和数据建设,为害虫网络信息化管理提供重要的信息平台。 展开更多
关键词 棉铃虫 网络数据 预测预报 MICROSOFT SQL SERVER 自动化数据采集
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机器学习化数据库系统研究综述 被引量:34
11
作者 孟小峰 马超红 杨晨 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2019年第9期1803-1820,共18页
数据库系统经过近50年的发展,虽然已经普遍商用,但随着大数据时代的到来,数据库系统在2个方面面临挑战.首先数据量持续增大期望单个查询任务具有更快的处理速度;其次查询负载的快速变化及其多样性使得基于DBA经验的数据库配置和查询优... 数据库系统经过近50年的发展,虽然已经普遍商用,但随着大数据时代的到来,数据库系统在2个方面面临挑战.首先数据量持续增大期望单个查询任务具有更快的处理速度;其次查询负载的快速变化及其多样性使得基于DBA经验的数据库配置和查询优化偏好不能实时地调整为最佳运行时状态.而数据库系统的性能优化进入瓶颈期,优化空间收窄,进一步优化只能依托新的硬件加速器来实现,传统的数据库系统不能够有效利用现代的硬件加速器;数据库系统具有成百个可调参数,面对工作负载频繁变化,大量繁琐的参数配置已经超出DBA的能力,这使得数据库系统面对快速而又多样性的变化缺乏实时响应能力.当下机器学习技术恰好同时符合这2个条件:应用现代加速器以及从众多参数调节经验中学习.机器学习化数据库系统将机器学习技术引入到数据库系统设计中.一方面将顺序扫描转化为计算模型,从而能够利用现代硬件加速平台;另一方面将DBA的经验转化为预测模型,从而使得数据库系统更加智能地动态适应工作负载的快速多样性变化.将对机器学习化数据库系统当前的研究工作进行总结与归纳,主要包括存储管理、查询优化的机器学习化研究以及自动化的数据库管理系统.在对已有技术分析的基础上,指出了机器学习化数据库系统的未来研究方向及可能面临的问题与挑战. 展开更多
关键词 数据库系统 机器学习 学习化索引 自动化数据库系统
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基于维持种群多样性的测试数据生成算法的研究 被引量:2
12
作者 王建民 蔡媛 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2012年第5期1039-1048,共10页
测试数据自动化生成技术尝试寻找一个相对小的数据集来满足测试充分性标准,以降低软件测试的成本,提高测试效率.当测试项的数据集大小超过其上限时,算法会使用淘汰算法把差异性较小的测试数据从集合中淘汰掉,把差异性较大的测试数据留下... 测试数据自动化生成技术尝试寻找一个相对小的数据集来满足测试充分性标准,以降低软件测试的成本,提高测试效率.当测试项的数据集大小超过其上限时,算法会使用淘汰算法把差异性较小的测试数据从集合中淘汰掉,把差异性较大的测试数据留下来,以维持种群的多样性.针对此问题,提出一种基于维持种群多样性的演化算法来求解测试数据集,算法利用启发信息迭代地选择一个条件?判定语句作为子目标,通过演化算法生成数据以覆盖目标.在此算法框架内,利用一种新的计算评估值的方法计算数据与测试项的距离信息;以及利用归一的曼哈顿距离计算测试数据差异性,通过淘汰策略把差异性较小的测试数据淘汰掉.在实验中,对14个计算机科学基础算法的基准函数进行了测试,并与现有文献中的测试数据生成方法进行对比,验证了算法有效提高了条件?判定覆盖率,并且减少了测试数据的生成数量,提高了测试性能. 展开更多
关键词 结构化测试 测试数据自动化生成 测试用例 条件/判定覆盖 元启发式搜索技术
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一种基于数据链管理的印刷ERP解决方案 被引量:1
13
作者 皮阳雪 何永志 《包装工程》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期122-127,共6页
目的为了克服传统印刷ERP的不足,开发出一套满足印刷企业需要,能够解决企业管理面临的问题,易学好用的印刷ERP解决方案。方法通过对多家印刷企业的调研,总结了印刷企业管理中存在的主要问题,以工单为核心,开发出一款基于数据单据链条化... 目的为了克服传统印刷ERP的不足,开发出一套满足印刷企业需要,能够解决企业管理面临的问题,易学好用的印刷ERP解决方案。方法通过对多家印刷企业的调研,总结了印刷企业管理中存在的主要问题,以工单为核心,开发出一款基于数据单据链条化的新型印刷ERP系统。结果新系统能很好地解决印刷企业管理中存在的各种问题。通过124家企业的试用,满意度高达91%,其中物料损耗降低了7%,部门协作效率提高了3倍,平均每个工单节约了5个工时,管理成本下降了3.7%,企业平均利润上升了2.3%。结论基于数据单据链条化的印刷ERP解决方案,把传统印刷企业管理中复杂、繁琐的信息进行简化,达到"轻松、易用"的目标,并快速地得到企业的认同和正式使用。 展开更多
关键词 印刷ERP 生产工单 数据单据链条化 数据流转自动化
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基于ISO/IEC国际标准的信息安全性工程数据库群及其应用
14
作者 宝达 程京德 《信息安全研究》 2017年第8期701-709,共9页
任何信息系统的整体安全性永远取决于其安全性能最弱的环节,所以只有遵照统一的基准来设计、开发、运用、维护的系统才能在其整个生命周期中保证其安全性始终如一.多年以来国际标准化组织(ISO)颁布了一系列有关信息安全性的国际标准,这... 任何信息系统的整体安全性永远取决于其安全性能最弱的环节,所以只有遵照统一的基准来设计、开发、运用、维护的系统才能在其整个生命周期中保证其安全性始终如一.多年以来国际标准化组织(ISO)颁布了一系列有关信息安全性的国际标准,这些由世界各国学者专家集思广益严格定义的标准,都可以被作为保障信息系统安全性功能的基准.但是依照国际标准来设计、开发、运用、维护信息系统安全性功能以及依照国际标准来评估认证信息系统安全性功能都是复杂的工作.而且当国际标准进行订正和更新之后,针对新旧版本之间差异来对现存系统的安全性功能进行改良和维护更是一件繁琐的任务.由人工来完成复杂繁琐的工作任务必然导致效率低下、正确性差、准确性低、公平性无法保证等诸方面的缺陷.上述问题只有通过使用自动化智能化的方法来共享、管理、查询和运用数据才能得以解决.为此提出并开发了世界上第1个基于ISO/IEC国际标准的信息安全性工程数据库群.该数据库群系统化地囊括了众多信息安全性相关的国际标准及其相关的案例数据,方便各类用户管理和查询,并帮助他们设计、开发、运用、维护信息系统的安全性功能.重点介绍数据库群并说明其应用方法. 展开更多
关键词 信息安全性 国际标准化组织 数据库群 软件生命周期 数据管理自动化
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黄浩团身后空翻三周翻转角速度变化及特征画面团身紧度运动学研究 被引量:1
15
作者 郝庆威 董力 《沈阳体育学院学报》 CSSCI 1996年第3期23-24,共2页
黄浩团身后空翻三周翻转角速度变化及特征画面团身紧度运动学研究郝庆威,董力(沈阳体育学院110032)AKinematicStudyoftheChangeofAngularVelocityofHuangHao’sTri... 黄浩团身后空翻三周翻转角速度变化及特征画面团身紧度运动学研究郝庆威,董力(沈阳体育学院110032)AKinematicStudyoftheChangeofAngularVelocityofHuangHao’sTripleBackwardSomers... 展开更多
关键词 团身后空翻三周 转角速度 运动学研究 腾空阶段 水平位 自动化数据处理 波动性 纵轴 全国技巧锦标赛 动量矩守恒定律
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电子手薄在山东焦家金矿地质专业中的应用
16
作者 刘胜光 高海峰 黄锁英 《黄金科学技术》 2010年第3期79-82,共4页
利用电子手簿手写电子数据功能对基础地质数据进行自动化采集,实现钻孔、坑道和地质素描数据的自动化采集及数据格式的转换、传输和基本专业计算功能。电子手簿中的电子数据具有自动导出、查询与成图等功能,基本替代了传统的手工工作,... 利用电子手簿手写电子数据功能对基础地质数据进行自动化采集,实现钻孔、坑道和地质素描数据的自动化采集及数据格式的转换、传输和基本专业计算功能。电子手簿中的电子数据具有自动导出、查询与成图等功能,基本替代了传统的手工工作,减少了手工作业流程的失误,提高了专业工作精度和成效,同时所收集的数据为SURPAC矿山软件的快速、高效推广应用提供了良好的基础。 展开更多
关键词 电子手薄 地质素描 自动化数据采集 焦家金矿 山东省
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聚焦离子束技术在常温生物样品三维重构方面的方法探讨 被引量:10
17
作者 李晓敏 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期196-205,共10页
聚焦离子束连续切片扫描电镜(focused ion beam serial block face scanning electron microscopy,FIB-SEM)技术,目前已被广泛应用于小体积细胞或组织样品的三维重构,具有自动化程度高、Z轴分辨高等优点。本文从包埋块样品准备与处理、... 聚焦离子束连续切片扫描电镜(focused ion beam serial block face scanning electron microscopy,FIB-SEM)技术,目前已被广泛应用于小体积细胞或组织样品的三维重构,具有自动化程度高、Z轴分辨高等优点。本文从包埋块样品准备与处理、样品区域选定、软件设置前准备、软件参数(离子束加工和电子束扫描)设置、软件运行与图像采集和图像处理等多个方面,详细介绍应用FIB-SEM技术对常温生物包埋块样品进行三维重构的流程和细节,并对某些关键性参数展开讨论。 展开更多
关键词 聚焦离子束连续切片扫描电镜技术 生物包埋块 自动化数据收集 三维重构
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VBA在试卷分析中的应用 被引量:1
18
作者 籍颖 常淑惠 杨断利 《现代电子技术》 2005年第5期33-34,41,共3页
在试卷分析过程中 ,传统的成绩统计采用手工的办法 ,费时费力。针对此问题提出用 VBA编程的方法 ,实现计算机对数据的自动化处理 ,提高了工作效率和准确性。
关键词 VBA EXCEL 试卷分析 数据自动化
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影响高空探测质量主要因素及应对措施 被引量:8
19
作者 贺美萍 《内蒙古农业科技》 2015年第4期60-61,69,共3页
文章从实际工作出发对影响高空探测质量的主要因素进行了讨论,提出了措施建议。研究表明,雷达标定方法、雷达观测环境、湿度基点电阻和基测数据准确性、施放瞬间气象要素的准确性都是影响高空资料质量的重要因素。采用科学的雷达标定方... 文章从实际工作出发对影响高空探测质量的主要因素进行了讨论,提出了措施建议。研究表明,雷达标定方法、雷达观测环境、湿度基点电阻和基测数据准确性、施放瞬间气象要素的准确性都是影响高空资料质量的重要因素。采用科学的雷达标定方法、确定测站雷达的探测性能、基点电阻、基值测定和施放瞬间数据自动化、台站二次订正等措施是提高高空探测质量的技术保证。 展开更多
关键词 基点电阻 雷达标定 地面要素 准确性 数据自动化
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基于CITIS的工作流服务资源优化配置研究
20
作者 潘智男 姜莉莉 《机械设计与制造》 北大核心 2010年第12期248-250,共3页
实施承包商集成技术信息服务(Contractor integrated technical information service,简称CITIS)的目的是提供一个公共的信息共享平台,实现协同制造企业间的数据集成和交换。工作流技术是解决CITIS数据集成和数据自动化传递的一个重要... 实施承包商集成技术信息服务(Contractor integrated technical information service,简称CITIS)的目的是提供一个公共的信息共享平台,实现协同制造企业间的数据集成和交换。工作流技术是解决CITIS数据集成和数据自动化传递的一个重要手段。如何对工作流服务资源进行优化配置,成为了工作流在CITIS环境下优化业务过程的一个重要内容。以服务性能、价格成本、交货期、技术水平和风险防范为目标,借助模糊BP神经网络来求解多目标的工作流服务资源配置问题。通过MATLAB7.1编程仿真,说明此方法是收敛的和可行的。 展开更多
关键词 CITIS 流服务 资源优化 配置研究 NEURAL network based WORKFLOW 工作流技术 information service 数据集成和交换 服务资源 信息共享平台 数据自动化 integrated 优化配置 业务过程 信息服务 协同制造 神经网络 配置问题
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