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6个鸡种腺苷单磷酸脱氨酶1基因克隆及序列分析
被引量：
5
1
作者
张学余
季从亮
+3 位作者
陈国宏
黄兆明
苏一军
沈晓鹏
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2004年第2期224-226,237,共4页
以肌苷酸合成代谢过程中主要的催化酶之一的鸡腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosinemonophosphatedeaminase1,AMPD1)基因作为候选基因,分析了其在6个鸡种中的序列多样性,发现在525bp的片段中共存在10个多态位点,其中120位的A→G,355位的A→G的...
以肌苷酸合成代谢过程中主要的催化酶之一的鸡腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosinemonophosphatedeaminase1,AMPD1)基因作为候选基因,分析了其在6个鸡种中的序列多样性,发现在525bp的片段中共存在10个多态位点,其中120位的A→G,355位的A→G的碱基变化仅在泰和乌骨鸡、北京油鸡、茶花鸡肌苷酸含量较高的鸡种中出现,推测这两个位点与肌苷酸含量密切相关。另外该基因与体重也可能具有相关性。
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关键词
鸡种
腺苷单磷酸脱氨酶1
基因克隆
序列分析
肌
苷
酸
肌肉鲜味
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职称材料
山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
被引量：
1
2
作者
王德凤
杨永强
韩勇
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013年第7期127-132,共6页
为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AM...
为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。
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关键词
腺苷单磷酸脱氨酶1
单核
苷
酸多态性
启动子
小香羊
黔北麻羊
努比山羊
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职称材料
题名
6个鸡种腺苷单磷酸脱氨酶1基因克隆及序列分析
被引量：
5
1
作者
张学余
季从亮
陈国宏
黄兆明
苏一军
沈晓鹏
机构
中国农业科学院家禽研究所
扬州大学畜牧兽医学院
出处
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2004年第2期224-226,237,共4页
基金
国家863计划(2001AA243082)
江苏省科技计划(BG2001319
BJ200043)
文摘
以肌苷酸合成代谢过程中主要的催化酶之一的鸡腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosinemonophosphatedeaminase1,AMPD1)基因作为候选基因,分析了其在6个鸡种中的序列多样性,发现在525bp的片段中共存在10个多态位点,其中120位的A→G,355位的A→G的碱基变化仅在泰和乌骨鸡、北京油鸡、茶花鸡肌苷酸含量较高的鸡种中出现,推测这两个位点与肌苷酸含量密切相关。另外该基因与体重也可能具有相关性。
关键词
鸡种
腺苷单磷酸脱氨酶1
基因克隆
序列分析
肌
苷
酸
肌肉鲜味
Keywords
chicken breeds
inosinic acid
AMPD
1
gene
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
被引量：
1
2
作者
王德凤
杨永强
韩勇
机构
贵州省畜牧兽医研究所
贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013年第7期127-132,共6页
基金
贵州省科学技术基金项目“AMPD1基因与小香羊肉质风味的关联研究”(黔科合J字[2011]2225号)
贵州省畜禽健康养殖技术创新能力建设项目(黔科合院所创能[2010]4004号)
留学回国人员科研启动项目《贵州小香羊优质肉质风味关键影响因子研究》
文摘
为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。
关键词
腺苷单磷酸脱氨酶1
单核
苷
酸多态性
启动子
小香羊
黔北麻羊
努比山羊
Keywords
AMPD
1
SNP
promoter Small-xiang goat
Qianbei ma goat ~ Nubian goat
分类号
S816.79 [农业科学—饲料科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
6个鸡种腺苷单磷酸脱氨酶1基因克隆及序列分析
张学余
季从亮
陈国宏
黄兆明
苏一军
沈晓鹏
《云南农业大学学报》
CAS
CSCD
2004
5
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职称材料
2
山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
王德凤
杨永强
韩勇
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013
1
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