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题名秋茄低温胁迫转录组分析及脱落酸信号途径基因挖掘
被引量：2
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作者
郭晋敏
杨升
刘星
王金旺
王文卿
陈秋夏
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机构
浙江省亚热带作物研究所
温州市资源植物创新利用重点实验室
厦门大学环境与生态学院
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出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2023年第2期39-49,共11页
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基金
浙江省高质量红树林营建与碳汇能力研究(2022SY08)
浙江省“十四五”育种专项林木协作组课题“沿海防护林树种新品种选育”(2021C02070-6)。
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文摘
[目的]深入了解秋茄响应低温胁迫的分子机制以及培育秋茄的抗寒新品种。[方法 ]以耐寒红树植物‘龙港’秋茄1年生容器苗为实验材料,15℃处理12 h为对照组(CK),-5℃处理12 h为低温组(LT),采用Illumina HiSeq测序平台进行转录组测序,挖掘脱落酸信号途径相关基因。[结果 ]转录组测序共鉴定到148个转录因子,分属于25个转录因子家族,其中,ERF、NAC、WRKY、bHLH、MYB、bZIP、HB-other和MYB-related等家族所包含的基因数量较多,分别为17、14、12、12、10、9、6和6;差异组共筛选到1 330个差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs),其中,698(52.48%)个上调表达,632(47.52%)个下调表达;KEGG通路富集分析发现,DEGs显著富集在植物激素信号转导、苯丙素生物合成、半乳糖代谢、光合作用-天线蛋白和α-亚麻酸代谢等通路中;脱落酸信号途径相关基因KoPYL1、KoABF1和KoABF2上调表达,KoPP2C1和KoABF3下调表达,且这些基因表达情况与qRT-PCR验证结果一致。[结论 ]ERF、NAC、WRKY、b HLH、MYB、bZIP、HB-other和MYB-related等家族转录因子对秋茄响应低温胁迫起重要调控作用。植物激素信号转导、苯丙素生物合成、半乳糖代谢、光合作用-天线蛋白和α-亚麻酸代谢等是秋茄响应低温胁迫的重要KEGG通路。脱落酸信号途径中的KoPYL1、 KoPP2C1、KoABF1、KoABF2和KoABF3基因可作为后期研究秋茄响应低温胁迫的重要候选基因。
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关键词
秋茄
低温胁迫
转录组
转录因子
脱落酸信号途径
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Keywords
Kandelia obovata
cold stress
transcriptome
transcription factor
abscisic acid signaling pathway
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分类号
S718.5
[农业科学—林学]
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题名橡胶树蛋白激酶基因SnRK2.7的克隆及表达
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作者
刘云飞
李言
田维敏
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机构
海南大学热带作物学院
中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/海南省热带作物栽培生理学重点实验室
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出处
《热带生物学报》
2024年第1期1-9,共9页
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基金
广东省重点领域研发计划项目(2020b020217002)
海南省科技专项(ZDKJ2021012)
国家天然橡胶产业技术体系项目(CARS-33-YZ1)。
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文摘
为了探索蔗糖非发酵相关蛋白激酶2(Sucrose non-fermentating1-related protein kinase 2,SnRK2)在巴西橡胶树响应低温胁迫应答中的作用,采用RT-PCR技术,从橡胶树抗寒无性系93-114的叶片中克隆了SnRK2亚家族的一个成员,命名为HbSnRK2.7。该基因包含一个1095 bp的开放阅读框,编码364个氨基酸。HbSnRK2.7的分子量为41.39 kD,等电点为4.70,具有保守丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域,预测其能催化磷酸基从ATP转移到蛋白质底物上的丝氨酸/苏氨酸残基上,也是磷酸化位点的集中区域,还具有非生物胁迫所需的结构域和ABA(脱落酸)依赖的HbSnRK2.7激活所需结构域。q-PCR结果显示,HbSnRK2.7基因响应ABA诱导,呈下调表达模式。在ABA处理8 h时,表达量下调到最低点。在低温胁迫下,HbSnRK2.7的表达量极显著降低。低温胁迫4 h和8 h时,HbSnRK2.7持续下调表达,低温胁迫24 h时,HbSnRK2.7表达量下调到最低,大约为非胁迫表达量的1/2。而且,HbSnRK2.7在不抗寒种质中的表达量显著高于抗寒种质。这些结果表明,HbSnRK2.7可能作为负调控因子介导橡胶树依赖ABA的低温胁迫抗性形成。
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关键词
巴西橡胶树
蔗糖非发酵相关蛋白激酶
荧光定量PCR
低温胁迫抗性
脱落酸信号途径
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Keywords
Hevea brasiliensis Muell.Arg
SnRK2
q-PCR
cold resistance
ABA signaling pathway
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分类号
S794.1
[农业科学—林木遗传育种]
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