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四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)的序列分析
被引量：
9
1
作者
侯万儒
陈瑜
+3 位作者
吴夏
彭正松
周才权
杨军
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期91-96,共6页
以四川境内的四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)序列信息设计引物.运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列.采用GenScan、Blast2·1、ORF finder...
以四川境内的四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)序列信息设计引物.运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列.采用GenScan、Blast2·1、ORF finder和Clustal W等软件分别对DNA序列进行预测、相似性比较、ORF查找以及多序列比对,并利用PredictProtein软件对蛋白质进行预测和结构分析.结果表明;PCR扩增所得DNA序列长度为957bp,包含了ND1基因,其ORF为957bp,编码317个氨基酸,编码蛋白的分子量为35·6×103Da,pI为7·83.四川黑熊的ND1基因序列及其所编码的氨基酸序列与其它熊、浣熊和小熊猫等动物的ND1基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性.
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关键词
四川黑熊
线粒体
脱氢酶亚基1基因
分析
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职称材料
线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用
2
作者
吕凤军
王冰洁
+11 位作者
丁伟强
赵莉
班万里
段兰利
穆尼拉·特列吾汗
吴小霞
徐晶
陈云英
郭涛
王方
乌云花
张壮志
《草食家畜》
2020年第4期43-51,共9页
(目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫...
(目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫线粒体NADH1基因和微卫星标记进行检测。(结果)PCR扩增分别得到大小约为510 bp的NADH1核苷酸片段和200~300 bp不等的微卫星标记片段,产物的长度与引物设计的预期产物长度一致;序列比对发现不同地区、不同宿主来源的样品序列存在碱基的颠/转换和碱基缺失现象;测序发现8份牛、羊肝/肺包囊样本均为细粒棘球蚴G1基因型感染,4份野生鼠肝包囊均为多房棘球蚴感染,2份狐狸肠道寄生棘球绦虫样本为多房棘球绦虫感染。(结论)线粒体NADH1基因和微卫星标记均适用于棘球绦虫种间和种内的鉴别、分类及系统进化分析研究。
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关键词
棘球绦虫
NADH
脱氢酶亚基1基因
微卫星
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职称材料
题名
四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)的序列分析
被引量：
9
1
作者
侯万儒
陈瑜
吴夏
彭正松
周才权
杨军
机构
西华师范大学生命科学学院
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期91-96,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30570275)
四川省应用技术项目(2006J13-057)
+2 种基金
四川省教育厅重点科研项目(2004A101)
西华师范大学科研启动项目(2003)
四川省重点学科建设项目(SZD0420)
文摘
以四川境内的四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)为研究对象,根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)序列信息设计引物.运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND1基因序列.采用GenScan、Blast2·1、ORF finder和Clustal W等软件分别对DNA序列进行预测、相似性比较、ORF查找以及多序列比对,并利用PredictProtein软件对蛋白质进行预测和结构分析.结果表明;PCR扩增所得DNA序列长度为957bp,包含了ND1基因,其ORF为957bp,编码317个氨基酸,编码蛋白的分子量为35·6×103Da,pI为7·83.四川黑熊的ND1基因序列及其所编码的氨基酸序列与其它熊、浣熊和小熊猫等动物的ND1基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性.
关键词
四川黑熊
线粒体
脱氢酶亚基1基因
分析
Keywords
the Asian black bear Sichuan subspecies （Ursus thibetanus ssp. mupinensis）
mitochondrion
ND
1
gene
analysis
分类号
Q751 [生物学—分子生物学]
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用
2
作者
吕凤军
王冰洁
丁伟强
赵莉
班万里
段兰利
穆尼拉·特列吾汗
吴小霞
徐晶
陈云英
郭涛
王方
乌云花
张壮志
机构
新疆农业大学动物医学学院
新疆乌鲁木齐市米东区农业农村局
新疆畜牧科学院兽医研究所(新疆畜牧科学院动物临床医学研究中心)
新疆畜牧科学院
新疆博尔塔拉蒙古自治州博乐市畜牧兽医站
出处
《草食家畜》
2020年第4期43-51,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0501300)
国家自然科学基金项目(31560692)
新疆维吾尔自治区公益性科研院所基本科研业务经费项目(KY2017022)。
文摘
(目的)利用线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(NADH1)和微卫星标记进行棘球绦虫感染的基因型和遗传多样性分析。(方法)对不同地区牛、羊肝/肺包囊(8份)、野生鼠肝包囊(4份)和狐狸肠道寄生棘球绦虫成虫(2份)共14个样本提取DNA后,分别用棘球绦虫线粒体NADH1基因和微卫星标记进行检测。(结果)PCR扩增分别得到大小约为510 bp的NADH1核苷酸片段和200~300 bp不等的微卫星标记片段,产物的长度与引物设计的预期产物长度一致;序列比对发现不同地区、不同宿主来源的样品序列存在碱基的颠/转换和碱基缺失现象;测序发现8份牛、羊肝/肺包囊样本均为细粒棘球蚴G1基因型感染,4份野生鼠肝包囊均为多房棘球蚴感染,2份狐狸肠道寄生棘球绦虫样本为多房棘球绦虫感染。(结论)线粒体NADH1基因和微卫星标记均适用于棘球绦虫种间和种内的鉴别、分类及系统进化分析研究。
关键词
棘球绦虫
NADH
脱氢酶亚基1基因
微卫星
Keywords
echinococcus
NADH
1
gene
microsatellite
分类号
S855.99 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四川黑熊(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体NADH脱氢酶亚基1基因(ND1)的序列分析
侯万儒
陈瑜
吴夏
彭正松
周才权
杨军
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007
9
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职称材料
2
线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用
吕凤军
王冰洁
丁伟强
赵莉
班万里
段兰利
穆尼拉·特列吾汗
吴小霞
徐晶
陈云英
郭涛
王方
乌云花
张壮志
《草食家畜》
2020
0
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职称材料
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