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基于网络药理学及分子对接分析醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的分子机制
1
作者
李文坚
余盼
王小寅
《山东医药》
CAS
2024年第22期60-63,共4页
目的探讨醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的作用机制。方法通过TCMSP数据库,查找醒神开窍合剂所有药物的有效成分,再通过生物信息数据库Genecards(筛选要求基因得分>10)、OMIM数据库、TTD数据库、PharmGkb数据库、Drug Bank数据库筛选...
目的探讨醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的作用机制。方法通过TCMSP数据库,查找醒神开窍合剂所有药物的有效成分,再通过生物信息数据库Genecards(筛选要求基因得分>10)、OMIM数据库、TTD数据库、PharmGkb数据库、Drug Bank数据库筛选并利用R软件剔除重复数据,得出脑干出血昏迷相关基因,最后获取疾病与药物的共同靶点。运用STRING数据库和Cytoscape软件,构建药物分子-靶点的网络调控图及蛋白互作网络,使用R软件及相关数据库确定醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的核心靶点。对共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的分析。运用分子对接技术进行靶点有效性的基础验证。结果醒神开窍合剂的药物分子共73个,筛选查重后最终获得44个化学成分,疾病基因靶点6779个。确定药物疾病共同靶点基因163个,PPI网络分析确定RELA、AKT1、IL6、HSP90AA1、ESR1、TP53、TNF、BCL2、MAPK1等是醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷核心靶点。GO生物功能富集得到2333个生物过程(BP)、107个细胞组成(CC)、202个分子功能(MF);KEGG通路富集到178个条目,醒神开窍合剂主要通过相关炎症信号调控通路、病毒感染通路、癌症通路及控制细胞凋亡、脂质与动脉硬化等相关分子、蛋白通路来调控脑干出血的发展与平衡。分子对接研究结果提示醒神开窍合剂的核心化合物与脑干出血关键靶点的结合能(Bind energy)均为负值,提示化合物与受体有一定结合活性。结论醒神开窍合剂配伍科学,其基因分子机制主要是通过RELA、AKT1、IL6、HSP90AA1、ESR1、TP53、TNF、BCL2、MAPK1等核心靶点治疗脑干出血昏迷。
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关键词
脑干出血昏迷
醒神开窍合剂
网络药理学
分子对接
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题名
基于网络药理学及分子对接分析醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的分子机制
1
作者
李文坚
余盼
王小寅
机构
东莞市中西医结合医院建卫康复科
广东省第二中医院针灸康复科
出处
《山东医药》
CAS
2024年第22期60-63,共4页
基金
东莞市社会发展科技项目(20231800902852)。
文摘
目的探讨醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的作用机制。方法通过TCMSP数据库,查找醒神开窍合剂所有药物的有效成分,再通过生物信息数据库Genecards(筛选要求基因得分>10)、OMIM数据库、TTD数据库、PharmGkb数据库、Drug Bank数据库筛选并利用R软件剔除重复数据,得出脑干出血昏迷相关基因,最后获取疾病与药物的共同靶点。运用STRING数据库和Cytoscape软件,构建药物分子-靶点的网络调控图及蛋白互作网络,使用R软件及相关数据库确定醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的核心靶点。对共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)的分析。运用分子对接技术进行靶点有效性的基础验证。结果醒神开窍合剂的药物分子共73个,筛选查重后最终获得44个化学成分,疾病基因靶点6779个。确定药物疾病共同靶点基因163个,PPI网络分析确定RELA、AKT1、IL6、HSP90AA1、ESR1、TP53、TNF、BCL2、MAPK1等是醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷核心靶点。GO生物功能富集得到2333个生物过程(BP)、107个细胞组成(CC)、202个分子功能(MF);KEGG通路富集到178个条目,醒神开窍合剂主要通过相关炎症信号调控通路、病毒感染通路、癌症通路及控制细胞凋亡、脂质与动脉硬化等相关分子、蛋白通路来调控脑干出血的发展与平衡。分子对接研究结果提示醒神开窍合剂的核心化合物与脑干出血关键靶点的结合能(Bind energy)均为负值,提示化合物与受体有一定结合活性。结论醒神开窍合剂配伍科学,其基因分子机制主要是通过RELA、AKT1、IL6、HSP90AA1、ESR1、TP53、TNF、BCL2、MAPK1等核心靶点治疗脑干出血昏迷。
关键词
脑干出血昏迷
醒神开窍合剂
网络药理学
分子对接
分类号
R743 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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出处
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1
基于网络药理学及分子对接分析醒神开窍合剂治疗脑干出血昏迷的分子机制
李文坚
余盼
王小寅
《山东医药》
CAS
2024
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