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猕猴桃6个LOX基因家族成员实时定量PCR引物特异性的检测与应用
被引量:
5
1
作者
张波
徐昌杰
陈昆松
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期262-267,共6页
从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电...
从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电泳、交叉PCR扩增和PCR产物测序等分析手段,有效消除其它成员的交叉扩增干扰,为利用QPCR检测基因家族成员表达提供了特异、准确与可行的途径.
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关键词
猕猴桃
脂氧合酶基因家族
成员
引物
特异性
实时定量PCR
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职称材料
高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析
被引量:
5
2
作者
刘梦
魏玉磊
+3 位作者
丁冬
赵训超
罗伟毅
徐晶宇
《河南农业科学》
北大核心
2020年第11期37-44,共8页
利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础。结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置...
利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础。结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置命名为SbLOX1—SbLOX11,该家族基因可分为2个亚族(9-LOX、13-LOX)且同一亚族基因结构基本相似。表达分析发现,不同基因家族成员在不同组织部位的表达模式各不相同,SbLOX10和SbLOX9基因在各个组织部位中表达量均较低,SbLOX2—SbLOX5、SbLOX8在各个组织部位中表达量均较高。对低温(4℃)处理下高粱LOX基因转录组数据进行分析发现,耐冷型高粱9-LOX亚族中的SbLOX1、SbLOX3、SbLOX5和13-LOX亚族中的SbLOX4、SbLOX9在大多时间点均呈上调表达,且在冷敏感材料中表达量也较高,推测LOX基因在低温胁迫响应中具有重要作用。
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关键词
高粱
脂氧合酶基因家族
基因
结构
进化关系
表达模式
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职称材料
题名
猕猴桃6个LOX基因家族成员实时定量PCR引物特异性的检测与应用
被引量:
5
1
作者
张波
徐昌杰
陈昆松
机构
浙江大学果实分子生理与生物技术实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期262-267,共6页
基金
国家自然科学基金(No.30571284)
高等学校博士学科点专项科研基金(No.20040335022)
高等学校学科创新引智计划(No.B06014)资助~~
文摘
从基因家族成员的视角开展基因表达研究是阐明基因功能的重要组成内容,实时定量PCR(QPCR)技术是分析基因表达的有效手段.以猕猴桃脂氧合酶(LOX)基因家族6个成员为对象,分析了引物特异性的检测方法.该方法整合了熔点曲线分析、琼脂糖电泳、交叉PCR扩增和PCR产物测序等分析手段,有效消除其它成员的交叉扩增干扰,为利用QPCR检测基因家族成员表达提供了特异、准确与可行的途径.
关键词
猕猴桃
脂氧合酶基因家族
成员
引物
特异性
实时定量PCR
Keywords
kiwifruit lipoxygenase (LOX) gene family members
primer
specificity
real-time quantitativePCR
分类号
S663.4 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析
被引量:
5
2
作者
刘梦
魏玉磊
丁冬
赵训超
罗伟毅
徐晶宇
机构
黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室/黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心
出处
《河南农业科学》
北大核心
2020年第11期37-44,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0101002)
黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目(YJSCX2018-Y104)。
文摘
利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础。结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置命名为SbLOX1—SbLOX11,该家族基因可分为2个亚族(9-LOX、13-LOX)且同一亚族基因结构基本相似。表达分析发现,不同基因家族成员在不同组织部位的表达模式各不相同,SbLOX10和SbLOX9基因在各个组织部位中表达量均较低,SbLOX2—SbLOX5、SbLOX8在各个组织部位中表达量均较高。对低温(4℃)处理下高粱LOX基因转录组数据进行分析发现,耐冷型高粱9-LOX亚族中的SbLOX1、SbLOX3、SbLOX5和13-LOX亚族中的SbLOX4、SbLOX9在大多时间点均呈上调表达,且在冷敏感材料中表达量也较高,推测LOX基因在低温胁迫响应中具有重要作用。
关键词
高粱
脂氧合酶基因家族
基因
结构
进化关系
表达模式
Keywords
Sorghum bicolor
Lipoxygenase(LOX)gene family
Gene structure
Evolutionary relationship
Expression pattern
分类号
S514 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猕猴桃6个LOX基因家族成员实时定量PCR引物特异性的检测与应用
张波
徐昌杰
陈昆松
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析
刘梦
魏玉磊
丁冬
赵训超
罗伟毅
徐晶宇
《河南农业科学》
北大核心
2020
5
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
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