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韭葱黄条病毒、洋葱黄矮病毒和胡葱黄条病毒六安分离物CP基因克隆及同源性分析
被引量:
3
1
作者
韦传宝
华俊雅
+2 位作者
杨宇
隗洋洋
史利利
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期231-237,172,共8页
设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序。分别...
设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序。分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系。结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%~84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%~90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%~94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小。进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远。
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关键词
韭葱黄
条
病毒
洋葱黄矮
病毒
胡葱黄条病毒
CP基因
序列分析
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职称材料
感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析
被引量:
2
2
作者
田保华
王永勤
王婵
《中国蔬菜》
北大核心
2012年第08X期36-41,共6页
以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区...
以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区碱基数均为774bp,均编码258个氨基酸;在该编码区内存在2个碱基的差异,编码的蛋白存在1个氨基酸的差异。系统进化树分析表明:SYSV分离物可以区分为两个主要群体,SYSV-CP1和SYSV-CP2位于第Ⅱ组内,它们与来自浙江的SYSV的分离物亲缘关系最近,表现出一定的地理分布相关性。
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关键词
大葱
胡葱黄条病毒
外壳蛋白基因
克隆
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职称材料
胡葱黄条病毒外壳蛋白的原核表达与抗血清的制备
3
作者
罗朝鹏
林林
+2 位作者
陈炯
吴云锋
陈剑平
《浙江农业学报》
CSCD
2007年第3期147-150,共4页
设计特异性引物PCR扩增得到胡葱黄条病毒(SYSV-O)的全长外壳蛋白(CP)基因,构建原核表达载体pET32a-SYSV-O CP,转化大肠杆菌诱导表达。结果表明,SYSV-O CP基因在大肠杆菌中得到了高效表达,分子量约为46 kDa。用纯化表达产物免疫小鼠制备...
设计特异性引物PCR扩增得到胡葱黄条病毒(SYSV-O)的全长外壳蛋白(CP)基因,构建原核表达载体pET32a-SYSV-O CP,转化大肠杆菌诱导表达。结果表明,SYSV-O CP基因在大肠杆菌中得到了高效表达,分子量约为46 kDa。用纯化表达产物免疫小鼠制备抗血清,Western blot检测结果表明,抗血清与SYSV-O的CP发生了强烈的特异性反应。使用该抗血清进行了田间样品的带毒检测。
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关键词
胡葱黄条病毒
原核表达
抗血清
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职称材料
胡葱黄条病毒吉林毛葱分离物全基因组序列测定与分析
被引量:
4
4
作者
马俊丰
张宸
+2 位作者
张春雨
李小宇
王永志
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第6期44-48,共5页
使用RT-PCR方法从吉林省疑似感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的分蘖洋葱(毛葱)叶片中获得了SYSV吉林毛葱分离物SYSV-JL(MN607702)的全基因组序列。SYSV-JL的全长序列为10427 nt,与GenBank已登录的3条SYSV全长或近...
使用RT-PCR方法从吉林省疑似感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的分蘖洋葱(毛葱)叶片中获得了SYSV吉林毛葱分离物SYSV-JL(MN607702)的全基因组序列。SYSV-JL的全长序列为10427 nt,与GenBank已登录的3条SYSV全长或近全长序列在多个基因上保持着较高的序列一致性,但在P1基因上核苷酸和氨基酸序列一致性较低,分别为69.5%~84.2%和60.9%~76.9%,进一步通过变异分析发现,P1基因包含369个变异位点,表现出较为明显的高变异特征。系统发育分析显示,不同SYSV分离物具有较为明显的地区差异,SYSV-JL分离物与多个中国分离物系统发育关系较近。
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关键词
胡葱黄条病毒
分蘖洋葱(毛葱)
全基因组
变异分析
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职称材料
题名
韭葱黄条病毒、洋葱黄矮病毒和胡葱黄条病毒六安分离物CP基因克隆及同源性分析
被引量:
3
1
作者
韦传宝
华俊雅
杨宇
隗洋洋
史利利
机构
皖西学院
安徽省植物生物技术实训中心
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期231-237,172,共8页
基金
安徽省教育厅自然科学基金重点项目(KJ2011A272,KJ2010A328)~~
文摘
设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序。分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系。结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%~84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%~90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%~94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小。进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远。
关键词
韭葱黄
条
病毒
洋葱黄矮
病毒
胡葱黄条病毒
CP基因
序列分析
Keywords
Leek yellow stripe virus
Onion yellow dwarf virus
Shallot yellow stripe virus
CP gene
sequence analysis
分类号
S436.421 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析
被引量:
2
2
作者
田保华
王永勤
王婵
机构
北京市农林科学院蔬菜研究中心
山西大学生命科学学院
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2012年第08X期36-41,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31071794)
农业部"948"计划项目(2011-Z61)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX201101010)
文摘
以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区碱基数均为774bp,均编码258个氨基酸;在该编码区内存在2个碱基的差异,编码的蛋白存在1个氨基酸的差异。系统进化树分析表明:SYSV分离物可以区分为两个主要群体,SYSV-CP1和SYSV-CP2位于第Ⅱ组内,它们与来自浙江的SYSV的分离物亲缘关系最近,表现出一定的地理分布相关性。
关键词
大葱
胡葱黄条病毒
外壳蛋白基因
克隆
Keywords
Welsh onion
Shallot yellow stripe virus(SYSV)
Coat protein gene
Cloning
分类号
S436.33 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
胡葱黄条病毒外壳蛋白的原核表达与抗血清的制备
3
作者
罗朝鹏
林林
陈炯
吴云锋
陈剑平
机构
西北农林科技大学植保学院
浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所
出处
《浙江农业学报》
CSCD
2007年第3期147-150,共4页
基金
973前期专项(2006CB708209)
国家自然科学基金项目(30200008)
浙江省重大招标项目(2003C12023)
文摘
设计特异性引物PCR扩增得到胡葱黄条病毒(SYSV-O)的全长外壳蛋白(CP)基因,构建原核表达载体pET32a-SYSV-O CP,转化大肠杆菌诱导表达。结果表明,SYSV-O CP基因在大肠杆菌中得到了高效表达,分子量约为46 kDa。用纯化表达产物免疫小鼠制备抗血清,Western blot检测结果表明,抗血清与SYSV-O的CP发生了强烈的特异性反应。使用该抗血清进行了田间样品的带毒检测。
关键词
胡葱黄条病毒
原核表达
抗血清
Keywords
shallot yellow stripe vires
prokaryotic expression
antiserum preparation
分类号
Q344.13 [生物学—遗传学]
在线阅读
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职称材料
题名
胡葱黄条病毒吉林毛葱分离物全基因组序列测定与分析
被引量:
4
4
作者
马俊丰
张宸
张春雨
李小宇
王永志
机构
吉林省农业科学院植物保护研究所
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第6期44-48,共5页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0201604),农业部东北作物有害生物综合治理重点实验室开放课题(DB2018-08)。
文摘
使用RT-PCR方法从吉林省疑似感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的分蘖洋葱(毛葱)叶片中获得了SYSV吉林毛葱分离物SYSV-JL(MN607702)的全基因组序列。SYSV-JL的全长序列为10427 nt,与GenBank已登录的3条SYSV全长或近全长序列在多个基因上保持着较高的序列一致性,但在P1基因上核苷酸和氨基酸序列一致性较低,分别为69.5%~84.2%和60.9%~76.9%,进一步通过变异分析发现,P1基因包含369个变异位点,表现出较为明显的高变异特征。系统发育分析显示,不同SYSV分离物具有较为明显的地区差异,SYSV-JL分离物与多个中国分离物系统发育关系较近。
关键词
胡葱黄条病毒
分蘖洋葱(毛葱)
全基因组
变异分析
Keywords
Shallot yellow stripe virus(SYSV)
Tillering onion
Complete genome:Variation analysis
分类号
S436.33 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
韭葱黄条病毒、洋葱黄矮病毒和胡葱黄条病毒六安分离物CP基因克隆及同源性分析
韦传宝
华俊雅
杨宇
隗洋洋
史利利
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
在线阅读
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职称材料
2
感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析
田保华
王永勤
王婵
《中国蔬菜》
北大核心
2012
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
胡葱黄条病毒外壳蛋白的原核表达与抗血清的制备
罗朝鹏
林林
陈炯
吴云锋
陈剑平
《浙江农业学报》
CSCD
2007
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
胡葱黄条病毒吉林毛葱分离物全基因组序列测定与分析
马俊丰
张宸
张春雨
李小宇
王永志
《中国蔬菜》
北大核心
2020
4
在线阅读
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职称材料
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