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基于TCGA数据库数据NME基因家族生物学功能、在肝癌诊断和预后预测中的应用分析 被引量:2
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作者 姚清媚 宋伟 +2 位作者 王鹏飞 刘玲珑 周素芳 《山东医药》 CAS 2020年第27期24-28,共5页
目的基于TCGA数据库数据分析肿瘤转移相关(NME)基因家族(NME 1、2、3、4、5、6、7)生物学功能、相关信号通路,并探讨NME基因家族成员对肝癌的诊断、预测预后效能及其与肝癌患者预后的关系。方法从TCGA数据库获取NME基因家族在肝癌组织... 目的基于TCGA数据库数据分析肿瘤转移相关(NME)基因家族(NME 1、2、3、4、5、6、7)生物学功能、相关信号通路,并探讨NME基因家族成员对肝癌的诊断、预测预后效能及其与肝癌患者预后的关系。方法从TCGA数据库获取NME基因家族在肝癌组织和癌旁组织中的表达水平和肝癌患者临床病理资料。对NME基因进行基因本体论(GO)及KEGG代谢通路分析。比较肝癌组织与癌旁组织中NME基因的表达。应用ROC评价NME基因对肝癌的诊断效能。采用单因素生存分析、Log-rank检验和多因素COX生存分析法分析NME基因家族与肝癌患者预后的关系。结果NME基因主要参与调节核苷二磷酸激酶活性、细胞凋亡、发育等生物学过程,主要涉及新陈代谢、抗生素合成、嘌呤和嘧啶代谢途径等相关通路。肝癌组织中NME1、NME2、NME3、NME6、NME7水平均高于癌旁组织(t分别为8.927、7.044、5.267、8.370、4.349,P均<0.0001),肝癌组织中NME5水平低于癌旁组织(t=4.306,P<0.0001),肝癌组织及癌旁组织中NME4水平比较,t=1.403,P=0.1613。除NME4外,其他NME基因家族对肝癌的诊断效能良好,曲线下面积(AUC)分别为0.8872、0.8262、0.7459、0.7457、0.8715、0.7255。吸烟等危险因素、TMN分期、肿瘤浸润情况和是否治疗新发肿瘤影响肝癌患者的生存时间,P均<0.01;NME6和NME7与肝癌患者的预后相关,P均<0.05;NME5、NME6、NME7低表达组肝癌患者的总生存时间高于高表达组(P均<0.05)。结论NME基因家族主要参与调节核苷二磷酸激酶活性、细胞凋亡和细胞发育等生物过程,影响细胞新陈代谢和嘌呤、嘧啶代谢等相关通路。除NME4外,其他NME基因家族对肝癌的诊断效能良好。NME5、NME6、NME7基因水平与肝癌患者的预后相关,可预测预后。 展开更多
关键词 肿瘤转移相关基因家族 肿瘤转移相关基因家族生物学功能 肿瘤转移相关基因家族信号通路 肝癌
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肺腺癌转移相关转录本1在眼部疾病中的研究进展 被引量:1
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作者 袁园 谭薇 《国际眼科杂志》 CAS 北大核心 2022年第2期220-224,共5页
肺腺癌转移相关转录本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)是最早鉴定出的与人类疾病相关的长链非编码RNA(LncRNA)之一,与LncRNA家族中的大多数成员不同,MALAT1在几乎所有人体组织中都以相对较高的水平... 肺腺癌转移相关转录本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)是最早鉴定出的与人类疾病相关的长链非编码RNA(LncRNA)之一,与LncRNA家族中的大多数成员不同,MALAT1在几乎所有人体组织中都以相对较高的水平表达。目前已知MALAT1在肿瘤、心血管疾病、神经系统疾病等多种疾病的病理生理过程中起着至关重要的作用,近年来有研究发现MALAT1可能在许多眼部疾病(如糖尿病视网膜病变、白内障、青光眼、视网膜母细胞瘤、新生儿视网膜病变等)的病理发展过程中扮演着重要角色,有望成为诊断和治疗眼部疾病的有效靶点。现就以近年来MALAT1参与的眼部疾病的研究进展做一综述。 展开更多
关键词 肺腺癌转移相关转录本1 眼部疾病 生物学功能 基因 基因调控
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非小细胞肺癌患者血浆 RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO 基因甲基化状态观察 被引量:7
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作者 曹丽 孙阳阳 +3 位作者 曹若琼 张毅 王建飞 钟理 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第43期84-87,共4页
目的观察非小细胞肺癌(NSCLC)患者血浆抑癌基因runt相关转录因子3(RUNX3)、ras相关结构域家族基因1A(RASSF1A)、3-0-硫基转移酶-2(3-OST-2)、死亡相关蛋白激酶(DAPK)、膜结合受体型蛋白酪氨酸磷酸酶O(PTPRO)等基因启动子区域的甲基化状... 目的观察非小细胞肺癌(NSCLC)患者血浆抑癌基因runt相关转录因子3(RUNX3)、ras相关结构域家族基因1A(RASSF1A)、3-0-硫基转移酶-2(3-OST-2)、死亡相关蛋白激酶(DAPK)、膜结合受体型蛋白酪氨酸磷酸酶O(PTPRO)等基因启动子区域的甲基化状态。方法采用甲基化特异PCR技术对63例NSCLC患者血浆中RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因是否甲基化进行观察,并以25例健康人作对照。结果 NSCLC患者血浆中甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因检出率分别为46.0%、50.8%、26.9%、34.9%、41.3%;健康人血浆中甲基化PTPRO基因检出率为12.0%,而甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK均未检出;两者甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因检出率相比,P均<0.05。NSCLC患者血浆中上述5种甲基化基因联合检测的敏感度为88.9%、特异度为88.0%。血浆甲基化RUNX3基因检出率与NSCLC的病理类型、临床分期以及分化程度有关(P均<0.05);甲基化RASSF1A基因检出率与NSCLC的分化程度有关(P<0.05)。结论 NSCLC患者血浆中甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因检出率明显高于健康人。联合检测血浆中甲基化RUNX3、RASSF1A、3-OST-2、DAPK、PTPRO基因有可能会有助于NSCLC的早期诊断及其生物学行为的判断。 展开更多
关键词 抑癌基因 runt相关转录因子3基因 ras相关结构域家族基因1A 3-0-硫基转移酶-2基因 死亡相关 蛋白激酶基因 膜结合受体型蛋白酪氨酸磷酸酶O基因 甲基化基因 基因启动子区域 肿瘤 非小细胞肺癌
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胃癌RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化与DNMT1表达的意义 被引量:2
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作者 杜芳 常志伟 +2 位作者 孙哲 高珊珊 蒋宗彩 《山东医药》 CAS 北大核心 2009年第1期26-28,共3页
目的探讨RAS相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子CpG岛甲基化和DNA甲基转移酶1(DN-MT1)的表达与胃癌发生的关系。方法运用甲基化特异性聚合酶链反应和免疫组织化学方法检测胃癌癌旁正常组织和癌组织RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化发生率及... 目的探讨RAS相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子CpG岛甲基化和DNA甲基转移酶1(DN-MT1)的表达与胃癌发生的关系。方法运用甲基化特异性聚合酶链反应和免疫组织化学方法检测胃癌癌旁正常组织和癌组织RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化发生率及DNMT1的表达情况。结果癌旁正常组织中RASSF1A基因启动子CpG岛甲基化发生率、DNMT1阳性表达率显著低于相应癌组织(P均<0.01)。RASSF1A启动子CpG岛甲基化患者DNMT1阳性表达率与非甲基化患者比较无统计学差异(P>0.05)。结论RASSF1A基因启动子区CpG岛甲基化和DNMT1的高表达可能与胃癌发生有一定关系。 展开更多
关键词 肿瘤 基因 RAS相关区域家族1A DNA甲基转移酶1 甲基化
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肿瘤多药耐药逆转的研究现状
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作者 蒋东霞 胡杰英 宋永平(审校) 《河南医学研究》 CAS 2006年第4期376-378,共3页
关键词 多药耐药逆转 肿瘤细胞 肺耐药相关蛋白 谷胱甘肽转移 BCL-2基因家族 Fas/Fasl 细胞耐药性 获得性耐药
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上皮钙粘附蛋白研究进展
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作者 马力群 窦科峰 《中国现代普通外科进展》 CAS 2000年第2期13-14,共2页
上皮钙粘附蛋白(E-cadhdrin,E-Cad)是一种钙依赖性,存在于正常上皮细胞中以维持正常上皮细胞的极性和分化,维持组织正常形态,具有特殊生物学特性,与癌细胞侵袭转移密切相关的上皮细胞粘附分子^([1-2])。有关E-Cad的研究进展迅... 上皮钙粘附蛋白(E-cadhdrin,E-Cad)是一种钙依赖性,存在于正常上皮细胞中以维持正常上皮细胞的极性和分化,维持组织正常形态,具有特殊生物学特性,与癌细胞侵袭转移密切相关的上皮细胞粘附分子^([1-2])。有关E-Cad的研究进展迅速,本文将E-Cad结构、生物学功能、在肿瘤中的作用综述如下。 展开更多
关键词 上皮钙粘附蛋白 肿瘤转移 基因定位 分子结构 生物学功能
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