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双向电泳和肽质量指纹谱技术鉴定支气管上皮细胞恶性转化相关蛋白质ANX1-human 被引量:21
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作者 谢玲 应万涛 +4 位作者 张开泰 项小琼 钱小红 王玉芝 吴德昌 《中国生物化学与分子生物学报》 CSCD 2000年第5期569-573,共5页
采用 2 - D PAGE及质谱技术对α粒子照射诱发人支气管上皮恶性转化细胞的不同阶段进行了比较蛋白组分析与鉴定 .2 - D电泳后在分子量 1 4.4~ 94k D,等电点 3~ 1 0范围内分离出约 1 1 0 0个不同蛋白质斑点 .对等电点约 7,分子量约 40 ... 采用 2 - D PAGE及质谱技术对α粒子照射诱发人支气管上皮恶性转化细胞的不同阶段进行了比较蛋白组分析与鉴定 .2 - D电泳后在分子量 1 4.4~ 94k D,等电点 3~ 1 0范围内分离出约 1 1 0 0个不同蛋白质斑点 .对等电点约 7,分子量约 40 k D的蛋白质点进行了质谱分析 .鉴定出分子量为38.58k D、等电点 6.64的蛋白质 ANX1 - human(脂皮质蛋白 ,lipocortin ) ,并且发现该蛋白质在BEP2 D细胞恶性转化过程的不同时期存在差异表达 .提示蛋白质 ANX1 - human参与了支气管上皮细胞恶性转化过程 ,与细胞恶性转化相关 . 展开更多
关键词 双向电泳 肽质量指纹谱 BEP2D细胞 蛋白质 肺癌
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结膜松弛症泪液蛋白质肽质量指纹谱分析 被引量:2
2
作者 项敏泓 张兴儒 +4 位作者 李青松 张梦晖 鲁静 张群业 张延 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2010年第1期43-46,共4页
目的分析结膜松弛症泪液蛋白表达谱的变化。方法收集22例结膜松弛症患者和13例正常对照组的泪液样本,毛细管从每眼收集15μL泪液,采用ZipTip C18柱浓缩和纯化泪液样本,利用基质辅助的激光解吸质谱进行线性模式和肽质量指纹谱(PMF)检测,... 目的分析结膜松弛症泪液蛋白表达谱的变化。方法收集22例结膜松弛症患者和13例正常对照组的泪液样本,毛细管从每眼收集15μL泪液,采用ZipTip C18柱浓缩和纯化泪液样本,利用基质辅助的激光解吸质谱进行线性模式和肽质量指纹谱(PMF)检测,并对PMF图谱数据进行多变量数据统计分析,比较结膜松弛症组和正常对照组的泪液PMF的差异。结果2组泪液的质谱检测峰在数量上差异无统计学意义(P>0.05),主成分分析结合偏最小二乘法分析显示结膜松弛症组泪液蛋白质表达与正常对照组比较有差异,结膜松弛症组泪液蛋白质表现为"离群"样本,且离群分散度较大的样本为结膜松弛症Ⅳ级的患者。结论应用ZipTipC18柱分离联合基质辅助的激光解吸质谱技术可有效筛查泪液蛋白质。对PMF图谱进行多变量数据统计分析,可以观察到结膜松弛症组与正常对照组泪液蛋白质存在差异,并可为结膜松弛症临床诊断、疾病发生发展的机理及治疗提供参考。 展开更多
关键词 泪液蛋白质 结膜松弛症 基质辅助的激光解吸质 肽质量指纹谱 主成分分析
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肽质量指纹谱技术的建立及其在人肺癌细胞蛋白质组研究中的初步应用 被引量:2
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作者 钱小红 王京兰 +3 位作者 蔡耘 罗凌 万晶红 贺福初 《质谱学报》 EI CAS CSCD 1999年第3期75-76,共2页
Proteome means the whole proteins expressed by genome in a cell or tissue.Two- dimensional electrophoresis (2-DE), computer image analysis and mass spectrometry were known as the three key techniques in proteome resea... Proteome means the whole proteins expressed by genome in a cell or tissue.Two- dimensional electrophoresis (2-DE), computer image analysis and mass spectrometry were known as the three key techniques in proteome research. Peptide mass fingerprinting (PMF) is becoming a widely used and rapidly developed technique for protein identification after 2- DE. In this study, a systematic method to identify the proteins after 2-DE by PMF was developed. Proteins were digested in-gel by trypsin and the masses of peptides were measured by matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI- TOFMS). the data obtained from PMF were used for protein database searching and protein identification. the proteins from human lung cancer cell isolated by 2-DE were identified by The method developed in this research. 展开更多
关键词 肺癌细胞 蛋白质组 肽质量指纹谱 PROTEOMICS
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Hela细胞蛋白质分离和肽质量指纹谱鉴定方法的建立 被引量:5
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作者 胡家 李燕英 +3 位作者 孙丽翠 殷爱红 武文琦 贺俊崎 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2009年第3期331-335,共5页
目的研究Hela细胞总蛋白质的分离及利用肽质量指纹谱对蛋白质进行鉴定的方法。方法提取了Hela细胞的总蛋白质,通过双向电泳技术对蛋白质进行了分离,并应用图像扫描仪及图像分析软件获取蛋白质点的数字化信息。对其中不同丰度的蛋白质点... 目的研究Hela细胞总蛋白质的分离及利用肽质量指纹谱对蛋白质进行鉴定的方法。方法提取了Hela细胞的总蛋白质,通过双向电泳技术对蛋白质进行了分离,并应用图像扫描仪及图像分析软件获取蛋白质点的数字化信息。对其中不同丰度的蛋白质点,进行胶内酶切后,通过基质辅助激光解吸/电离直角型飞行时间质谱(MALDIO-TOF-MS)分析,再将检测出的多肽质量数通过Mascot搜索引擎检索NCBInr数据库。结果获得了Hela细胞总蛋白质双向电泳图谱及蛋白质点的数字化信息,通过MALDIO-TOF-MS检测得到的肽质量指纹谱再经过网上公共数据的检索从而获得3个蛋白质点分别是α-葡萄糖苷酶(α-glucosidase)、γ-肌动蛋白(γ-actin)和过氧化物酶2(peroxiredoxin 2)。结论Hela细胞总蛋白质双向电泳的分离效果较好,肽质量指纹谱法能有效地对Hela细胞的蛋白质斑点进行鉴定。 展开更多
关键词 HELA细胞 蛋白质组 2-DE MALDIO-TOF-MS 质量指纹
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肽质量指纹图谱鉴别诊断IgA肾病和非IgA肾病的可行性分析 被引量:2
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作者 高静 王涌 +3 位作者 温新宇 鲁鸿昊 董振南 田亚平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1309-1313,共5页
目的探索肽质量指纹图谱(PMF)在IgA肾病和非IgA肾病的分类中是否可行。方法采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)分析IgA肾病和非IgA肾病患者的血清肽质量指纹图谱。结果 IgA肾病和非IgA肾病的血清肽质量指纹图谱具... 目的探索肽质量指纹图谱(PMF)在IgA肾病和非IgA肾病的分类中是否可行。方法采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)分析IgA肾病和非IgA肾病患者的血清肽质量指纹图谱。结果 IgA肾病和非IgA肾病的血清肽质量指纹图谱具有9个差异多肽;其中,最显著的两个多肽峰是4476.46和1968.10,ROC曲线下面积分别为86.18%和79.77%;主因素分析(PCA)表明前8个因素(差异峰)的累积解释变异量超过95%,说明该模型的鉴别诊断能力较MA好L。DI比-T对OF蛋质白谱质技数术据在库Ig,A多肾肽病53和3非8.0I8gA为肾粘病蛋的白分4类同中工,型具的有片可段行;性而,此多技肽术20在82系.7统7为疾α病1-的Ⅱ亚型类胶分原类同中工具型有的广片阔段的。前景结。 展开更多
关键词 IGA肾病 非IgA肾病 质量指纹 基质辅助激光解吸电离飞行时间质
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动物源大肠杆菌MALDI-TOF MS质谱库的建立及在北京地区区域性差异应用分析
6
作者 张启龙 钱云开 +9 位作者 刘利勤 傅彩霞 贾宏丽 刘海莹 栗云鹏 杨逸舟 田辉 董志军 朱家强 周德刚 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第2期117-123,共7页
为比较不同区域大肠杆菌是否具有差异性,本研究针对自北京市怀柔区收集分离的11株大肠杆菌和延庆区收集分离的22株大肠杆菌进行了鉴定,分别采用常规生化法、16S rRNA测序和基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的鉴定方... 为比较不同区域大肠杆菌是否具有差异性,本研究针对自北京市怀柔区收集分离的11株大肠杆菌和延庆区收集分离的22株大肠杆菌进行了鉴定,分别采用常规生化法、16S rRNA测序和基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的鉴定方法进行鉴定,比较了3种方法鉴定的准确率,并对获得的细菌肽质量指纹谱数据进行分析。结果显示:两地采集的大肠杆菌用3种方法鉴定,其准确性都在95%以上,其中MALDI-TOF MS鉴定采用多点点靶时准确率可达99%以上,多点点靶下MALDI-TOF MS鉴定重复性强、准确高、时间快;不同区域的大肠杆菌虽具有相似的肽质量指纹谱特征,但聚类分析和主成分分析显示所有数据可清晰地按地区聚成两簇,其中怀柔一簇、延庆一簇,两簇之间区分明显。表明自怀柔和延庆采集的大肠杆菌的肽质量指纹谱具有区域性差异,可为基于MALDI-TOF MS的大肠杆菌溯源性分析提供技术依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 MALDI-TOF MS 肽质量指纹谱 北京
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液泡前体蛋白质的双向电泳分离和质谱分析
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作者 莫蓓莘 姜里文 《华东师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期91-97,共7页
该文通过改进双向电泳方法克服了膜蛋白由于有疏水性而很难进入双向电泳第一相——等电聚焦电泳凝胶,以及由于从蔗糖密度梯度离心中分离得到的液泡前体富含干扰等电聚焦电泳效果的蔗糖等两大难点,成功地分离了通过蔗糖密度梯度离心分离... 该文通过改进双向电泳方法克服了膜蛋白由于有疏水性而很难进入双向电泳第一相——等电聚焦电泳凝胶,以及由于从蔗糖密度梯度离心中分离得到的液泡前体富含干扰等电聚焦电泳效果的蔗糖等两大难点,成功地分离了通过蔗糖密度梯度离心分离得到的液泡前体蛋白,并使膜蛋白进入了双向电泳凝胶.双向电泳后分离到约200余个蛋白质点,用基质辅助激光解吸/电离飞行时间串联质谱(MS/MS)进行肽质量指纹谱分析,并通过数据库检索进行蛋白质鉴定与功能预测,分析的23个蛋白中有13个在数据库中没有找到相对应的吻合蛋白,查询到的10个吻合蛋白中有6个功能未知. 展开更多
关键词 双向电泳 肽质量指纹谱 液泡前体 膜蛋白 烟草
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应用双向电泳和质谱技术筛选口腔扁平苔藓差异蛋白 被引量:13
8
作者 王文梅 蒋文晖 +1 位作者 胡勤刚 郑春兰 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期120-123,共4页
目的:筛选口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的差异表达蛋白,为口腔扁平苔藓的发病机制及诊断治疗的研究提供实验室依据。方法:收集口腔扁平苔藓组织及正常口腔黏膜组织,提取组织蛋白,蛋白定量,进行双向电泳,图象分析寻找差异点,基质辅助激光... 目的:筛选口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的差异表达蛋白,为口腔扁平苔藓的发病机制及诊断治疗的研究提供实验室依据。方法:收集口腔扁平苔藓组织及正常口腔黏膜组织,提取组织蛋白,蛋白定量,进行双向电泳,图象分析寻找差异点,基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析鉴定表达差异量较大的蛋白质点,确定所分析的蛋白质类型和功能。结果:(1)人口腔扁平苔藓及正常黏膜组织的双向电泳图谱的平均蛋白质点数分别为1576±67和1608±73,同一组织凝胶在蛋白质点位置上重复性较好。(2)通过比较人口腔扁平苔藓与正常黏膜组织的双向凝胶电泳图谱,得到差异表达蛋白质点数为13个,其中7个点在口腔扁平苔藓中为高表达,6个点在口腔扁平苔藓中为低表达。选择10个表达差异量较大的蛋白质点进行质谱和生物信息学分析,鉴定了其中的4个点,包括有锰超氧化物歧化酶(Mn-SOD),膜联蛋白I,波形蛋白,未知蛋白等。结论:锰超氧化物歧化酶,膜联蛋白I,波形蛋白,未知蛋白可能参与了口腔扁平苔藓的发生和发展,其相关机制尚待进一步阐明。双向电泳-质谱分析技术为口腔扁平苔藓发生发展过程中差异表达蛋白的研究提供了有效的技术手段。 展开更多
关键词 口腔 扁平苔藓 双向凝胶电泳 蛋白质组 质量指纹 锰超氧化物歧化酶 膜联蛋白I 波形蛋白 未知蛋白
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家蚕精巢蛋白质的双向电泳及质谱分析 被引量:5
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作者 聂红毅 钟晓武 +3 位作者 邹勇 衣启营 赵萍 夏庆友 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期369-378,共10页
精巢是雄性家蚕Bombyxmori的生殖腺,它的主要功能是产生精子,全面检测和鉴定精巢器官的蛋白分布将为分析家蚕雄性个体的发育和繁殖奠定基础。本研究利用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳和蛋白硝酸银染色技术对家蚕5龄第5天幼虫的精巢组织进行了... 精巢是雄性家蚕Bombyxmori的生殖腺,它的主要功能是产生精子,全面检测和鉴定精巢器官的蛋白分布将为分析家蚕雄性个体的发育和繁殖奠定基础。本研究利用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳和蛋白硝酸银染色技术对家蚕5龄第5天幼虫的精巢组织进行了蛋白检测,利用基质辅助激光解析质量飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对表达量较高的蛋白点进行了肽质量指纹图谱鉴定。结果表明:家蚕精巢蛋白质可以检测出1000个以上的蛋白点,这些蛋白点主要集中在分子量为15~90kD区域,等电点3.5~9之间,其中60个蛋白点得到了成功鉴定,按照已知或推测的蛋白功能,将其分为8类,包括:细胞骨架和细胞结构蛋白,膜蛋白或信号相关蛋白,大量应激反应蛋白(伴侣蛋白),线粒体和能量产生相关蛋白,转录调控和翻译及DNA/RNA结合相关蛋白,酶和少量血液组成蛋白。其中很多蛋白可能在鞭毛形成、能量代谢及减数分裂过程中有重要作用。这些结果为进一步认识家蚕精子形成过程提供了重要的生物学信息。 展开更多
关键词 家蚕 精巢 精子形成 蛋白质 双向电泳 质量指纹鉴定 分析 生物信息学分析
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小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳-飞行时间质谱研究 被引量:3
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作者 杨拴盈 张王刚 +7 位作者 张潍 周斌 田应选 南岩东 卜丽娜 阮禹松 孙秀珍 杨德昌 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期533-537,共5页
目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌(SCLC)与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳(2-DE)分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助... 目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌(SCLC)与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳(2-DE)分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱(PMF);通过Mascot软件查询NCBI或SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果每张图谱约检测到800多个蛋白质点。经匹配分析,肺癌组织之间和正常肺组织之间凝胶图像的匹配率分别为75.5%和78.2%;选择14个背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析,结合表观分子量及等电点(pI),初步鉴定了11种(六类)蛋白质:①与蛋白质降解通路有关的蛋白质:蛋白酶体α亚单位3型、蛋白酶体β亚单位2型及β亚单位5型;②自由基/抗氧化剂类:锰-超氧化物歧化酶(Mn-SOD)、过氧化氢酶(CAT)和黄素还原酶(FR);③细胞骨架类:原肌球蛋白-3(Tpm-3);④与能量代谢有关的蛋白质:硫氧还蛋白过氧化物酶(TPX1);⑤分子伴侣:抑制素(PHB),内质网蛋白ER29(Erp29);⑥其他:可溶性NSF黏附蛋白(alpha SNAP)。结论应用2-DE及MALDI-TOF-MS方法分离并初步鉴定了11种(六类)蛋白质;这些蛋白质与SCLC发生发展密切相关,部分可能成为SCLC诊断及治疗的分子靶点。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 蛋白质组学 双相电泳 基质辅助激光解吸电离飞行时间质 质量指纹
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基于质谱和生物信息学分析的小菜蛾蛋白质鉴定 被引量:3
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作者 谢苗 成娟 +2 位作者 尤民生 杨广 蔡敬轩 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1206-1212,共7页
本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutella xylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析。采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析... 本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutella xylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析。采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析,获得该点的肽质量指纹图谱(PMF)及串联质谱(MS/MS)图谱。将获得的PMF分别用MASCOT和ProFound等常用软件在NCBInr的Metazoa蛋白质数据库进行搜索,匹配结果不理想。进一步用PMF+MS/MS谱图搜索NCBInr的Metazoa蛋白质数据库,以及小菜蛾EST数据库。在NCBInr库中匹配结果为拟暗果蝇Drosophila pseudoobscura中的一种假定蛋白GA18218-PA,而用EST库搜索的结果为家蚕Bombyx mori的ATP合酶的亚基。为验证搜索结果,将该蛋白质点进行磺基异硫氰酸苯酯(SPITC)化学衍生后de novo测序,最后确认该点可能为ATP合酶的一个亚基。最后着重讨论了蛋白质的质谱鉴定与生物信息学分析的联合使用,希望据此选择出最适合于非模式昆虫蛋白质组学鉴定的方法。 展开更多
关键词 小菜蛾 蛋白质 质量指纹 串联质 denovo测序 生物信息学
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电泳和质谱技术研究4种胰脏铁蛋白的亚基类型和等电点特性 被引量:1
12
作者 林志超 林青 +1 位作者 朱峰 黄河清 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期96-101,共6页
采用电泳和质谱技术对所制备的鸡、鸭、牛和猪胰脏铁蛋白的亚基类型和等电点特性进行了研究。采用天然聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术研究的结果表明,上述4种铁蛋白呈现不同的迁移率,据此可知鸡胰铁蛋白的相对分子质量(Mr)〉鸭胰... 采用电泳和质谱技术对所制备的鸡、鸭、牛和猪胰脏铁蛋白的亚基类型和等电点特性进行了研究。采用天然聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术研究的结果表明,上述4种铁蛋白呈现不同的迁移率,据此可知鸡胰铁蛋白的相对分子质量(Mr)〉鸭胰铁蛋白的Mr〉黄牛胰铁蛋白的Mr〉猪胰铁蛋白的Mr,而且均大于马脾铁蛋白(HSF)的Mr。采用十二烷基硫酸钠(SDS)-PAGE技术研究的结果表明,上述4种铁蛋白均由H(heavychain)和L(1ightchain)类型的亚基组成,但H和L亚基的相对数量(即H/L亚基数量的比值)有差别。采用肽指纹图谱技术分别鉴定各铁蛋白的H和L亚基。选用变性等电聚焦方法研究发现,上述4种铁蛋白分别由3~6种不同等电点的亚基聚合体组成,说明铁蛋白的H和L亚基之间呈现复杂的相互作用和不同的聚合体。不同陆生动物胰脏铁蛋白亚基之间相互作用的强度和聚合态存在着差异,这一差异特性可能与调控铁蛋白释放铁的速率有关,也与动物对铁的需求和铁解毒速率有关。 展开更多
关键词 电泳 质量指纹 铁蛋白 胰脏 亚基 鉴定
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果梅完全花与不完全花的差异蛋白分析 被引量:18
13
作者 王珊 蔡斌华 +3 位作者 章镇 侯计华 徐军霞 高志红 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2008年第4期465-468,共4页
应用双向电泳技术对果梅完全花与不完全花的蛋白质组分进行了比较分析。经专业分析软件(PDQuest)对电泳图谱分析表明两者的蛋白分布相似,在完全花中发现了1个特异蛋白、1个上调蛋白、21个下调蛋白,在不完全花中发现2个特异蛋白,这些蛋... 应用双向电泳技术对果梅完全花与不完全花的蛋白质组分进行了比较分析。经专业分析软件(PDQuest)对电泳图谱分析表明两者的蛋白分布相似,在完全花中发现了1个特异蛋白、1个上调蛋白、21个下调蛋白,在不完全花中发现2个特异蛋白,这些蛋白差异点可能与雌蕊的败育有关。应用质谱技术对3个特异点及5个差异大的蛋白点进行分析,得到的肽段数据与蛋白质数据库比对发现其中一个蛋白(28.2kD,pI 4.53)与光敏色素B有关。 展开更多
关键词 果梅 完全花 不完全花 差异蛋白 肽质量指纹谱
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与浓缩苹果汁后混浊有关的蛋白质组成分析 被引量:5
14
作者 李娜 李全宏 蔡同一 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第8期106-110,共5页
从新鲜苹果和浓缩苹果汁中分离纯化蛋白质,用肽质量指纹谱对其进行鉴定,测定氨基酸组成和多酚及多糖的含量,结果表明,新鲜苹果蛋白的主要组分为Thaumatin-likeprotein1,是一糖蛋白,其疏水性氨基酸含量高,易引起苹果汁的后混浊。浓缩苹... 从新鲜苹果和浓缩苹果汁中分离纯化蛋白质,用肽质量指纹谱对其进行鉴定,测定氨基酸组成和多酚及多糖的含量,结果表明,新鲜苹果蛋白的主要组分为Thaumatin-likeprotein1,是一糖蛋白,其疏水性氨基酸含量高,易引起苹果汁的后混浊。浓缩苹果汁中蛋白组分比较复杂,在贮存过程中与多酚及多糖发生结合,使分子量增大,其分子量均大于新鲜苹果蛋白。 展开更多
关键词 浓缩苹果汁 蛋白质 肽质量指纹谱 氨基酸分析
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人大肠癌不同转移潜能细胞株SW620及SW480的差异蛋白质组分析 被引量:7
15
作者 曲利娟 丁彦青 梁莉 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2005年第10期1211-1215,1220,共6页
目的分析比较人大肠癌不同转移潜能细胞株的差异表达蛋白质图谱,筛选并探讨肿瘤转移相关蛋白与大肠癌发生发展转移的关系.方法利用双向凝胶电泳(2-DE)和基质辅助激光解析离子化-飞行时间-质谱技术,分析高低转移性细胞株SW620和SW480蛋... 目的分析比较人大肠癌不同转移潜能细胞株的差异表达蛋白质图谱,筛选并探讨肿瘤转移相关蛋白与大肠癌发生发展转移的关系.方法利用双向凝胶电泳(2-DE)和基质辅助激光解析离子化-飞行时间-质谱技术,分析高低转移性细胞株SW620和SW480蛋白质图谱的差异表达,查询数据库筛选大肠癌转移相关蛋白质.结果MalenieⅢ软件分析3次相同条件下的2-DE图谱,结果显示重复性、匹配性较好.SW620检测到(1316±62)个蛋白点,平均匹配率82%;SW480检测到(1332±74)个蛋白点,平均匹配率80%;蛋白点分布以PI 4~7、相对分子质量20 000~70 000范围内最多.两种细胞株25个差异蛋白点(SW620 14个、SW480 11个)胰酶胶内酶解、质谱分析获得23张肽质量指纹谱;数据库查询结果高度匹配已知蛋白质3个,初步匹配已知蛋白质或片段14个.在这些差异表达的蛋白质中,部分与基因转录、细胞周期、信号转导、细胞凋亡有关,可能参与大肠癌的分化、增殖、侵袭、黏附和转移等多种生物学行为.结论人大肠癌不同转移潜能细胞株SW620和SW480的2-DE蛋白质图谱具有明显的差异表达,提示大肠癌转移过程的发生是多种蛋白质功能共同作用的结果. 展开更多
关键词 大肠肿瘤 SW480 SW620 电泳 凝胶 双向 蛋白质组 肽质量指纹谱
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二磷酸果糖对低温保存兔心肌组织蛋白质的影响 被引量:2
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作者 曹西南 杨远和 《医药导报》 CAS 2006年第7期618-620,共3页
目的研究二磷酸果糖(FDP)对低温保存兔心肌组织蛋白质的影响。方法兔心肌组织分别在4℃保存于含5mmol.L-1FDP或无FDP的StThomas液中,提取心肌组织蛋白质经SDS凝胶电泳比较,肽质量指纹谱质谱分析和Westernblot鉴定蛋白质分子。结果肽质... 目的研究二磷酸果糖(FDP)对低温保存兔心肌组织蛋白质的影响。方法兔心肌组织分别在4℃保存于含5mmol.L-1FDP或无FDP的StThomas液中,提取心肌组织蛋白质经SDS凝胶电泳比较,肽质量指纹谱质谱分析和Westernblot鉴定蛋白质分子。结果肽质量指纹谱分析鉴定到β-肌球蛋白重链、莱恩素受体(ryanodinereceptor)、α肌动蛋白、电压依赖的阴离子通道蛋白1(VDAC1)和腺苷酸激酶3等5种蛋白质差异,Westernblot鉴定到β-肌球蛋白重链、蛋白激酶Cε(PKCε)和IgG重链3种蛋白质差异。加入FDP后心肌组织中β-肌球蛋白重链、α肌动蛋白和PKCε得到更好保存。结论FDP可以增加低温保存的兔心肌组织中一些与心功能相关的重要的蛋白质的保存量,以上所述的存在差异的蛋白质,在心脏低温保存条件研究中,具有作为生物标记分子的潜在应用价值。 展开更多
关键词 二磷酸果糖 心脏 低温保存 肽质量指纹谱
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PHA-L4的纯化及结构分析
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作者 张晓元 郭勇 +2 位作者 吴晖 赵起 黄敏 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第12期145-150,共6页
通过阴离子交换层析对植物血球凝集素(PHA)提取物进行组分分离、纯化和活性检测,制得了高丝裂原活性的PHA-L4糖蛋白,并利用SDS-PAGE、质谱、N-端氨基酸序列、肽质量指纹谱等分析方法对其结构进行了鉴定.结果表明,PHA-L4是由4个PHA-L蛋... 通过阴离子交换层析对植物血球凝集素(PHA)提取物进行组分分离、纯化和活性检测,制得了高丝裂原活性的PHA-L4糖蛋白,并利用SDS-PAGE、质谱、N-端氨基酸序列、肽质量指纹谱等分析方法对其结构进行了鉴定.结果表明,PHA-L4是由4个PHA-L蛋白亚基组成的四聚体糖蛋白,相对分子质量为120000,每个亚基N-端第12位天冬酰胺残基被糖基化,糖基化呈现微不均一性. 展开更多
关键词 植物血球凝集素 纯化 鉴定 N-端氨基酸序列 肽质量指纹谱
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低氧胁迫对玉米根尖蛋白表达影响的研究 被引量:5
18
作者 刘新宇 黄玉碧 《西南农业学报》 CSCD 2004年第3期318-323,共6页
玉米根系在缺氧前经2~4h的低氧锻炼预处理后,能显著提高根尖对缺氧的耐受力。本文利用蛋白质组学研究方法,用肽质量指纹谱鉴定蛋白技术,分析并鉴定了玉米幼苗根尖在低氧胁迫状态时的蛋白表达情况,以及相关功能蛋白的表达对玉米根尖适... 玉米根系在缺氧前经2~4h的低氧锻炼预处理后,能显著提高根尖对缺氧的耐受力。本文利用蛋白质组学研究方法,用肽质量指纹谱鉴定蛋白技术,分析并鉴定了玉米幼苗根尖在低氧胁迫状态时的蛋白表达情况,以及相关功能蛋白的表达对玉米根尖适应低氧胁迫所起的作用。获得了玉米幼苗在低氧胁迫锻炼时有关基因表达图谱。 展开更多
关键词 玉米 低氧胁迫 2-DE 肽质量指纹谱 逆境蛋白
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家蚕伴性赤蚁sch胚胎期致死特异蛋白差异的研究 被引量:5
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作者 卢忠燕 侯勇 +2 位作者 赵萍 林英 夏庆友 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期42-46,共5页
利用双向电泳技术分析了家蚕生态致死突变伴性赤蚁sch和正常黑蚁夏芳在常温常湿、高温干燥催青条件下的蚕卵差异表达蛋白质,发现高温敏感伴性致死赤蚁的蚕卵在高温催青处理后,一个分子量50kD左右的蛋白点P34与正常相比有明显差异,高温... 利用双向电泳技术分析了家蚕生态致死突变伴性赤蚁sch和正常黑蚁夏芳在常温常湿、高温干燥催青条件下的蚕卵差异表达蛋白质,发现高温敏感伴性致死赤蚁的蚕卵在高温催青处理后,一个分子量50kD左右的蛋白点P34与正常相比有明显差异,高温干燥处理后该蛋白点浓度较弱,表达量较低;对照黑蚁夏芳的P34蛋白没有明显差异。对P34进行胰蛋白酶消化并测定了其肽质量指纹图谱,通过同源性比较分析发现P34蛋白是一种新的蛋白质。 展开更多
关键词 双向电泳 质量指纹 伴性赤蚁(sch) 差异蛋白
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口腔鳞癌组织与口腔正常黏膜组织蛋白质差异表达的初步研究 被引量:4
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作者 王文梅 郑春兰 +3 位作者 胡勤刚 蒋文晖 黄晓峰 唐巍 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期540-543,共4页
目的:筛选口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质,为研究口腔鳞癌发生机制提供实验依据。方法:收集10例口腔鳞癌组织及正常口腔黏膜组织,进行二维电泳,选择在表达差异量较大的29个点进行质谱和生物信息学分析,确定所分析的蛋白质... 目的:筛选口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质,为研究口腔鳞癌发生机制提供实验依据。方法:收集10例口腔鳞癌组织及正常口腔黏膜组织,进行二维电泳,选择在表达差异量较大的29个点进行质谱和生物信息学分析,确定所分析的蛋白质类型。结果:口腔鳞癌及相应正常口腔黏膜组织凝胶的平均蛋白质点数分别为2325±390和2487±281。双向凝胶电泳图显示,口腔鳞癌及正常口腔黏膜组织的差异表达蛋白质点数为29个,这29个点在癌组织中均为低表达,对其进行了质谱(PMF)和生物信息学分析,鉴定了其中的3个点,它们是:β纤维蛋白(fibrin beta)、磷酸丙糖异构酶(tri-osephosphate isomerase TIM)、unknown蛋白。结论:β纤维蛋白、磷酸丙糖异构酶、unknown蛋白在口腔鳞癌发生发展过程中发生了改变,其机制尚待进一步阐明。 展开更多
关键词 口腔 鳞癌 双向凝胶电泳 蛋白质组 质量指纹
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