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显性效应对内蒙古绒山羊产绒量和绒纤维直径育种值估计准确性的影响
1
作者
习海娇
李金泉
+6 位作者
张燕军
王瑞军
吕琦
梅步俊
王娜
苏蕊
王志英
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第2期571-581,共11页
旨在分析动物遗传评估模型中加入显性效应是否可以有效提高内蒙古绒山羊绒毛性状育种值预测的准确性。本研究基于课题组前期积累的健康状况良好的内蒙古绒山羊(阿尔巴斯型)2256只个体的70K SNP芯片测序数据,收集整理1至8岁个体的绒毛性...
旨在分析动物遗传评估模型中加入显性效应是否可以有效提高内蒙古绒山羊绒毛性状育种值预测的准确性。本研究基于课题组前期积累的健康状况良好的内蒙古绒山羊(阿尔巴斯型)2256只个体的70K SNP芯片测序数据,收集整理1至8岁个体的绒毛性状(绒纤维直径和产绒量)生产性能数据和系谱记录,根据是否考虑显性效应,建立两个动物模型,利用BLUP和GBLUP方法进行遗传参数及育种值的估计,进一步通过交叉验证的方法评价绒毛性状育种值估计的准确性,确定最佳遗传评估模型。最后建立多变量动物模型进行两个性状的遗传相关及育种值准确性估计,对比单性状和多性状模型下估计遗传参数及育种值准确性的差异。研究结果表明:当遗传评估模型中不考虑显性效应时,基于BLUP和GBLUP法估计产绒量的加性遗传力分别为0.156和0.215,育种值估计准确性分别为27.58%和60.33%;绒纤维直径的加性遗传力为0.252和0.292,育种值估计准确性为28.08%和62.33%。在动物模型中同时考虑加性和显性效应时,基于BLUP和GBLUP法估计产绒量的加性遗传力分别为0.150和0.200,显性遗传力为0.147和0.070,育种值估计准确性分别为38.50%和72.62%;绒纤维直径的加性遗传力为0.263和0.290,显性遗传力为0.288和0.026,育种值估计准确性为39.66%和65.97%。最佳模型下,产绒量和绒纤维直径的遗传相关为0.3400,表型相关为0.0385。产绒量和绒纤维直径育种值估计准确性比基于单性状下的育种值估计准确性分别提高9.81%~19.43%和14.01%~21.97%。综上所述,产绒量属于中等偏低遗传力,绒纤维直径属于中等偏高遗传力,两个性状的遗传相关相对较小,说明对产绒量的选育提高不会造成绒纤维直径的变粗。GBLUP法的估计的各性状育种值准确性显著高于BLUP法,产绒量提高了10.92%~12.29%,绒纤维直径提高了3.64%~11.58%。基于多性状动物模型下育种值估计准确性高于单性状动物模型。当模型中同时考虑加性效应和显性效应时,可以显著提高基因组预测准确性,说明对内蒙古绒山羊产绒量和绒纤维直径进行选育过程中应该考虑显性效应的影响。
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关键词
内蒙古绒山羊
绒纤维直径
产绒量
显性效应
育种值估计准确性
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下载PDF
职称材料
基于多性状模型内蒙古绒山羊早期生长性状基因组预测准确性研究
被引量：
1
2
作者
高林豫
许琦
+10 位作者
何钰霄
习海娇
刘一帆
张涛
李金泉
张燕军
王瑞军
吕琦
梅步俊
苏蕊
王志英
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期421-430,共10页
内蒙古绒山羊是经过长期自然选择和人工选育后形成的优良家畜品种,是目前世界一流的绒肉兼用山羊。多性状动物模型被认为可以显著提高畜禽遗传评估的准确性,实现性状间的间接选择。本文基于内蒙古绒山羊个体的系谱、基因型、环境以及早...
内蒙古绒山羊是经过长期自然选择和人工选育后形成的优良家畜品种,是目前世界一流的绒肉兼用山羊。多性状动物模型被认为可以显著提高畜禽遗传评估的准确性,实现性状间的间接选择。本文基于内蒙古绒山羊个体的系谱、基因型、环境以及早期生长性状的表型记录,建立多性状动物模型,利用ABLUP、GBLUP、ssGBLUP三种方法进行早期生长性状(初生重、断乳重、断乳前平均日增重、周岁重)遗传参数及基因组育种值的估计,进一步利用五倍交叉验证方法评价基因组育种值估计准确性和可靠性。结果显示,3种方法估计的初生重遗传力为0.13~0.15,断乳重遗传力为0.13~0.20,日增重遗传力为0.11~0.14,周岁重遗传力为0.09~0.14,均属于中等偏低遗传力;断乳重和日增重、日增重和周岁重之间存在强的正遗传相关,相关系数分别为0.77~0.79和0.56~0.67,表型相关发现同样的规律;ABLUP、GBLUP和ssGBLUP法估计的初生重育种值准确性分别为0.5047、0.6694、0.7156,断乳重分别为0.6207、0.6456、0.7254;日增重分别为0.6110、0.6855、0.7357,周岁重分别为0.6209、0.7155、0.7756。综上所述,内蒙古绒山羊早期生长性状属于中等偏低遗传力,对其进行遗传选育改良速度相对较慢;通过对断乳重的选择可以实现其他生长性状的遗传改良;ssGBLUP方法估计内蒙古绒山羊早期生长性状基因组育种值的准确性和可靠性均最高,且显著高于ABLUP法,说明该方法是内蒙古绒山羊早期性状基因组选育的最佳方法。
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关键词
内蒙古绒山羊
早期生长性状
多性状动物模型
基因组
育种值估计准确性
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职称材料
题名
显性效应对内蒙古绒山羊产绒量和绒纤维直径育种值估计准确性的影响
1
作者
习海娇
李金泉
张燕军
王瑞军
吕琦
梅步俊
王娜
苏蕊
王志英
机构
内蒙古农业大学动物科学学院
农业农村部肉羊遗传育种重点实验室
内蒙古自治区羊遗传育种与繁殖重点实验室
河套学院农学系
内蒙古亿维白绒山羊有限责任公司
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第2期571-581,共11页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD1300201,2022YFD1300204)
内蒙古自治区高等学校“青年科技英才支持计划”(NJYT22038)
+3 种基金
财政部和农业农村部:国家绒毛用羊产业技术体系项目(CARS-39)
内蒙古农业大学高水平成果培育专项(QT202201)
内蒙古自治区高等学校创新团队发展计划项目(NMGIRT2322)
内蒙古自治区直属高校基本科研业务费项目(BR220112)。
文摘
旨在分析动物遗传评估模型中加入显性效应是否可以有效提高内蒙古绒山羊绒毛性状育种值预测的准确性。本研究基于课题组前期积累的健康状况良好的内蒙古绒山羊(阿尔巴斯型)2256只个体的70K SNP芯片测序数据,收集整理1至8岁个体的绒毛性状(绒纤维直径和产绒量)生产性能数据和系谱记录,根据是否考虑显性效应,建立两个动物模型,利用BLUP和GBLUP方法进行遗传参数及育种值的估计,进一步通过交叉验证的方法评价绒毛性状育种值估计的准确性,确定最佳遗传评估模型。最后建立多变量动物模型进行两个性状的遗传相关及育种值准确性估计,对比单性状和多性状模型下估计遗传参数及育种值准确性的差异。研究结果表明:当遗传评估模型中不考虑显性效应时,基于BLUP和GBLUP法估计产绒量的加性遗传力分别为0.156和0.215,育种值估计准确性分别为27.58%和60.33%;绒纤维直径的加性遗传力为0.252和0.292,育种值估计准确性为28.08%和62.33%。在动物模型中同时考虑加性和显性效应时,基于BLUP和GBLUP法估计产绒量的加性遗传力分别为0.150和0.200,显性遗传力为0.147和0.070,育种值估计准确性分别为38.50%和72.62%;绒纤维直径的加性遗传力为0.263和0.290,显性遗传力为0.288和0.026,育种值估计准确性为39.66%和65.97%。最佳模型下,产绒量和绒纤维直径的遗传相关为0.3400,表型相关为0.0385。产绒量和绒纤维直径育种值估计准确性比基于单性状下的育种值估计准确性分别提高9.81%~19.43%和14.01%~21.97%。综上所述,产绒量属于中等偏低遗传力,绒纤维直径属于中等偏高遗传力,两个性状的遗传相关相对较小,说明对产绒量的选育提高不会造成绒纤维直径的变粗。GBLUP法的估计的各性状育种值准确性显著高于BLUP法,产绒量提高了10.92%~12.29%,绒纤维直径提高了3.64%~11.58%。基于多性状动物模型下育种值估计准确性高于单性状动物模型。当模型中同时考虑加性效应和显性效应时,可以显著提高基因组预测准确性,说明对内蒙古绒山羊产绒量和绒纤维直径进行选育过程中应该考虑显性效应的影响。
关键词
内蒙古绒山羊
绒纤维直径
产绒量
显性效应
育种值估计准确性
Keywords
Inner Mongolia cashmere goat
cashmere diameter
cashmere production
dominance effects
accuracy of estimated breeding value
分类号
S827.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
基于多性状模型内蒙古绒山羊早期生长性状基因组预测准确性研究
被引量：
1
2
作者
高林豫
许琦
何钰霄
习海娇
刘一帆
张涛
李金泉
张燕军
王瑞军
吕琦
梅步俊
苏蕊
王志英
机构
内蒙古农业大学动物科学学院
农业农村部肉羊遗传育种重点实验室
内蒙古自治区羊遗传育种与繁殖重点实验室
河套学院农学系
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期421-430,共10页
基金
国家重点研发计划项目(编号:2022YFE0113300,2022YFD1300201,2022YFD1300204)
内蒙古自治区科技攻关项目(编号:2021GG0086)
+4 种基金
内蒙古自治区高等学校“青年科技英才支持计划”(编号:NJYT22038)
财政部和农业农村部:国家绒毛用羊产业技术体系项目(编号:CARS-39)
内蒙古农业大学高水平成果培育专项(编号:QT202201)
内蒙古自治区高等学校创新团队发展计划项目(编号:NMGIRT2322)
内蒙古自治区直属高校基本科研业务费项目(编号:BR220112)资助。
文摘
内蒙古绒山羊是经过长期自然选择和人工选育后形成的优良家畜品种,是目前世界一流的绒肉兼用山羊。多性状动物模型被认为可以显著提高畜禽遗传评估的准确性,实现性状间的间接选择。本文基于内蒙古绒山羊个体的系谱、基因型、环境以及早期生长性状的表型记录,建立多性状动物模型,利用ABLUP、GBLUP、ssGBLUP三种方法进行早期生长性状(初生重、断乳重、断乳前平均日增重、周岁重)遗传参数及基因组育种值的估计,进一步利用五倍交叉验证方法评价基因组育种值估计准确性和可靠性。结果显示,3种方法估计的初生重遗传力为0.13~0.15,断乳重遗传力为0.13~0.20,日增重遗传力为0.11~0.14,周岁重遗传力为0.09~0.14,均属于中等偏低遗传力;断乳重和日增重、日增重和周岁重之间存在强的正遗传相关,相关系数分别为0.77~0.79和0.56~0.67,表型相关发现同样的规律;ABLUP、GBLUP和ssGBLUP法估计的初生重育种值准确性分别为0.5047、0.6694、0.7156,断乳重分别为0.6207、0.6456、0.7254;日增重分别为0.6110、0.6855、0.7357,周岁重分别为0.6209、0.7155、0.7756。综上所述,内蒙古绒山羊早期生长性状属于中等偏低遗传力,对其进行遗传选育改良速度相对较慢;通过对断乳重的选择可以实现其他生长性状的遗传改良;ssGBLUP方法估计内蒙古绒山羊早期生长性状基因组育种值的准确性和可靠性均最高,且显著高于ABLUP法,说明该方法是内蒙古绒山羊早期性状基因组选育的最佳方法。
关键词
内蒙古绒山羊
早期生长性状
多性状动物模型
基因组
育种值估计准确性
Keywords
Inner Mongolia cashmere goat
early growth traits
multi trait animal model
accuracy of genomic estimated breeding value
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
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被引量
操作
1
显性效应对内蒙古绒山羊产绒量和绒纤维直径育种值估计准确性的影响
习海娇
李金泉
张燕军
王瑞军
吕琦
梅步俊
王娜
苏蕊
王志英
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
基于多性状模型内蒙古绒山羊早期生长性状基因组预测准确性研究
高林豫
许琦
何钰霄
习海娇
刘一帆
张涛
李金泉
张燕军
王瑞军
吕琦
梅步俊
苏蕊
王志英
《遗传》
CAS
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