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肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应指纹图谱技术用于细菌分型的研究进展
被引量：
1
1
作者
侯霞霞
王云霞
+3 位作者
胡雪
吕志勇
刘丽君
李翠枝
《乳业科学与技术》
2019年第2期28-34,共7页
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)指纹图谱技术利用普遍存在于生物体内的ERIC进行引物设计,通过基因扩增,获得能够表征其基因组结构...
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)指纹图谱技术利用普遍存在于生物体内的ERIC进行引物设计,通过基因扩增,获得能够表征其基因组结构的产物,该方法简单易行、重复性好、用时短,被广泛应用于细菌基因分型及同源性判别。本文简述细菌分型的研究背景和ERIC-PCR指纹图谱技术的原理及特点,归纳该技术在细菌基因分型方面的优缺点及其在常见食源性致病菌基因分型中的应用现状,并对ERIC-PCR指纹图谱技术应用于乳品企业污染菌溯源的研究进行展望。
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关键词
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应
指纹图谱技术
细菌
分型
污染菌溯源
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职称材料
大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响
被引量：
14
2
作者
范颖
赵鑫
+2 位作者
李娜
吴曼曼
李新莉
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2018年第22期141-146,共6页
应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)和聚合酶链式反应--变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophore...
应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)和聚合酶链式反应--变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)研究大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响。灌胃红星二锅头建立小鼠急性酒精性肝损伤模型,ERIC-PCR和PCR-DGGE电泳获得肠道菌群指纹图谱,分析肠道菌群的相似性和多样性并鉴定优势条带序列。ERIC-PCR结果表明急性酒精性肝损伤模型小鼠肠道菌群结构发生明显改变,以360 bp的条带为优势条带,610 bp左右的条带强度减弱,大蒜多糖预防给药组中360 bp左右的条带强度减弱。PCR-DGGE结果显示急性酒精性肝损伤的小鼠肠道菌群多样性指数降低,优杆菌属和乳酸菌属细菌明显减少。大蒜多糖高剂量组的多样性指数和均匀度指数最高,优杆菌属和乳酸菌属细菌增多。大蒜多糖可以促进肠道中优杆菌属和乳酸菌属生长,调节急性酒精性肝损伤伴有的肠道菌群失调。
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关键词
大蒜多糖
急性酒精性肝损伤
肠道
菌群
肠杆菌
基因
间
重复
共有
序列
基因
扩增
聚合
酶
链式反应
-
变性梯度凝胶电泳
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职称材料
肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性分析及ERIC-PCR分型
被引量：
9
3
作者
李楠
赵思俊
+7 位作者
王娟
赵建梅
李玉清
黄秀梅
王君玮
丁宜宝
刘焕奇
曲志娜
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期120-124,共5页
目的：了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法：采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反...
目的：了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法：采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应（enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR）法对33株不同生产环节耐药菌株进行分子分型;采用SPSS 20.0软件、Gel-Pro Analyer 4.0和NTSYS pc 2.1软件进行分析。结果：171株肠炎沙门氏菌对13种药物耐药情况不同,其中对氨苄西林耐药情况最严重,耐药率高达90.06%,对恩诺沙星、氧氟沙星最为敏感,耐药率均仅为5.26%;不同环节间耐药性差异极显著（P〈0.01）;多重耐药率高达95.32%,共有26种耐药谱型。不同环节的33株肠炎沙门氏菌分为4种（Ⅰ~Ⅳ）基因型,遗传相似性在66%~100%,Ⅰ型为优势基因型;基因型相同的菌株耐药谱不一定相同,反之,耐药谱相同的菌株基因型不一定相同。结论：肉鸡生产链条中沙门氏菌对多种抗菌药物产生耐药性,且耐药谱种类繁多;沙门氏菌能够沿着生产链进行水平传播,肉鸡场环节菌株基因型相对复杂,菌株基因型与耐药表型之间无明显相关性。
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关键词
肠炎沙门氏菌
肉鸡
耐药性
肠杆菌
基因
间
重复
共有
序列
-
聚合
酶
链式反应
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职称材料
题名
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应指纹图谱技术用于细菌分型的研究进展
被引量：
1
1
作者
侯霞霞
王云霞
胡雪
吕志勇
刘丽君
李翠枝
机构
内蒙古伊利实业集团股份有限公司
出处
《乳业科学与技术》
2019年第2期28-34,共7页
文摘
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)指纹图谱技术利用普遍存在于生物体内的ERIC进行引物设计,通过基因扩增,获得能够表征其基因组结构的产物,该方法简单易行、重复性好、用时短,被广泛应用于细菌基因分型及同源性判别。本文简述细菌分型的研究背景和ERIC-PCR指纹图谱技术的原理及特点,归纳该技术在细菌基因分型方面的优缺点及其在常见食源性致病菌基因分型中的应用现状,并对ERIC-PCR指纹图谱技术应用于乳品企业污染菌溯源的研究进行展望。
关键词
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应
指纹图谱技术
细菌
分型
污染菌溯源
Keywords
enterobacterial repetitive intergenic consensus
-
polymerase chain reaction
fingerprinting technology
bacterial typing
tracing of microbial contaminants
分类号
Q939.97 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响
被引量：
14
2
作者
范颖
赵鑫
李娜
吴曼曼
李新莉
机构
大连医科大学临床技能中心
大连医科大学生物技术系
出处
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2018年第22期141-146,共6页
文摘
应用肠杆菌基因间重复共有序列基因扩增(enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR)和聚合酶链式反应--变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)研究大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响。灌胃红星二锅头建立小鼠急性酒精性肝损伤模型,ERIC-PCR和PCR-DGGE电泳获得肠道菌群指纹图谱,分析肠道菌群的相似性和多样性并鉴定优势条带序列。ERIC-PCR结果表明急性酒精性肝损伤模型小鼠肠道菌群结构发生明显改变,以360 bp的条带为优势条带,610 bp左右的条带强度减弱,大蒜多糖预防给药组中360 bp左右的条带强度减弱。PCR-DGGE结果显示急性酒精性肝损伤的小鼠肠道菌群多样性指数降低,优杆菌属和乳酸菌属细菌明显减少。大蒜多糖高剂量组的多样性指数和均匀度指数最高,优杆菌属和乳酸菌属细菌增多。大蒜多糖可以促进肠道中优杆菌属和乳酸菌属生长,调节急性酒精性肝损伤伴有的肠道菌群失调。
关键词
大蒜多糖
急性酒精性肝损伤
肠道
菌群
肠杆菌
基因
间
重复
共有
序列
基因
扩增
聚合
酶
链式反应
-
变性梯度凝胶电泳
Keywords
garlic polysaccharide
acute alcohol
-
induced hepatic injury
intestinal microflora
enterobacterial
分类号
R151 [医药卫生—营养与食品卫生学]
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职称材料
题名
肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性分析及ERIC-PCR分型
被引量：
9
3
作者
李楠
赵思俊
王娟
赵建梅
李玉清
黄秀梅
王君玮
丁宜宝
刘焕奇
曲志娜
机构
中国动物卫生与流行病学中心
青岛农业大学动物科技学院
中国兽医药品监察所
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期120-124,共5页
基金
"十二五"科技基础性工作专项(2012FY111000)
农业部"引进国际先进科学技术"重点项目"兽药监管技术引进项目"(2011-G14)
文摘
目的：了解肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性情况以及各生产环节菌株间亲缘关系,为临床用药及菌株追踪溯源提供依据。方法：采用微量肉汤稀释法对171株肠炎沙门氏菌进行13种抗菌药物药敏实验;采用肠杆菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应（enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction,ERIC-PCR）法对33株不同生产环节耐药菌株进行分子分型;采用SPSS 20.0软件、Gel-Pro Analyer 4.0和NTSYS pc 2.1软件进行分析。结果：171株肠炎沙门氏菌对13种药物耐药情况不同,其中对氨苄西林耐药情况最严重,耐药率高达90.06%,对恩诺沙星、氧氟沙星最为敏感,耐药率均仅为5.26%;不同环节间耐药性差异极显著（P〈0.01）;多重耐药率高达95.32%,共有26种耐药谱型。不同环节的33株肠炎沙门氏菌分为4种（Ⅰ~Ⅳ）基因型,遗传相似性在66%~100%,Ⅰ型为优势基因型;基因型相同的菌株耐药谱不一定相同,反之,耐药谱相同的菌株基因型不一定相同。结论：肉鸡生产链条中沙门氏菌对多种抗菌药物产生耐药性,且耐药谱种类繁多;沙门氏菌能够沿着生产链进行水平传播,肉鸡场环节菌株基因型相对复杂,菌株基因型与耐药表型之间无明显相关性。
关键词
肠炎沙门氏菌
肉鸡
耐药性
肠杆菌
基因
间
重复
共有
序列
-
聚合
酶
链式反应
Keywords
Salmonella enteritidis
broiler
antimicrobial resistance
enterobacterial repetitive intergenic consensuspolymerase chain reaction
分类号
S859.7 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肠道细菌基因间重复共有序列-聚合酶链式反应指纹图谱技术用于细菌分型的研究进展
侯霞霞
王云霞
胡雪
吕志勇
刘丽君
李翠枝
《乳业科学与技术》
2019
1
在线阅读
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职称材料
2
大蒜多糖对急性酒精性肝损伤小鼠肠道菌群失调的影响
范颖
赵鑫
李娜
吴曼曼
李新莉
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2018
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
肉鸡生产链中肠炎沙门氏菌耐药性分析及ERIC-PCR分型
李楠
赵思俊
王娟
赵建梅
李玉清
黄秀梅
王君玮
丁宜宝
刘焕奇
曲志娜
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
9
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职称材料
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