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题名鱼菜共生模式中不同鱼类肠道微生物群落结构的比较
被引量：22
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作者
李建柱
侯杰
张鹏飞
柳尧全
夏闰红
马徐发
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机构
华中农业大学
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出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期42-50,共9页
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基金
国家科技支撑计划项目(2012BAD25B05)
湖北省自然科学基金项目(2013CFA095)
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文摘
为研究鱼菜共生模式下不同鱼类肠道微生物的菌落结构,采用宏基因组学测序技术和生物信息学分析手段,构建了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲫(Carassius auratus)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙(Aristichthys nobilis)4种鲤科鱼类的肠道内含物等12个样品的16S rDNA测序克隆文库,分析了这4种鲤科鱼类肠道微生物的菌落组成和多样性。结果表明,鱼菜共生模式下不同鲤科鱼类肠道内含物微生物优势菌落的组成十分相似(P>0.05,Kruskal-Wallis),优势微生物菌群均是鲸杆菌属(Cetobacterium)和梭状芽孢杆菌属(Clostridium)、拟杆菌属(Bacteroides)和芽孢杆菌属(Bacillus)等,其中鲸杆菌属和梭状芽孢杆菌属含量最丰富,且主要在非优势菌属之间具有显著差异(P<0.05,Kruskal-Wallis),研究结果还表明食性不是造成不同食性鲤科鱼类肠道微生物菌落差异的唯一决定性因素。
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关键词
鱼菜共生模式
鲤科
肠道微生物群落结构
食性
16SrDNA
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Keywords
aquaponics system
carp
intestinal microbial community structure
feeding habits
16S rDNA
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分类号
S917.1
[农业科学—水产科学]
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