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广西地区猪肠病毒G型的流行病学调查及VP1基因序列分析
被引量:
4
1
作者
杨春杰
刘雪婷
+4 位作者
米雪
陈樱
韦祖樟
黄伟坚
欧阳康
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020年第4期1216-1224,共9页
为分析广西地区猪肠病毒G型(EV-G)的流行状况及分子遗传演化特征,本研究收集2017-2018年广西地区222份临床腹泻样品,进行EV-G的检测、流行病学调查及VP1基因的扩增、克隆和序列分析。流行病学调查结果显示,广西地区2017-2018年EV-G的样...
为分析广西地区猪肠病毒G型(EV-G)的流行状况及分子遗传演化特征,本研究收集2017-2018年广西地区222份临床腹泻样品,进行EV-G的检测、流行病学调查及VP1基因的扩增、克隆和序列分析。流行病学调查结果显示,广西地区2017-2018年EV-G的样品阳性率为6.76%(15/222),而猪场阳性率则高达16.98%(9/53)。值得注意的是,广西地区2017-2018年EV-G的样品阳性率从2017年的4.55%上升至2018年的10.00%,上升幅度较大。同时发现该病毒在冬春季节的检出率较高。序列同源性分析结果显示,本研究获得的2株EV-G VP1基因之间的核苷酸同源性为99.2%,氨基酸同源性为98.8%,与国内外毒株VP1基因的核苷酸同源性为62.4%~80.1%,氨基酸同源性为45.7%~71.7%。遗传进化分析显示,本研究获得的2株EV-G VP1序列在同一分支,均属于G1亚型,与美国分离株13-03212遗传关系密切。氨基酸序列比较结果显示,广西地区该2株EV-G VP1氨基酸在多个位点发生了变异。抗原指数分析显示,广西地区EV-G型流行毒株的抗原性变化较大。表明2017-2018年广西地区存在一定程度的EV-G感染,本研究结果为明确EV-G型的流行概况及EV-G型的分子特性提供了参考依据。
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关键词
猪
肠病毒
g
型
(
ev-g
)
流行病学
序列分析
抗原性
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职称材料
2013—2022年云南地区猪肠病毒G型的分子流行病学调查
被引量:
2
2
作者
王位
朱沛
+5 位作者
李占鸿
薛晓岩
杨钦鸿
李雪
李素华
姚俊
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期5000-5012,共13页
【目的】了解肠病毒G型(Enterovirus G,EV-G)在云南地区猪场中的流行状况及其分子特征,为云南地区EV-G的防控提供理论依据。【方法】根据EV-G的5′-非翻译区(UTR)保守区域设计引物,RT-PCR扩增监测2013-2022年云南地区猪临床腹泻样品的E...
【目的】了解肠病毒G型(Enterovirus G,EV-G)在云南地区猪场中的流行状况及其分子特征,为云南地区EV-G的防控提供理论依据。【方法】根据EV-G的5′-非翻译区(UTR)保守区域设计引物,RT-PCR扩增监测2013-2022年云南地区猪临床腹泻样品的EV-G阳性率,从阳性样品来源的区域、猪群结构及类型分析EV-G在云南地区的感染情况。利用EV-G VP 1基因巢式PCR引物,通过RT-PCR扩增EV-G VP 1基因全序列;采用MegAlign软件分析EV-G云南株的VP1序列与EV-G的20个基因型标准株的相似性及关键氨基酸突变,采用Mega 7.0软件构建VP 1基因的遗传进化树,并通过Protean软件的Jameson-Wolf分析法对VP1蛋白进行抗原指数分析。【结果】云南地区2013-2022年收集的1941份临床样品EV-G总阳性率为19.42%(377/1941),其中大理(54.54%)、玉溪(45.45%)、红河(43.24%)猪群的EV-G感染阳性率明显高于云南其他地区;乳猪(25.19%)和保育猪(24.68%)2个年龄组的猪群阳性感染率高于其他猪群;肛拭子阳性样品的检出率(53.58%)高于肠道内容物(29.71%)及粪便(16.71%)样品。基于20株EV-G代表株VP 1基因序列相似性分析及遗传进化表明,17个云南株为EV-G1型,2株为EV-G6型,1株为EV-G17型。17个EV-G1基因型云南分离株VP1蛋白在第125-150、170-190位氨基酸处抗原指数活跃度显著增强,此区域同时存在多个亲水性氨基酸位点的突变,如P^(127) S、P^(143) S、G^( 146) R、P^( 188 )S。【结论】EV-G1、EV-G6和EV-G17等多种基因型在云南地区猪群中流行,以EV-G1型流行为主。EV-G1基因型云南分离株的VP1蛋白在第125-150、170-190位氨基酸处存在显著的抗原活跃度,可能介导EV-G1基因型毒株在云南的感染和流行。
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关键词
肠病毒
g
型
(
ev-g
)
VP1
分子流行病学
基因特征
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职称材料
题名
广西地区猪肠病毒G型的流行病学调查及VP1基因序列分析
被引量:
4
1
作者
杨春杰
刘雪婷
米雪
陈樱
韦祖樟
黄伟坚
欧阳康
机构
广西大学动物科学技术学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020年第4期1216-1224,共9页
基金
广西创新驱动发展专项资金项目(桂科AA17204057-1)
广西自然科学基金(2017GXNSFAA198138)
+1 种基金
广西高校中青年教师基础能力提升项目(2018KY0048)
贵港市科学研究与技术开发计划项目(贵科攻1829012)。
文摘
为分析广西地区猪肠病毒G型(EV-G)的流行状况及分子遗传演化特征,本研究收集2017-2018年广西地区222份临床腹泻样品,进行EV-G的检测、流行病学调查及VP1基因的扩增、克隆和序列分析。流行病学调查结果显示,广西地区2017-2018年EV-G的样品阳性率为6.76%(15/222),而猪场阳性率则高达16.98%(9/53)。值得注意的是,广西地区2017-2018年EV-G的样品阳性率从2017年的4.55%上升至2018年的10.00%,上升幅度较大。同时发现该病毒在冬春季节的检出率较高。序列同源性分析结果显示,本研究获得的2株EV-G VP1基因之间的核苷酸同源性为99.2%,氨基酸同源性为98.8%,与国内外毒株VP1基因的核苷酸同源性为62.4%~80.1%,氨基酸同源性为45.7%~71.7%。遗传进化分析显示,本研究获得的2株EV-G VP1序列在同一分支,均属于G1亚型,与美国分离株13-03212遗传关系密切。氨基酸序列比较结果显示,广西地区该2株EV-G VP1氨基酸在多个位点发生了变异。抗原指数分析显示,广西地区EV-G型流行毒株的抗原性变化较大。表明2017-2018年广西地区存在一定程度的EV-G感染,本研究结果为明确EV-G型的流行概况及EV-G型的分子特性提供了参考依据。
关键词
猪
肠病毒
g
型
(
ev-g
)
流行病学
序列分析
抗原性
Keywords
porcine enterovirus
g
(
ev-g
)
epidemiolo
g
y
sequence analysis
anti
g
enicity
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
2013—2022年云南地区猪肠病毒G型的分子流行病学调查
被引量:
2
2
作者
王位
朱沛
李占鸿
薛晓岩
杨钦鸿
李雪
李素华
姚俊
机构
西南林业大学生命科学学院
云南畜牧兽医科学院
云南农业大学动物医学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期5000-5012,共13页
基金
云南省农业重大科技专项计划“云南省猪重要疫病防控技术体系构建及应用”(202102AE090007)
云南省财政专项-畜禽种质创新及标准化养殖技术推广课题“牛结节性皮肤病防控技术研究与示范”(云财农【2022】5号)
乡村振兴科技专项-科技特派团(202304BI090003)。
文摘
【目的】了解肠病毒G型(Enterovirus G,EV-G)在云南地区猪场中的流行状况及其分子特征,为云南地区EV-G的防控提供理论依据。【方法】根据EV-G的5′-非翻译区(UTR)保守区域设计引物,RT-PCR扩增监测2013-2022年云南地区猪临床腹泻样品的EV-G阳性率,从阳性样品来源的区域、猪群结构及类型分析EV-G在云南地区的感染情况。利用EV-G VP 1基因巢式PCR引物,通过RT-PCR扩增EV-G VP 1基因全序列;采用MegAlign软件分析EV-G云南株的VP1序列与EV-G的20个基因型标准株的相似性及关键氨基酸突变,采用Mega 7.0软件构建VP 1基因的遗传进化树,并通过Protean软件的Jameson-Wolf分析法对VP1蛋白进行抗原指数分析。【结果】云南地区2013-2022年收集的1941份临床样品EV-G总阳性率为19.42%(377/1941),其中大理(54.54%)、玉溪(45.45%)、红河(43.24%)猪群的EV-G感染阳性率明显高于云南其他地区;乳猪(25.19%)和保育猪(24.68%)2个年龄组的猪群阳性感染率高于其他猪群;肛拭子阳性样品的检出率(53.58%)高于肠道内容物(29.71%)及粪便(16.71%)样品。基于20株EV-G代表株VP 1基因序列相似性分析及遗传进化表明,17个云南株为EV-G1型,2株为EV-G6型,1株为EV-G17型。17个EV-G1基因型云南分离株VP1蛋白在第125-150、170-190位氨基酸处抗原指数活跃度显著增强,此区域同时存在多个亲水性氨基酸位点的突变,如P^(127) S、P^(143) S、G^( 146) R、P^( 188 )S。【结论】EV-G1、EV-G6和EV-G17等多种基因型在云南地区猪群中流行,以EV-G1型流行为主。EV-G1基因型云南分离株的VP1蛋白在第125-150、170-190位氨基酸处存在显著的抗原活跃度,可能介导EV-G1基因型毒株在云南的感染和流行。
关键词
肠病毒
g
型
(
ev-g
)
VP1
分子流行病学
基因特征
Keywords
Enterovirus
g
(
ev-g
)
VP1
molecular epidemiolo
g
y
g
enetic characteristics
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广西地区猪肠病毒G型的流行病学调查及VP1基因序列分析
杨春杰
刘雪婷
米雪
陈樱
韦祖樟
黄伟坚
欧阳康
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2020
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
2013—2022年云南地区猪肠病毒G型的分子流行病学调查
王位
朱沛
李占鸿
薛晓岩
杨钦鸿
李雪
李素华
姚俊
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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